生態学のデータ解析 - 本/R による生態学モデリングとデータ解析

• Bolker (2008) 「R による生態学モデリングとデータ解析」を紹介します

  Benjamin M. Bolker (2008) Ecological Models and Data in R. Princeton University Press, Princeton.

  • 出版社のペイジ: http://press.princeton.edu/titles/8709.html
    • Google books: http://books.google.com/books?id=yULf2kZSfeMC
  • 著者のペイジ: http://people.biology.ufl.edu/bolker/emdbook/

内容

• R を使った生態学的なモデリング，とくに観測データの統計学的なモデル化を中心にとりあつかっている
• 本書の独自な点:
  • R を徹底的に使ったデータ解析・作図
  • 従来型の数理モデルと，現代的な統計モデルの比較
  • 尤度・最尤推定方法について具体的に詳しく説明
  • 従来型の統計学的な手法と，現代的な統計モデルの対応づけ
  • その他，いろいろ

目次

1. Introduction and Background (導入と背景)
2. Explanatory Data Analysis and Graphics (探索的なデータ解析と作図)
3. Deterministic Functions for Ecological Modeling (生態学的モデリングで使う決定論的な関数)
4. Probability and Sthochastic Ditributions for Ecological Modeling (生態学的なモデリングで使う確率分布)
5. Sthochastic Similation and Power Analysis (確率論的なシミュレイションと検出力解析)
6. Likelihood and All That (尤度あれこれ)
7. Optimization and All That (最適化法あれこれ)
8. Likelihood Examples (尤度を使った解析例)
9. Standard Statistics Revisited (標準的な統計学的手法の再検討)
10. Modeling Variance (ばらつきをモデル化する)
11. Dynamic Models (動的なモデル)
12. Afterword (あとがき)

• Appendix: Algebra and Calculus Basics (付録: 代数と微積分の基礎)