ぎょーむ日誌 2013-11-(21-30)

2013 年 11 月 21 日 (木)

• 0550 起床． なぜかしら， 背筋がものすごく痛い．
• コーヒー． 朝飯の準備． 朝飯． とらめし． 0820 自宅発． 0850 研究室着．
• 昨日の署名あつめにてちがいがあったので， その修正．
• 生態学特集とりまとめの Google Groups 操作 …… ちゃんと動作してるのかな?
• 昼飯． なんかしんどいなあ ……
• 論文原稿よみのつづき．
• 時間がかかりそうなので， 現時点までのコメントなどを， とりあえず送信してみる …… 原稿ファイルおくっていただいてから， ずいぶんと時間が経過してしまったので． うう
• 論文原稿よみのつづき． 今日は中央食堂ではなく， クラーク会館に逃げています ……
• 1710 研究室発． 1740 帰宅． とら風呂． とらめし． 晩飯．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): バナナ．
  • 昼 (1100): 研究室． 米 0.7 合． 鶏肉．
  • 晩 (1900): 米 0.7 合． 豆腐の味噌汁． ギョウザ． シュンギク・タマネギ・卵の炒めもの．

2013 年 11 月 22 日 (金)

• 0540 起床． コーヒー． 朝飯・弁当の準備． 朝飯．
• とら坊おきてきたので， ミルクあげたんだけど， 「飲むいきおい」がない …… その後， しばらく Ergo おんぶして作業してたら， いきなりさっきのミルクを吐いた!
• うーむ， だいじょうぶなのか? 体温は 37 度弱． とらめし …… やはり， あまり食べないか． 0810 自宅発． 0820 保育所着． 0850 研究室着．

[マイバスケット開店]

• 何やらあれこれ連絡事項とか．
• 昼飯．
• この時期， 毎年恒例になってしまった， 生態学会大会の口頭発表編成のおてつだい …… 今回は，

  注意事項を記載いたします。第1希望31、第2希望30としている方は
  英語口頭発表の方ですので、この方々については，ご考慮いただかなくて
  結構です。第1希望31を正式に選択された方は2名いますので、ご注意ください。
  

  などというわけのわからない条件がついている． 調べてみると，

  > dx <- d0[d0$分野1 == "31_生態学教育・普及" & d0$分野2 == "30_物質循環",]
  > dim(dx)
  [1] 52 10
  

  52 件もいるのか． 216 - 52 で残り 164 件を並び替えればよし， ということ?
• 会場わく数 168 でけっこうぎりぎりだな． しんどいかも ……
• で， 発表分野のうちわけとやらは?

  > summary(d$分野1)
                  01_群落           02_植物個体群         03_植物生理生態 
                        9                       4                       9 
              04_植物繁殖           05_植物生活史                 08_菌類 
                        3                       2                       1 
                  10_景観           11_遷移・更新         12_フェノロジー 
                        7                       6                       1 
  13_動物と植物の相互関係                 14_進化           15_生物多様性 
                        8                      12                       3 
                  16_数理             17_動物群集             18_動物繁殖 
                       10                      10                       4 
            19_動物個体群           20_動物生活史                 21_行動 
                        7                       3                      14 
          22_動物の社会性                 23_分子               24_古生態 
                        4                       2                       3 
                  25_保全           26_生態系管理               27_外来種 
                       16                      11                       7 
              29_物質生産             30_物質循環     31_生態学教育・普及 
                        1                       5                       2 
  

  3 未満は「つぶす」ので， そのように処理するとこうなる．

  > # 発表数 3 未満のグループを廃止
  > g <- d$分野1
  > table.g <- table(g)
  > removed.g1 <- levels.g[table.g < 3]
  > people.removed.g1 <- g %in% removed.g1
  > 
  > # 第一希望が通らなかった人たちを第二希望に
  > g[people.removed.g1] <- d[people.removed.g1, "分野2"]
  > table.g <- table(g) # 再計算
  > removed.g <- levels.g[table.g == 0]
  > g <- factor(g)
  > table.g <- table(g) # 再計算
  > table.g
  g
                  01_群落           02_植物個体群         03_植物生理生態 
                        9                       5                       9 
              04_植物繁殖                 10_景観           11_遷移・更新 
                        4                       7                       6 
  13_動物と植物の相互関係                 14_進化           15_生物多様性 
                        8                      12                       3 
                  16_数理             17_動物群集             18_動物繁殖 
                       11                      10                       4 
            19_動物個体群           20_動物生活史                 21_行動 
                        9                       3                      14 
          22_動物の社会性               24_古生態                 25_保全 
                        4                       3                      18 
            26_生態系管理               27_外来種             30_物質循環 
                       11                       7                       6 
  

• そして， 発表会場の構成はこう． まあ， 単純だな …… いや， ちがった． 一日目は A 会場が使えないのか． しかし， そうすると発表わく数は， 84 + 96 = 180 あるのか． ありがたいこってすな．
• いや， どうも送られてきたあれこれが， まちがっている 可能性に気づいた． とりあえず， 広島に問い合わせ．
• ともかく部屋・わくの構成さえわかれば， 作業はこれでほとんど終わりのはずだ …… いや， エラーがひどい場合には， もっとめんどうなことになってしまうか?
• また北大生協・中央食堂に逃げる．
• で，食堂の無線 LAN (eduloam) でメイルがおいかけてきた …… 部屋のワク数， ぜんぜんちがう!
• 作業やりなおし ……
• うーむ， こういう口頭発表もうしこみのヒトがいて ……

       分野1     分野2   分野3  X
     08_菌類 09_微生物 00_なし NA
  

  「08_菌類」も「09_微生物」も消滅したので， 別の発表分野に移動してもらわんといかんな …… とりあえず， 「物質循環」に移動してもらおうかな? 地中生態系のハナシがいくつかあるんで ……
• おっと， こういうのにかまけていないで， 38 度高熱のとら坊へるぱーぎょーむに移動しなくては． 1630 研究室発． 1650 帰宅． とらめし． 晩飯．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0620): 米 0.7 合． サトイモの味噌汁．
  • 昼 (1100): 研究室． 米 0.7 合． ネギ・鶏肉のグリル． シュンギク・ネギ・卵の炒めもの． リンゴ．
  • 晩 (1910): 米 0.7 合． サトイモの味噌汁． ジャガイモ・ニンジン・タマネギ・豚肉の煮物． シシャモ．

2013 年 11 月 23 日 (土)

• 3 時ごろ高熱とら泣き． だっこうろうろとかで， 4 時ごろ寝てくれた．
• 0555 またとら泣き． とらめし …… 食べる量がかなり少ない． とらおんぶしたまま， かんたん朝飯． 座ると泣くので．
• 8 時のとら体温 38.0 度ですか ……
• といったかんじで， とらを寝かしつけたり， だっこその他でうろうろしたり， あれこれやっているうちに一日終了．
• あいまあいまに， 口頭発表編成の手伝い (昨日のつづき) も進めた．
• 夜になっても 38 度超のまま．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0730): モンクールのパン． チーズ．
  • 昼 (1310): ネギ・イカパスタ．
  • 晩 (1910): 米 0.7 合． ネギ・豆腐の味噌汁． カスベの煮つけ． ジャガイモ・ニンジン・タマネギ・豚肉の煮物．

2013 年 11 月 24 日 (日)

• 高熱とら坊， 夜明け前から始まった活動は以下のごとし …… 0445 ごろふげーと泣いて， あらあらまたノドが乾いたのかなと少しあたためた牛乳をやると， 鍋とかをさして (いつもの) 「これ」「これ」指示． え? 鍋で「これ」って何だろうと思ったら， どうも空腹みたいで (一昨日から食事量がすくなくなったせいか?) …… まあ，ためしにほんの少しだけ食べものをあげると， ちょっと食べた． 6 時前に再就寝 …… と数分後に起床． こういう「時間差こうげき」みたいなのはよくあるので， 「当方に迎撃の用意あり」 で寝かしつける．
• 自分自身はどうにも眠れないので， 20 分ほど横になってから起床． いつものように， とら事変が発生する前にさっさと朝飯をすませる …… で， これまた予想どーり， とらが 7 時すぎにおきてきたので， とらめし …… やはりあまり食べない．
• 機嫌がわるいので絵本よみ． それでも「ぐずぐずとらちゃん」 (これは半おふぃしゃるな通称?) なので， エルゴおんぶしてみるとそのまま寝た …… 眠かったのか ……
• といったことが一日つづくわけで．
• 少しだけ， 生態学会大会の口頭発表編成おてつだい作業をすすめた …… うーむ， データ構造のちょっとした改変をともなう再プログラミングが必要かも． とら坊にかくらんされつつ， この問題を検討してみる …… しかしこれって放水あびせかけられてる黒板にチョークで何かを書くようなもので， 考えがまとまらずに苦しくなる．
• 夜になって， またとら熱上昇．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0650): らでぃっしゅぼーやのパン．
  • 昼 (1340): どんぐりのサンドイッチ．
  • 晩 (1900): 米 0.7 合． ネギ・豆腐の味噌汁． ワラサの照り焼き． ミズナ・がんもの煮物．

2013 年 11 月 25 日 (月)

• 夜中のとら泣き， だっこしてみるとかなりの高熱． だいじょうぶなのか? ぱたっと寝てくれるんだけど ……
• 0555 起床． コーヒー． 朝飯・弁当の準備． かんたん朝飯． とらめし．
• とら体温 37.4 ℃ぐらい． 高熱はひいたようだけど， 保育所の「撤退決定温度」は 37.5 なので …… まあ， 今日はおやすみということで． 0840 自宅発． 曇天． 0850 保育所着 …… これは， 荷物 (昼寝ふとんのシーツなど) を置いたり， 署名書類その他を提出したりするため． 0920 研究室着．
• カラダがうごかん …… ぢりぢりとメイル返信とか．
• 昼飯．
• 口頭発表編成関連のデータ処理プログラム (in R and Perl) の改訂作業．
• 自分のだーてぃこーでぃんぐメモ: 「発表不可能時間帯」は ESJoral.pm 内の get.ptime() の定義内で強引に指定されていた!
• その後もあれこれ改善プログラミングに没頭 ……
• おっともうこんな時間だ …… 1710 研究室発． 暴風雨， とでもよぶべき悪天． 買いもの． 1740 帰宅． とらめし． 晩飯．
• とら熱， あいかわらず下がらず．
• オンライン口頭発表編成のための web programming， だいたい完了．

• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． ネギ・豆腐の味噌汁．
  • 研究室． 米 0.7 合． ソーセイジ． ブロッコリー． リンゴ．
  • 晩 (1900): 米 0.7 合． ジャガイモ・ニンジン・豚肉の味噌汁． サツマイモ・ニンジン・鶏肉の煮物． ミズナ・ソイ刺身のサラダ．

2013 年 11 月 26 日 (火)

• 2013-11-26 Tue 03:00 午前 3 時， とら泣き． 体温高い， 38.8℃． よく眠れないようなので， 解熱剤． とりあえず， ねた．
• 一時間後にまたおきた． だっこ要求にしたがってだっこ …… とらのアタマの中に家の中の地図が入っているようで， 「あっち」「こっち」の指示にしたがって歩いていると， キッチンに到着． 冷蔵庫をさすので牛乳をだして， 少し電磁加熱してから飲ませる …… うーむ， 1 歳 3 ヶ月児にあやつられているなあ．
• その後， エルゴうろうろ 寝たか？
• 0620 起床． ねぼう． とらはまだ寝ている． コーヒー． 朝飯・弁当の準備． 朝飯． とらめし．
• とら体温， いまだに 39 度ちかいので， 今日は保育所と大学は休み．
• 10 時すぎ， とらおんぶして自宅発． 地下鉄にのっていつもの耳鼻科へ．
• 今日は幸運にもぜんぜん混んでいない! いきなり中待合室に直行， ほとんど待たずに診断開始．
• で， 結果は左耳の中耳炎再発 (右耳の鼓膜はチューブがささったままだったので無事)． 左鼓膜にもチューブさし処置．
• 薬局でクスリを出してもらって撤退， また地下鉄にのって帰宅．

[耳鼻科のクスリあれこれ]

メインとなる抗生物質， 抗生物質によるダメジを軽減する整腸剤， その他あれこれ …… うーむ， 過去 2.5ヶ月にわたって「抗生物質ふりー」な生活をしていたのに ……

• とらめし． クスリのんでだっこしてたら， ぐーぐー寝てしまった．
• 昼飯．
• 一時間ちょっとでとらおき， 体温あいかわらず 39 度ちかい． 新チューブも抗生物質もすぐには効かない ……
• とら， ひたすらおんぶ寝． 当方はひたすらおんぶうろうろ ……
• とら， おやつに作ったふかしサツマイモ+牛乳をぱくぱく食べる ……
• とらめし． 晩飯．
• とらちゃん， 高熱ハイ …… いろいろしゃべったり， 「あっち」「こっち」 指示を乱発したり， むやみにつかまり立ちとか， つかまり無し立ちをやってみたり ……
• 21 時前にねかしつける．
• 生態学会大会の口頭発表の編成ぎょーむ， だいたい準備ができたので作業バックアップ作成の自動化について再検討 …… えーと， backup_cron.txt に 00 0-23/3 * * * /home/kubo/esj/backup.sh (3 時間おきに backup.sh を実行) とかでいいのかな? cron 登録は crontab backup_cron.txt， その確認は crontab -l， 削除するには crontab -r とすればよさそうだ．
• で， 発表編成部会のみなさんに連絡メイルを．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． ネギ・豆腐の味噌汁．
  • 昼 (1230): 米 0.7 合． ネギ・豆腐の味噌汁．
  • 晩 (1900): 米 0.7 合． ハクサイ・シイタケ・鶏だんごの鍋．

2013 年 11 月 27 日 (水)

• 朝 4 時前， とら泣き． だっこ・おんぶうろうろ． 熱が下がってるのかどうか， よくわからん ……
• 0600 起床． しんどい …… コーヒー． 朝飯・弁当の準備． いつものようにかんたん朝飯．
• とらがおきてきた …… おお， 体温いきなり下がって 36.8 度! 鼓膜チューブ処置 & 抗生物質服用が効力を発揮したのか …… とらめし． まあ， ふつーに食べてる? もういっかい検温してみたけど問題なし， あわてて保育所いきの準備 …… 何やら時間がかかってしまう． 0850 自宅発． 0900 保育所着． 先週は「ぱんでみっく」による半減状態だったひよこ組， 今日はとら参加で全メンバーがそろった! ただし， とらは「え? ここどこだっけ?」と混乱ぎみのもよう ……
• 0920 研究室着． こちらも混乱ぎみかも …… 背中 (今日も消炎鎮痛湿布を装着ずみ) も重い ……
• いろいろとどおこっていたメイルぎょーむをかたづける …… のろのろしてるなあ ……
• 昼飯．
• ちょっと「R グラフィックス」な用件とか．
• 研究室から脱出して， また ThinkPad をもちだして， ぢりぢりとぎょーむをススめる ……
• 研究室にもどってぢりぢり ……
• 水永さんのデータ解析こんさる …… そうそう， 最初にでくわすデータ読みこみまわり， そして「全データが見える」作図ってのが， なかなか難しいんですよ ……
• それ以前に R の reproducible な (つまり，いつでも最初からやりなおせる) 使いかたが重要なんですよ …… まあ reproducible といっても Sweave 使えとかいうハナシではなく， R script をちゃんと書きましょうということなんだけど．
• 全国の R 慣れしてない大学院生は .RData と Rhistory だけで数ヶ月にわたる修論データ解析をのりきろうとするわけだが …… それって自滅的ですよ．
• 1700 研究室発． 保育所でとら回収 …… 今日も「うにゃうにゃとらちゃん」で， なかなか手のかかる状態だったみたいで …… 1740 帰宅． とらふろ． とらめし． 晩飯．
• 夜もうにゃうにゃ ……
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.7 合． ハクサイ・ネギ・豚肉の味噌汁．
  • 昼 (1150): 研究室． 米 0.7 合． サケ．
  • 晩 (1900): 米 0.7 合． 野菜・豚肉の味噌汁． ホッケ． ハクサイ・ネギ・豚肉の炒めもの．

2013 年 11 月 28 日 (木)

• 朝 3 時ごろ， とら泣き …… うっかり加湿器をつけ忘れたのが原因なのかな? ともあれ水が必要だったみたいで， ごくごく飲む …… しかしこれで収束するとは思えなかったので， また消炎鎮痛の湿布を貼ってみたら， やはり「ねむれないよー」というかんじで泣きだした． しばらく体重 10 kg 超ぼーいをエルゴおんぶなどして (エルゴでも背筋はそれなりに疲労するんだよね)， なんとか寝かしつける ……
• そういえば， 昨晩測定したら体重 70.0 kg， 1 kg ぐらい落ちてた． まあ， けっこうあがったりさがったりするほうなんだけど．
• そんなこんなでまたねぼうしてしまって， 0630 起床． あわてて， 朝飯・弁当の準備しつつ， かんたん朝飯． とらめし …… あまり食べてくれないなあ． コーヒー．
• その後も， とらふんばり泣き事件 (一歳児もいろいろつらいねー) とかあって， 今日も遅くなってしまって， 0900 自宅発． 降雪， いつのまにかけっこう積雪してるし． 0910 保育所着． ひよこ組のみんなは元気だ …… どうも「毎朝くるへんなおやじ (人畜無害)」 と認識されているようで， いろいろちょっかい出してきたり， おもちゃを貸してくれたり (しかし， とら坊はこわがりなので， よその親からは逃げているのではなかろうか?) …… 0940 研究室着．

[いよいよ積雪しーづん?]

とら坊をおんぶして， 雪ふるミニ大通公園を歩く．

• バックアップ手間を少し軽減するために， server 機 (といっても北大くらうど内) にも Dropbox を入れてみたらどうだろう …… という実験を開始．
• インストールじたいはふつーにできるのだが …… logout すると dropbox daemon も必ず停止するように見える．
• いろいろ試行錯誤してみたんだけど， あまり複雑に考えずに， 手元の計算機から hosho (server 機) に対して ssh hosho $HOME/.dropbox-dist/dropboxd というふうに dropbox daemon を起動してやると， その後も background で dropboxd が動いて自動的に同期しているようにみえる ……
• まあ， これでしばらく様子をみましょう．
• 昼飯．
• 「数理科学」をけっこういっしょうけんめい 読んで しまった ……
  • 数理科学最新号 www.saiensu.co.jp/?page=book_det… (送っていただき，ありがとうございます) とてもおもしろい内容．伊庭さんの記事は，この文字数でいろいろな内容を首尾一貫してよく書けるもんだなあ (脚注うんちくもすごい)…
  • 私などが作る統計モデル(数理モデル)なんて，いろいろな意味でいいかげんなものなんだけど，この数理科学特集「物理学における存在とは」の記事あれこれ読むと，いろいろと考えさせられますねえ…
  • まあ，物理学は生態学なんかとはかなり異なるアプローチで成功を収めていると考えるべきなのか…うまく理想化できる現象があり，しかも重要な予測は対象の詳細によらない場合があるってのはすごい…まあ，詳細に依存するので，わくぐみがひっくりかえった場合というのも，いろいろありそうだけど…

• 根の論文原稿よみをぢりぢりとすすめる ……
• 1700 研究室発． AEON 桑園で買いもの． 1730 帰宅．
• 1750 とら保育所へ． 今日は最年長組の子供たちが日ごろの鍛錬・精進をひろうする 「ちょうちんまつり」， いろいろ楽しませてもらいました． やっぱり， ここの子供たちの身体能力はすごいね ……
• 1840 ごろ帰宅して， 「ちょうちんまつり」 の「祝い膳」で晩飯．

[祝い膳]

最年長組の親御さんたちが 200 食ぶんを用意してくださいました …… たいへんおいしいのだけど， 自分も 5 年後にはこれを作ったりしないといけないのかな ……

• 夜中にあれこれ洗濯もの干しの工夫・試行錯誤 ……
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0650): 米 0.5 合． ネギ・豆腐の味噌汁．
  • 昼 (1220): 研究室． 米 0.7 合． スティックホッケ． トマトスープ．
  • 晩 (1900): 祝い膳．

2013 年 11 月 29 日 (金)

• 朝 3 時ごろ目がさめた． とら坊は泣いてない． 口の中がかわいている …… 加湿器は運転中． ふと， 「うーむ，背中が痛いと口が無意識のうちに開く?」 といったことを思いついた． どうやら， 数日前に高熱とらをだっこしすぎたせいか， どうも背筋やられぎみ． あまり意識してないんだけど， すとれすふる．
• とりあえず， また消炎鎮痛の湿布を貼って， ふとんで横になる． 5 時ごろにはまた寝たのかな?
• 0600 起床． コーヒー． 朝飯・弁当の準備． 朝飯． とらめし． 0830 自宅発． 晴． 路面つるつる， とら坊おんぶしているので， ちょっと緊張する箇所も． 0840 保育所着． 0910 研究室着．
• のどがちょっと痛くて， 風邪っぽいかも (これはあとでホントに風邪だとわかった)． どうもいまいちだな ……
• 昼飯． きぶんてんかんに， 「さか田」で蕎麦を食べてみた．

[かきあげあられ蕎麦]

やはりさか田はうまい!

• あ， 本を送っていただきました……!
  • 訳者せとやまさん @sessan60jp のご厚意でggplot2 作図本「Rグラフィックスクックブック」 www.amazon.co.jp/dp/4873116538/ を送っていただきました．一部ページはカラー印刷，見ているだけでも楽しい一冊です! https://pic.twitter.com/qVSTim0hmm twitter
  • この「Rグラフィックスクックブック ―ggplot2によるグラフ作成のレシピ集」の目次は O'Reilly Japan のサイトで見てください! www.oreilly.co.jp/books/97848731… twitter

• 「統計モデリング入門」 まちがい 一覧 にさらに一個追加．
• どうも調子がわるいので， 1600 研究室発． 散髪． 保育所でとら回収． 1740 帰宅．
• 体温を測ってみたら 38 度ちかかった ……
• とらめし． 晩飯．
• 風邪でぐったり． ノドがいたい．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.7 合． ネギ・豆腐の味噌汁．
  • 昼 (1230): さか田の蕎麦．
  • 晩 (1900): 米 0.7 合． ハクサイ・豚肉の鍋．

2013 年 11 月 30 日 (土)

• こちらはノドをやられている風邪なのだが …… とら坊はそんなことに遠慮するはずもなく， 朝 3 時すぎにとら泣き． 暗闇のなか， エルゴうろうろでねかしつけ． 40 分以上を費やす．
• 0720 起床． コーヒー． 朝飯の準備． とらめし． 朝飯．
• 9 時すぎに自宅発． 家のすぐ近所の医院は …… ああ， やっぱりむちゃくちゃにこんでますな． AEON 桑園の薬局で風邪クスリを買うことに．
• 他にも (けっこう重たい荷物となった) 買いものなどがあり， その後， 帰宅．
• とらめし． 昼飯．
• 午後はできるだけぐったりしてみる．
• とら坊をどんどんねかしつけて， こちらの体力を温存．
• 風邪クスリはなかなか即効性重視みたいなやつで， ノドの痛みもとれるし熱も下がるんだけど …… 数時間すると体温が 37-38 度ぐらいにもどり， ノドもいたくなる．
• [今日の運動]
  • 風邪をひこうが， とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0750): モンクールのパン．
  • 昼 (1300): 雑炊．
  • 晩 (1920): 米 0.7 合． ネギ・ナメコの味噌汁． コマツナ・エノキダケ・豚肉の炒めもの． ゴボウの炒めもの．