ぎょーむ日誌 2006-08-(11-20)

2006 年 08 月 11 日 (金)

• 0650 起床． 朝飯． コーヒー． 0835 自宅発． 晴． 今日も真夏日にならぬ， という予報． 0850 研究室着．
• 航空機テロ未遂 か …… いま知っている研究者たち何人かが海外に短期出張してるんだけど， 帰国とかたいへんそうだな．
• くだんの DNS 設定， まだ引けない． whois でみると一見ただしく設定されているようにも見えるが． 登録時刻は Last Updated On:10-Aug-2006 04:07:03 UTC． 昨日の 1307． こっちに何かまちがいあったのか， と自分がやった設定をみなおす． 特に問題あるようには見えない． なんか先方がしくじってるんじゃないかな …… 本日夕方までは待ってやるか．
• 林冠モデルの作文のつづき … のはずが， 昨日まで書いた部分をひたすら修正することになってしまった． 自分で読んでてもくらくらする． (人間のアタマの中ではぱられるっぽい) 三次元世界の操作あれこれが 文章という一次元の世界に無理やり射影というか直列化されてて， ですね．
• 人間には想像困難な多次元 (少なくとも 1000 次元よりは多い次元) の世界をさまよっているからだろうか， MCMC 計算の説明作文ほうはかえってくらくら感が少ない． しかし， 削ったり書き足すべきことが多々あるのはまちがいない．
• SGP なんちゃらシンポと (その流れで?) 苫小牧遠足でここ数日みかけなかった 甲山さんがふらふらとやってきて， 苫小牧で見物した院生たちのサンプリングの様子などを． やはり 苫小牧 での 高所作業車 レンタルしてのサンプリングはなかなかたいへんみたいで， ブーム 20m ぐらい伸ばすため アウトリガー四脚ふんばって足場をカタめるわけだが， せまい林道でこれをやるのがまず困難である， とのこと． さらに樹木個体頂部にアクセスするべく樹冠「内部」に突入することになるので， この刈りはらい作業もなかなか …… 思ってたよりかなり破壊的なサンプリングだな． いずれにせよ， またしても苫小牧の技官さん・補佐員さんたちに すごーくお世話になってるよーで …… そしてそうやって得られた観測データには 「ちゃんと解析しなくては」 という心理的圧力がかかってくるのである．
• 作文ひととーり修正できた． が， 時刻はすでに 1330 か． やれやれ． ひとやすみ． そしてくだんの腐れ疑惑の DNS 設定は (設定後 24 時間が経過したにもかかわらず) 依然としてネット上に反映されとらん．
• 今まで左の図みたいなやつを ``flat leaf'' とか呼んでたんだけど， ひょっとしたら ``horizontal leaf'' のほうが正しいのかも， と不安になってきた． しかし LAI-2000 なる語といっしょに Google scholar で検索すると …… うーむ， horizontal leaves でも flat leaves でもどちらでもいいような気がしてきた．

• いや待てよ， ``non-flat leaves'' は 針葉 とかに対して使われてるコトバなのか? うーむ， やはり horizontal のほうが無難な気がしてきた．
• とうだうだしてたら， 林冠モデル共同研究者の小林さんから Agricultural and Forest Meteorology まわりなんかの LAI 文献を教えていただく． あるいは昔の日本語文献とか …… 昔の日林誌とか Plant and Cell Physiology なんかは CiNii 経由とかでかなりダウンロードできるようになってるんだなあ． 荒木 (父) さん (1971) とか Kira, Shinozaki and Hozumi (1969) とか．
• 返信メイルとか書いてるうちに急速にばててきたので， ネット雑用なんかも放置したまま撤退． 1940 研究室発． 2005 帰宅． 体重 74.2kg． 晩飯．
• [今日の運動]
  • 腹筋運動 30 × 3 回． 腕立ふせ 5 × 3 回．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0730): クロワッサン．
  • 昼 : 食ってない
  • 晩 (2140): 米麦 1.0 合． ホウレンソウ・ブナシメジの卵とじ．

2006 年 08 月 12 日 (土)

• 0720 起床． 朝飯． コーヒー． 洗濯． 怠業．
• 昼飯． また怠業．
• しばらく前に当家のトイレの便座が壊れたんで (何というべきか「アーム」が折れた)， 修理せねばと思ったんだけど， どうも部品ごと交換したほうがよさそう． で， 便利なものでそういう部品もネット上で簡単に買えるようになっている． 本日それが届いた． TOTO　前割便座/ふたなしタイプ (レギュラーサイズ) 2425 円 + 送料 650 円．

[部品購入]

これに便器固定用のネジ一式がつく． 撮影用に自宅用イスの上にのせているだけで， ここで使用するために買ったわけではない． 為念．

• 独占企業 TOTO のおかげで部品の互換性とか気にしなくてよい …… なになに， Wikipedia によると TOTO はシェア 60% で独占してるわけではなく， 業界二位の INAX とあわせると 90% こえる寡占状態， のよーで．
• そして考えてみれば独占企業が部品互換性とか保証するわけでもなんでもなく， マイクロソフトおひすのファイルが version 間であれこれとめんどうを惹起している現状など反例はいくらでもあるだろう．
• 1530 自宅発． 晴． 1545 研究室着． メイルかきとか．
• 例の生態学会関連の雑用 DNS 設定問題， 50 時間経過したのにあいかわらずひけない． ということで貸さーばー屋のアライブネットに 「何か設定に問題なかったか確認していただけないでしょうか (意訳: なにかとてつもなくマヌケな設定ミスやったんじゃねーの?)」 メイルをだす．

  ; QUESTION SECTION:
  ;e-eafes.org.                   IN      A
  ;; AUTHORITY SECTION:
  org.                    8059    IN      SOA tld1.ultradns.net. domadmin.ultradns.net. ...
  

• 母子里林冠モデルの説明作文つづく． 天球光分布など …… モデルに関してはひととーりかけたかな． これだけで 2600 words ちょい．
• なーんか， スリランカ で 政府軍と反政府軍の衝突 とか 北部から東部で戦闘 とか報道されてるけど， だいじょうぶなのかね …… Smithsonian Institute CTFS がスリランカで開催している一ヶ月間の International Field Biology Course とやらにここの研究室の M1 一人が参加してんだよね． 場所は Sinharaja か (世界遺産) …… まあ， かなり南部ではあるな (これって Arther C. Clark が住んでるあたりか?)．
• 2205 研究室発． 2220 帰宅． 体重 74.2kg． 晩飯．
• [今日の運動]
  • うんどう休養日
• [今日の食卓]
  • 朝 (0800): クロワッサン．
  • 昼 (1340): うどん．
  • 晩 (2250): 米麦 0.8 合． ニラ・ブナシメジ・豆腐の卵とじ．

2006 年 08 月 13 日 (日)

• 0840 起床． 朝飯． コーヒー．
• 昨日とどいた交換用便座をとりかえるついでに， トイレ・浴室掃除． ここだけの秘密であるが， すご―――くひさしぶりである．
• それでも， まあたいていはざっと洗えば問題ないわけだが …… やっかいなのは便器内壁にびっしりとはりつき 「結晶化」 してるかのようにみえる汚れだ． ブラシなどでは何の効果もなく， 割り箸 (あとで再利用などしてません，為念) で側方から加圧すると「剥離」する． 私はこいつに見おぼえがある …… たぶん炭酸カルシウム …… あとで検索してみたら， 炭酸カルシウムより リン酸カルシウム のほうが主成分， とのこと．
• なんで化学にヨワい私が「炭酸カルシウムだ」と見当がついたかといえば， じつは北大の「飲料水」は地下水でカルシウムが多分に含まれていて， それがためにお茶部屋のヤカン内壁なんかには 炭酸カルシウム白くびっしりと成層しているのを毎日のように観察しているからである …… ということで， 「北大の水」は飲まないというヒトも少なからずいる． まあ， たしかに …… 私は気にせず飲んでて特に問題ないけど， 腎臓結石できやすいヒトだったら飲まないほうがよいだろう．
• というか， 北大の水のんでたらカルシウム rich な尿になって， それが自宅のトイレの便器の内壁に …… というハナシだったらイヤだな． ぢつにイヤなかんぢだ．
• さて便器カルシウム壁除去問題だが …… 物理的にはがすか化学的に溶かすか， だな． トイレ掃除用の酸 (サンポールとか?) もってないので， まずは物理的な方法を試みることにする． 割り箸とかではまるでチカラ不足でステンレス小パイプ (取り外した破損便座の軸棒) ぐらいの強度がないと通用しない． かなりの労力必要． しかも便器内側にキズがつくので， あまりよろしくないかんぢだ (おそらく次の結晶形成の起点になってしまうだろうから)． キズを平滑化するクレンザー (研磨剤) とか持ってないし …… ええ， ええ私でも歯みがきペイストなら持ってますけど， こういうのって近ごろは「研磨剤少なめ」がウリなんじゃないですかね．
• これまたあとでネット上の 掃除サイト とか見ると …… なるほど， 耐水サンドペイパー 1000 番で削りとって， あとから 1500 番でなめらかにしあげる， と． これはうまい手口だな． まあ， しあげ工程は粉末クレンザーでもいいんだろうけど．
• ということで， ややハンパながら作業終了． 昼飯．
• 1400 自宅発． 晴． 北 9 の Homac でいろいろと買いもの． 1540 研究室着．
• Homac で「つい」買ってしまった LOAS USB マルチカード reader/writer (CRW-11M21) に苦闘する． これは CF, SD, Smart Media, Memory stick その他あれこれが 認識できます， というシロモノなんだが例によって例のごとく Linux という異端 OS 上では苦闘させられるのである．
• ネット上でいろいろ調べてわかった． 解決策 1: CONFIG_SCSI_MULTI_LUN = y としてカーネル (OS 中核部，私が使っているのは 2.4.31) を作りなおせばよい． @IT にも解説ある． 実際， 私もやってしまった． カーネル本体だけでなくカーネルモジュールも作りなおす必要がある． たしかに認識はする．
• しかし解決策 1 はあまりおススめではない (が後述するように必要条件である可能性がある)． カーネル再構築なんかやらなくたって 同じように動作させることができるからだ …… と書いてからよく考えてみると， どうもこれは自信がない． というのも， カーネル本体は CONFIG_SCSI_MULTI_LUN が設定されてなくてもよいが， kernel module である scsi_mod は CONFIG_SCSI_MULTI_LUN = y 条件のもとでコンパイルされたやつじゃないとダメ? よくわからない．
• 解決策 2: /etc/modules.conf に options scsi_mod max_scsi_luns=2 などと設定する．
• 前後の流れとはまったく無関係ながら， 現在の自分の /etc/modules.conf の重要な部分をメモしとく (backup):

  alias parport_lowlevel parport_pc
  alias scsi_hostadapter usb-storage
  alias eth0 e100
  #alias ath0 ath_pci
  options scsi_mod max_scsi_luns=2
  

• ここで options scsi_mod max_scsi_luns=8 とか設定しけば CONFIG_SCSI_MULTI_LUN が設定されてないカーネルであっても， scsi_mod が (ニセ) SCSI ポートを順番にまわって点検してくれる (かどうかよくわからない; 上記 scsi_mod コンパイルに関する注意も参照)．
• options scsi_mod max_scsi_luns=2 はどういうカーネルであっても設定したほうがよいのかもしれぬ． というのも 「scsi_mod による巡回点検」 にえらく時間かかるからだ． 私が買ったリーダーの場合だと /dev/sd[a-d] の 4 個のポートが認識される． これに SD カードだけ入れて USB ソケットを接続すると …… どのポートが使われてる/使われてないをチェックしていくのだけど， 「使われてない」とタイムアウトするのにえらく時間がかかる．
• ということで， このカードリーダの場合，
  • /dev/sda: CF カード
  • /dev/sdb1: SD カード
  が割り付けられてしまってこれは動かせない． もし SD カードだけさしこんだリーダーをさしこんで， mount させてみると， まず /dev/sda の CF カードの有無をのんびりと点検するので …… なんとマウントするのに 168 秒もかかる．
• この悪しき事態を回避する策は …… そう， 下の写真のごとく， 必要もないのに CF カードもさしこんで認識させればよい． この場合だと mount に必要な時間はわずか 0.6 秒であった．

[カードリーダ]

左が CF カード (ここしばらくぜんぜん使ってない)， そして右の青いのがでぢかめ用 SD カード． 捕捉しとくと options scsi_mod max_scsi_luns=2 と 2 と限定してるのは scsi_mod が /dev/sdc だの /dev/sdd だのを点検しはじめると， これまた mount するのに時間がかかるからである．

• かくして， 私はネット上の利他的な Linux 情報提供者たちの助力をえて， 「Linux のことなんか何も考えてない USB 周辺機器」 のひとつがまた Linux の軍門にくだりわれわれは勝利をおさめた!
• …… と言いたいところだが， ぬぐいがたい敗北感がある． でぢかめ SD メモリカードを認識させるだけのために， わざわざ必要もない CF カードをリーダにさしこまねばならぬ， といった不合理きわまりない行動を取らねばならぬところに 追い込まれてしまったのは， なんとも絶望的にマヌケな気がする． これはひょっとすると， 戦闘には勝利したけれど戦争には負けている状況ではあるまいか?
• まあ， しばらくは「意味なし」 CF カードさしっぱなしで使ってみるけど …… そのうちイヤになって大学院生とかに放出するかもしれぬ． そもそも SD 専用 USB リーダーが買えば， ここまで苦闘することもなかったわけだよな． いやはや． 脱力
• ということで， 本日は仕事ススまず． 2040 研究室発． 2100 帰宅． 体重 74.8kg． なンか重いんですけど …… 晩飯．
• [今日の運動]
  • そして本日もうんどう休養日
• [今日の食卓]
  • 朝 (0830): 米麦 0.6 合． ニラ・ブナシメジ・豆腐の卵とじ．
  • 昼 (1210): 明太子スパゲッティー．
  • 晩 (2250): 米麦 0.8 合． ダイコン・コンニャク・ワカメ・サケの味噌汁．

2006 年 08 月 14 日 (月)

• 0720 起床． 朝飯． コーヒー． 0850 自宅発． 晴． 予報では本日もまた真夏日になってしまうとか． 願わくば， 今年最後の真夏日であってほしい． 0905 研究室着．
• 生態学会がらみの例の腐れ DNS 設定疑惑， まだまだ続く． そしてアライブネットは土日とかは客からの質問を放置する習慣のよーで …… れんたるさーばーで商売とかやってる客とかだったら， いったいどうなっていることやら．
• メイルかき． べいづとかあれこれ新しい手法のハナシを聞くことが多いんですけど， 統計学ってどこまで勉強すればいいんでしょうか， とやや不安を感じておられる大学院生にさしあげたもの． さてさて， どこまでアタってることやら．

じつは「幹」というか，そういう部分は (単純→複雑の順に)
1. 線形モデル
2. 一般化線形モデルと最尤推定法
3. (一般化線形) 混合モデルと random effects
4. Bayes モデルと Gibbs 分布
で終わりです (4. がじつにいろいろなタイプのモデルを内包しているから)．
実際には「幹」というより (4. (3. (2. (1.)))) というような含有関係です
が，まあともかく統計学の考えかたの中軸を単純→複雑な順にならべると上の 
1.-4. でおわっています．
この「幹」からいろいろな「枝」が出てますが基本の応用にすぎません．
やっかいなのはこの中軸から完全に逸脱している統計学的手法 (と考えられて
いるもの) がいくつかあります．たとえば (いわゆるところの) 多変量解析な
どです．これは確率・統計とどういう関係があるのかいまいち判然とせず，極
端にいえば「単なる図を描くためだけの技法」なのかもしれません．
なんでもかんでも 1. の世界で完結させようとしていた時代には，(その制約
ゆえに) 難解なる計算技法があみだされていて (しかも統計モデルという考え
かたが背後に隠されてしまったので)，統計学はわかりにくいものになりまし
た．それに比べれば現代の統計学は，いろいろな応用わざを首尾一貫してつく
り出せる中軸がはっきりしたので，ずいぶんとわかりやすくなっています．
つまり勉強の要点は，いろいろな方法を関連づける全体の見取図をはっきりさ
せる，中軸にあたる基本わざから修得していく，ということになります．

• 来週 (…… 来週か!) の東京出張の要旨を書いてみる． 本日しめきり． まあ， そんなに急いで提出しなくてもいいか， 林冠モデルペイジに アップロード してしばらく放置してみる． というのも， シンポジウム仕切り人の黒田さんは現在アフリカ大陸南端にいるので．
• どうも私は出張が必ずしも好きではないらしく， 9 月上旬の 統計関連学会連合大会 (仙台) に行ってみようという気力がかなり減衰してしまっている． 今回も発表しないし， 聞いてみたいと思える講演も今回は多くはないし ……
• めでたく天気予報はハズれつつ …… というか本日の最高気温に関して下方修正しつつあるようで， 30°C は突破しない可能性が． 「真夏日」なる便宜的かてごりーが これほどまでに人間心理に影響を与えるとは．
• アライブネットより返信． ほほー， こっちの設定に問題ある， と …… で， もういっぺんいろいろ調査してみたんだけど， やはりこちらの設定がしくじってるとは思えぬ． というのも， 良くも悪くもあの忌まわしき Turbo Linux Appliance Server (TLAS) の支配下ではそんなに変わった設定など， やりたくてもできないようになっているわけで．
• カラーレイザープリンター CANON LBP-2810 の交換用定着器がとどく． 税込み 43492 円 …… プリンターは際限なくカネを食いつぶす． でかいハコに入ってるな， と思ったら二重構造になってた． はい， 定着器はワレものですからね …… とつい先日 「割って」しまった私は 反省をあらたにするのであった． 交換． 定着器のカウンターをリセット． えーと， 古いほうは着払のペリカン便でキヤノンエコロジーインダストリーとやらに送れ， と荷札が入っている．

• ついでにネットワークファームウェア (NB-E2) もアップデイト．
• 生態学会さーばー雑用． ***.e-eafes.org を使えるようにせよ， ってことでじたばたしてるわけだが …… アライブネットから返信あり (なぜか担当者が変わり)， ほーらやっぱり

  .ORGの場合、レジストリのポリシーとして、NSを複数用意しないと
  INACTIVEになり、rootから名前解決が出来ないようです。
  弊社の方でも把握しておらず、大変申し訳ありませんでした。
  つきましては、久保様の方で新たにネームサーバーを用意していただくか、
  弊社のネームサーバーをご利用いただく形になるかと思います。
  

  とのこと． しかしながら， ナンともややこしいことが要求されていますなぁ …… で， その後いろいろとやりとりなどがあって， 最終的にはアライブネットの name server 二台 で ***.e-eafes.org のたぐいのホスト名を正引きすることになった． 設定変更は本日の 1521 (日本時刻で)． まあ， 明日ぐらいまでには世界中にひろまるだろう． 生態学会さーばー機も依然として 「聞かれたら返答する」 DNS server として機能してるが， 誰からも引かれないのでそのまま放置すればよい， ということ．
• うっかりど忘れする前にアフリカ南端に要旨を送信．
• いつまでも雑用ばかりにかまけているわけにはいかんので， 林冠モデル原稿の作文のつづき． 先週のぢたばたでひととーりモデルまわりは書けたので， とりあえず計算結果とかその周辺を．
• 生態学会さーばー雑用， 無事に終了． 正しく DNS が設定されていれば *.org な名前はすぐに引けるようになる． 総合地球環境学研の関野さんがさっそく http://www.e-eafes.org/ サイトをスタートさせている．
• 林冠モデル …… 結果のテイブルはこれひとつか? まあ， 図とかいろいろあるけど． と書いて， そういうや結果のテイブルはこれだけになりそうだけど， パラメーター表を作らんといかんかった， といまさらながら思いだした． 葉群の光透過とか非同化部の光遮蔽とか林冠内の光散乱とか …… 今回はこういったパラメーターどもを「決め打ち」にしている． 本来なら， こいつらもベイズ推定すべきなんだろうが．

• 亀山さん・平尾君は東北の 鳴子温泉 とやらに湯治に行ってしまった． いいねえ …… 東京出張とかと比べると．
• 本日は院生密度がやや高い， か? お茶部屋かたすみにおいやられて傍聴していた会話の断片．
  「暑い」
  「本州より涼しくても暑いと思ったら暑い」
  「私，最近は一日一食です」
  「こっちの部屋は西日あたって暑い，家のほうが涼しい」
  「昔は包装されてなかったから……本屋でマンガの立ち読みができてよかった」
  「レンタル DVD 屋とかで他の院生と会いそうで会わない」
  「行動圏がびみょーに重なってないのよ」
  「調査中は山の上で高校野球の実況中継きいてた」
  「あしたの駒笘の試合は TV でちゃんとみなくちゃ!」
• 林冠モデルの本文かきのほうはススまず． 1950 研究室発． 2005 帰宅． 晩飯．
• トイレそうじ続報． この目的のための市販けみかる溶液にはアルカリ系と酸系がある． 前者はいろいろな会社から多種多様なものがでているが， 後者については サンポール がかなり独占的にみえる． で， この塩酸を主成分とする液体はなかなか兇悪で …… 内壁面で結晶化していた リン酸カルシウム・炭酸カルシウムのたぐいは 何もかもきれいさっぱり問答無用にて溶解・消失してしまった． 加減がわからなかったので， 今回は原液ボトル一本 500ml まるごと投入の 12 時間以上放置， という過剰殺戮ぎみな処理だったんだけど．
• [今日の運動]
  • 腹筋運動 30 × 3 回． 腕立ふせ 5 × 3 回．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0800): 米麦 0.6 合． ダイコン・コンニャク・ワカメ・サケの味噌汁．
  • 昼 : 食ってない
  • 晩 (2250): 米麦 0.8 合． ダイコン・コンニャク・ワカメ・サケの味噌汁．

2006 年 08 月 15 日 (火)

• 0730 起床． 朝飯． コーヒー． 0900 自宅発． 曇天ぎみ． いいねえ． 0915 研究室着．
• 林冠モデル説明作文のつづき． Table の追加， 図の説明書きなど．
• お茶部屋で苫小牧ボス・鍋嶋さんから直径成長と気象データの関連づけについて いろいろと御下問を． 口頭試問うける受験生のごとく， ヒヤ汗をながしつつ回答を試みる．
• 作文つづき． モデルまわりの説明かきからなかなか脱出できない．
• 露崎さんがアラスカからもどってきた．
• 作文にちょっと一区切りついたので， 昨日の「プリンター廃定着器りさいくる問題」にとりくむ． これは着払ペリカン便にてキヤノン傘下の会社に送るべし …… という指示である． ゐきぺぢあ によれば日通は企業間物流にかまけてたので， ペリカン便をあつかってくれるこんびにはほとんどない． 院生に言わせれば 「そんなの取りにきてもらえばいいぢゃないですか」 ということになるのだが， ここの所在を電話とかで日通に説明すんのも面倒だ．
• ところで本日登校途中に自宅と大学の中間にある運送屋が ペリカン便あつかってることに気づいた． ということで， 廃定着器のハコをかかえてそこまで出むくことに． 1630 研究室発． 5 分ちょいで同運送屋着． お盆ということでまったく閑散としており， しかも残留してるヒトたちもペリカン便のあつかいがわからず， あちこちに問い合わせたり． なんとか送りだして研究室にもどる．
• 昼飯くってなくても午後のほとんどの時間は問題ないわけだが …… ある時刻をさかいに急速に疲れてしまうらしい， ということがわかってきた． その時刻に晩飯を食うべきなんだろうか? 1930 研究室発． 1945 帰宅． 体重 74.4kg．
• [今日の運動]
  • うんどう休養日 …… これまた夕刻以降の血糖値急速低下らしきものの影響， と言いますか
• [今日の食卓]
  • 朝 (0750): 米麦 0.6 合． ダイコン・コンニャク・ワカメ・サケの味噌汁．
  • 昼 : 食ってない
  • 晩 (2140): 米麦 0.8 合． レトルトパウチドカレー．

2006 年 08 月 16 日 (水)

• 0740 起床． 朝飯． コーヒー． 0900 自宅発． 曇． 今日から曇天・雨天がつづくはず， なんだが． 0915 研究室着．
• 林冠モデル作文のつづき． モデルの説明はよーやくひとくぎりついたか? …… つまりここらへんの院生なら「すかっ」と読みとばしてくれる 「データ解析の方法」 section に 3000 語ちかく使ったわけか． まあ， これがこの論文の主題なんでこの長さで問題ないんだけど．
• さて結果とかについて書くか． えーと， 加藤京子さんに計算していただいた値とかは このへん にまとめておいたか． まずはちょっと再計算を試みる．
• 来年 10 月に開催したい光合成関連研究の会議の申請うんぬん， というご案内いただく． 来年 10 月， か …… 私などはかなり門外漢というべきであろうが， まあ， そのころまでにはもう一度ぐらい光計算がらみのこととか やりなおしたいので， まきこまれてみることに． どうなることやら．
• なんだかノドがやられぎみだ． 危ない． とりあえずうがい．
• 加藤さんのリターデータについて再計算してみる． ゑくせる上で平均値の割算値の …… と呪われ度が高そうな計算をしていることが解読できた． しかしこの場合はこれで問題なしと確認できた (分母・分子のリタートラップ数がキャンセルしたりして)． 林分内推定総枚数はびみょーに異なる たぶんゑくせるというソフトウェアにとって 四則計算は困難すぎる演算であるからだろう． しかし最終的な LAI 推定値にはほとんど影響しない， とわかった．
• ということで， まずはそのあたりの説明作文．
• その他の結果も， と …… あらら， results section が 3 ぱらぐらふでオワってしまった． うーむ， しんぷるだ．
• ぢゃ， discussion は， と． 現時点で思いつくのは，
  1. Gibbs 林冠モデルで (他の観測方法と比較して) 適切と思われる LAI が推定された
  2. LAI と林分生産力の関係は線形ではない
  3. 今後の発展: よりベイズ推定をおしすすめたものにする …… この部分は意外と重要かも
  ぐらいか． とりあえず最初のふたつを書く．
• ネット雑用． セミナー案内 …… しかも要旨が図・数式いりの腐れ MS わーどファイルで， 数式オブジェクトが OpenOffice.org ですら解毒できない (これは PDF 化してもいまいちおかしいので， なにかヘンな MS 規格を使っているのだろう)． しょうがないので院生部屋のゐんどーづ機 & MS-Word2003 & Adobe Distiller を使って解毒． PDF ファイルアップロード， trendy-ml に案内をだす．
• MS おひすの毒にノドをやられてしまったので， またうがい． 今回はイソジン使用．
• 林冠モデル， discussion を書いてるうちに， あまり重要なものを含んでいないんだけど， 葉群の法線ヴェクトルの天頂角の分布も示しておいたほうがやりやすい， と気づいたのでそういう作図プログラムをかく．

[葉群の天頂角分布]

事前分布 (一様分布) からあまりずれてない． 「たってる」 (敵国語訳として nearly upright としてみた) 葉は reject される確率やや高くなるけど． うーむ， これは事前分布が不適切， もしくはこの観測データには角度分布情報が含まれてない， と考えるべきか．

• この結果はあまり面白くないものだけど， まあ妥当な気もするし， かつ結果に含めるべきだな． MCMC 計算やったからといって何もかも推定できるわけではない． 当然ながら．
• 1920 研究室発． 買いもの． 1940 帰宅． ノドはいよいよ悪化感あり， またうがい． 晩飯．
• ノドあめ， なかなかよろしい．
• 粕谷さんが 助教 問題についていろいろとまとめておられる． 私などはまさに来年度から任期つき助教になる当事者なのだが (そのあたりの はっきりしない説明 を 4 月にうけた)， まあ何といいますか雇傭されかたとしては悪くなるんだろうな， というのはわかるんだけど， じゃあそれについて真剣に考えようという気にはなっていない．
• ひとつに 傭われ者としての私にくっつく権利・義務に関する書類をもらったことがなく， 「これは契約違反だ」 とか法的道義的に問題あるという認識がもてないせいなのかもしれない． 辞令なるものはあるんだけど， これはごくあいまいに「こんなふうにやれば?」 と書かれているばかりである．
• つまり現在の傭われ状態に関しておそらくあいまいなままであり (たぶんどこにも「終身雇用」みたいなことをかいた紙きれは存在しない)， そのあたり気楽に放置して平気なる 私は自分の商売にある種のいかがわしいものが含まれていると考えており， それゆえに経緯あいまいなまま「来年度から任期つき」と言われても， 「どうせ (内閣総理大臣からここの研究院長に至る) 傭うがわは例によって何も考えてないんだろうし， こっちはやくざな商売だし， しょうがないか」 ぐらいのひどく無責任な感想しかもちえていない， と． 何かを批判してやる価値もない．
• もちろん来年度から「任期つき助教」にされてしまうヒトたちが 誰しもこう考えているわけではない．
• しかしながら私はこういったことに関して， 自分のことであれ他人のことであれ 「ことさらに無責任な方向で」 考えがちで …… たとえば雇傭条件わるくなり， 大学が若い研究者たちにとって魅力的な職場でなくなり， その帰結として大学がますます衰退するとしても， まあ「勝手に自滅しろ」というか． 大学とかには自治なるものが存在するのであれば 自滅する権利もあるんでしょうね， と投げだすばかりだ． つまり， どうなろうとも自分にも他人にもさしつかえなかろう， と．
• ふーむ …… 人間によって構成されるいかなる集団にも 何か意味らしきものを見いだせないかのようでもあるし， その一方で 人類社会に内在する冗長性にかなり信頼をおいてるかのようにも見える．
• 粕谷さんはそのあたりいろいろと憂慮されてるようなので， このあたりは粕谷さんサイトで質問してみましょうかね．
• [今日の運動]
  • quasi 夏風邪のため， と称してまたうんどう怠業日
• [今日の食卓]
  • 朝 (0830): クロワッサン．
  • 昼 : 食ってない
  • 晩 (2200): 米麦 0.8 合． ショウガ・ニラいり麻婆豆腐． 病人食ふう．

2006 年 08 月 17 日 (木)

• 0750 起床． 朝飯． コーヒー． ノド問題は解決しつつあるように思える． 0920 自宅発． 本日からひさしぶりに雨ふるはず …… という数日前の天気予報ハズれて晴． で， そのあてにならぬ天気予報によれば， また真夏日になるよーで． たしかに暑い． 0935 研究室着．
• スリランカ の争乱はぜんぜんおさまらないね． 北端のジャフナ半島と北東部のトリンコマリーが主戦場， とのこと (地図)． 島の南西部のコロンボ市内の爆弾テロはいまは一段落ついてるのかな．
• また林冠モデル作文のつづき． 昨日追加した結果， 葉群の角度分布うんぬん， といったあたり．
• 先に revision をだしたアカマツ原稿の editing 請求． 41000 円． 思えば不思議なコストだ …… とひっかかていてもしょうがないので， 手紙を書いて九大事務に転送する． そちらで管理してもらってる科研費から支払ってもらうので．
• ところでそのアカマツ原稿の現状は， といえば …… すでに二週間ちかくが経過したのに status: with editor ですか． あいかわらず 「時間をかければかけるほど良い」 なる反主流派ぽりしーを貫徹してやがるな．
• 午前中にすでに気温は 30°C 突破．
• 林冠モデル， 角度うんぬんについて作文してるうちに気になったので， 下のような図を描いてみる． やはり「高さ」によって葉群の角度分布がびみょーに異なる． しかしこのあたりは biological な意味があると考えるより， むしろ推定における偏りみたいなもの， という気がする …… そうか， このあたりを補正するべいづ推定を組みこめば， むしろ収束が速くなるかも!

• ふーむ …… 上の図みてるうちに， 高度別角度分布の図とか作らなくてもいいとは思うんだけど (あってもあまり意味がないから)， 葉群垂直分布 (左上) は追加するべきだね． これまた 「推定があまりうまくいってない」 側面を示すものとして．
• ということで論文用の図を描くべく， R の作図プログラムを改訂．

[タテ histgram]

これは hist() だけでは描けないので， hz <- hist(データ, ..., plot = FALSE) で結果を格納し， hz$breaks だの hz$counts を sapply() などで取りだしつつ rect() でハコを描く．
にしても地面ふきんに葉が多いのは， 観測データと推定モデルの両方が「いまいち」であるから， というもの． このあたり解決したければ， かなり Bayesian 化をおしススめる必要がある．

• 他にも図を作り直したり， 文章をそれにあわせて書き直したり． R で postscript() で出力するときに， どうもフォント問題か何かで問題が生じる場合がある …… といっても dvips 出力とかふつーのヒトには関係ない状況におけるものだが． R --vanilla < 作図プログラム で出力させれば何も問題ナシ．
• お茶部屋でちょっと一休み． 知床調査隊が本日もどってきて， その放出行動食であるリッツクラッカーなどかじり， お茶をのむ． 高校野球ふぁんの大学院生への追従 (お茶部屋における私の社会的地位は最底辺に近いので)．
  「本日も応援の甲斐あって，駒笘は逆転勝ちしちゃいましたね」
  「です」 (当然です，の意)
• 夕刻． だんだん曇ってきた． 気温低下中． よしよし．
• results 節も discussion 節もぢりぢりと肥大化中． 私はみょーなクセがあり， いちばん最後のパラグラフは 何か「まとめ」じみたことを書かないと落ちつかない (体裁としてはそんなことはする必要ないんだが)． まとめみたいなもの， ということで抽象的になるんだけど， その作文がなかなかできない …… しかしながら， 他の部分， 文献とか読まずに書ける discussion はほぼでそろってきた．
• 1855 研究室発． 1910 帰宅． 2035 自宅発北大構内走． 走ってる途中からぱらぱらと雨ふりはじめる． 2115 帰宅． 体重 74.2kg． 帰宅してしばらくすると本格的に降ってきた． 慈雨． 晩飯．
• 語学堪能なる院生から， 昨日の quasi 夏風邪なる表現はなかなかよろしい， とのご講評をいただく． なンと学部生のときにラテン語の授業まで ……
• [今日の運動]
  • 北大構内走 40 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0820): クロワッサン．
  • 昼 : 食ってない
  • 晩 (2200): 米麦 0.8 合． 昨日の麻婆豆腐ののこり． ネギ・卵の炒めもの．

2006 年 08 月 18 日 (金)

• 0730 起床． 0750 自宅発． 曇． 0805 研究室着． 朝飯． コーヒー．
• A802 院生室で亀山さんからツガザクラ話など拝聴しつつ， CANON LBP-2810 紙づまりに苦闘する院生と修復の試行錯誤を． うーむ， このプリンター， 静電搬送系に問題があるのか， かなり紙の状態に気をつけてやる必要があるな． 室内にむきだしで放置されてた紙はだめだ．
• あいかわらずアフリカ南端におられる黒田さんが 「生物資源の数理モデリング」 の要旨集まとめられ， PDF ファイルで送っていただいた (近日中に一般公開される)． 午前は保全よりなハナシで， 午後はべいぢあんなハナシが多い． 私のはともかく， 他の人のハナシはいろいろと勉強になりそう．
• はあ， 準備せんといかんなあ …… いやいや， 旅費をだしてもらえるのにこんなコトを言っててはいかんか． いかん， 旅費とかいうとまた心理的圧迫感が．
• げ． 同しんぽ発表者 Bayesian 先鋒たる岡村さんから (私は次鋒)， こんな Bayes 統計学説明します PDF ファイルが …… その説明方法はまったく意表をついたもので， Thomas Bayes 師 (1702-1761) と現代の Bayesian 統計学者 Alan Gelfand 先生 (本) の肖像を順番に投影することで Bayes 統計学 250 年の歴史的発展の経緯を一瞬にして理解せしめん， と企図するものであった． 嗚呼， 私などはいったい何をどう説明すればいいのだろうか ……
• 今年はまぬがれたか， と期待していたのだが甘かった． 今月末の大学院入試がらみの雑用を申しつけてくる電話．
• とつぜん学部生のときの同級生が来てくれたので， いっしょに昼飯にでる． ちょっと分野のちがうヒト相手にデータ解析雑談がおもしろがってもらえると， これはなかなか楽しい．
• もどってみると， お茶部屋院生密度が今月最大値まで上昇． とうぜんのごとく， 食べもの (もちろん院生たちの) とそれをめぐる個体間競争が中心的な話題となっている．
• 林冠モデル作文のつづき． 文献とか見ずにかける範囲の discussion 節を書いてしまう． こういうのは後からかなり書き直しになったりするわけだが， まあ別にそれはさしつかえない．
• で， ここまで書いた作文をみなおすわけだが …… かなり面倒でなかなか進捗しない． 自分の作文の読み返しに苦闘する， というのはいつものコトなんだけど， 今回は「作文がまずい」 だけでなく「ホントに難しいことが書いてある」 効果もあって， いよいよしんどい． 自分で書いものだろーがなんだろーが， アタマの中で三次元 vector だの何だの想像しながら読むのは， けっこうツラいねえ．
• 「とりあえず版」を make pdf してアップロード． 共著者に現時点ではここまでできてますメイル． 2005 研究室発． 2020 帰宅． 体重 74.6kg． 晩飯．
• [今日の運動]
  • なぜか本日もうんどう休養日になってしまった ……
• [今日の食卓]
  • 朝 (0830): セイコーマートサンドイッチ．
  • 昼 (1240): 百周年記念館きゃら亭の昼定食． オムライス．
  • 晩 (2140): うどん．

2006 年 08 月 19 日 (土)

• 0900 起床． 朝飯． コーヒー． 洗濯． 怠業．
• 助教任期あれこれについて， 粕谷さんから丁寧なるメイルいただいたので， その返信を試みる． 私の場合は丁寧というより， いつものことながら雑談メイルふうに長くなる． こんなの読まされるほうはたいへんなわけだが， 書いてるほうには多少のご利益があり， アタマの中が整理される． 曰く， 書くことは考えることである， と． ということで， 馬車馬 blog のほうにはたいへん短く圧縮したコメントができた． しかし読みかえしてみると， なンだか偉そうだな．
• 1405 自宅発北大構内走． 曇天． 1505 帰宅． 体重 73.8kg． 昼飯．
• 1640 自宅発． 曇． 1700 研究室着．
• お茶部屋には北海道新聞と読売新聞がおかれている． 土曜日の楽しみは， ドナルド キーン さんが読売新聞朝刊連載している自伝エッセイ 「私と 20 世紀クロニクル」 で 1940-1950 年代の日本の興味ぶかい描写と ユーモアのある文章はじつによい (翻訳文なんだけどそれもよい)． そして 山口晃 画伯による挿絵もすばらしい． 単行本化のときにこの絵も全部つけてほしい．
• で， 本日は仕事もせず， お茶部屋雑談にとらっぷされていた． 悪夢にうなされれる大学院生とか， 酢納豆誕生秘話とか．
• で， こんな時間に． 2235 研究室発． 2300 帰宅． 晩飯．
• [今日の運動]
  • 北大構内走 60 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0930): 食パン．
  • 昼 (1550): うどん．
  • 晩 (2340): 米麦 0.7 合． キムチ・タマネギ炒飯．

2006 年 08 月 20 日 (日)

• 0830 起床． 朝飯． コーヒー． 洗濯． 怠業．
• 1125 自宅発北大構内走． 晴． 1215 帰宅． 体重 74.2kg．
• 1310 自宅発． 晴． 1325 研究室着．
• お茶部屋料理にとりくむ． 先月上旬の屋久島調査隊院生たちに 「鯖ぶし」 (その実体はゆでサバのソフトな薫製， 真空パックもの) のおみやげいただいたんだけど， これについて日々 「ちゃんと食べましたか」 「ちゃんとした料理にしたんでしょうね」 「変な料理に使っていませんよね」 と日々追及をうけており， コワくてなかなか食べられなかった．
• お茶部屋でそのサバぶしを料理し， 証拠写真をとり， さらに院生たちにも食べていただくことで そこで自分自身の安全保障問題を解決をもくろんだのであった．

[サバぶしカルパッチョ]

タマネギをみじん切り (これはむしろ薄くスライスのほうがよかったと反省)． 水にさらしたりして辛味をとる (自分だけで食う料理だったらぜったいこんな手間はかけない)． サバぶしすらいすとあえる．
皿にサニーレタスをしきつめ (自分だけで以下同文)， タマネギ・サバぶしをいれ， プチトマトをそえる (自分以下同文)．
てぬきでミツカンの カルパッチョ用ソース なるものを買ってきたんだけど， こういうノンオイルなやつじゃなくて， サラダ用ドレッシングとかのほうがあっているかもしれない (サバぶし自体は淡泊なかんぢなので)．
調理時間約 20 分間． 日々の久保料理を知る人々にとって， これは異様にテのこんだものと理解できるだろう．
はい， ということで屋久島サバぶしおいしくいただきました． ありがとうございます ……

• そして私はこの写真公開によって， 「サバぶし保護観察処分態勢」 からよーやくにして釈放されるのであった． なお上の写真に写ってるのは 「お茶部屋公開・みなさんに食べてもらう用」 であって， 自分の昼飯用にはその残り材料を流用しました．
• ということで昼飯．
• そしてお茶部屋冷蔵庫整理整頓にとりくむ． 大学院生たちの欲望がうずまく冷蔵庫内， と申しますか …… 昨日のお茶部屋雑談で判明したんだけど， 「おやつを買ってきて冷蔵庫にいれる， そのまま忘れる， あとでみても自分のものかどうかわからない」 状態におちいることがときどきある， とのこと． こと食べものに関してまさかそんなことが …… と思って庫内を整理していると， たしかに賞味期限が数カ月前にきれたヨーグルトだのプリンだのが 三つも四つも ……
• これらだけでなく廃棄すべきものは多々ある． どう見ても年単位で収納されている野菜ジュースとか， ドレッシングとか …… 「これ， ホントに捨てていいんだろうか? あとで怒られたりしないだろうか?」 と type-I error に恐怖しつつ， しかし誤棄却に伴う社会的経済的精神的肉体的制裁措置におびえて この現場から逃げ出してしまっては 冷蔵庫内いよいよ渾沌無秩序阿鼻叫喚のるつぼとなるばかりなので， なけなしの勇気をふるって思い切ってあれこれと捨てた． ふう． ドレッシングのびんだの 粘液化しつつある野菜ジュースのペットボトルだの， 中味は捨てて容器を洗浄してから廃棄．
• 稲葉さんが石狩浜ハマエンドウ種子食害卒研 (北大農学部) みつけてきたので， それを二人してながめつつ結果をよみとる． かなりおもしろい内容が含まれていて， あんな海浜群落でかくもややこしい昆虫の群集が形成され， 動植相互作用があるとは． ところで， もったいないことにというか， 虫の食害による種子重変化が何で決まるか解析はあまり正しくなく， これでは何も言えない． 本人に伝えるべきか， しかし面識ぜんぜんない相手に指摘すんのも面倒だし ……
• メイル書き．
• 東京出張の発表準備 …… がススまない． うう． お茶部屋料理ばて & 片づけばて， か?
• 2255 研究室発． 2310 帰宅．
• [今日の運動]
  • 北大構内走 50 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0900): バゲット．
  • 昼 (1410): 研究室お茶部屋． バゲット． レタス・タマネギ・トマト・屋久島サバぶし のカルパッチョ．
  • 晩 (1900): 研究室お茶部屋． バゲット． レタス・タマネギ・トマト・屋久島サバぶし のカルパッチョ．