ぎょーむ日誌 2013-12-(01-10)

2013 年 12 月 01 日 (日)

• とら泣きはなかったんだけど， のどが痛くて 3 時ごろに一度おきた． 風邪がなかなかなおらない．
• 0640 起床． とらめし． 朝飯．
• 体調はいまいち． クスリをのむと症状が緩和されるわけだが …… まあ， とりあえず服用． 体温は 37.8℃とか?
• とりあえず大学で休むことに． 家にいると， とら坊と遊んでしまう (ようにあやつられてしまう) からね ……
• ということで， 静かに読書など． ちょっとぎょーむ関係をやる気力はない ……
• 夕方． 体温は 37.2℃． なかなか 37℃未満にならない ……
• 1750 帰宅． 晩飯の準備． とらめし． 晩飯．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0730): らでぃっしゅぼーやのパン． ブロッコリー・ニンジンのサラダ．
  • 昼 (1200): 研究室． こんびにサンドイッチ．
  • 晩 (1900): らでぃっしゅぼーやのパン． ジャガイモ・ニンジン・ブロッコリー・ソーセイジ・チーズの蒸し鍋．

2013 年 12 月 02 日 (月)

• 口の中がすごくかわいて 0520 起床． まだ風邪がなおってないのか? …… いや， 加湿器が止まっているのが原因だな． とらもほぼ同時に起きる …… ドライとらになっているのかな? 親子ともども水分補給． とらはまた寝かしつける．
• もう 6 時ちかいので， 朝飯・弁当の準備． 朝飯． 体温 36.9 ℃． コーヒー． とらめし． 0820 自宅発． 曇天． 0830 保育所着． 0910 研究室着．
• いまいちやみあがりなかんじ ……
• Jordan さんのデータ解析こんさる． 教えることあれば， (非意図的であっても) 教わることあり． glmmML() はデータの欠測にヨワい． たぶん， 応答変数・説明変数のどちらか一方でも NA があればダメなのだろう．
• 昼飯．
• うーむ進捗よくない ……
• とりあえず， また北大生協の中央食堂に逃げてみる．
• その前に， 理学部博物館玄関にある郵便ポストに郵便物を投函． 学内には少なくともあと二つ (正門近くと工学部玄関) に郵便ポストがある．
• 中央食堂で根の論文原稿よみのつづき ……
• モデルの部分は (よーやくにして) 読解できたのだが …… これはけっこうたいへんなものだな．
• ところで実験方法せつめいセクションをよむと， あたかも 1 個体を 1 培地で育てたという記述 (とも読める) なのだが …… そうするとパラメーター数が過剰じゃない?
• アタマがぐらぐら …… しかも風邪回復途上のカラダだと， この中央食堂は結構寒い．
• どこか無線 LAN 接続できる温かいところは …… 北大図書館本館に行ってみるか．
• 結論だけ書くと， 北大図書館のほうがずっと温かい． そして 2F のおーぷんすぺーすとやらは， 学生さんたちが 100 人以上いるせいなのか， eduroam 無線 LAN がまったく接続できない ……
• 3F 開架閲覧室にも eduroam あるようだ …… おお， ここだとすぱっと接続できた．
• で， 過去メイルを検索してみると …… おお， 1 培地に 5-7 個体でしたか! この実験方法がよいのかどうか私にはわかりませんが， とりあえず統計モデル的には問題なしですな．
• などとやっているうちに帰宅すべき時刻に …… 1710 図書館発． 買いもの． 保育所でとら回収． 1750 帰宅． 晩飯の準備． とらめし． 晩飯．
• だめだ， カゼの症状が再発してきて， かなりしんどい ……
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． タマネギ・油揚げの味噌汁．
  • 昼 (1130): 研究室． 米 0.5 合． ソーセイジ． ジャガイモ． ニンジン．
  • 晩 (1900): 米 0.5 合． ジャガイモ・ニンジン・タマネギ・豚肉のカレー．

2013 年 12 月 03 日 (火)

• 昨晩，寝る前の体温は 38.4 ℃ぐらい．
• 0520 ごろ， ノドがかわいたとら坊の泣きおき． キッチンにだっこしていって，ミルクごくごく …… とらダンスで寝かしつけ． ともかく， 風邪だろうが筋肉痛だろうがおかまいなし
• 0600 起床． だめだ依然として体温 38.5 ℃とかだ． かんたん朝飯． コーヒー． 朝飯の準備． とらめし．
• 今日はひとりで自宅発． もよりの「朝からやっている医院」 に行ってみたのだが …… やっぱり， むちゃくちゃにこんでいる．
• どーにもしんどいので， JR バスにのって札幌駅へ． 近距離バスは札幌いや北海道ではあまり人気のない移動手段なんだけど， 通勤時間なのでこんでいる． バスに乗るのはすごくひさしぶりだ …… 運賃しはらいは， まずバーコードつき整理券を投下し， その後に (札幌市公共交通機関に共通する) ウィズユーカード をスロットに入れればよい．
• JR 札幌駅の薬屋は (他の店もそうだけど) 8 時から開店しているので， 店員さんおすすめのカゼ薬を購入 …… けっきょく医者にかかっても， 対処療法的な薬物しかでないのではないかなあ， ということで．
• 研究室の中であまり体力を消耗しないよう， ぐったりしてみる．
• 1030 から 研究室セミナー， 担当は釜野さんでサロベツ湿原テフラまき実験 (2000 年ごろ実施) の追跡調査についての報告 …… 釜野さん自身はソツがないヒトなのだが， この大昔に開始された実験とその現状は， あまりわかりやすいものではなかった． 全 60 plot が 21 m × 12 m の狭い範囲におしこめられているので， 空間相関とかも気になるところ．
• かんたん昼飯． 体温はいぜんとして 38.2℃とか．
• 快適な中央図書館に逃げようかな ……
• 図書館で文献よみ．
• 16 時から Tika さんの予備審．
• 終了． 体温 36.7℃ …… しかし， アタマはちょっとふらふらしている． 1710 研究室発． しんどいので北 5 西 10 からバスにのる …… 札幌市の重要な幹線道路なんだけど， バスは一時間に 2 本ぐらい． たまたままにあった (帰宅時間帯の自家用車混雑のおかげで)．
• 10 分ほどバスにのって北 5 西 17 でおりる． 1750 帰宅． とらめし． 晩飯．
• いつまでたってもかぜがなおらないので， さっさとねる ……
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． タマネギ・油揚の味噌汁．
  • 昼 (1230): 研究室． パンオレ．
  • 晩 (1900): 米 0.5 合． カレー．

2013 年 12 月 04 日 (水)

• 0600 起床． 朝飯・弁当の準備． とらめし． 朝飯． コーヒー． とらおんぶして， 0820 自宅発． 曇天． 0830 保育所着． ひよこ組のみんなは朝から元気だ …… 0900 研究室着．
• 熱はさがったけど， アタマがいまいちぼーっとしている．
• 昼飯．
• 訪花昆虫のデータ解析こんさる …… 時系列なデータでけっこう難しい …… 今日も「data.frame をどう操作すればよいか」 「適切な作図法をみつけるにはどうしたらよいか」 といったことのコーチング．
• うーむ， やはり熱があがった． 37.4℃．
• 1700 研究室発． 保育所でとら回収． 1740 帰宅． とらめし． 晩飯．
• 20 時すぎにとらをねかしつけようとしたら …… だっこうろうろしているうちに， 当方の体温がどんどん上がって「冷却機構損傷?」 などと危惧したのだが …… とら坊ねたあとに体温はかったら 39 度こえてた． なかなかなおりませんなあ ……
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.3 合． 味噌汁．
  • 昼 (1130): 研究室． 米 0.3 合． カボチャ・鶏ひき肉の煮物．
  • 晩 (1900): 米 0.3 合． 味噌汁． ダイコン・鶏肉の煮物．

2013 年 12 月 05 日 (木)

• 0600 起床． どうもまだ風邪ぎみ状態がつづく． 朝飯・弁当の準備． 朝飯． コーヒー． とらめし． 0815 自宅発． 曇天． あ， アタマがぼけててとら連絡帳わすれた． 0825 保育所着． 0900 研究室着．
• 歩いて大学までたどりついたが， ちょっとしんどい．
• 帰りはバスにしようかな， 何かいい経路とかあるかな …… などといったことをいきなり調べはじめる． さっぽろえきバス， がんばっているけど， どーにもいまいちだね．
• この「なんともはや」な JR 北海道バス時刻表 のほうが入力の手間が少ないので， まだマシかも． 札幌市の地図がアタマに入ってないと使えない， という点では同じだけど．
• もそもそと昼飯．
• library(lattice) の barchart しつもん． たとえば， このような架空データ data05.csv といったファイルをよみこんで， 「つみあげぼうグラフ」とやらを書きたければ， 以下のようにできるだろう．

  > d <- read.csv("data05.csv")
  > head(d)
    x       y z
  1 A 1.58649 1
  2 A 5.01285 2
  3 A 1.24178 3
  4 A 0.88056 4
  5 A 4.06050 5
  6 A 3.66314 6
  > summary(d)
   x            y               z       
   A:10   Min.   :0.173   Min.   : 1.0  
   B:10   1st Qu.:0.521   1st Qu.: 3.0  
          Median :1.149   Median : 5.5  
          Mean   :1.740   Mean   : 5.5  
          3rd Qu.:2.029   3rd Qu.: 8.0  
          Max.   :5.762   Max.   :10.0 
  > library(lattice)
  > barchart(y ~ x, data = d, groups = z, stack = TRUE)
  

• それでは， この図の縦軸を「わりざん値」 (たとえば total が 100% になるように) 変更するといったことはできるのだろうか? Sarker の Lattice 本 (2008) だと Chapter 8 に何か記述がありそうなものだが …… 私が調べた範囲ではない． 軸のスケイルを変えるのは， scales = list(y = list(...)) といった指定になるはずなんだけど， 相対化するとかそういうオプションはない．
• ということで， どうしても「割算値ぼうグラフ」を描きたければ， 下記のように tapply() わざでも使うしかないだろう．

  > barchart(y / tapply(d$y, d$x, sum)[d$x]  ~ x, data = d, groups = z, stack = TRUE)
  

• ほかの「ぼうグラフ」関数もざっと見たけど， そういう「規格化」「割算値化」みたいなのはないなあ …… あえていえば， plot(xtabs) とかかな? (参照: 2012 年 ESJ 「分割表」自由集会の 投影資料 PDF) …… これはタテだけでなくヨコまで割算にするという意外な手法で， 情報を「すこしでも多く生き残らせている」うまい例．
• ともかく， R 作図機構の開発者たちとしては， 「わりざん値ぼうグラフはやめよう」 …… ということなのかもしれない．
• アイルランドの音楽家 (ホンモノ) であり Boids (鳥の群れの人工生命的モデリング) などに興味をもっているヒトからメイル． 次は樹冠とかの時間発展が森林生態系の diversity と productivity を変えていくようなテーマの作品を作りたいので， 久保の森林・樹木シミュレイターとかで何か良さそうなのはないか …… といった問い合わせ．
• 「樹冠とかの時間発展が森林生態系の diversity と productivity を変える」 という発想は興味ぶかいけど， 自分がやっているのはそこまでの要望に答えるものではない (樹冠構造をやや精密にした場合は一種だけのモデル， 複数種モデルにすると樹冠は単なる「たまっころ」) …… と当方ではあまりお役にたてそうにないですよと連絡してみた．
• 昼飯後はクスリのんでないけど体温は 36.9℃． しかし， このあととらだっことかすると急上昇するのかもな ……
• 1700 研究室発． 買いもの， 具体的にはとらおむつ． 保育所で「借金おむつ」を保育士さんに返済し， 「借金のかた」にとられていたとら坊を回収． 1750 帰宅． とらめし．
• しばらくとら坊と遊んで， 寝かしつけ …… 風邪がなおりきってなかったので， 時間がたつにつれて「体温の暴走的上昇」が体感される …… 20 分ぐらいでなんとかなった．
• しばらくぐったりやすんで， 晩飯．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.3 合． タマネギの味噌汁．
  • 昼 (1230): 研究室． 米 0.7 合． カボチャ・鶏ひき肉の煮物． ミニトマト．
  • 晩 (2040): 米 0.4 合． タマネギの味噌汁．

2013 年 12 月 06 日 (金)

• 0600 起床． 朝飯・弁当の準備． 朝飯． コーヒー． とらめし． 体温は 36.8℃とかなんかだけど， いまだになおっているかんじがしない …… 0815 自宅発． 曇天． 0825 保育所着． 0900 研究室着．
• うーむ， 進捗しないなあ …… 体温は 36.6℃．
• 昼飯 …… たべるとまた体温が上昇． まあ， ノド (というか耳?) の痛みがなくなってきたのは， ありがたいけど．
• 体温が 37.4-37.5 度あたりをうろうろ． うーむ ……
• どうもよくない …… 1700 研究室発． 保育所でとら坊を回収． 1750 帰宅． とらめし． 晩飯．
• とらねかしつけ， 自分の体温急上昇でちょっとふらふらしたけど， まあなんとかなった．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． 豆腐の味噌汁．
  • 昼 (1230): 研究室． 米 0.7 合． カレイ． ジャガイモ．
  • 晩 (1900): 米 0.5 合． 豆腐の味噌汁．

2013 年 12 月 07 日 (土)

• 夜中に何度かとら泣き? こっちもアタマがふらふらしていて， 何がなんだか ……
• 0620 起床． ほぼ平熱にもどっているはずだけど， 今朝もしんどいな． とらめし&朝飯の準備． 朝飯． コーヒー．
• とら担な保育士 …… どうもとらアタマがこんらんぎみだなぁ …… これはもしやと考えて， エルゴおんぶしてみると， すぐにばたっと寝てしまった． 「平日の保育所づかれ」 なのかねえ …… 1.5 時間ほど寝る．
• 11 時すぎにとらめし準備． とらめし． すごくぱくぱく食べる．
• 1230 自宅発． 地下鉄でひと駅， 耳鼻科着． 午後の診療の受付開始 15 分前に診察券をハコに投入できたのだが …… 私のひとつ前のひと組， 家族 3 人が全員受診するという意外なグループで， 診察・会計処理・薬局でのクスリうけとりに 3 倍の待ち時間を要してしまう， という不運な状況になってしまった．
• とら坊， 左右鼓膜チューブに問題なし． これで年内はのりきれるかな?
• 帰宅する前に， 西 11 丁目ふきんとかをうろうろしてみる．

[ふぉーまるではないケイブル]

(後述する) 区民センターの北側に， 二階建てのわりと大きな「百均」があるんだけど， そこで iOS device 用の「旧型」ケイブルを買ってみた …… というのも， とらちゃんが一本「なめて」だめにしてしまったので． あとで家に帰って使ってみたところ， とくに問題なく 100 円ケイブルが使えているもよう ……

[中央区民センター]

内部に図書室・演劇ホール・セミナールーム・市民ギャラリィがある 札幌市の文化施設， としか紹介しようがない． 図書室を偵察してみた．

[区民センターの図書室]

図書室はそんなに広くないんだが， まあがんばっているかんじ． 写真は「絵本コーナー」． マットが敷いてあって， 寝ころんで読んだりできるようだ． この写真には写ってないけど， そこそこの冊数の絵本が収納されている書棚あり． 今日はとくに借りたりはせずに撤退．

[札幌市電]

帰りは路面電車． 「中央区役所」からのってひと駅「西 15 丁目」でおりた． 170 円．

• 1455 帰宅． とらおやつの準備． 食べてもらう．
• とら昼寝するかと思いきや， 昼寝せず． ひたすらだっこだの， 絵本よみだの ……
• だんだん背中がいたくなってくる． 今日は体温上昇はないもよう．
• とらめしの準備． とらめし． 晩飯．
• とら風呂． なんとかねかしつける．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合．
  • 昼 (1150): 診察券を出して， 受付が開くまでの 10 分間あまりを利用して， 耳鼻科すぐ南のサンクスでサンドイッチ・コーヒーのあわただしい昼飯．
  • 晩 (1900): 米 0.7 合． 焼き鳥．

2013 年 12 月 08 日 (日)

• 0600 起床． とらめし． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー．
• 今日は一日， とらといっしょにいたような?
• 午前はまず， ひたすら絵本．

[ちかごろお気に入りの 3 冊]

これを何度も読む (ように「これ」「これ」と指示される) …… 何のぐうぜんなのか， 宮田さんからいただいた「たべもの絵本」ばかり． どれもおもむきの異なるものなんだけど， いずれも 100-200 万部も売れてるモンスター． 何十回も読んでるうちに， たしかに「すごい」本のように思えてきた．

• 上の 3 冊のうち， 「14 ひきの…」以外は文章が長いので， とらにはかなり「要約」しているんだけど …… もしかしたら， そろそろそのまま読んでもだいじょうぶかも．
• 1030 ごろ， とらともどもに眠気におそわれてしまったので， 二人して 1.5 時間ほどぱたっと寝る．
• 昼飯．
• とらと AEON 桑園に買いものに……
• 夕方もどって， 積み木とかまた絵本とか ……
• とら風呂． とらめし． 晩飯．
• 寝かしつけはわりとあっさりと …… こちらの体力もかなり回復してきた．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): らでぃっしゅぼーやのパン．
  • 昼 (1230): キノコうどん．
  • 晩 (1830): 米 0.7 合． ハクサイ・エノキダケ・鶏肉のショウガ鍋． タラコ・コンニャクの煮物．

2013 年 12 月 09 日 (月)

• 0600 起床． 朝飯・弁当の準備 …… なんだかさがしものにいろいろ時間くう． 朝飯． とらめし． コーヒー． とら坊 & 月曜日はとくに大きくなる荷物を輸送しながら， 0820 自宅発． 晴． 0830 保育所着． 朝からひよこ組の子供たちは元気だなー …… 0910 研究室着．
• ちょっと図書館に逃避 ……
• 北大図書館にいるからといって， 仕事がはかどるわけではない …… しかし， 静かな気分にはなる．
• ようようにして， 根の論文原稿読解のつづき ……
• まー， なんとかひととーり終了．
• 14 時すぎに研究室にもどる． 昼飯．
• むねんな対応 (on twitter) ……
  • ざんねん無念なお知らせ…「統計モデリング入門」goo.gl/Ufq2 第 9 刷でたくさんのまちがいを修正するつもりだったのですが，修正されないまま印刷されてしまいました．原因は私と出版社のあいだの連絡ミスです．みなさん，どうもすみません…
  • いつも「修正点ありますか?」という問い合わせがあるので，それを待っていたらいつのまにか…という連絡ミス．次の第10刷がいつになるかわかりませんが(早くとも半年以上さきになりそう)，その刷では hosho.ees.hokudai.ac.jp/~kubo/ce/Iwana… にあげているまちがいなどを全部修正します．
• で， その問題の 統計モデリング入門 の第 9 刷は 2013-12-05 に岩波倉庫を出庫とのこと ……
• いろいろめいるやりとり ……
• 1700 研究室発． 1730 帰宅． とら風呂． とらめし． 晩飯．
• とら寝かしつけ …… このところ， とらアトピーのぐあいがよくないみたいで， ふとんに「そーっ」とおろして「これで寝るかな?」 と見てたら， あちこちぽりぽりひっかきはじめ， ついには「ばりばりばり」とやってるうちに完全におきてしまう …… だいじょうぶかなあ ……
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.4 合． ネギ・ナメコの味噌汁．
  • 昼 (1330): 研究室． 米 0.7 合． コンニャク・タラコの煮物． ニラ・モヤシのナムル． ワカメ・イカのあえもの． ブロッコリー．
  • 晩 (1820): 米 0.9 合． カブの味噌汁． キャベツ． 豚肉の炒めもの． ワカメ・イカのあえもの．

2013 年 12 月 10 日 (火)

• 0320 とら泣き． とりあえずおむつ替え． まあ， のどでもかわいたのかな …… と水をあげても飲まない． 容器のなかみを確認し， 「ぽいっ」とわきにどける． しょうがないのでミルクを少し加熱して飲ませる．
• で， それから一時間ほどだっこうろうろして， よーやく寝てくれた …… ひさびさにしんどい寝かしつけだった．
• 0600 起床． コーヒー． 朝飯・弁当の準備． かんたん朝飯． とらめし． 0800 自宅発． ちょっと雨． 気温は高い． 雪はほとんど消えた …… まあ， 一週間もすればまたかなり積もるだろうけど． 0810 保育所着． あ， 今日もとら連絡帳を持ってくるのを忘れていた …… うう． 0850 研究室着．
• 背中がおもい．
• 1030 より 研究室セミナー， 今日は Jordan さんでカラフトナニワズ (Daphne kamtschatica) の繁殖生態学． メス個体と雌雄同体個体からなる多年草なんだけど， 種子生産などはメス個体が多いようで， 雌雄同体個体のメス機能はあまり役だってなさそうな gynodioecy． まあそういう集団を千歳・野幌とかで調べていますという経過報告みたいなやつで， 亀山さんもプロジェクトに参加していて， 遺伝子で親子判定とかしているとのことなので， 空間構造とからめてこれからいろいろと明らかになっていくのでしょう．
• 昼飯．
• 統計モデリング入門， 直販わりびき販売 (3000 円) で一冊うれた． 買ってくれたヒトとちょっと雑談．
• ちょっと用事で外出， そのまままた研究室の外で文献よみとか．
• 研究室もどる．
• 生態学特集の書き出しとかどうしたものかね …… こんにち出版される生態学の論文のほとんどでは統計学的な手法が使われていないがら， じつはその論文の著者は自分が何をやっているのかよくわかっていないことが多い …… そういう学問分野である， とか? これって生態学だけのハナシではないよな．
• 1700 研究室発． 保育所でとら回収 …… 今日は巨大な「パンダぬいぐるみ」 を見たらこわくなって号泣していたそーです …… 1740 帰宅． とら風呂． とらめし． 晩飯．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.7 合． カブ・油揚の味噌汁．
  • 昼 (1150): 研究室． 米 0.7 合． ブロッコリー． イカ．
  • 晩 (1830): 米 0.8 合． カブの味噌汁． ハクサイ・シイタケ・鶏ひき肉の蒸し煮． トマト．