生態学のデータ解析 - WinBUGS のインストール

• ここでは WinBUGS のインストール方法を簡単に説明します
  • 参照: WinBUGS 雑, ベイズ統計 & MCMC, R2WinBUGS
  • 注意: Windows Vista を使っている人は http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs/winbugs/contents.shtml 内の Vista についての注意を読んでからインストールしてください

[もくじ]

• とりあえずのインストール方法
• 注意

とりあえずのインストール方法 

1. http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs/winbugs/contents.shtml から以下をダウンロード
   • Winbugs14 (.exe か .zip)
   • patch for 1.4.3
2. 自分の計算機に WinBUGS 1.4 (WinBUGS14.exe) をインストール
3. patch をあてて version を 1.4 から 1.4.3 にする
   1. WinBUGS14.exe を起動
      • Windows Vista, Windows 7 の場合，右クリックして「管理者」として起動する必要あり
   2. (menu) File → Open でファイルの種類を (*.txt) にして patch...txt を開く
   3. (menu) Tools → Decode で decode all ボタンを押す
   4. WinBUGS14.exe をいったん終了
4. http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs/winbugs/WinBUGS14_immortality_key.txt (テキストファイル) のライセンスキーファイルを取得
   • これがないと WinBUGS の全機能を使うことができない
   • 上の patch あてと同じ手順で key の text file を decode

注意 

• 64-bit 版 Windows 上に直接インストールするのは無理みたいです
  • 上記の配布サイトには「このディレクトリをいれろ」みたいな zip ファイルが配られていますが (たぶんインストーラーに互換性がないんでしょう)，これで WinBUGS 1.4 を起動できますが 1.4.3 patch はあてられません
  • そこでまず 32-bit 版 Windows 上に WinBUGS をインストールし，1.4.3 patch などをあてます
  • つぎにその 32-bit 機の Program Files ないの WinBUGS14 ディレクトリごと，64-bit 機に移動します
  • これで 64-bit 機上で WinBUGS 1.4.3 が動作します
• 上の方法でも 64-bit 機上で WinBUGS 1.4.3 が動作しない場合があります
  • たとえば Program Files フォルダにいれると，一般ユーザーには一時ファイルなどを保存する権限がないので，うまく動作しないかもしれません
  • 管理者権限で動かす?
  • あるいはユーザーが自由に利用できる場所に WinBUGS ディレクトリを置くという手法があるかも --- この場合，R2WinBUGS を使っている人は正しく bugs.directory オプションを指定して WinBUGS を呼びだす必要があります
• MacOS X 上で WinBUGS を動かすことはかなり困難なようです
  • 伊東さんのメモなど参照してください
    • Mac OS X上で、WinBUGS+R2WinBUGSを使用する http://www001.upp.so-net.ne.jp/ito-hi/stat/winbugs.html
    • http://ito-hi.blog.so-net.ne.jp/search/?keyword=winbugs+intel+mac
  • JAGS を使ったほうがよいかも -- JAGS 雑 参照
• Linux 上では Wine を使って WinBUGS を動かすことができます
  • どうやら Ubuntu 10.04 上では default でインストールされる Wine 1.2 では WinBUGS は動作しません

	対策例
	$ sudo apt-get remove wine
	$ sudo apt-get install wine1.0