ぎょーむ日誌 2008-05-30

2008 年 05 月 30 日 (金)

• 0740 起床． ねむい． 朝飯． コーヒー． 0930 自宅発． 晴． 0945 研究室着．
• そういや， 昨日でいったんは作業にひと区切りのついたアリ作文， 「そもそも supercolony なんて概念はどうでもいいコトなんだ」 てなことをはっきりとは書いてなかったな． まあ， それにちかいことは書いてるからいいか．
• うーむ， X 上のターミナル選定にはまってしまった．
  • kterm: 基本的に良いのだけどあまりにも古く， さすがに現代的な terminal のほうがあれこれ便利なかんぢで …… 最近はとくにつかわないようにしている
  • rxvt: 上とおなじ
  • gnome-terminal: いまいち気に入らないんだけど， まあなんとなく「現代の標準的な」というかんぢがするので なんとなく使っている …… 常時ひらいてる 2 枚のうち 1 枚
  • mlterm: gnome-terminal にくらべるとイヤなかんじが少なく， なかなかよいのだが …… いかんせん scim-canna というヘンてこなシステムとびみょーに相性がよくない (変換候補一覧がでない) …… さらにどうでもよいことだがなぜかしら WindowMaker ともびみょーに ……
  • Terminal: 本日から使いはじめた xfce の標準ターミナル， いろいろまにあっくな使いかたがあるみたいだけど 私はふつーに使うことに， …… 常時ひらいてる 2 枚のうち 1 枚
  ということで scim-canna で問題がない gnome-terminal と Terminal を併用してる状態．
• そうそう， 長年の Linux 使いでもあるにもかかわらず， 今まで使っていなかった GNU screen を最近はぽちぽちと使いはじめている．
• おっと， ちょっと脱力脱線ぎみだな …… えーと， 現在位置を確認してみると， 5/16 の状況 からの変化と現時点で処分できる・処分すべき順番を考えると， こんなかんぢか?
  • 学内雑用: 研究室紹介ぽすたーの生成・印刷
  • 3 月の R 自由集会の記事かき …… 6 月末しめきりだけど， 私の分担部分はさっさと書くのがよさそう
  • 事務書類かき: 学内研究費申請書 (6/4)
  • 帯広開花モデリング (5 月中?) …… 6 月にずれこみそう
  • アリ論文原稿をさっさとかたづけて脱アリしたいよー …… 作業再開は 6/9 (月) 以降のハズ
  それから， 脱アリ後 (投稿できた時点でとりあえずの脱アリということにしよう) の着手になってしまうと思うんだけど， エゾアカヤマアリにつづく 「おもしろそうなデータなのに闇にほうむられそうな 地環研修士論文さるべいじ作戦」 第二段たる屋久島葉寿命データ解析の論文化に着手できれば， と考えている． うーむ， 考えてみると牛原さんは 2006 年 3 月卒業だ．
• きぶん転換にポスターはりかえ．

[アリポスターは廊下に]

2008 年 3 月の生態学会福岡大会でつかったもの (要旨)． その横は 2006 年 3 月新潟大会で発表した母子里ダケカンバ 三次元 Gibbs 樹冠モデル． これはよーやく， つい先日 Agricultural and Forest Meteorology の online 版がでた． 印刷版はまだ．

[屋久島ポスターは室内に]

2007 年 3 月の松山大会でつかったもの (要旨)． うーむ， さっさと論文化しなくては ……

• ということで， 研究室紹介ぽすたー作業． 院生のみなさんの尽力で今朝になって必要な材料はでそろった． とりあえず Web 版 を生成．
• perl + LaTeX なポスター生成のしかけをいじくって， Web 版 と対応する PDF ポスター版も生成してみる． こんなところか? とりあえずメイリングリストで皆さんに 「どうでしょう?」 メイルを．

• うーむ， タテヨコの余白が気になるが …… まあ印刷のときに工夫すればいいのかな? 情報基盤センターの大判プリンターも だんだん使いこなせるようになってきたので， なんとかなるのでしょう．
• 印刷は月曜日あたりにやることにして， それまでポスター問題は放置． 昼飯．
• うーむ …… 重点配分経費・研究支援事業なるモノに応募しようかと思っていたのだが， 昨年度採択 ぶんをみると当方が考えてる研究費よりヒトけた多すぎる． 20-30 万円ぐらいで十分なんだけどな． 書類には 100 万円限度 30 件とか書いてあるけど …… 現実には「少額ばらまき」型ではなさそう． まあ， ぜんぜん「戦略的」でもない研究課題でだすことになりそうだから， これはヤメときますか．
• 他にも応募しやすそうなモノとしては， 住友財団 の基礎科学研究助成・環境研究助成ってのもあるけど， これまた最低でも 50 万円ぐらいか． 50 万ねえ． 計算機はそんなに買う必要ないだろうし (とゆーか管理コストを考えると不要な計算機は買いたくない)， 研究室内の周辺機器もひととおりそろってはいる …… ああ， プリンターの中で溶けるように消失していく高額なるトナー代なんかは 一部分担するべきなんだろうねえ． A 棟 7-8 F あわせて年間かるく 30 万円以上かかってるんだろうなぁ．
• いろいろ出張ででかけてみるのも何かの勉強になるのかもしれないけど， 「出張」というと またまた新しい下うけ計算なんかがどかっとのしかかってくるような恐怖感があって， ですね． これまたおそろしいともうしますか ……
• うーむ， いまやりたいことって 「新しいぷろじぇくと」 ではなく「さるべいじ」というかまあ借金返済みたいなことなんだよねえ． 屋久島葉寿命のハナシは一年以上放置してるしなぁ． 宿題といえば他にも ……
• ふと思いついたんだけど， 宿題消化かつ「新しい研究課題」っぽいことを両立できるようなハナシとして， 苫小牧樹木直径データのベイズモデル化， ってのはありうるなぁ． これは鍋嶋さん・日浦さんとススめてきて現在は GLMM 版を投稿中なんだけど． じつはこの巨大なる時系列個体データセットのごく一部を使ってるだけだし， まだまだモデリングには改良すべき点が多々あるわけだし， 「WinBUGS でちょいと計算」ではすまされない ぐらいの難しさはあるわけだし (というかホントはかなり難しい問題が山積)， ハナシはわかりやすいし， かんきょー love なヒトたちにもウケはよいだろうし …… まあ難点は 「どんなに統計モデリングを工夫しても推定計算がまったくうまくいかない」 かもしれない， といった危惧があるぐらいだろう． 時系列モノ， 気象モノはしんどいからねえ．
• これを住友 (6/30 締切) にだすか， それとも秋の科研費書類かきに使うか …… まあ， もうちょっと放置することにしてみるか．
• 現時点では甲山さんの熱帯林科研費の分担者なんだけど， ここは私以外のヒトたちはぢゃんぢゃんお金を使いそうだし， またうっかり使うと悪夢のごとき熱帯林計算なんかを押しつけられそうだし …… いや， 使おうが使うまいがなんだか押しつけられるような気がしてきた．
• ともあれ， しばらく放置ということで． いまの時点ではおカネはまったく必要ではない．
• お， R-help の ``Including a tilde in a plotmath-type call'' なる質問に対してに対して Ripley 御大がなかなか興味ぶかい回答を． なるほど expression() の中で symbol() なる関数を使えるんだ．

I think what you are asking for is not a tilde.  That is a raised symbol
(an accent), and not as in TeX's $\sim$ .  It is character 126 in the Adobe
Symbol encoding (Adobe's name is '\similar'), so one way is

expression(X*symbol("\176")*N(mu, sigma^2))

There are others, and in most circumstances

expression(X * "~" * N(mu, sigma^2))

will work.

• さてさて， 次なる時限爆弾， 3 月の生態学会福岡大会の R 自由集会 の紹介記事を書かねばならぬハナシ． 生態学会誌掲載， 6 ペイジ (1 ペイジあたりの字数はおよそ 2000 字，ただし図表こみ)． 粕谷さん・竹中さんにもちょっと書いていただく予定なのだが …… ともかく， まずは 全体のわくぐみみたいな部分を私が準備しなければならない， と．
• えーと， 投稿規定は これ か． 区分は「学術情報」． 生態学会誌には二年ほど前にも「学術情報」とやらで GLMM 解説記事 とか書いたんだけど， なんだかあれこれめんどうなんだよねえ．
• まあそのときの LaTeX file 一式や原稿 PDF ファイル生成のしくみをまた流用すればいいや， と作業にとりくんでみたのだが ……
• あまりススまず撤退． 1915 研究室発． 1930 帰宅．
• 1950 自宅発北大構内走． 2045 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯．
• [今日の運動]
  • 北大構内走 55 分間． ストレッチ．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0800): 米麦 0.6 合． 麻婆豆腐．
  • 昼 (1330): 研究室お茶部屋． 米麦 0.6 合． ワカメスープ． キャベツ・ニンジン・ネギ・ミズナのサラダ．
  • 晩 (2230): 米麦 0.7 合． ビーフシチュー．