ぎょーむ日誌 2005-12-07

2005 年 12 月 07 日 (水)

• 0900 起床． いやはや． 朝飯． コーヒー． 1000 自宅発． 晴． 1015 研究室着．
• イヤなことを先にすませる． わーどファイルなんぞで送られてきた 自由集会 要旨集原稿書式を OpenOffice.org で解毒してテキストファイルにする． 内容うめて， とりあえず自由集会関係者の皆様に「これでいいですか」送信．
• R の library(grid) グラフィック環境ぷろぐらみんぐのつづき． grid では「わく (viewport())」を押しこむ (push)・ぬける (pop) を繰りかえして「階層的」に作図していく (RjpWiki 内の grid 事始 も参照)．

  grid.newpage() # 新しい grid page
  pushViewport(viewport( # 一番外のわくを準備，これは 2x2 に分割されている
  	x = 0.5, y = 0.5,
  	h = 1, w = 1,
  	layout = grid.layout(2, 2)
  ))
  	for (i in 1:nrow(df.grid)) { # 2x2 のわくのひとつひとつに
  		plot.each(           # 2x1 に分割された図を押しこんでいく
  			name.parameter = p.fixed[i],
  			col = df.grid[i, 1],
  			row = df.grid[i, 2]
  		) # (注: ``plot.each(...)'' は久保の自作関数)
  	}
  popViewport() # 一番外のわくからぬける
  

  これを実行すると， たとえば下のような図がえられる (昨日の 2x2 図は ImageMagick の montage コマンドではりあわせたもの)．

• ところで， 新緑期の伸長が終わったあとに (芽鱗痕のこしつつ) 夏以降にシュートが伸びる現象である 「二度のび」あるいは「土用のび」の英語呼称は何か， という問題． 甲山さんにお尋ねしてみると ``Lammas shoot'' がそうやって伸長してできたシュートの呼びかた， とのこと． Lammas はイギリスの収穫祭 (8/1?) みたいなものらしい．
  • 岩波の生物学辞典では Lammas shoot の訳語として 「土用芽」があてられている．
  • lammas shoot といった小文字表記もよくある．
  • (甲山さんに教えてもらった本) Kramer and Kozlowski (1979) ``Physiology of Woody Plants'' の ``Abnormal Late-Season Shoots'' 節 (p.73) によると， an abnormal late-season burst of shoot growth にはどういったものがあるかというと，
    1. lammas shoot: 頂芽の伸長によって形成
    2. proleptic shoot (岩波生物学辞典では「先発枝」): (頂芽の基部にある?) 休眠していた側芽の伸長によって形成
       (これに対して休眠しない側芽が作るのは 同時枝 sylleptic shoot)
    ただし Kozlowski のさらに古い本では sylleptic も abnormal late-season shoots に含まれてしまっている．
  • 甲山さんによると …… たとえば Abies なんかの側枝の芽なんかも proleptic ということになる． 側枝の茅も 形態学的には頂芽と同時に形成され， 「休眠」したまま頂芽の伸長によって位置を移動し， 翌年になって資源が分配されて側枝形成をはじめるから．
  • 検索してみると ``lammas growth'' といった使われかたが見つかる． たぶんこう呼称してもいいのだろう．
    (ただし lammas growth は「頂芽」の成長だけ， と限定し proleptic/sylleptic と区別するかどうかは使う人に依存してるようだ)
  • あとで長谷川さんに教えてもらったところでは， ``secondary elongation'' という呼びかたも (third, fourth, ... とつづく?) つかわれている． 鈴木牧さんの AOB 論文 では ``lammas elongation''．
  で， 牛原さんにお尋ねしてみると， 屋久島シュートデータの「二度伸び」は頂芽のもあるし， そうでないのもある， とのこと． まあ， おおざっぱに ``lammas'' でいいか．
• 昼飯．
• 屋久島シュートべいづモデル MCMC 計算プログラム (in Perl) とその作図プログラム (in R) 内の ``duplication'' を ``lammas'' にとりあえず変更してみたり．
• 1530 から 1740 ごろまで． 牛原さんに屋久島シュート休眠の階層ベイズモデル & その MCMC 計算法の解説． このあたり， こういうシュート伸長休眠問題みたいな簡単な実例に密着して 具体的に説明していくのであれば， ぢつはぜんぜん難しいハナシではない． ただし， 表面的には， というのも注記すべきなんだろうけど．
• 自由集会， 要旨集用の原稿をだしてしまう．
• 1835 研究室発． 1850 帰宅． 洗濯 …… これのために本日は早めの帰宅． いやー， ズボンのひざの部分がさけてしまって， ろーていしょんやりくりが ……
• 2040 自宅発北大構内走． 2125 帰宅． 体重 73.2kg． 晩飯．
• [今日の運動]
  • 北大構内走 45 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0930): 米麦 0.7 合． ナバナあえもの．
  • 昼 (1250): 研究室お茶部屋． 米麦 0.5 合． ネギ卵炒飯． ナバナあえもの．
  • 晩 (2210): 米麦 0.7 合． ハクサイ・セロリ・ピーマン・ショウガ・タコの炒めもの． ナバナあえもの．