更新: 2012-12-19 07:15:39
生態学のデータ解析 - 国際水研統計モデル講習2012
- 2012 年 12 月 17-19 日,国際水産資源研究所 (静岡市清水区) の統計モデルセミナー (統計学授業)
- 場所: 清水テルサ の 7 階会議室 A (ネットが使えます)
- このペイジの短縮 URL: http://goo.gl/OyB2k
- 参考文献: 統計モデリング入門, 講義のーと2008
12 月 17 日 (月) の予定
12:40 開場.第 1 日目は初心者むけの内容です.
- (s1) 13:00-14:20 全体の概要紹介と「R の練習」
- 投影資料: s1.pdf (全体の概要説明)
- 初心者むけの R 練習: r1.pdf
- 参照: R-primer/plot 実習 1, data.csv (練習用ファイル)
- (s2) 14:40-16:10 一般化線形モデル (GLM) -- ポアソン回帰
- 投影資料: s2.pdf
- 参照: FAQ 一般化線形モデル, GLM 参照
- 例題のファイル
- ひとつめの例題: data.RData
- ふたつめの例題: data3a.csv
12 月 18 日 (火) の予定
第 2 日目は GLM の応用,そして階層ベイズモデルの説明など
- (s3) 09:00-10:20 一般化線形モデル (GLM) -- 何でも「割算」するな!
- (s4) 10:20-12:00 階層ベイズモデルの基礎 -- MCMC と個体差のモデリング
- 投影資料: s4a.pdf (基本編, 作業中)
- 投影資料: s4b.pdf (WinBUGS 編,作業中)
- 例題のファイル
- R2WBwrapper.R,これををうまく読み込めない人は
source("http://hosho.ees.hokudai.ac.jp/~kubo/ce/r/R2WBwrapper.R")
を試してください (インターネットに接続された状態で) - data7a.csv
- runbugs.R
- model.bug.txt
- R2WBwrapper.R,これををうまく読み込めない人は
- 参照: GLMM 参照, ベイズ統計 & MCMC
- (s5) 13:00-14:20 階層ベイズモデルの応用 -- 空間・時間構造などをあつかう
- 投影資料: s5.pdf
- 植木鉢の例題:
- データファイル: d1.csv
- runbugs.R
- model.bug.txt
- 空間構造の例題:
- 例題データ: Y.RData
- runbugs.R
- model.bug.txt
- (s6) 14:40-16:10 階層ベイズモデルの応用 -- 重量比の問題など
- 投影資料: s6.pdf
- 参照: 生態学会大会2011, 統計学授業2011
(懇親会)
12 月 19 日 (水) の予定
第 3 日目はみなさんから出していただいた例題の検討など (途中でてきとうに休憩時間をはさみつつ)
- (s7) 09:00-12:00 例題の検討
- 例題にとりくむ前に,ちょっとばかり分割表の統計モデリングを説明します
- 国際水研統計モデル講習2012 s7
- 捕獲数から集団サイズの推定
- CPUE の統計モデリング
- 体長サイズ分布
- 実データの作図問題とかもやりたいですね