ぎょーむ日誌 2009-05-24

2009 年 05 月 24 日 (日)

• 0840 起床． 朝飯． コーヒー． 洗濯． 怠業． 1040 自宅発． 曇． 1100 研究室着．
• 昨日列挙してみた「放置」案件のうち， とりあえず他人の人事にかかわる放置事務書類かき …… うだうだと能率わるく進捗させたので， 2 時間ほど費やしてしまった．
• 昼飯． ひと月後ぐらいにせまった A 棟耐震工事疎開ひっこしが気になるので， お茶部屋においてた Nature バックナンバーをヒモでくくって 廃棄できるようにする． これからは毎日のようにゴミすて作業をしないといけないような気もする．
• 作業テイブルの脚がぐらついていたので， モンキーレンチでボルトをしめなおしてみる． そうか， このテイブルは解体できるのか， とまたひっこし作業について考えてしまう．
• 次． 放置データ解析である Alpinia 結実． 先週， R で自動データ点検やって入力まちがいと思われる箇所を いくつかみつけて， 発注者に「おかしいんぢゃない?」 とお尋ねしたところ， やはりまちがいだったとわかった．
• で， さっさとまちがいを修正して計算やりなおせばよかったのだが …… まあ， なンともやる気がでなくて放置していた次第．
• CSV ファイルをひねくってデータ修正 (われながらザツだなぁ)． データ変換プログラムを修正して「結実数ゼロの果実」 に対処できるようにする (じつはここでしくじって， このあと一時間ぶんの計算がムダになった)．
• ところで， 先日 cairo R を作った， といったハナシをしたけど， X11(type = "cairo") は X11(type = "Xlib") に比べてかなり描画速度が遅いような気がする． $HOME/.Rprofile は grDevices::X11.options(type = "Xlib") と設定しておいて (cairo が使えれば type は自動的にそちらを使ってしまう)， 必要なときだけ cairo したほうがよいかも．
• うーむ， library(Cairo) の CairoX11() は多少速い (?) ような気がする．
• で， 個体差と個花差が 「ホントに個体群なのか?」 と思えるほどに絶望的にばらばらなデータなので， 絶望的に計算時間が長くなってしまう階層ベイズモデルの推定やりなおし．

[個体差・個花差]

あとからみつけやすい場所に図メモ． 全データの PDF ファイル．

• で， 絶望的に長い計算時間はとっとと別のぎょーむに取りくめばよいのだが …… またぎょーむ日誌の atom.xml を改良するとゆーどうでもよいプログラミングにはまってしまった． 本日は各えんとりーの <updated>2009-05-24T16:26:40+09:00</updated> タグを改善する， といった案件で …… 自分で構築したシステム (ヒトことで言えば，テキストベイスのデータベイス) なんだけど， このあたり不必要に複雑ぎみなので 改良作業にも時間がかかる．
• Alpinia 再計算の結果でた． データ修正個所が多くなかったせいか， 推定結果 は 以前 とほぼ同じ， と．
• 1830 研究室発． ちょっとうろうろ散歩． 晩飯． 2030 帰宅．
• Alpinia したうけ， 一段落したと思ったら論文かけ指示がでてがっくり． どんどん「論文修正しろ」「論文かけ」 が堆積していく ……
• [今日の運動]
  • なかなかうんどう再開できない日々がつづく ……
• [今日の食卓]
  • 朝 (0920): 食パン． ニンジン・ニラ・卵の炒めもの．
  • 昼 (1330): 研究室お茶部屋． 食パン． ワカメスープ． リンゴ．
  • 晩 (1930): 心 のスープカレー．