ぎょーむ日誌 2010-03-(01-10)
2010 年 03 月 01 日 (月)
-
0700 起床．
朝飯．
コーヒー．
0820 自宅発．
晴．
昨晩はひさしぶりに積雪だった．
0830 研究室着．
-
今日は院試なので液晶プロジェクターなど準備してみる
……
うーむ，
なんでだろ．
-
先日
「ぽいっ」とした木製標本棚
(じつは農学部の備品だったそーだ……備品番号ついてなかったが)
に関して，
甲山さんと相談．
まあ，
しょうがないでしょう，
というかんぢで．
-
私の教員室は荷物が (他とくらべて)
格段に少ないのだが，
かたづけがまだまだ進捗してない．
とりあえず二脚しかない本棚をくみたててみる．
少しばかり，
本の収納．
-
メイルかき．
-
院生部屋の CANON LBP5400 が不調．
また再生トナーカートリッジ問題のような気がする．
そのあたりと連絡．
明日とりあえず来てみるとのこと．
CANON の安もの系プリンターがへぼいのかどうかわからんけど，
トナーカートリッジの質には敏感かもしれない
……
-
昼飯．
-
宮田さんと WinBUGS
相談．
「でるはずの傾向がでない」
問題のつづき
……
試行錯誤しながら調べてみると，
これはやはり
2010-01-07
と似たような問題だとわかった
……
つまり，
-
パラメーターが 0.001 周辺といった値になるとき，
WinBUGS の Gibbs sampling がうまくいかない場合がある
-
うまくいかない結果 (1): random walk M-H みたいなサンプリングをやっているのだが，
特定の値のあいだを離散的にいったりきたりするだけ
-
うまくいかない結果 (2): Gibbs sampling しているように見えるが，
本当はゼロではない値をとるはずなのに，
ゼロを中心とする事後分布からのサンプリングとなる
今回はうまくいかない結果 (2) のほうで，
解決策はいささかばかばかしいのだが
……
応答変数のスケイルを変える，
つまり応答変数のデータを 1000 倍とか 10000 倍して，
WinBUGS にあたえる．
なぜかしらこれでうまくいく．
-
このようなことが生じてしまう原因はまったく不明なのだが
……
WinBUGS 内部で「0.001」といった数値が何か精度に関する
マジックナンバーとして使われている?
うーむ
……
-
とりあえず
WinBUGS 雑
ペイジも修正．
-
1530 から 17 時すぎまで院試につきあう．
受験者は D 課程の二人だけだったのだが
……
一人は研究計画を綿密にたて，
もうひとりは「研究計画って何ですか?」
状態．
前者は具体的に説明したので
……
そういう具体的なハナシをすると，
ついつい「院試の面接」という趣旨を完全に忘れて，
コマかい植物まにあっくなハナシをするヒトたちがいるんだよね
……
なにか「まにあもーど暴走」とラベルのはられたボタンを押されたかのように．
しょうがないので，
私があたかも指導教員予定者が本来やるべき
大学院脱出戦略的な質問などをしなければならぬ仕儀に．
後者については
……
どうなることやら．
-
ぐったりしつつ放置メイル返信かきのつづき．
-
18 時すぎから研究室の追い出しコンパ．
場所はここ A 棟 8F で．
耐震工事終了後 A 棟帰還によって，
じつに半年以上ぶりに「お料理場所」
を与えられた大学院生たちがお料理おさるになってしまって，
いろいろ作ってくれた
……
-
M2 な院生たちと一時間弱ばかり話してるうちに，
酔っぱらい比率がたかまってきたので，
こっそりと撤退．
2000 研究室発．
買いもの．
2020 帰宅．
またいきなり寝てしまった
……
2 時間ほどでおきたけど．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0730):
シリアル．
ヨーグルト．
- 昼 (1200):
研究室．
こんびに握り飯．
- 晩 (1830):
研究室おいだしコンパ．
2010 年 03 月 02 日 (火)
-
0710 起床．
朝飯．
コーヒー．
0850 自宅発．
晴．
今日も真冬日，
とゆー予報．
0900 研究室着．
-
深谷君メイルに触発されて，
手もとのベイズ本あれこれを調べてみる．
-
小山さんとサロベツやちパワー解析の
階層ベイズモデルの詳細を再検討する作業のつづき．
全パラメーターのうちひとつだけ
「収束がおそい」
ものがあって，
それは
(私のなかばやけくそな formulation によって定義された)
tau[1]
なるばらつき (== 分散の逆数)
パラメーターで
……
これを全種共通にしてるんだよね．
-
そのあたりに無理があるのか，
こいつの収束がおそい
……
調べてみると，
この
tau[1]
によってばらつきをコントロールされてるパラメーターたちが，
数千ステップに一度「全パラメーターほとんどゼロ」
といった状態におちこむんだよね．
そうすると
tau[1]
は 1.0E+3 から 1.0E+4 といった範囲の値になる
(分散の逆数なので)．
で，
いったんこうなると，
またゼロ近くまでもどってくるのに時間がかかって
……
そう，
あたかも収束してないかのように見えるんだよね．
ただし必ずゼロ近辺に戻るので，収束が遅いと解釈すべきなのだろう．
-
とゆーことで抜本的な解説策としては，
今より計算時間を 10-100 倍ほど長くしてやればめでたしめでたしなのだが
……
うーむ，
私自身もあまり非力な PC に長時間計算させるのは好きではないし，
まあなんといいますか，
私の一存では冷汗の流出量を制御できない問題でもあり
……
-
しょうがないので，
tau[1]
の事前分布 (つまり超事前分布)
を
dgamma(1.0E-4, 1.0E-4)
から
dgamma(1.0E-2, 1.0E-2)
と変更してみたら，
(みかけ上)
収束が速くなった．
まあ，
この変更によって影響をこうむるのはどのあたりだろう，
と R で作図などしてココロの平和を追求してみたのだが
……
tau[1] > 1.0E-2
では「見た目」はそんなにかわらないんじゃないの，
ということで
(tau[1] は 1.0E+0 から 1.0E+1 ぐらいのケタ)，
この設定でいきますか．
-
ここまでの顛末を要約すると，
「無情報」 (non-informative)
ということになっている事前分布は，
たしかにカタチを多少ひねくっても全体的な傾向はほとんど変えないけれど
……
ただし，
収束のおそいばらつきパラメーターが
「あたかもさっさと収束している」
かのように見せかけることができたりしますよ，
とゆーことで
……
うーむ．
-
昨日の CANON LBP5400 (in A710 院生部屋)
のふちょー問題のつづき．
とりあえず，
K トナーカートリッジを交換してみたら，
と再生トナーカートリッジ屋さんが助言してくれたので，
そうしてみたらうまく動作してるように見える．
問題の K トナーカートリッジは持ち帰って調査するとのこと．
-
生態学会から何やらとどく．
[東京大会 ESJ57 の名札など]
毎年問題になる「初日の受付ぎょーむ」
その他を回避するために事前に名札・領収書などが
郵送されてきた．
これはたいへん便利なのだが
……
当日，
何割ぐらいのヒトがこれを忘れるだろうか?
私などはそういったど忘れ危険性が高いので，
ESJ57 関係あれこれをまとめてファイリングしてみる
……
[耐震つっかい棒の流用]
このように壁際に設置して
……
[机の前の本棚を増設]
さきほどの棒とファイリングキャビネット (左下)
に三段やすもの本棚をのせてみた．
先日 Homac で買った別の耐震つっかい棒で上からも
おさえる
……
ただしここは天井板がぜいじゃくなので，
震度 6 とかにはぜんぜん耐えられないだろうけど．
ともあれ，
ここ A 棟最上階は地震に敏感で，
札幌市だと 2 年に一度ぐらいある震度 3 の地震でも，
ここでは震度 4 ぐらいのゆれになるので，
そのときに被害を多少は軽減できるかな，
ぐらいの対策．
-
で，
またベイズ本しらべたり，
メイルを書いたり
……
-
A801 院生部屋のプリンター，
CANON LBP3410 もトナーぎれ．
-
そして A801 で配線工事．
-
1910 研究室発．
買いもの．
1930 帰宅．
晩飯の準備．
晩飯．
-
えーい，
なかなか仕事に復帰できない日々だ．
-
そしてまた新しい雑用が累積することになってしまった．
なんでだろうね．
根気よくぢりぢりと攻略する以外に，
方法はない．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0730):
米麦 0.6 合．
ダイコン・ニンジン・タマネギ・豚肉の味噌汁．
- 昼 (1320):
とつぜん蕎麦を食べたくなったので，
北 13 条門前の「さか田」のあられかきあげ蕎麦．
- 晩 (2030):
米麦 0.8 合．
ダイコン・ニンジン・タマネギ・豚肉の味噌汁．
コマツナ・卵の炒めもの．
ヨーグルト．
2010 年 03 月 03 日 (水)
-
0710 起床．
ねむい．
朝飯．
コーヒー．
0840 自宅発．
曇．
0850 研究室着．
-
またちょっと部屋のかたづけとか．
なかなかダンボール箱が減らない．
-
1030 より
研究室セミナー，
本日は三好君で野幌の林床の土壌化学特性とか．
野幌の中でじめじめしたところにヤチダモがはえて，
嫌気的なので (?) 有機物は分解されず窒素もたまりやすい，
といったハナシのよーで
……
-
7F 事務室でプリンター設定．
-
窓の外は大雪．
-
岩波本とか生態学会大会の自由集会準備とかとてもとても気になるのだが
……
圧迫感に敗北して，
サロベツやちパワー解析の定式化の方法を検討してみる．
-
Geeta さんが無事に北大脱出するので，
皆で写真撮影．
-
小山さんとサロベツやちぱわー時系列図の検討．
-
昼飯．
[院生カレー]
昨日の追いコンで大量に作られたカレー．
その残り．
昼飯としていただきました．
-
その後はあまりぎょーむが進捗せず
……
-
1730 研究室発．
1740 理髪店
着．
散髪．
また
二ヶ月
ほど間があいてしまったか．
1830 理髪店発．
1900 帰宅．
晩飯の準備．
晩飯．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0750):
米麦 0.6 合．
ダイコン・ニンジン・タマネギ・豚肉の味噌汁．
- 昼 (1350):
自宅からもってきた米麦 0.6 合．
院生カレー．
- 晩 (2000):
米麦 0.8 合．
ダイコン・ニンジン・タマネギ・豚肉の味噌汁．
キャベツ・卵の炒めもの．
ヨーグルト．
2010 年 03 月 04 日 (木)
-
0700 起床．
朝飯．
コーヒー．
0820 自宅発．
曇．
0830 研究室着．
-
またちょっと部屋のかたづけ．
ケイブル類はもうちょっと整理整頓してから，
A808 ものおき部屋おくりだな．
-
サロベツやちパワー階層ベイズモデルの定式化
(というかパラメーターの説明方法の最適化)
を試行錯誤してみる．
-
またプリンター設定の手伝い．
荷物はこびの手伝い．
-
最近ぼけているので
(というより，自分のぼけにより自覚的になった，とでも言うべきか)，
自宅の暖房つけっぱなしにしてたかもと不安になって帰宅．
自宅が近くなってラクだなぁ．
暖房はだいじょうぶだった．
ついでに昼飯つくって食べた．
また研究室もどる．
これで往復一時間ぐらい．
-
午前中に検討してみた定式化を
……
不本意ながら，
MS わーどファイル化してみる作業．
MS おひすはイヤだ．
しかし OpenOffice は数式おぶぢぇくとの互換性が
……
-
1.5 ペイジほど説明を書いたところでチカラつきた．
あいかーらず，
書くのがおそい．
1850 研究室発．
雪．
買いもの．
1910 帰宅．
晩飯．
-
なーんかカゼっぽい症状が
……
こりゃー MS わーどストレスによる免疫力低下か，
と思ったんだけど，
体温はかったら平熱だった．
よかった．
とりあえず，
よくウガイしてみる．
-
ここまでの原稿を Linux 版 OpenOffice.org-3.0.1 版で開いてみる試み
……
数式オブジェクトを何とかうまく変換してやろうという努力はみとめられるのだが
……
組版の box & glue model がうまくいってないのか，
こういう押しつぶされたような表示になるね．
-
[今日の運動]
-
うんどー不足でイヤになるなぁ
……
A 棟帰還後は毎日 8F までの階段のぼりおりが追加されたけど
……
-
[今日の食卓]
- 朝 (0740):
米麦 0.6 合．
ダイコン・ニンジン・タマネギ・豚肉の味噌汁．
- 昼 (1250):
帰宅してネギ卵炒飯つくって食べた．
- 晩 (2020):
米麦 0.6 合．
ダイコンの葉・豆腐・鶏肉の味噌汁．
ヨーグルト．
リンゴ．
2010 年 03 月 05 日 (金)
-
0650 起床．
朝飯．
コーヒー．
0830 自宅発．
雪．
すでに真冬日の日々は終わっているようなんだけど
……
0840 研究室着．
[雪が積もったり消えたり]
A 棟から南側をみる．
まあ，
あと一ヶ月ぐらい雪がふったりするんでしょう
……
-
そうそう，
昨日のぎょーむ日誌に書き忘れていたんだけど
……
B 棟ネットワーク室の「耐震工事期間の
server 機器退避用の仮想 A 棟」
かたづけ問題，
当方以外はみなさん早々に自分の研究室に
server 機器を回収されたそーで．
こちらの server 機器は
……
めんどくさいから，
しばらくそのまま放置してみるか．
ネットワーク室の鍵は私があずかることに．
-
生態学会自由集会の準備とか何もできてなくて，
アセりを感じているのだが
……
しかしながら，
「これをオワらせないと，
次にススめない」
感のつよい階層ベイズモデル記述節かきつづきを
……
-
とゆーことで，
また word 作業．
-
本文に収納すべきぶんはひととーり書けたかな?
とゆーあたりで昼飯．
-
志水さんと地衣類標本場所に関する相談．
とうぶんは久保部屋で．
地衣類の標本は，
そもそも同定のために保管されているわけだが，
現場にもっていってどういうできる，
といったものではないらしい．
簡単に言えば，
同定のためには実体顕微鏡などが必要とされるので．
ということでスライドグラスなどふくむ現物が必要，
電子化不可能といったハナシになるらしい．
ついでに，
サンプリングを大雪国立公園内でやったとすると，
サンプル (地衣類の張りついた岩)
は同定・あれこれ計測後にはまたもとの位置にもどす必要があるとか
……
-
まだまだ残存するひっこしぎょーむ．
7F で箱づめ状態で放置されてる
back number ぢゃーなるを
8F のよくわからん部屋にぢゃーなる輸送・配架する作業のてつだい．
すでにオンライン化されてる volume の現物まで
とっとく必要あるのかなーとか，
甲山さんの鹿児島大時代の
南太平洋研究
とかとっとく必要あるのかなぁとか
……
-
ひっこし作業のせいなのか，
どーもちかごろ腰が少しいたい
……
-
私は関与してないのだが
……
7F 実験室の実験台が搬入されつつある．
なにやら設計・実験台発注があれこれアマかったよーで，
あちこちに不具合が発生しているもよう
……
-
作文ぎょーむに復帰．
印刷出力した自分の作文をみなおしてると，
いつものことながらアタマがぐらぐらしてきて
……
-
ぐらぐらにたへつつ，
さくぶん修正
……
-
Appendix にまわすぶんも含めて，
とりあえず 5 ペイジほどのモデル説明がかけた．
もうちょっと修正が必要だろうな，
と思ったのだが
……
じつは Methods 節内の他の部分との連携も必要なので，
現状版をアップロードして小山さんに連絡メイル．
-
さーて，
遅くなったから帰ろうかな，
と
1840 研究室発．
しかし，
院生部屋をちょっとのぞいてしまったために，
投稿論文しあげ作業にやられてる院生にとっつかまってしまった
……
1920 ごろ脱出．
買いもの．
1940 帰宅．
晩飯．
-
[今日の運動]
-
うーむ
……
日によっては真冬日でなかったり，
歩道上の雪が解けたりしてるから，
北大構内走でもやってみるべきか?
凍結路面はコワいけど
……
-
[今日の食卓]
- 朝 (0730):
米麦 0.6 合．
ダイコンの葉・豆腐・鶏肉の味噌汁．
- 昼 (1220):
研究室．
自宅からもってきた米麦 0.8 合．
春雨スープ．
リンゴ．
- 晩 (2030):
米麦 0.6 合．
ニラ・シイタケの卵とじ．
ヨーグルト．
2010 年 03 月 06 日 (土)
-
0730 起床．
朝飯．
コーヒー．
洗濯．
怠業．
-
……
しかし，
あまりにもうんどう不足なので，
数ヶ月ぶりに北大構内走に出てみることに．
0925 自宅発北大構内走．
ちょっと雨．
やはりあちこちに残雪・水たまりがあって，
なかなか走りにくい．
しかも北大構内は土曜日の朝だとゆーのに，
みょーに人どーりが多い．
なんとなく受験生 + その母親という組み合わせのようにも見えるのだけど，
二次試験後期は来週の金曜日のはずだし
……
ひさしぶりの構内走なので 20 分できりあげて，
0945 帰宅．
これまたひさしぶりに体重を測定してみると
……
体重 73.6 kg．
うんどう不足ふとりだ．
-
1030 自宅発．
曇．
1050 研究室着．
-
あららまた雪か．
-
プリンター設定でちょっと苦闘してみる．
CANON はこのよーにきちんと
CAPT printer driver
を準備してくれているのだが
……
どうも USB まわりでツマるんだよね．
うーむ?
-
EPSON LP-S6000
のほうは
AVASYS のペイジ
を参考したり，
なぜか
/usr/local/bin/
にあった pstolps6000.sh
その他を
/usr/bin/
に移動したらうまく印刷出力できるようになった．
-
過去二日間放置してた，
データ解析なメイルかきあれこれ．
-
ちょっと昼飯．
-
粕谷さんの統計モデリングメモの読解．
-
途中で矢澤さんがわりこんできたので，
中断して，
熱帯林データ解析相談．
まあ，来年度 D3 のヒトにはあまりややこしー
統計モデリングを要求できませんなぁ
……
-
また粕谷さんメモよみ．
そのコメントメイルかき．
-
ちょっとひとやすみ．
[岩波本の目次]
をまたはりだしてみる．
カラー付箋紙は「追記すべきこと」メモなど．
いつになったら岩波本作業を再開できるのやら．
9 日後に始まる (ひー!)
生態学会東京大会では，
できるだけ宿とかにひきこもって執筆をススめよう，
と計画中なのだが
……
まだその東京大会の
自由集会
の準備もまったくできてませんねー
……
-
で，
その自由集会の発表者の一人である伊東さんが，
(まだ何も準備できてない私とは対照的に)
いろいろと内容のメモなど送ってくださったので，
今度はそっちの読解にとりくんでみる．
-
ひととーり理解できたような気がしたけど，
どういうコメントがいいんだろーな
……
と検討しつつ撤退．
1840 研究室発．
急に冷えこみ，
路上の水たまりは完全凍結．
買いもの．
1905 帰宅．
晩飯の準備．
晩飯．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0800):
シリアル．
- 昼 (1300):
研究室．
自宅からもってきた米麦 0.8 合．
春雨スープ．
リンゴ．
- 晩 (1940):
米麦 0.8 合．
ネギ・ショウガ・ニンニク・ひき肉の味噌炒め．
ヨーグルト．
2010 年 03 月 07 日 (日)
-
0800 起床．
朝飯．
コーヒー．
けっこう大雪．
北大構内走とかとてもではないけどムリ，
などといいつつ怠業
……
[ヘンな天気]
自宅から見た国道 5 号線と創成川．
大雪ふったり，
いきなり晴れたり
……
-
昼飯．
なかなか怠業もーどから脱出できん
……
1400 自宅発．
雪．
1410 研究室着．
-
生態学会
自由集会
の準備ができてないにもかかわらず
……
どーにも，
A804 くぼオフィスのものおき部屋状態が気になってしまって，
A 棟 7-8F の余剰ケイブル類の整理整頓といったとてつもなくめんどーそうな作業に
とりくんでしまった
……
無線 LAN 化もススんだのだから，
もーこんなに長大なる ethernet ケイブルとかいらんよな，
などと思いつつ
……
-
ケイブル類，
かなり捨てた．
そして意外とすっきり整理できた．
-
メイルかき．
昨日よんで今日もよみなおした伊東さんメモ
(自由集会
「『X の誤差』も統計モデル化」に関するもの)
のコメントかき
……
その一部抜粋:
................ 私としてはまず「ベイズ統計モデルによって，明示的に X の
誤差をくみこんだ統計モデルを容易に定義でき，しかも推定計算できる」といっ
たことではないかと思います．非ベイズ & 最尤推定のわくぐみのもとでも定
式化は不可能ではないかもしれませんが，ベイズモデルのほうがわかりやすい・
推定しやすいといった主張には説得力があると思います．
次に注目したいのは，「ベイズを使ったからといって，推定結果のバイアスが
なくなるわけではない」 (今回の例題セットでは) という点も重要だと思いま
す．私などは「ベイズモデル化すれば，X のずれがうまい方向に補正されるだ
ろう」などとばくぜんと考えていたのですが，それはぜんぜんそうではない，
ということですね．
で，解決策としては，ベイズだろうが非ベイズだろうが，測定時誤差が重要と
考えられる場合には (推定結果のバイアスをへらしたい)，とにかく複数回のサ
ンプリングをしなさい，といったハナシだろうと思います．ここでちょっと実
用的におもしろそうな問題のひとつとしては，「全サンプルのうち何割ぐらい
を『再測』すればいいんだろう?」といったことがあるかもしれません．...
そうそう，
伊東さんといえば，
さっそく
MAGRO
について
いろいろと
調査
しておられるな
……
たしかにこれは，
ぎょーむ日誌
2010-02-11
で言及してたやつですよ．
MAGRO なるむりやりな名前の由来は，
おそらく発注者たる食総研の小関さんのハナシですかね
(cf. ぎょーむ日誌 2009-03-03
のマグロ JAGS モデリング)．
MAGRO についてはまた後日調査しようということで
……
えーと，
夕方 17 時すぎから大学正門ちかくの小映画館
「蠍座」
でラーメン屋映画「たんぽぽ」
みてました．
[たんぽぽ (1985)]
上記リンク先のゐきぺであの記述のごとく，
本スジのハナシとはまったく関係ない食べものエピソードが錯綜する
……
とにかくめちゃくちゃなのか計算され尽くされたのかよくわからぬ構成なんだけど，
私はこういう脈絡のないコメディも好きなので楽しめました
(もと大田区住民としては東京モノレイルが意味もなく走るアヤしさも)．
しかも，
監督わざとやってるんだろーけど，
ハナシの展開とか演出が，
なんだみょーにマンガ的なんだよね
……
-
あとから気づいたんだけど，
このラーメン屋たてなおし映画を大学院生映画にみたてたらどうだろう
……
ラーメン屋女主人のたんぽぽを大学院生とすると，
これに対する各人得意わざをもつ教員たち，
ゴロー (接客・総合とりまとめ)・ガン (服飾など)・先生
(スープ)・運転手 (麺)・土建屋 (店の内装外装)
といった人々の協議による集団指導，
すなわちハナシに聞くところによるメリケンな大学なんかの
博士論文指導委員会制みたいな体制，
なのではないかな?
つまり，
「たんぽぽ」
はこのあたり日本ばなれしてる世界なんだよね
……
日本の大学であればたんぽぽ=ゴローの師匠・弟子な
(一見緊密だけど実態は……な)
閉じた世界になるんではないかなあ
……
-
「蠍座」ではなぜかいま「食べもの映画」
シリーズが続いていて
(食べもの映画ではない作品も上映しているが)，
来週は中谷美紀さん主演の中華料理屋もの
「しあわせのかおり」 (2009)．
生態学会の準備をさっさと終わらせて，
ぜひ見てみたい．
これは師匠・弟子という純日本ふうな体制による問題解決のよーだけど
……
おそらくハナシとしてわかりやすいだろう．
-
1930 帰宅．
晩飯．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0900):
イソップベイカリーのクロワッサンとか．
- 昼 (1230):
スパゲッティー．
- 晩 (2000):
スパゲッティー．
2010 年 03 月 08 日 (月)
-
0750 起床．
朝飯．
コーヒー．
0850 自宅発．
曇．
0900 研究室着．
-
さっさと生態学会
自由集会
の準備に着手しなければならないのだが
……
昨日の研究室内のケイブル整理整頓のつづきに着手してしまった
……
[ケイブル箱 7]
A808 ものおき部屋の地図棚
(この地図棚ってのがなんともよくわからぬ超重量物なのだが……)
の上に整理したケイブルいれた箱をのせていった．
下のようなラベルをつけて，
内容物に赤マルつけたり，
補足メモを追記したり
……
-
ついでに，
「お茶部屋本」
の整理も．
A810 院生室 (4 つある院生・PD 部屋のなかで利用可能な面積最大)
の南東側の本棚に収納することにした．
[お茶部屋本を A810 に]
「お茶部屋本」とは工事前 A 棟 8F お茶部屋に収納されてた，
生態学本・統計学本あれこれ一式のこと．
今の A 棟 8F は共有ユーティリティーなる区画はあるんだけど，
本棚をおける場所がないので，
A810 院生部屋におくことになった．
すでに「本棚は整理せずにはいられない」
性格の斉藤君によって使いやすく配架されている．
2010 年 03 月 09 日 (火)
-
0700 起床．
朝飯．
コーヒー．
ちょっと部屋のかたづけ．
0830 自宅発．
晴．
0840 研究室着．
-
いよいよせっぱつまってきた生態学会
自由集会
の準備にとりくむ
……
例題データを生成するところから着手せんといかんな．
-
10 時すぎから一時間ちょい，
カントク説明会に時間とられる．
会場がキャンパス北端なので往復 15 分ぐらい歩くし．
いつもの内容なのだが
……
えーい，
一年前
とまったく同じく，
また今年も総長訓示で受験生「ないーぶ」よばわりが．
「おつきのもの」
たちもまわりでへらへら笑ってないで，
だれか「それってないーぶではなく『なーばす』 (nervous) では?」
とでも諌言して忠臣ぶりを発揮しなさいよ．
-
研究室にもどって，
自由集会準備のつづき．
-
……
のつもりだったんだけど，
研究室の ML で「廊下に放置してるホワイトボード
+ メイル通知でセミナー室の管理をする」
といったなんともまぬけなアナウンスが流れて
……
まー，
こんなの放置放置と思ったのだが，
Google Calendar わざで切り抜ければいいぢゃん，
というアイデアがアタマの中から消去できなくなってしまったので，
研究室 web 掲示板
(研究室 web site の
Top Page
上に)
イキおいにまかせて新しく作ってしまった．
-
こういううめこみ式 Google カレンダーに
複数の「カレンダー」 (セミナー予定 + セミナーじゃない予定)
をいれる方法がわからず苦労した
……
Google の
help
では，
「Google カレンダー埋め込み支援ツール」
うんぬんと書いてあるのだけど，
それにどうアクセスすればよいのかわからなかった．
-
またど忘れしそうな自分のために正解 (のひとつ)
を記録しておくと，
設定ペイジで下記右の
Customize the color, size, and ...
をクリックすると，
見かけをカスタマイズしたり他のカレンダーを追加できたりする．
-
おそい昼飯．
-
さきほど設定した研究室 Google Calendar を院生にちょっと使ってもらったのだが
……
たしかに，
自分のカレンダーと混同しやすいね．
Lab 機能の中に背景画像の追加があったので，
研究室 top page と同じ背景にして区別しやすくしてみた．
-
自由集会準備はススまず
……
1830 研究室発．
買いもの．
1850 帰宅．
晩飯の準備．
晩飯．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0720):
シリアル．
リンゴ．
- 昼 (1430):
A 8F 共用コーナー．
米麦 0.8 合．
キャベツ・ニンジン・タマネギ・鶏肉のカレー．
- 晩 (2030):
米麦 0.8 合．
シジミの味噌汁．
麻婆豆腐．
キャベツ・ネギのゴマサラダ．
2010 年 03 月 10 日 (水)
-
0720 起床．
朝飯．
コーヒー．
ちょっと部屋のかたづけ．
0850 自宅発．
曇．
0900 研究室着．
-
昨日のつづきで，
研究室の Google Calendar を研究室雑用 wiki にはりつける作業にテをだしてしまった
……
こちら
で公開されている PukiWiki 用 plugin を使わせてもらった．
あと，
Google Calendar の (ややややこしーように思える)
共有設定が使えるようになった．
-
そして研究室 ML あれこれの運用について検討
……
いかんいかん，
研究室雑用にはまりこんでる場合ではない!
-
ということで，
ますますせっぱつまってきた生態学会
自由集会
の準備にとりくむ
……
しんどいよー
-
とうだうだしてたら，
宮田さんの生態学会大会ポスター発表について検討することに．
ひとつおもしろいことに気づいたので，
ど忘れ対策としてメモしておく．
ここでは水利用効率 (WUE) なる割算値が (概念として)
登場するのだけど，
WUE 自体はみつもられているわけではない．
ここでの WUE の定義は葉面積あたりの光合成速度 (A) わる蒸散速度となるのだけど
(このとき，何らかの意味での長期時間平均値どうしの割算
--- おそらく割算値の長期平均ではなく ---
が想定されているようなのだが，
そのあたりの詳細は明確には定義されない世界)，
これらの数量のうち前者だけが使ってよい測定値として得られている．
さてさて，
とりあえず
A の樹高依存性を知りたいわけだが，
宮田さんモデルではこれは窒素濃度に依存し，
窒素濃度は葉密度に依存し，
葉密度は樹高に依存する．
で，
このモデルなぜかしら (計算がやりやすいことに) 何もかも対数線形なので，
log(樹高増大)
の 1 単位あたりの A 増幅の中央値は
e(三つのパラメーターの積の中央値)
なんかで見つもることができる．
で，
ためしにざっと計算してみると WUE (と何か関係あるのではと言われている測定値)
の増分と同じよーなかんじなんだけど，
びみょーに足りない
……
かもしれない．
ということで，
WUE 定義の分母の減少量が気になります
……
とゆーハナシかもね，
といったあたりで．
-
昼飯．
-
上記のよーな割算値問題をぎょーむ日誌に書いてみると，
アタマが少し整理されたのだが
……
で，
よーやく気づいたのだけど，
「WUE かもしれない量」
のモデリングだけは対数線形ではなく単なる線形なので
……
といった問題にいろいろトラップされてみたり．
最終的にはぜんぶ対数線形にするのがすっきりするかも．
-
教訓としては，割算値呪われ世界において，
対数線形モデルはものごとをすっきりさせるのに役にたつ
……
場合もあるかもね，
ということで．
-
専攻科雑用に時間とられる
……
-
さーて，
ようやく自由集会の準備を
……
と思ったのだが，
宮田さん割算値迷宮は上のごとき
ナマやさしい問題ではない，
と判明してしまって，
夜まで脱出案あれこれを検討してみた．
-
そもそもの元凶は
……
まあ，
具体的に書いてしまうと，
δ13C
なる割算値，
そして上に書いた WUE なる割算値，
植物生理生態のヒトたちは何も考えずに
これらの割算値を (いっぽうを説明変数にしちゃって)
直線回帰してしまうのだが
……
そういう直線回帰すると，
ひじょーに困ることになるんだよね．
ヒトことでいえば「げた」の部分があれこれジャマしてくれて，
ですね
……
-
で，
いろいろ検討してみたんだけど，
これのためにヌケ道がないとわかった．
いやはや，
δ13C ∝
WUE
となっていれば何の問題もなかったのに，
「げた」
のせいで何もかもむちゃくちゃ
……
ぐったり．
-
1930 研究室発．
買いもの．
1950 帰宅．
ぐったり．
晩飯の準備．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0740):
米麦 0.6 合．
キャベツ・ニンジン・タマネギ・鶏肉のカレー．
- 昼 (1300):
米麦 0.8 合．
キャベツ・ニンジン・タマネギ・鶏肉のカレー．
A 8F お茶コーナー．
- 晩 (2030):
ハクサイ・ネギ・シイタケ・カキの鍋もの．
うどん．
