更新: 2015-11-17 14:51:58

生態学のデータ解析 - 北海道総研機構2015

2015-11-16 「統計解析技術勉強会」(出張統計学授業 , 11 時間)
北海道総合研究機構
- 場所: 北海道総合研究プラザ（札幌市北区１９条１１丁目）
教科書: 本/データ解析のための統計モデリング入門
このペイジの現状: いろいろまちがいがあるので修正中……

[もくじ]

第 1 日目 (11/16 月曜日)
第 2 日目 (11/17 火曜日)

まとめてダウンロード
- 資料 PDF ファイル + 例題データ: kubo2015hro.zip updated_at 2015-11-17 14:51:20
- まだ修正つづいてます: 概要は変わりませんが，細かい修正はまだまだ続きそうです (久保)

第 1 日目 (11/16 月曜日)

(01) 10:00 統計モデリング講義の概要

投影資料 kubo2015hro01.pdf

(02) 11:00 確率分布と最尤推定

投影資料 kubo2015hro02.pdf
例題ファイルなど: data.RData

(03) 13:00 R 実習 (2 時間): data.frame 操作と作図

実習資料 kubo2015r1.pdf
例題ファイルなど: data.csv

(04) 15:00 ポアソン回帰の GLM

投影資料 kubo2015hro04.pdf
例題ファイルなど:
- data3a.csv
  - うまく読めない場合は R 上で以下の命令を実行してください:

d <- read.csv("http://hosho.ees.hokudai.ac.jp/~kubo/stat/iwanamibook/fig/poisson/data3a.csv")

(05) 16:00 モデル選択と検定

投影資料 kubo2015hro05.pdf
例題ファイルなど:
- (04) と同じ
- pb.R

第 2 日目 (11/17 火曜日)

(06) 10:00 ロジスティック回帰の GLM

投影資料 kubo2015hro06.pdf
例題ファイルなど:
- data.RData (二項分布の説明)
  - あるいは data <- c(4,3,4,5,5,2,3,1,4,0,1,5,5,6,5,4,4,5,3,4)
- data4a.csv (ロジスティック回帰)
- data4b.csv (offset 項)

(07) 11:00 ロジスティック回帰の GLMM (混合モデル)

投影資料 kubo2015hro07.pdf
例題ファイルなど:
- data.csv
二項分布ではなく多項分布の場合は？……参考: カウントデータの統計モデリング入門

(08) 13:00 マルコフ連鎖モンテカルロ法を使った事後分布推定

投影資料 kubo2015hro08.pdf
例題ファイルなど:
- data.RData ((06) と同じ)
  - あるいは data <- c(4,3,4,5,5,2,3,1,4,0,1,5,5,6,5,4,4,5,3,4)
- R で install.pacakges(c("rjags", "R2WinBUGS")) が必要
- runjags.R
- JAGS の入手先 (にリンクのある page): http://mcmc-jags.sourceforge.net/

(09) 14:00 階層ベイズモデル (1) 個体差や場所差

投影資料 kubo2015hro09.pdf
例題ファイルなど:
- R で install.pacakges(c("rjags", "R2WinBUGS")) が必要
- data7a.csv
- runjags.R (注意: (08) と同じファイル名だけど別もの)
- JAGS の mcmc.list を bugs データに変換する関数: mcmc.list2bugs.R

(10) 15:00 階層ベイズモデル (2) 時系列データ解析

投影資料 kubo2015hro10.pdf

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出張統計学授業