更新: 2012-09-24 21:50:27
生態学のデータ解析 - 本/Bayesian_Inference
- ベイズ本の紹介です: W.A. Link and R.J. Barker (2010) Bayesian Inference: With ecological applications. Academic Press. ISBN 0123748542, 9780123748546
- 出版社のペイジ: http://www.elsevierdirect.com/product.jsp?isbn=9780123748546
- Google Books (内容かなり読めます)
- 北大図書館にもあります: 目録
- 参照: ベイズ統計 & MCMC
[もくじ]
- 章ごとの輪読会発表メモなど
- Chapter 1. Bayesian Inference
- Chapter 2. Probability
- Chapter 3. Statistical Inference
- Chapter 4. Posterior Calculations
- Chapter 5. Bayesian Prediction
- Chapter 6. Priors
- Chapter 7. Multimodel Inference
- Chapter 8. Hidden Data Models
- Chapter 9. Closed-Population Mark-Recapture Models
- Chapter 10. Latent Multinomials
- Chapter 11. Open Population Models
- Chapter 12. Individual Fitness
- Chapter 13. Autoregressive Smoothing
- 輪読会 (2010 年 12 月)
- 輪読会 (2010 年 5 月)
章ごとの輪読会発表メモなど
Chapter 1. Bayesian Inference
- chapter1.pdf (山浦)
Chapter 2. Probability
- chapter2.pdf (平尾)
Chapter 3. Statistical Inference
- chapter3A.pdf (前半; 矢澤)
Chapter 4. Posterior Calculations
- chapter4A.pdf (前半; 川森)
- chapter4B.pdf (後半; 萩野)
- Chapter4B.pdf (後半全訳; 萩野)
Chapter 5. Bayesian Prediction
- chapter5B.pdf (後半; 野間野)
Chapter 6. Priors
- chapter6.pdf (飯島)
- Ch6presentation.pdf (飯島)
Chapter 7. Multimodel Inference
- chapter7A.pdf (前半; 久保)
- chapter7B.pdf (前半; 深谷)
Chapter 8. Hidden Data Models
- chapter8A.pdf (志田)
- chapter8B.pdf (安田)
- chapter8C.pdf (久保)
Chapter 9. Closed-Population Mark-Recapture Models
- chapter9A.pdf (上野)
- chapter9B.pdf (平岩)
- chapter9C.pdf (深谷)
- chapter9D.pdf (野間野)
Chapter 10. Latent Multinomials
- chapter10.pdf (長田)
Chapter 11. Open Population Models
- chapter11A.pdf (飯島)
- p247code.txt (飯島)
- chapter11B.pdf (奥田)
- chapter11C.pdf (川森)
Chapter 12. Individual Fitness
- chapter12A.pdf (野間野)
- chapter12B.pdf (香川)
Chapter 13. Autoregressive Smoothing
- chapter13.pdf (深谷)
輪読会 (2010 年 12 月)
- 日時：12月18-19日
- 場所：北海道大学環境科学院 A809
- 輪読本と範囲：Link, W. A. and R. J. Barker (2010) Bayesian Inference: with ecological applications. Academic Press. pp.163-297.
前回前半をやったときは統計のお勉強といった感じでしたが、 今回は実際の生態学データへの適用の部分で、 各章のタイトルは以下のようになります。
- 8. Hidden Data Models
- 9. Closed-Population Mark-Recapture Models
- 10. Latent Multinomial Models
- 11. Open Population Models
- 12. Individual Fitness
- 13. Autoregressive Smoothing
前回と同様、2日間で100ページ超を進めていきます。 参加者の人数にもよりますが、基本的には一人だいたい10-20ページくらいの 担当を持って発表していただきます。
発表形式は、前回と同様に基本的にはレジュメand/orパワーポイントを用意して、 当日紙に印刷して参加者に配布する形とします。 資料は後日このページにてアップする予定です。
12/18 (土)
- 8. Hidden Data Model
- 9:30-10:20: pp. 163-175 (志田)
- 10:30-11:20: pp. 176-186 (安田)
- 11:30-12:20: pp. 186-200 (久保)
- 9. Closed-Population Model Mark-Recapture Model
- 13:30-14:20: pp. 201-209 (上野)
- 14:30-15:20: pp. 209-218 (平岩)
- 15:30-16:20: pp. 218-224 (岨)
- 10. Latent Multinomial Models
- 16:40-17:30: pp. 225-237 (長田)
12/19 (日)
- 11. Open Population Models
- 10:00-10:50: pp. 239-247 (飯島)
- 11:00-11:50: pp. 247-260 (奥田)
- 13:00-13:50: pp. 260-270 (川森)
- 12. Individual Fitness
- 14:10-15:00: pp. 271-281 (野間野)
- 15:10-16:00: pp. 281-286 (香川)
- 13. Autoregressive Smoothing
- 16:20-17:10: pp. 287-297 (深谷)
輪読会 (2010 年 5 月)
- とりまとめ役: 深谷肇一 (環境科学院・動物生態), 野間野史明 (環境科学院・生態遺伝)
- 場所: 環境科学院 A 棟 8F A809 セミナー室 (エレヴェイター出てすぐ前の部屋)
- 範囲: Chapter 1-7
- 日程: 2010 年 5 月
- 28 (金) 9:30 - 17:50
- １章 山浦（pp.3-12; 9:30-10:30）
- ２章 平尾（pp.13-21; 10:35-11:25）
- ３章 矢澤 (pp.23-36; 13:00-) 黒阪（pp.36-45; -15:00）
- ４章 川森（pp.47-59; 15:15-16:30）萩野（pp.59-74; 16:35-17:50）
- 29 (土) 9:30 - 17:40
- ５章 小林（pp.77-93; 9:30-10:45）野間野（pp.93-107; 10:50-12:05)
- ６章 飯島（pp.109-125; 13:00-14:15）
- ７章 久保（pp.127-139; 14:20-15:35） 深谷（pp.139-159; 15:40-17:40）
- 28 (金) 9:30 - 17:50
- 参加者
- 北海道大学低温研: 平尾
- 北海道大学理学研究院: 川森
- 北海道大学環境科学院: 久保，野間野，萩野，深谷，矢澤
- 北海道大学農学研究科: 小林，山浦
- 北海道大学経済学研究科: 黒阪
- 山梨森林総研: 飯島