ぎょーむ日誌 2010-09-(21-30)

2010 年 09 月 21 日 (火)

• 0730 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー． 0920 自宅発． 曇． 0940 研究室着．
• さっさとぎょーむにとりくみたいのだが ……
• よーやく 11 時まえに 岩波統計モデル本 作業を開始． いやぱや．
• この尤度比検定章もなかなかにたいへんだ．
• 岩波本は「かなり具体化した例，つまり数値例なんかを 当方から提示しないとより抽象化されたアイデアを理解できないヒト」 を読者モデルとして書いているんだが …… その方針でいくと， 具体例の例示 → 抽象化といったパターンが多くなる． ところが検定の説明みたいなやつだと， 帰無仮説とかみたいなより抽象的な概念を先に出せとかゆーご指摘があって， ですね．
• オブジェクト指向プログラミング (OOP) 的にいえば， 帰無仮説というクラスの構造と属性と演算の定義を先にやって， そこから具体的な帰無仮説のひとつを生成する， といった方向性で …… まあ， 数理な本ではそれがふつーだろうし， だからこそ， そのあたりをマネして OOP なるわくぐみが提示されたわけだが．
• で， 第 5 章の尤度比検定章をながめているのだが， やはり「この例題でいえば，帰無仮説の統計モデルの逸脱度は 475.3 であり」 といった記述は避けられないな． ペイジ数が増えないように， 最初にあいまいなままわくぐみ提示 → 数値例で説明 → でてきた概念をちょっと抽象化， という順番で説明してみるか．
• 昼飯．
• 第 5 章， またアタマからのかきなおしになっているので， 時間かかっている ……
• 脚注かきで気ばらし．

• 本日の岩波本修正作業， 全 265 ペイジ (修正前のペイジ数) 中の 96 ペイジまで終了．
• セミナーの予習， 少しばかり．
• 1630 より Trendy セミナー， 本日は Peter Bellingham さん， ニュージーランドの外来植物・動物について． 太平洋南部にぽつんとうかぶ日本よりやや小さいこの群島， ここ 700 年ばかりで莫大な種数の外来生物が入ってきたわけだが …… で Bellingham さんたちがやろうとしてることは， 外来種が在来の群集に与える効果を野外実験で調べたい． 三とーりほど例がでて河川の氾濫原の植物のバイオマスに関しては， 今年の 2/28 に日高で黒川さんから聴いた内容と同じだった …… いろいろ実験処理してもよくわからないんだよねえ． SLA と窒素濃度で何やら割算値 vs 割算値な直線回帰とかしてるけど …… 他の二つも同じような印象で， 野外実験で生物群集の操作を調べるのは簡単ではないような．
• 1750 研究室発． 買いもの． 1820 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯．
• 三ヶ月間きいてきた NHK ラジオ第二の カルチャーラジオ 「「新約聖書」とその時代」 の最終回． 今回も楽しめました．
• 2200 自宅発 ミニ大通公園 走． 2245 帰宅． 体重 70.6 kg． やはり晩飯ぶん増えるか ……
• [今日の運動]
  • ミニ大通公園 走 45 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0750): 米 0.6 合． ネギ・油揚の味噌汁． トマト・キャベツ・ニンジン・豆豆・豚肉のスープ． 鶏のスペアリブ・レンコンのバルサミコ炒め．
  • 昼 (1220): 研究室． 食パン． リンゴ．
  • 晩 (1910): 米 0.8 合． シジミの味噌汁． ピーマン・タマネギ・ナス・シイタケ・ベイコンの炒めもの． ゆでブロッコリー． キュウリとタマネギドレッシング．

2010 年 09 月 22 日 (水)

• 0750 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー． 0910 自宅発． 曇． 0930 研究室着．
• 札幌出張にきた大澤君と 1.5 時間ほど雑談．
• あとは， またまた他のことはほうりだして， 岩波統計モデル本 作業． 第 5 章尤度比検定章のかきなおし．

• 第 5 章， ひととーり修正できたかな …… 本日の岩波本修正作業， 全 265 ペイジ (修正前のペイジ数) 中の 109 ペイジまで終了．
• 帰宅前にちょっと雑用．
• 1850 研究室発． 買いもの． 1900 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯．
• またリンゴジャム作りにとりくんでみる． 前回はバルサミコ酢， 今回はレモン果汁を添加． そういうので pH さげて砂糖を加えるとペクチンがでる， とのことなのだが ……

[皮ざる作戦]

リンゴの皮にはたくさんペクチン成分が含まれてるらしい， しかしジャムに混ぜるのはどうだろう …… ということで， このように鍋にざるをいれてその中に皮をいれてみた． うーむ， 効果があったのかなかったのか ……

• 2230 自宅発 ミニ大通公園 走． 満月にちかい． 2305 帰宅． 体重 70.6 kg．
• [今日の運動]
  • ミニ大通公園 走 35 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0810): 米 0.6 合． ダイコン・油揚の味噌汁． ゆでブロッコリー． ダイコンおろししらすぼし．
  • 昼 (1200): 研究室． 食パン． バナナ．
  • 晩 (1910): 米 0.8 合． ダイコン・油揚の味噌汁． ゆでブロッコリー． サケの塩焼き． ネギ・ミツバ・アサリの酒蒸し．

2010 年 09 月 23 日 (木)

• 0700 起床． 怠業． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー． また怠業．
• 岩波本作業をつづけたいところだが …… 北大図書館から依頼されてる HUSCAP えっせい， そろそろ着手しなくては ……
• あまりススまぬうちに， 昼飯の準備． 昼飯．
• 午後も HUSCAP えっせいの停滞にくるしんでみる．
• 夕方， AEON 桑園で買いもの． 米 5 kg かついで帰宅．
• 晩飯の準備． 晩飯．
• かたづけしたあと， あたかも自分自身に shutdown -h now を命じたかのように， 次々と各所が機能停止していき， 絨毯の上でばったりと寝てしまった …… ふとん以外で眠りこんでしまうのはひさしぶりだ．
• ふと気づくとすでに二時間ほど寝てしまった． アタマの中がぼーっとしたまま， また意識が回復したときには， なぜかしら， 自宅から至近距離にある温泉・極楽湯 の電気風呂でびりびり感電していた．
• 10 分ちょっとぐらいで， 風呂からはぽいっと出て， 休憩室の畳の上でごろごろしながら本を読んで， 雨の中帰宅．
• 仕事のススまぬ秋分の一日であった …… どーもあれこればててたようで．
• [今日の運動]
  • うんどう休養日．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0800): 米 0.6 合． タマネギ・油揚の味噌汁． トマト・キャベツ・ニンジン・豆豆・豚肉の煮物． キャベツ・ネギ・ハムのサラダ． ヨーグルト・リンゴジャム．
  • 昼 (1240): 卵パンケイキ． 「粉もの」を焼くのはひさしぶりだ． リンゴジャムなど．
  • 晩 (1920): 米 0.8 合． タマネギ・ジャガイモ・ソーセイジのスープ． カスベの煮もの． ワカメのサラダ． 豆太の豆腐．

2010 年 09 月 24 日 (金)

• 0750 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー． 0910 自宅発． 晴． 気温 15 度ぐらいなので長袖シャツを着用． 0930 研究室着．
• 本日は 岩波統計モデル本 はあとまわしで， HUSCAP えっせい書きにとりくんでみる．
• またなかなかススまん． 私は読み書きがかなり遅いんではないかな …… いまさらながらだけど．
• データ解析こんさるメイルかき． 他の人が数時間しらべてわからないところを 5 分で修正． しごとやったきぶんになる． いかん．
• いかんという気分のまま昼飯．
• ぐだぐだとかきすすめる ……
• 本日はそれで時間ぎれ．

• 1730 研究室発． 買いもの． 1750 帰宅． いそいで晩飯の準備． 晩飯．
• うろうろ． 帰りに AEON 桑園でヒノキのすのこ買う．
• ということで， また数日はひとりぐらし状態となった．
• [今日の運動]
  • うんどう休養日， つづく．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0800): 米 0.6 合． タマネギ・ジャガイモ・ソーセイジのスープ． キャベツ・ネギ・ハムのサラダ．
  • 昼 (1230): 研究室． 食パン． バナナ．
  • 晩 (1840): 米 0.8 合． カブ・ネギ・タマネギ・シイタケ・豚肉の味噌汁． ホッケのひらき． ダイコンおろし． キャベツ・ネギ・ハムのサラダ． トマト．

2010 年 09 月 25 日 (土)

• 0750 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー． 怠業．
• うー
• 1100 自宅発． 曇． JR 札幌駅まわりうろうろして， 1140 研究室着．
• いかん． 研究室内怠業状態つづく． 昼飯．
• HUSCAP えっせいは推敲必要だが …… まあ， 放置しとこう．
• よーやく 14 時すぎに 岩波統計モデル本 作業にとりくむ． 次の第 6 章修正にとりくみたいところだが ……
• けっこう構造改革してしまった第 5 章尤度比検定章をみなおすことに．
• うー
• だめだ． かなりなおさんといかん．
• 本日の岩波本修正作業， 全 265 ペイジ (修正前のペイジ数) 中の 109 ペイジまでで停滞中．
• 1810 研究室発． 買いもの． 1830 帰宅．
• 1900 自宅発 ミニ大通公園 走． 1940 帰宅． 体重 70.4 kg．
• 晩飯の準備． 晩飯．

[またリンゴジャム作り]

5 個 298 円の「見切り」リンゴ売ってたので． 見切り品だったけど， ほとんどいたんでなかった． しかし， いつものことながら， すごく縮むもんだねえ ……

• 流し周辺をちょっとふきそうじ．
• [今日の運動]
  • ミニ大通公園 走 40 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0820): 米 0.6 合． カブ・ネギ・タマネギ・シイタケ・豚肉の味噌汁． トマト・卵の炒めもの． キャベツ・ネギ・ハムのサラダ． ダイコンおろし．
  • 昼 (1300): 研究室． 食パン． リンゴ．
  • 晩 (2030): うどん． カブ・ネギ・タマネギ・シイタケ・豚肉の味噌汁． キャベツ・ネギ・ハムのサラダ． ヨーグルト．

2010 年 09 月 26 日 (日)

• 0810 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー． 怠業．
• 1130 自宅発． 寒いと思ったら雨か． 気温 12 度． けっこう「さむい」感ある． 1150 研究室着． 晴．
• 起動状態， ぐたぐだ．
• てれてれと昼飯．
• 1330 すぎに， 岩波統計モデル本 作業のつづきにとりくむ．
• 北大図書館 HUSCAP えっせいの推敲作業がまだ終了してないんだが …… まあ， 先にちょっと岩波本をすすめておきましょう， とゆーことで．
• 第 5 章尤度比検定章， また図を追加．

• これは第 4 章 AIC 章の図と対応させたつもりなのだが …… わかりやすくなったのかどーか． まあ， 作文能力の欠如に苦しむ著者の気やすめなのかも．

• 文章なおすのはしんどいよー
• とりあえず尤度比検定章の再修正は， ひとまずオワったことにしよう …… 本日の岩波本修正作業， 全 265 ペイジ (修正前のペイジ数) 中の 109 ペイジまでで停滞中．
• 1750 研究室発． 雨やんでる． 買いもの． 1820 帰宅．
• 1845 自宅発 ミニ大通公園 走． 1945 帰宅． 体重 70.6 kg．
• 晩飯の準備． 晩飯．
• ばてた．
• [今日の運動]
  • ミニ大通公園 走 45 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0840): 米 0.8 合． 卵焼き． ヨーグルト・リンゴジャム．
  • 昼 (1220): 研究室． 食パン． ハム． プルーン． バナナ．
  • 晩 (2020): 米 1.0 合． 今日も一人なのでお手軽に， 一ヶ月以上前に作って 冷凍保存しといた トマト・タマネギ・ピーマン・ダイコン・豚肉のカレー． ヨーグルト・リンゴジャム．

2010 年 09 月 27 日 (月)

• 0740 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー． 0900 自宅発． 曇． 0920 研究室着．
• 朝からいきなり計算機なあれこれにはまりこんでしまった． 32 GB SSD の partition サイズを変更したかったのだが …… gparted とゆー Linux ユーティリティで簡単にできた．
  1. root として login
  2. gparted 起動．
  3. 今回変更したい /dev/sda3 と /dev/sda4 をアンマウントして， サイズ変更を設定
  4. 変更の実施
  5. 必要なパーティションを再マウント
  それぞれ問題なく変更できた． /dev/sda4 なんかはゐんどーづ XP が入っていたのだけど， いかなる魔法によるものか問題なく boot できた (初回は chksum が動いたけど)．

• どうでもよいことだが， Windows XP sp3 では Corega WLCB-54GT が使えず (Corega が driver を更新してないので)， 研究室内で無線 LAN 使いたければ共用の Buffalo WLI-UC-G (USB にさすタイプ) を使うしかない． これは Linux ではつかえない (が，Corega WLCB-54GT は使える) …… ど忘れ対策メモ．
• なぜか佐竹さんと 1330 ごろまでパラメーター推定のそうだん． 相談後， どわすれしないうちに， メモがわりの BUGS code かいてみた．
• おそい昼飯．
• 本日しめきりの北大図書館 HUSCAP レターえっせいの最終的な推敲． 図の準備． あれこれ送信 …… ぐったり． 時刻はすでに 17 時． うう．
• 何もしないまま撤退するのはキモチわるいので …… ちょっとだけ 岩波統計モデル本 作業． 第 6 章 GLM あれこれ章の修正にとりくむ．
• さくいん語の指定とか， そういうのだけで終了． 本日の岩波本修正作業， 全 265 ペイジ (修正前のペイジ数) 中の 109 ペイジで停滞中．
• 1750 研究室発． 買いもの． 1820 帰宅．
• 1925 自宅発 ミニ大通公園 走． 2005 帰宅． 体重 70.4 kg．
• 晩飯の準備． 晩飯．
• 真夜中うろうろ．
• [今日の運動]
  • ミニ大通公園 走 40 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0810): 米 0.8 合． ネギ・卵の炒めもの．
  • 昼 (1400): 研究室． 北大生協コップパンのベイグルとか． リンゴ．
  • 晩 (2030): 米 0.8 合． タマネギ・油揚の味噌汁． コマイの丸干し． キャベツ・ミズナ・ネギ・ハムのサラダ．

2010 年 09 月 28 日 (火)

• 0740 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー． 0900 自宅発． 晴． このあと雨になるとの予報． 0920 研究室着．
• いやはや， いきなり生態学会ぎょーむ & 生態学会さーばーぎょーむに つかまってしまった．
• そもそもの発端は， 「そういやもうすぐ生態学会・札幌大会の一般講演もうしこみ がはじまるけど，分野わけとかゆーめんどうな問題はどうなったかな?」 と思って， 大会企画委員会の pukiwiki を見ようと思ったら表示されなかった， とゆーのが発端．
• ぢつはこれは単に古い URL にアクセスしたのが敗因なのだけど， それとは気づかずに， えーいまた web server まわりの権限問題とかで何かコケてるな， と思って生態学会さーばー (CentOS) Plesk インターフェイスで 調べてみた． 何かよけーな自動更新とかやったのでは， と疑ったわけだが ……
• じつはこの Plesk な default 設定のもとでは， OS が自動更新されないとわかった． よくわからぬまま，8 から 9.52 に udpate．

• 時間かかる． アクセスログとか調べる． rotate が設定されてなくてたいへんなことに． 蛇足ながら， 仮想化されてる esj.ne.jp のログは /var/www/vhosts/esj.ne.jp/statistics/logs/ 以下にある．
• そして update も何の関係もなし． このあたりで「そもそも古い URL にアクセスしてた」 とゆー自爆に気づいた．
• ばてた． まあ， システムが更新されたからよしとするか．
• さーて， 本来の生態学会・札幌大会の分野わけ問題だが …… 昨年の自分の分野わけ 作業を見てもよくわからんので， ポスター部会の関さんに相談メイルをおくってみる． 私の担当は口頭発表だけど， この分野わけはポスターのそれと連動するとかしないとか， いろいろギロンがあって， ですね ……
• すでに正午． 昼飯．
• となりのとなりは A 棟 8F お茶部屋区画なのだが …… さいきん， 院生らんちたいむはみょーな興奮状態にあるよーだ． 調査しーづんがぼちぼち終了， 院生密度が高まっているためか?
• 来週の授業について， わけのわからぬ指示 …… まあ， それは放置するとして， 来週の月曜日朝から じゅぎょー ですなぁ．
• とりあえず， 本日も 岩波統計モデル本 作業をつづけよう． あれこれと放置しつつ ……
• 第 6 章 GLM 帝国拡大膨張篇． 第 3 章末尾の「あれこれできます」説明をおしこんだので (第 3 章の修正作業でばててしまってめんどうになったから)， また整合作業が追加されてしまった ……

• 15 時から 1.5 時間ほど深谷君とモデリング相談． 今回のは時間スケイルが細かいわけだが， まあ「がくがく」と変動するわけで …… 生態学の時系列モデリングはしんどい．
• 岩波本作業のつづき．
• 本日の岩波本修正作業， 全 265 ペイジ (修正前のペイジ数) 中の 121 ペイジまで終了．
• 1810 研究室発． 暴風雨． 買いもの． 1840 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯．
• 天気わるいので， うろうろ散歩．
• [今日の運動]
  • うろうろ散歩 40 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0750): 米 0.6 合． タマネギ・油揚の味噌汁． コマイの丸干し． キャベツ・ミズナ・ネギ・ハムのサラダ．
  • 昼 (1200): 研究室． 食パン． バナナ． リンゴ．
  • 晩 (2000): 米 0.8 合． ダイコン・イカの煮物． コマツナとタマネギドレッシング．

2010 年 09 月 29 日 (水)

• 0720 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー． 0930 自宅発． 晴． 風はまだ強い． 0950 研究室着．
• 午前中は佐竹さんに BUGS coding を説明して終了．
• 昼飯をかじりつつ， 岩波統計モデル本 作業にとりくむ ……
• しかし午後も別件こんさる， スンモヌさんの非線形関数あてはめとか R わざ伝授なあれこれ， 1.5 時間ほど．
• すでに「やばい季節」， すなわち， こんさるはんぼうきに突入しつつあるのかもしれない ……
• 図を修正しなさいなおしなさい指摘が各方面からあるので， まずは， そのあたりの作業を ……

• しんどい．
• また本文を修正しつつたどる作業．
• 本日の岩波本修正作業， 全 265 ペイジ (修正前のペイジ数) 中の 126 ペイジまで終了．
• 今日はよくわからぬ時間に届く荷物をうけとらねばならない + その他あれこれなので …… 1710 研究室発． 買いもの． 1730 帰宅．
• ただちに家をとびだす． 1740 自宅発 ミニ大通公園 走． 1820 帰宅． 体重 70.4 kg．
• で， 1830 以降にとどく荷物にそなえつつ， 晩飯の準備． 一人なので簡単な晩飯．
• 晩飯くってもとどかないので洗濯．
• 1930 すぎ， 北区から中央区までおっかけてきた (?) らでぃっしゅぼーやの野菜ダンボール箱がとどいた．
• ハコをあけると野菜があふれてたので， さっそく料理にとりくむ． とりあえずいちばん威嚇効果の高かったダイコンの葉は ただちにきざんでしまって ……
• とゆーかんぢで隔週でとどく野菜箱との戦いの日々が再開された．
• Google 日本語入力の 開発まんが がおもしろい．
• [今日の運動]
  • ミニ大通公園 走 40 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0740): 米 0.6 合． ダイコン・イカの煮物． キャベツ・ミズナ・ネギ・ハムのサラダ．
  • 昼 (1210): 研究室． 食パン． バナナ． リンゴ．
  • 晩 (1910): 米 0.6 合． ネギ・卵の炒めもの． キャベツ・ミズナ・ネギ・ハムのサラダ．

2010 年 09 月 30 日 (木)

• 0730 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー． 0840 自宅発． 晴． 0900 研究室着．
• うーむ， なんか岩波本作業もーどが起動しない ……
• うーむ， 来週の月曜日あさはやくから じゅぎょー 開始なんだけど， 準備が ……
• よーやく 10 時すぎに 岩波統計モデル本 作業に着手． 第 6 章 GLM 最後の栄光章の修正のつづき．
• だめだまたふりーづした …… 自分が．
• ぼちぼちと作業ススめる． 9 月も今日でおわりか． うー
• うー， ないちにち
• 第 6 章のカウントデータあつかう統計モデルの部分の修正は， まあひととーりできた． 残りは正規分布・ガンマ分布のかんたん説明， 残り 5-6 ペイジなのだが …… 時刻はすでに 17 時すぎ．

• そしてこれら連続値な確率分布の図も修正が必要． うー
• どうもばててきて能率が悪いので， 研究室からは撤収することに． 本日の岩波本修正作業， 全 265 ペイジ (修正前のペイジ数) 中の 133 ペイジまで終了 …… よーやく半分か．
• 1730 研究室発． 1750 帰宅． 晩飯の準備． 米をあらって， 鶏肉を塩・コショウ・バジル・すりおろしニンニク・ワインにつける．
• 1820 自宅発 ミニ大通公園 走． 1900 帰宅． 体重 70.4 kg．
• 晩飯の準備のつづき． 晩飯．
• 夜はばてたので， ぎょーむススまず．
• [今日の運動]
  • ミニ大通公園 走 40 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0750): 米 0.6 合． ダイコン・ネギ・豚肉の味噌汁． ダイコンの葉・ピーマン・シラスボシの炒めもの．
  • 昼 (1200): 研究室． 食パン． リンゴ．
  • 晩 (1950): 米 0.8 合． ダイコン・ネギ・豚肉の味噌汁． 鶏胸肉のグリル， タマネギ・トマト・ニンニクのソース． コマツナのバター炒め． ジャガイモ電磁波蒸し．