ぎょーむ日誌 2000-03-(11-20)
2000 年 03 月 11 日 (土)
- 1040 起床．
晴れ．
今朝は 0400 すぎまで仕事していた．
- 科学技術系ライターの
森山さん
の日記に
「赤の女王のハミルトン，
マラリアで死亡．
享年 63 歳」
といったことが書かれている
……
えっ，
William Hamilton 死んだの?
あとでネット上で調べてみるか．
- ついついプログラミングに手を出してしまう．
さっさと学校に行って
<蒼龍> 使ったほうが効率的なんだが．
- 1340 自宅発．
おお，
また雪が降ってきた．
札幌フードセンター琴似店で
お茶などを買う．
1409 JR 琴似駅発．
今日からダイヤ改正．
琴似に快速が止まるようになり，
利用できる列車がすごく増えた．
1425 研究室着．
- 皆さん，
苫小牧の進化植物学研究会に行ってしまった．
- 腹へってきたので，
お茶部屋で料理．
その片手間で Hamliton 情報など探してみる．
しかし Cambridge (の所属だったよね?) その他に
関連情報なし．
あるいは (私の参加してない) evolve
なんかではメイルが流れているんだろうか．
- 昼飯食って気力も回復したようなので，
さっそく <蒼龍> でプログラミングしてみたり，
あれこれと計算させてみる．
だいたいうまくいってるようなんだけど，
何箇所か気になる点がある．
気になる点は殲滅しておかないと，
後々足元をすくわれてしまう．
そこで気になる点がもっと露骨になるような
条件をいろいろと与えてみたり，
プログラムを書き換えてみたりする．
- 1820 ごろ，
jeconet に Hamilton の訃報が流れる．
3 月 7 日．
やはり事実だったのか．
- 誰もいない研究室でプログラミングと計算試験は続く．
だんだん思いどおりに動くようになってくる．
計算の効率も徐々に改善されつつある．
まぬけなバグもつぶしていく．
昨日から悩まされていたメモリーリークの原因
2200 ごろ発見．
ちょーバカな失敗．
C++ の new と delete はちゃんと対応を考えて
使わないといかんなー．
これで大きな系の問題も
取り扱えるようになった．
- すでに 2400 が近付きつつある
と気づく．
2350 研究室発．
ちょっと雪．
終電目指してダッシュ．
コケないように気をつける．
2358 JR 札幌駅発．
0030 帰宅．
- 晩飯作ったりしながら一息つく．
- 大域的な部分に重点をおいた改良を続ける．
- 今日の教訓:
ある種の最適化問題に乱数の使用は
きわめて有効である．
- 生態学会大会まであと 12 日．
- 今日の食卓
- 朝 (1100):
ビスケット数枚．
コーヒー．
疲れて食欲なし．
- 昼 (1500):
ホウレンソウとエノキダケの
スパゲッティー．
お茶部屋料理．
6 株 100 円のホウレンソウと
二パック 50 円のエノキダケを
半分づつ用いる．
ホウレンソウは軽く茹でたあとに，
エノキダケといっしょに炒めて，
野菜ケチャップなるものその他で
味付け．
ちょっとじゃんくなカンジ．
しかし，
ひさしぶりに野菜主体の料理で
なかなかおいしく感じてしまう．
- 晩 (0110):
タマネギと豆腐の味噌汁．
だしは昆布・煮干・干しシイタケ
という
てきとーなもの．
あ，
それからニラ・ニンニク・エノキダケ
の炒めものも作りました．
2000 年 03 月 12 日 (日)
- 1020 起床．
寝たのは 0330 ごろ．
曇り．
少し雪も降っている．
- 【一言近況】
今月末の生態学会大会 (広島)．
その準備におわれています．
うーん，
いつものことながら，
直前になってどたばたしてしまうんですよね
……
いやはや．
- 昨夜のプログラムの挙動を思い出してみるに，
どうもメモリーリークというか
「消し忘れ」があと一箇所ぐらい残っているような
気がしてならない．
しかし，
その点については
かなりしつこく点検したつもりなんだが
……
- あまり汚らしいカンジで学校に行くのも
……
と登校前にシャワー使ってるうちに，
今まで漠然としか見えていなかった
「最後の詰め」
に関してよいアイデアが得られた．
そっかー今まで考えていたのとは
逆の方向から結果を解析すれば，
かなり楽になりそうだぞ
……
などなど
風呂場で20 分ちかく考えこんでしまった．
いやはや．
- 1310 自宅発．
あ，
晴れてきた．
1336 JR 琴似駅発．
さきほどの「思いつき」に破綻がないか，
あちこちひっぱたいてみる．
考えごとしながら歩いてるとコケそうになる．
1350 研究室着．
- 怪しげなコードを分離して
可能なかぎりその機能を局在化していくと，
プログラムのぱふぉーまんすとやらが
急に良くなってしまった．
計算時間とメモリー使用が少なくなり，
結果が
「それらしく」
なっているような
……
うーむ?
- 「それらしい」ってのは危険な判断なんだけど，
最適化された尤度を見ても
文字通り
ケタ違いに上昇している．
収束も速い．
昨日の深夜に開発した
大域・局所問題の配分アルゴリズムが
うまくいってるのかな?
ここまで急速に改良されると不安だなあ．
いままでがヒドすぎた，
という結論ならば喜んで受け入れるが
……
- 1500 ごろ苫小牧から大学院生たちが帰ってくる．
今回も明け方まで
道内生態学者どうしの
歓談を楽しんでいたそうだ．
ああ，
私も参加したかった
……
キャンセルのほうは下野さんの尽力で
何とかなったらしい．
御迷惑をかけてしまったのでなければよいが．
- いろいろと条件を変えたりしながら，
試験運転をどんどん継続する．
そのかたわら，
最後の詰めの部分のアイデアをまとめてみようとする．
- 講座内のメイリングリストに
「レーザープリンター使いかたの常識」
なるメイルを出してみる．
残量少なくなったトナーカートリッジを振る，
といった基本的な貧乏テクニックが
あまり普及していないようなので．
- ひさしぶりに GridLight を少しだけ改良する．
Filereader クラスに key の有無を教えてくれる
機能をつけてみた．
何でいままでこれがなかったんだろう．
よーし，
これを利用すれば．
- GridLight まで改良して
抜本的にプログラムの入出力を
改善しよう
……
といった
狂気の欲望にとりつかれた作業に着手しようする寸前，
正気にもどった．
いやいや
現状のままでも結果はちゃんと出せるし，
いま何より問題なのは残された時間だ．
機能の制限された入出力部を用いる．
そのような枠ぐみで
「詰め」までの
経路を検討しなおす．
- 私の机の引出しで休眠状態にあった
<Exceed> が再び牧さんに
使われることになった．
- ちゃんとした昼飯も食いそびれたことだし，
気分転換も兼ねて帰宅することに．
<蒼龍> の卓絶した計算能力は
すでに十分活用させていただいたことだし．
2020 研究室発．
2041 JR 札幌駅発．
ダイヤ改正に伴い
琴似に快速が止まるようになったので，
さっそく利用してみる．
2120 帰宅．
- だんだん終わりが見えて来たので，
それに向けてプログラムを変形させつつ，
細かい修正を織り込んでいく．
ああ，
また生活時間がずれていく．
- 生態学会大会まであと 11 日．
- 今日の食卓
- 朝 (1050):
昨晩の残り．
味噌汁と炒めもの．
- 昼飯は研究室のお茶部屋で
作ろうと画策していたものの，
計算に没頭していたので
すっかり忘れていた．
お茶部屋のクラッカーやビスケットを
ときどきつまむ．
- 晩 (2210):
まだ残っている
タマネギと豆腐の味噌汁．
2000 年 03 月 13 日 (月)
- 0920 起床．
晴れ．
- あと一歩だと思いつつ，
新しく追加したコードのバグがなかなか取れない．
かなり奇怪な計算結果を出す．
どこかに単純なミスがあるはずなんだが．
なぜか
ガスで視界閉ざされた剱岳頂上直下を思い出す．
うん，
あのときは撤退したなあ．
- 1535 自宅発．
うわー，
吹雪．
1609 JR 琴似駅発．
ダイヤ改正されてもこの駅の
発車間隔の分散の大きさは修復されていない．
1620 研究室着．
- 1700 までに提出しなければならぬ事務書類を
30 分で書き上げる．
ぎりぎりで間に合った．
いやはや．
研究に夢中になっている日々が続くと
日常ぎょーむがおろそかになりがち．
- 苫小牧演習林の福島さんがやってきて
外づけハードディスク間でデーターを
コピーしたいという．
「演習林の Mac の OS は古くて……」
えっ?
SCSI ハードディスクでそれはないでしょう．
「ここの研究室の Mac も古いんじゃないですか?
ほら，
外づけハードディスクつけると起動しませんよ」
……
って
よく見るとドライヴにターミネイターが
ついてないじゃあないか!
- 「いやあ，
そうでしたか．
ははは」
と高らかに笑いながら，
高級官僚になる試験に合格すべく
福島さんは故郷に帰って行った．
- 研究室の蛍光灯がきれたので，
私がそれを外し，
その間に某大学院生が事務の会計掛に
換えをもらいに行った．
二本必要なのになぜか一本しかもらって来ない．
「えーっ，
何で二本なんですか?
また行くのヤですから，
久保さん取りに行ってくださいよ」
会計掛に行くと事務の方が，
やはり別の人が取りに来られましたか，
と
納得しておられる．
「さっき来た人は
『一本でいいです』
と高らかに宣言してましたからね」
二本目を持ち帰ると，
その当人は蛍光灯をもちいた
ライトセイバーごっこに興じている．
- ようやく仕事を再開
……
してすぐに，
今日半日悩まされていた
バグが生じた原因が確認できてしまった．
問題なのは
「こうなるから計算に食い違いが生じることがある」
というのはわかったのだけど，
いったいコードのどこでそうなっているのか，
それがわからない
……
こういうことは滅多にないのだけど．
- まあ，
問題が生じるケイスというのは
やや特殊なオプションを指定したときにだけ
発生するとわかったので，
それを避ければ問題ない
……
しかし気になる．
とはいえ，
残り時間を考えて仕事しなければならない．
- 知床にこもって論文書きをやってた
西村さんが戻ってこられる．
おみやげの牡蛎を皆でいただく．
とても新鮮で磯の味が濃厚で
まことにうまい．
利他的な牧さんが
低温研で仕事している浦口さんを電話で呼ぶ．
浦口さんとともに低温研から松木さんと
本間さんもやって来られる．
お茶部屋がにぎやかに．
- とはいえ，
私はといえばフルタイムでそれに参加できず，
プログラムの修正と改良にも時間とられる．
最後の結果を出す一歩手前まで完成させる．
よーし，
ほぼ予想どおりの結果だ．
- 2345 研究室発．
いつの間にか晴れている．
2358 JR 札幌駅発．
0035 帰宅．
- 家に帰っても ThinkPad で処理できるように
問題の規模を縮小してプログラムのアラ探しを
続ける．
明日には共同研究者にいろいろと報告できそうだ．
ようやくながら．
- 0315 ようやく今日一日悩まされていたバグが取れた．
およそあらゆる想像を絶した箇所に
問題を生じさせていた一命令が埋め込まれていた．
ここ数日で
朝令暮改の限りをつくして
1000 行以上のコードを
書いていたので，
このようなまったく意味不明のシロモノが混じって
しまったのだろうか．
- 発見方法はまったく基本そのもの．
消去法のようなやり方で
可能発生原の候補を何箇所かに
特定してしまい，
あとはデバッガー (gdb) を使って
ブレイクポイントを設定しておいて，
怪しげな流れを捕まえたらバックトレイス．
警察がやってるよーな，
容疑者をしぼって
張り込みやって
追跡して逮捕，
というのと同じですかね．
- しかし
まさかあんなところに，
まったく意味不明の命令が書かれて
それが今の今まで残っていたとは．
最初それを見つけたときは間違いとは信じられずに
何度も何度も前後の処理を読み直してみた．
いくら読み直してもわけがわからんので，
とうとう
それが完ペキなナンセンスコードだと
断定するに至った．
うーむ，
こんなもの書いたときは頭が錯乱していたのか?
ともあれ，
それでも無理やり
「それらしい」答えを捻り出していた
推定プログラムってなかなか凄いぞ．
- 生態学会大会まであと 10 日．
- 今日の食卓
- 朝 (1010):
タマネギ・豆腐の味噌汁の残り，
ハクサイとシイタケの炒めもの．
後者は火の通りかたが一様ではない
カンジ．
なかなか難しい．
- 昼 (1430):
ヨーグルト (雪印ナチュレ)
500 g．
プログラミングやめて
料理するのが面倒だったので．
- 晩 (2100):
お茶部屋で西村さんのお土産である
生牡蛎をいただく．
サロマ湖産．
殻つきで 2 Kg 1200 円だったそうだ．
大学院生たちの作った
牡蛎の酒蒸し，
ホーレンソウとエノキダケ・キャベツ
の和えもの，
キャベツとジャガイモの炒めもの，
えーっと名前失念した
東南アジア風スパイス炊きこみご飯
なども食べさせていただく．
ごちそうさまでした．
2000 年 03 月 14 日 (火)
- 1100 起床．
晴れ．
今朝寝たのは 0500 ごろだったなあ．
しかし 6 時間ぐらいは寝ないと
バグ取りで壊れた脳内配線が
修復しないような気がする．
と，
てきとーな理屈をつけたりするので
生活時間がずれていくのである．
- 今日もまず自宅で仕事に取り組んでみる．
結論を出すのに必要な計算と出力を
モジュールを作っては
組みたててうちに気になったのだが
……
C++ の
Standard Template Library (STL) の
``両頭待ち行列''
なる和名有する
<deque>
ってバグが多すぎるような気がする．
<vector> より <deque>
のほうが便利そうだから，
ついつい使ってしまう．
しかし，
まったく趣旨不明の
変なコンパイルエラーが良く出る．
そして
自分の C++ コードをよくよく見直してみると，
じつはたいていの処理は <vector>
で差し支えないと判明する．
この
<vector> は
完璧と言えるほどにバグがない
(コンパイルエラーが出ない)．
ということで，
<deque> を <vector> に置き換えていく．
ああ，
こうやって
<deque> はますます使われなくなるので
バグは放置されたままとなり，
一方で
<vector> のほうは
磨きがかかっていくのでは
なかろーか．
- 1440 中核推定プログラムにやらせるべきことは
すべてやらせて，
かつ
それを出力させる部分が完成．
まだ統計的な解析ほどこしてない
「生出力」
の段階だけど，
まことに面白い．
ちょっと興奮させられる．
こんなにうまくいくとは．
いやいや，
浮かれてはいかん．
まだまだバグがひそんでいるかもしれん．
よーし，
まとめの Perl スクリプトは研究室に行って書こう．
重要なファイルを tgz で固めて電話回線経由で
研究室の闇ルーター <鳳翔> に送り込む．
- 1510 自宅発．
1530 JR 琴似駅発．
札幌駅直行の快速
<いしかりライナー>．
途中の桑園に止まらないので 4 分ほどで
札幌駅につく．
普通だと 7 分ぐらいかかるだろうか．
1540 研究室着．
- 1630 ごろ，
お茶部屋で昼飯
(すでに夕方なんだが)
作ったり食ったりしながら，
いろいろな人と雑談を楽しむ．
あ，
すでにのんびりモードに入ってるな．
ちょっとそれは早すぎるぞ．
- 今回の推定から得られた結果をまとめる前に，
共同研究者に説明するための
web page を作って，
これまでの経過を簡単に説明する．
けっこう時間かかる．
ああ，
Netscape Navigator のスタイルシート解析エンジンって
どうして
こう
いつもいつも莫迦なんだろ．
少なくとも Linux 版はバグまみれだ．
- どうにかこうにか途中経過を web page にまとめたので，
<鳳翔> にアップロードする．
関係者の皆様にメイルを送り，
そのペイジを検分していただくようお願いする．
- 一段落ついたので帰宅することに．
2245 研究室発．
2256 JR 札幌駅発．
さすがに
駅の階段かけあがっても
息切れするほどには
まだ老化してはいないのだけど，
かけこんだ車内で一息ついたときに
ちょっと立ちくらみを覚えることがある．
うーむ
……
脳内の酸素が一瞬欠乏してそうなっているのかなあ．
ふだん無酸素運動やっていないから，
体内の酸素配分機構がこういった状況に
対応できなくなっているんだろーか．
2340 帰宅．
あああ，
2400 まで開いてる
「本の店・岩本」の琴似店に
寄り道してしまった．
逃避．
いかんいかん．
まだ
逃げてはだめだ．
- 中核推定プログラムは
およそ 4 MB に達する
テキストファイルを産み落とす．
行数にして 16 万．
とは言え，
べつにどうということのない量だし
データー構造も比較的単純だ．
これを
Perl スクリプトで
ねちねちと料理してみる．
夜は更けていく．
- 生態学会大会まであと 9 日．
- 今日の食卓
- 朝 (1130):
昨日の朝のハクサイ・シイタケ
の炒めものの残り．
- 昼 (1630):
キムチとゴマのスパゲッティー．
お茶部屋料理．
大学院生作の利他的なキムチを
また利用させていただく．
ごちそうさまでした．
- 晩 (0030):
ハクサイ・豆腐の
味噌汁．
モヤシ・ニラ・シイタケの
中華ふう炒めもの．
味噌汁のだしは煮干と昆布．
もう煮干が切れてしまった．
後者の炒めものって
なかなかよい
組み合わせを実現してると思う．
あ，
シイタケばかり食っているのは
15 個 198 円で安売りしていたので，
ついつい買ってしまったからである．
しかしシイタケって
値段のわりには
意外と味わい深いものですよね．
煮てよし，
炒めてもよし．
2000 年 03 月 15 日 (水)
- 0730 起床．
晴れ．
そろそろ「ふつー」の
生活時間帯を採用しなければ，
と無理矢理おきてみる．
眠い．
睡眠時間は 3 時間ぐらいか．
頭働かない．
- せっかく「早起き」したのに，
biometry (生物統計学のメイリングリスト) に
「決戦兵器としての
多次元確率分布をもちいた最尤推定法」
なる投書をしてみる．
ああ，
時間ないのに何をやってるんだ
……
- 時間ないのにヒゲを剃ったり
(さすがにかなり見苦しくなってきたので)，
洗濯してみたりする．
おいおい．
- 1002 自宅発．
また雪が降ってきた．
途中で野菜やコーヒーなど買う．
1026 JR 琴似駅発．
1040 研究室着．
- 昨日の報告について，
さっそく田中浩さんからコメントいただく．
大域的な補正に関する追加情報．
推定プログラムをそれにあわせて作り直してみる．
- 多忙きわめるのかヒマなのか何とも判じかねる
甲山教授から奇怪という他ないメイルをいただく．
そのmargaritaの作り方というのは，
ドライだったレシピ
テキーラ 2オンス
クアントロー（あまーいリキュール）小サジ2
ライムジュース 小サジ1
氷でシェイク
ロングだったレシピ
テキーラ 1/2オンス
クアントロー 1オンス
ライムジュース 1オンス
レモンジュース 1オンス
などなど．．
あ，禁酒だったっけ．．
- 登校してからも biometry なんぞに
最尤推定法がらみの
メイルを送って遊んでしまう．
うう．
いかんいかん．
- 1500 から 1800 すぎまで大学院生の
研究中間報告．
もっとも，
そのうち 2 時間ぐらいは
大学院生ならざる人が延々と
しゃべっておられたようだが．
- 計算機の前から引き離されたのを奇貨として，
ひたすら思考の内職にはげむ．
懸案の問題の「詰め」までの手順を
紙にまとめていく．
何度も何度も書き直してみる．
よーし．
ついに計算方法に関しては
ようやく最後まで到達する経路が
きっちりと確定した．
もうこれで
「解けるか解けないかも分からない問題」
からは解放された．
解けるとわかりきった問題になった．
やれやれ．
- もちろん，
まだ最後の計算やってないんだから，
どんな結果になるか今はわからない．
しかし，
もうそれはどう転んでもよい．
- セミナー終わっても
まだ biometry で最尤法の話題が
続いている．
ああ，
私も横から口出しして
議論をもっと混乱させたい．
- 「うう．
biometry にメイル投稿してあれこれ言ってやりたいです．
ほらほら，
三中さんなんか，
『最尤法について日本語で始めて書かれたのは 1996 年』
とか，
すげーインチキくさいこと書いてるんですよ．
いちゃもんつけてやりたーい」
「私には学会準備の時間がなくなり
あわてふためく久保さんの姿が見えます」
「はっ」
「そこの小さなホワイトボードよこしなさい」
「ああ，何を書くというのです」
「これです」
「……『おとなげ』」
「学会準備が終わるまで，
これを机の上に置いておきなさい」
- 大域的補正を入れた推定プログラムの
挙動を調べる試験運転を続行するかたわら，
口頭発表用の OHP シートの原稿を
LaTeX で作り始める．
- ちょっと気になる箇所が見つかり，
そこを調べる試験運転にはまってしまう．
今日は最後の計算までできそうにないな．
- 2335 研究室発．
また雪が降ってきたな．
2350 JR 札幌駅発．
0030 帰宅．
- 今日は早めに起きたのに，
結局いつもどおりの生活パターンに戻りつつある．
- 生態学会大会まであと 8 日．
- 今日の食卓
- 朝 (0900):
昨夜の残りそのまま．
ハクサイと豆腐の味噌汁．
モヤシ・ニラ・シイタケの炒めもの．
- 昼 (1420):
ピーマンとエノキダケのスパゲッティー．
お茶部屋料理．
- 晩 (0100):
ハクサイと豆腐の味噌汁．
まだ少し残ってる．
2000 年 03 月 16 日 (木)
- 0920 起床．
曇．
寝たのは 0300 ごろかなあ．
またいつもの生活にもどってしまった．
ゴミを出しにいく．
なんとかまだ間に合った．
- 自宅プログラミングにはげむ．
推定結果の巨大ファイルをさらに料理するための，
小さなプログラム群ですね．
今度はホントにあと少しだ，
と言いきかせつつ．
- またまた大変なことになりそうなメイル来る．
うーん，
私はとらぶるしゅーたーなのか．
面倒なので返事は後回し．
- ちょっとプログラミングにつまる．
気分を変えるために昼飯準備．
「どーしよかなー，どーしよかなー」
と
あまり知性を感じさせない独語とともに
野菜を切っていると
解決策を思いついた．
気分転換は重要ですね．
ただし料理の塩加減は間違えた．
- 1425 自宅発．
1450 JR 琴似駅発．
1510 研究室着．
- 昨日「おとなげ」と書かれたホワイトボードのまわりに，
「忍」「耐」「抑」「禁」といった落書きが
追加されている．
犯人は甲山さんである．
まことに
おとなげないいたずらである．
- 久しぶりに rxvt を使ってみる．
字がまともに表示されないので，
/usr/X11R6/lib/X11/app-defaults/Rxvt で
-alias-fixed-medium-r--16-*-jisx0208.1983-0
というカンジでフォント指定してみる．
X のフォントの処理って
いまだによくわからん．
- 最後の詰めに至る処理が結構あれこれと要素間の相互参照あって，
少々ややこしいので，
けっきょく中核推定プログラムを改造することにした．
これによって中核推定プログラムが
少し「専用化」されちゃうんだけど，
まぁ現時点で汎用推定プログラム作ることもないかあ，
と正気になったので，
またコードに手を入れているのである．
- 1820 分ごろ，
誤差と変異を分離できている結果を入手する．
ふう，
ここまでたどりついたか．
今まで変異だと思っていたうち
半分あるいはそれ以上の部分は
誤差にすぎない可能性が高い，
という結果．
ま，
そーいうもんなのかな．
空間分布を見ると，
いかにも間違えそうなところで
「間違えている確率」高い．
うん．
これで
いいことにしよう．
- 2010 共同研究者その他の皆様に今日の結果を説明する
web page (ちょー手抜き) を作り，
メイルを送る．
- その後もいろいろといじっくてみて，
定性的な結果がひっくり返らない，
とか
変化してる場所と読み取り誤差に過ぎない場所が
わかりやすく区別できるような
三次元お絵描きプログラムとか
こまごまとした作業に着手する．
- ともあれ一般講演用の
「『超』格子モデルの林冠動態」
(久保・田中・中静)
は最後まで話がつながった．
だいたい予想どおりの結果も得られた．
あとは LaTeX なんかで発表の準備するだけだ．
- つい一週間前の「ぎょーむ日誌」に
「よーやくプログラムの外回り完成」
などと
ふざけてるとしか思えないことが書いてあり，
さすがにあぜんとする．
てめー，
そんなところでのんびりしてるんじゃない，
と言ってやりたくなる．
そのまた一週間前の日誌を見ると
仕事もせずに
ThinkPad のカーネルの再構築ばかりやってる．
よほど莫迦なのか，
私は．
- いやはや，
今だって
のんびりしてるヒマはない．
一般講演の説明を用意するだけでなく，
まだ自由式シンポジウムの発表と
自由集会の準備もある．
明日からこれらを並行して進めていこう．
自由式シンポジウムはすでにできてる話だ．
自由集会は名波さんとかとーさんに
苦労してもらえばよい (ひひひ ← 利己的な笑ひ)．
もはや頭は使わなくともよい．
手を使い人を使うだけだ．
- 2350 研究室発．
終電に乗り遅れる．
我が家まで夜道を一時間以上歩く．
0110 帰宅．
- 家に帰ってもなんとなく推定プログラムを回して
面倒な最尤推定をやらせてみる．
いやあ，
おもしろいおもしろい．
おおっ，
またカッコいい絵が生成されたぞ
……
遊んでるのか仕事してるのか．
- 生態学会大会まであと 7 日．
- 今日の食卓
- 朝 (1000):
ハクサイと豆腐の味噌汁．
ようやく食べ尽くす．
- 昼 (1345):
冷蔵庫に残ってたモヤシと
ニラとシイタケの炒めもの．
また同じもの食ってるな．
- 晩 (0130):
昼の残り．
炊飯器にご飯入れっぱなしにしてたら，
すごーくマズくなってしまった．
悲しい．
2000 年 03 月 17 日 (金)
- 0840 起床．
晴．
眠い．
もっと早寝しなくては．
- 家でまたまた POV-Ray なんかで絵を描かせてみたりする．
ああ，
そんなことやってないで早く学校に行って
<蒼龍> でやらせたほうが何倍も速いのに．
- 1040 自宅発．
だいぶ気温高くなったな．
1109 JR 琴似駅発．
久しぶりに北大生協書籍部に立ち寄る．
1135 研究室着．
- <蒼龍> で一般講演用の絵を描かせてみたり，
Tanaka & Nakashizuka などなど読み返してみたり，
自由式シンポジウム用の文献を調べてみたり，
竹中さんその他に画像ファイルを貸していただくよう
お願いしたり，
あれこれとメイル書いてみたり
……
と支離滅裂な午後をすごす．
竹中さんにはメイルで
いろいろと教えていただきました．
- 打つべき手はいろいろと打ったので，
気分を変えるために家に帰ることに．
腹も減った．
1930 研究室発．
1950 JR 札幌駅発．
琴似のあちこちをふらふらと歩く．
さっさと帰るべきなんだけど，
どうにも気になる点がある．
あーでもない．
いや待て．
やはり．
これではダメだ．
……
ということで，
これまで最尤推定に用いていた尤度関数に
問題があることを確信した．
あのままでは意味不明だ．
修復できるだろう．
修復しなければならない．
2100 帰宅．
- 尤度関数の再設計に着手する．
- いくつかの試案を組み込んでみる．
くそう．
モノによってはなかなか収束しない．
- 0400 ようやく「これで正しい」と考えられる
尤度関数の設計に成功．
結果は定性的にはそれほどかわらない．
そして尤度関数の意味は明確になった．
いやはや助かった．
いやはや．
- 生態学会大会まであと 6 日．
- 今日の食卓
- 朝 (0915):
昨日の炒めものの残り．
- 昼 (1320):
タマネギとピーマンの野菜炒め．
お茶部屋料理．
味付けは
粉末中華スープ・塩・
胡椒 (マレーシア土産)．
タマネギがなかなか香ばしい．
「久保さんの料理にしては
おいしそうな匂いがしますね」
飯は弁当として持参．
- 晩 (2200):
ハクサイの味噌汁．
量を間違えてハクサイだけで
鍋がうめつくされてしまった．
考えごとしながら
料理するとダメですね．
2000 年 03 月 18 日 (土)
- 1040 起床．
うう眠い．
曇り．
郵便配達員にたたき起こされた．
- 遅い朝飯食いながら，
推定プログラムを手直ししたり，
試験運転を続行する．
うん，
尤度関数を直すことで
収束までに要する時間が格段に短縮された．
- 1330 自宅発．
途中で野菜など買う．
1402 JR 琴似駅発．
1430 研究室着
- 浦口さんから
「尤度比検定のプログラムがヘン」
とのクレイム．
ええええええ，
と焦りつつ
調べてみると浦口さんにお渡ししてたのは，
古いヴァージョンであること判明．
陳謝して新しいほうを使ってもらう．
冷汗．
- メイル連絡いろいろ．
その片手間に
<蒼龍> に尤度関数直したプログラムを入れて
推定試験をやり直してみる．
- あ，また雪．
と外を眺めつつ昼飯を夕方に食う．
- LaTeX を使って OHP 用原稿作り．
東大の油谷さんという人が作った
ohp.sty という LaTeX のマクロを利用する．
便利だけど
なかなか変な挙動も．
- POV-Ray だの Tpng だの自作の xpm 生成スクリプトだの
によって作られた
さまざまな画像の切れっ端は最終的には
eps に変換されて LaTeX ファイルに取り込まれて行く．
- 正直に申し上げて，
LaTeX で OHP 原稿の用意するのは
ちょっと面倒ではある．
しかしながら，
結局 Macintosh なんかを使った場合でも
画像の規格を変換してそろえていくのは
神経つかうもんだ．
うん．
少なくとも
Linux 上で作業していると
「絵が崩れ」たりはしない．
これはとても心がおちつくことだ．
- とはいえ，
しばらく Tpng なんぞを使っていなかったので，
Tpng の魔女
(尊称 ``wizard'' の女性形のつもりです)
である牧さんにこつを教えていただく．
- ImageMagick の convert コマンドに依存した
作業が続く．
ホント，
これなかったら何もできんな．
シェルのコマンドラインから
``convert foo.jpg bar.png''
(foo.jpg という JPEG 画像ファイルを
bar.png という PNG 画像ファイルに変換せよ)
といったカンジで
どんどん画像の規格の変更を指示できるのである．
いやいや，
画像の規格を変えるだけでない．
便利なオプション指定することで
あらゆる変換が可能なのである．
ホンの一例をあげると
……
- convert -geometry 500% -filter box a.xpm b.png :
5 倍に拡大．
拡大フィルターは箱型．
- convert -crop 0x0 c.png d.eps :
周りの空白を削除．
- convert -rotate 90 e.eps f.png :
90 度回転
- convert -colors 8 g.png h.jpg :
色を 8 色に制限．
などなど
……
とにかく，
使い切れないほど多くの
オプションが
いくつでも同時に指定できるのである．
しかも動作は速い．
- 作業を続けながらも，
また
闇ネット経由で <蒼龍> を動かす．
2 時間ほどかかる面倒な計算をやらせてみる．
500 MHz Pentium III ふたつが全力運転．
この間に，
いったい何億個の「樹冠」が
生成されては消えていったのか．
- 上の莫大な計算から
これまでに得られた結果の robustness を
確認する．
よーし．
尤度関数を改良すると
ばらつきも小さくなっている．
- 2130 研究室発．
あ，
雨かな．
2141 JR 札幌駅発．
いや，
雪になった．
2240 帰宅．
- 晩飯食って一息つく．
- 作業は続く．
- 生態学会大会まであと 5 日．
- 今日の食卓
- 朝 (1140):
昨日のハクサイの味噌汁に
豆腐とシイタケを追加．
- 昼 (1600):
春菊の雑炊．
春菊は一束 50 円で売られていたもの．
その半分を使う．
まず春菊を軽く茹でておく．
かつおでだしをひき
家から持って来た飯と春菊を入れる．
味つけは塩と醤油．
- 晩 (2330):
朝の味噌汁の残り．
2000 年 03 月 19 日 (日)
- 0900 起床．
晴．
眠い．
- 家で仕事．
xdvi のろい．
- 1340 自宅発．
1402 JR 琴似駅発．
1415 研究室着．
- 仕事．
- 2340 研究室発．
雪．
2350 JR 札幌駅発．
0025 帰宅．
- あああ，
疲れた．
今日は「ぎょーむ日誌」書いているヒマないほど
仕事ばかりしてた．
といっても，
もっぱら手を動かすばかりで，
頭はほとんど使ってないんだが
……
- 一般講演の OHP 用原稿がまだできん．
九割ちかく完成したんだけど
……
まあ，
明朝までにはできるかな．
- 生態学会大会まであと 4 日．
- 今日の食卓
- 朝 (0930):
昨日の味噌汁の残り．
- 昼 (1600):
春菊とエノキダケの雑炊．
お茶部屋にて．
昨日の材料の残りを使って．
エノキダケは今日買って来たもの．
- 晩 (0105):
ニラ・モヤシ・シイタケ・豆腐の
炒めもの．
セイコーマートの野菜は
高くて変色してる．
しかし深夜に調達できるのは
そこしかない．
2000 年 03 月 20 日 (月)
- 0850 起床．
晴．
うーむ，
今朝は結局 0300 ごろに寝てしまった．
まだ原稿できてない．
どーしてこう遅いんだろね．
- 1055 自宅発．
1120 JR 琴似駅発．
1140 研究室着．
- 一般講演の OHP 用原稿作成にはげむ．
- 最後に原稿ファイルを PDF にして，
Mac に持って行こうとするとうまくいかない．
ちょっと焦る．
というのも Macintosh に接続されている
インクジェットプリンターで最終的に出力する
つもりであるからだ
(印刷するのは明後日だけど)．
- 貴重な一時間を浪費してあれこれと試行錯誤して
判明したことには，
PDF を表示・印刷する Acrobat Reeader
(version は 4.05a) は
8-9 MB を超えるような巨大ファイルを
うまく取り扱えないことがある，
ということであった．
原稿を前半後半にわけて PDF 化することで，
問題が解決された．
いやはや．
まぁ，
合計 10 MB より大きい PDF ファイル作る
こちらも悪いとは思うけど．
- 1550 なんとか PDF をアップロードし，
関係者の皆様に「見て下さい」メイルを出す．
ふう．
これで一段落だ．
- また夕方に昼飯食って一休み．
- 自由式シンポジウムの準備に取り掛かる．
基本的には以前にやったやつを改造して
流用することに．
- 2020 かとー大先生から
要旨送っていただく．
- 【更新情報】
計算生態学
に加藤さんの要旨
「生態学のデータに対する
Perl を使ったデータ整理法」
を追加しました．
(20000320)
- 2055 研究室発．
2109 JR 札幌駅発．
2220 帰宅．
うーむ，
あれこれと寄り道してしまった
……
- 飯食ってとりあえず自由集会の要旨を
LaTeX 化してみる．
予定 4 ペイジのうち 3 ペイジはうまった．
さて残り 1 ペイジをどうしようか．
- 自由集会のほうは明日考えることに．
シンポジウムの準備を再開．
- 生態学会大会まであと 3 日．
- 今日の食卓
- 朝 (0920):
昨夜の炒めものの残り．
- 昼 (1630):
タマネギとピーマンのスパゲッティー．
お茶部屋料理．
- 晩 (2330):
朝の残り．