更新: 2018-12-12 16:00:24
生態学のデータ解析 - 統計学授業2018 (生態学基礎論)
- 統計学の授業やります (2018 年度後期, 2019 年 1 月)
- 講釈: 久保拓弥 (授業サイトの URL) http://goo.gl/76c4i
- 参照: 本/データ解析のための統計モデリング入門 (統計モデリングの教科書)
- 北海道大学・大学院環境科学院
- 「生態学基礎論 (生態学基礎論 II)」
- 後期後半: 2019-01-21 (月) と 23 (水) 第 4 講目 (16:30 - 18:00)
- 北大・地環研 D 棟 1F D-102 教室
- 全 2 回, 対象 M1 (とはいえ,どなたでも参加自由です)
- データ解析サイト内の参考ペイジ: 本/データ解析のための統計モデリング入門, R のインストール, GLM 参照, GLMM 参照
- 当日の資料配布のメイル通信!!
第 1 回: 2019-01-21 (月) 統計モデリングの基礎 (1):統計モデル・確率分布・最尤推定
- 資料: kubostat2018y.pdf , HOkubostat2018y.pdf (同じ内容のハンドアウト版)
- ポアソン分布説明の例題データ: data.RData
- R で読む:
load("data.RData")
- R で読む:
- ポアソン回帰の例題データ: data3a.csv
- CSV file をうまく読めない場合は R 上で以下の命令を実行してください:
- 例題データ: (logistic 回帰) data4a.csv, (offset 項) d2.RData, (GLMM) data.csv
- d <- read.csv("http://hosho.ees.hokudai.ac.jp/~kubo/stat/2014/Fig/poisson/data3a.csv")
第 2 回: 2018-01-23 (水) 統計モデリングの基礎 (2):GLM の階層ベイズモデル化
- 資料: kubostat2018z.pdf , HOkubostat2018z.pdf (同じ内容のハンドアウト版)
- 本/データ解析のための統計モデリング入門 の第 8-10 章の例題なども参考にしてください
- MCMC の例題ファイルなど:
- data.RData (3. と同じ)
- あるいは
data <- c(4,3,4,5,5,2,3,1,4,0,1,5,5,6,5,4,4,5,3,4)
- あるいは
- R で
install.pacakges(c("rjags", "R2WinBUGS"))
が必要 - runjags.R
- JAGS の入手先: http://sourceforge.net/projects/mcmc-jags/files/
- data.RData (3. と同じ)
- 階層ベイズの例題ファイルなど:
- R で
install.pacakges(c("rjags", "R2WinBUGS"))
が必要 - JAGS の mcmc.list を bugs データに変換する関数: mcmc.list2bugs.R
- R で
- 例題 (植木鉢上の植物個体の種子数) のデータ: d1.csv