ぎょーむ日誌 2006-08-26
2006 年 08 月 26 日 (土)
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0750 起床.
朝飯.
コーヒー.
洗濯.
怠業.
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駒場シンポジウム
が終わってから,
というのがマヌケなんだが,
ともかく終わってから
「ベイズな手法
の説明」
の手順みたいなのについて考えてみる.
抽象的なハナシをきいて自分で具体例を作れるヒトは
私の話など聞かなくても自分でどんどん勉強ススめるだろうから,
そちらは考慮しなくてよい.
ということで,
具体例を示しつつ説明する場合だけを検討すればよいわけで,
と.
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まあ上のような「手法間の関係を説明してるつもりの概念モデル」
を掲げつつハナシをするのであれば,
一般化線形混合モデル
(GLMM
--- これは経験ベイズ法の一種)
で解決するんだけど,
あえて
MCMC 計算で推定するとどうなるでしょう,
利害得失はこうです,
といったナガレがよいのかもしれんな.
この段階ですでに階層ベイズモデル (hierarchical Bayes model)
の考えかたが入ってくる.
屋久島データ解析みたいな
「多樹種各少標本数みたいな状況で便利だ」
という階層ベイズモデルの応用は「そうだそうだ」とウケてたみたいなんだけど,
これは
「少し独自の工夫 (「樹種」があたかも random effects) + 階層ベイズモデル」
の両方を同時に説明せんといかんので
二番目か三番目ぐらいに説明したほうがよいかもね,
と.
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で
母子里林冠モデル
みたいな
空間構造あり統計モデル
で Bayes とか MCMC
がたいへん重要,
というハナシは
……
これはけっこう難しそうなんで,
ずっとあとまわしにすべきかもしれんね.
空間な問題は図にしやすい点は良いのだけど,
「空間的なパターンに関する Gibbs 分布」
ってのは
……
そういうふうに考えたことないヒトのアタマに浸透するまでに,
いくばくかの時間が必要とされるのだろう
(これはむしろ抽象化というか,
サイズの小さい格子空間などごく単純化したモデルで説明するべきか).
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Gibbs 点過程による,
例えば個体間の反発によって電線上にほぼ等間隔にならぶ鳥の配置を
MCMC 計算で生成しました,
という順問題というかパターン生成の問題はまだわかりやすいだろう
(MCMC の説明にもよい).
これとは逆に,
観測されたパターンが Gibbs 分布からのランダムサンプルである,
と仮定したときにその相互作用パラメーターなどを推定せよ,
という逆問題つまりパラメーター推定なんかは説明が難しいよね.
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1130 自宅発北大構内走.
晴.
太陽に照らされながら走ってると,
アタマの中は (暑いところを好む昆虫である) アリに関するモデリングあれこれ,
もこもことわいたり縮んだり.
1235 帰宅.
体重 73.6kg.
昼飯.
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すぐ隣の北 12 条生協で買いもの.
外は暑い
……
とネット上でアメダスみてみると
……
札幌
29°C
ぐらい.
あらら,
東京
27°C
に「負けて」いる.
悔しいので (まったくアテにならぬ) 週間天気予報みて
「やっぱり中長期的には札幌の勝ちだな」
と溜飲をさげてみる試み.
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1430 自宅発.
晴.
1445 研究室着.
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明朝 8 時からの停電にそなえて shutdown 準備.
研究室の Unix 機と MacOS X 機に
ssh
で login して
at 07:50AM
と次の午前 7 時 50 分すなわち明日に次のことをせよ,
と指示する.
これは対話形式でプロンプトがでるので
(MacOS X ではでないけど)
/sbin/shutdown -h now
と指示して Ctrl+d でぬける.
ゐんどーづ機は
……
めんどうだから放置しようかな.
停電しょっくにどれだけ耐えられるか実験,
とか.
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といったところから,
いくつかのネット雑用に埋没.
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1750 研究室発.
本日は苫小牧ボスこと鍋嶋さんの就職祝い
(東京農工大)
&
送別会で北 11 西 3
ひだまり庭
に集合.
とても楽しい集まりになりました.
いやー,
鍋嶋さんて世間で「典型的な」と思われそうな
(しかし少なくとも生態学分野まわりではめったに実在しない)
「理系」女性研究者だよなあ,
と苫小牧ボスの一奴隷たる私は感銘をうけるのであった.
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支払い.
幹事大学院生殿 (A 棟 8F における圧倒的多数派つまり支配者カースト性別がわ)
からの「他の三人の教官にはこれだけいただいたんですけど!」
すなわちぼやぼやしてないでさっさと支払いやがれ命令に
「すみません今日はこれでかんべんしてください」
と手持ちの 1000 円札をすべてわたしてその場は無事にきりぬけた.
2240 帰宅.
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[今日の運動]
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[今日の食卓]
- 朝 (0830):
食パン.
- 昼 (1310):
米麦 0.5 合.
ワカメ飯.
タマネギサラダ.
- 晩 (1810):
ひだまり庭.