library(coda)
の
mcmc.list
オブジェクトに計算結果を chain ごとに格納すれば
(一昨日のアレ)，
これを plot()
するだけで chain ごとの遷移がわかる!
bugs()
が返す
bugs
オブジェクト中には
last.values
というデータも含まれていて，
これを使えば「つづきの計算」とかもできそう
……
といったご教示も．
こちらに転載してもよいとのことなので，
岡村さんの
bugs
オブエジェクトメモの一部を
bugs() の返り値
に掲載．
Wade, Paul R. 2000.
Bayesian Methods in Conservation Biology.
Conservation Biology 14: 1308-1316.
(url)
すでに 2000 年時点で Bayesian が保全生物学まわりで議論されていたとは!
Latimer, A. M., S. Wu, A. E. Gelfand and J. A. Silander, Jr.
2006.
Building statistical models to analyze species distributions.
Ecological Applications 16: 33-50.
あたりがいいんでは，
という気がする．
著者のひとり
John Silander さんのペイジ
からもダウンロードできる．
k2dt <- function(r, p.a, p.b)
{
(p.b - 1) / (pi * p.a^2) * (1 + r^2 / p.a^2)^(-p.b)
}
density.2dt <- function(r, p.a, p.b) k2dt(r, p.a, p.b) * r * 2 * pi
w.2dt <- function(r, p.a, p.b) density.2dt(r, p.a, p.b) * r
print(
integrate(
#density.2dt,
w.2dt,
lower = 0.0,
upper = Inf,
subdivision = 200,
p.a = 13.6,
p.b = 1.6
)
)
期待値は 77?
まあ，
スソの長い分布だからねえ．
下の図は density.2dt()
(上のコードで定義されている)．
Norby, R.J., K. OGLE, P.S. Curtis, F.-W. Badeck, A. Huth, G.C. Hurtt, T.
Kohyama, J. Peñuelas. (2001) Aboveground growth and competition in forest
gap models: an analysis for studies of climatic change. Climatic Change
51:415-447.
まあ，
おたがい面識はまったくないだろうけど．
Hierarchical Bayesian analysis of specific leaf area for
300+ tree species in the United States
なるこれまた素敵にスっとんだハナシをされたようで．
まだ論文になってないみたいだけど，
おそらく
publications
にある Tree Physiology 投稿中の論文がそれにあたるのだろうか
(2005 年 ESA 大会口頭発表にそれらしき
要旨
が)．
そして，
この研究の共著者はよりにもよって，
またしても「あの」 Pacala 先生，
ですか
……
財務部経理課より通知がありましたのでお知らせします。 平成１９年１月４日より、１０万円を超える現金を振込む場合には 金融機関での本人確認が必要となります。 入学料や授業料を振込む場合についても同様の扱いとなりますので 指導する学生へ周知方よろしくお願い致します。 特に留学生の方におかれましては、外国人登録証明書等の確認書類が 必要になりますので留意願います。 ※本人確認書類とは以下のような公的な書類に限られます。 ・運転免許証 ・健康保険証 ・国民年金手帳 ・旅券（パスポート） ・母子手帳 ・身体障害者手帳 ・外国人登録証明書 ----------------------------------------------------------------------------- 入学料・授業料などの振込みにあたって 入学料・授業料などを金融機関で振込む際には、本人確認書類をご用意ください！ ＊運転免許証＊健康保険証＊パスポート＊外国人登録証明書など * 平成１９年１月４日から、本人確認手続きに関する法令の改正*により、金融機関 において１０万円を超える現金の振込みを行う場合には、本人確認書類の提示が必 要となります。 （ＡＴＭでは１０万円を超える現金の振込みができません） * １０万円を超える入学料・授業料などの現金振込みの際には、 指定の振込用紙と ともに、振込みの手続きを行う本人確認書類（運転免許証、健康保険証、パスポー ト、外国人登録証明書など）をご用意のうえ、金融機関の窓口をご利用ください。 ＊マネー・ローンダリング、テロ資金対策のための国際的な要請を受けて行われたも のです。 ★本人確認書類の提示がない場合には、金融機関では、１０万円を超える現金による 入学料・授業料などの振込みができません。 ★保護者の方などが、振込名義人（受験生・入学者など）に代わって振込みの手続き を行う場合には、金融機関では、振込みの目的（入学料・授業料などであること） をお尋ねすることがあります。 ★詳しくは、振込みを依頼する金融機関にお問い合わせください。 -----------------------------------------------------------------------------
rsync
するところでつまずく．
symbolic link まわり
……
USB メモリのファイルシステム，
vfat
ではダメで
ext2
にせんといかん．