ぎょーむ日誌 2012-03-(11-20)

2012 年 03 月 11 日 (日)

• 0740 起床． ラジオ体操． 朝飯． コーヒー． 1020 自宅発． 1050 研究室着．
• 自由集会の内容の検討． 準備に使える時間がどんどん減少中 ……
• 1. 2 × 2 の分割表の GLM
  2. 3 × 2 の分割表の GLM
  3. 3 × 2 × 100 の分割表の GLMM
  4. 3 × 2 × 10 × 10 の分割表の GLMM
• 時間がないのに別のしたうけ計算にはまってしまった．
• 1620 研究室発． 1640 帰宅． 晩飯．
• [今日の運動]
  • 朝のラジオ体操．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0820): 米 0.5 合． タマネギ・油揚げの味噌汁． ダイコン・ニンジン・ゴボウ・コンニャク・鶏肉の煮物．
  • 昼 (1220): 研究室． シリアル． リンゴ．
  • 晩 (1800): なぜかしらエルムガーデンで晩飯．

2012 年 03 月 12 日 (月)

• 0620 起床． ラジオ体操． 弁当の準備． 朝飯． コーヒー． 0750 自宅発． 曇． 0820 研究室着．
• メイルかきぢりぢり …… さっさと 自由集会 の準備に着手しなくては ……
• などと時間がひっぱくしてるときにかぎって， 研究室の PC ぶちこわれ & 当方が修理せねばならぬ事態， とかになるんだよね．
• そういうことで， 午前中はゐんどーづごちゃごちゃやってました．
• で， 確認できたことは HDD の MBR がおそらく物理的にぶっこわれて， boot できなくなってるということ． いやはや． 昼飯．
• SATA 用の HDD ケイスもってたはずだけど …… ない． たしか院生に貸してたら無くなった， といういつものパターンだ．
• しょうがないので札幌駅横のヨドバシに買いにいく． 「なんで，こんなときに，ゐんどーづ修理なんかを……」 とイヤな気分で半分とけた凍結路面を走ってたら， すてーんとコケた．

[ケース大破]

雪面からの乱反射から目を保護するために， ときどきサングラス (偏光板) をかけてるんだけど， こけた表紙にかくのごとくケイスが大破した． 今日から使いはじめたのに …… 中のサングラスもちょっと壊れたので修理しなければならないことに．

• 研究室にもどる． MBR のぶっこわれた SATA HDD からデータとりだす． 何でこんな作業をやらされてるんだろうね ……

[SATA HDD ケイス]

これはコケても壊れなかった． これはあとで気づいたんだけど …… ケイスとアダプターが一体化しているやつは， サイズが小さくなるという利点はあるけれど， 意外と不便だ． いっぺんはめこむと， ぬきとるのがかなりしんどい． つまり「使い回し」が難しくなってしまう．

• なんとか復旧作業おわった． やっぱり， ゐんどーづでごちゃごちゃやるってのは， 何か毒物をとりあつかうような， かなり深刻な精神的疲労をもたらすように思う．
• で， メイル書いてるうちに本日終了． 雑用は一掃されたはずだけど， 自由集会の準備は何もススんでいない．
• 1800 から研究室のおいだしコンパ．
• 1920 研究室発． 買いもの． 1950 帰宅．
• 明日の飯の準備．
• 1/16-3/12 の灯油使用料 85 リットル， 8211 円．
• [今日の運動]
  • 朝のラジオ体操．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0700): 米 0.5 合． タマネギ・油揚げの味噌汁． ハーブ・ガーリックソーセイジ． レタス．
  • 昼 (1210): 研究室． 米 0.7 合． ハーブ・ガーリックソーセイジ． 加賀あげ． ジャガイモ． ミニトマト． レタス． リンゴ．
  • 晩 (1800): おいだしコンパ．

[本日の料理]

会場は A 棟 8F の一室． どこかで見た料理が並んでいるなあ …… と思ったら， なんと! 「松」のものだった． ていくあうとびぢねすもやってるのか …… 院生たちが作った料理もいろいろあり．

2012 年 03 月 13 日 (火)

• 0620 起床． ラジオ体操． 弁当の準備． 朝飯． コーヒー． 0750 自宅発． 雪． 0820 研究室着．
• メイルかき．
• 自由集会 の準備， ぢりぢり．
• 1030 より 研究室セミナー， 今日は保要さんと川合さん (ちかごろ直原さんに変わったとか) の植物個体群もの， それぞれモウセンゴケとハクサンイチゲ． まあ， 統計モデリングの受容という点だけに関していえば， 植物生態学も前の世代よりは少しぢりぢりと進展してるよね．
• 昼飯．
• テングザル研究の 松田一希君から 著書を送っていただいた． どうもありがとう．

[松田テングザル本]

テングザル -- 河と生きるサル， 若手生態学研究者の皆さんが書いている フィールドの生物学 しりーづの一冊． 学術的な内容 + 研究始動のエッセイ， 手軽に読めるペイジ数 (テングザル本の場合 146 ペイジ)． 帯の写真は松田君ではなく， なぜか登山家の野口健．

[おさる研究者]

松田君はこのようにおさるっぽいヒト．

[テングザル]

中は写真や図が多くて， ぱらぱらとながめているだけでも楽しい． 松田君はハナシがうまいヒトなんだけど， 作文もなかなか読ませる． パラグラフはやや長い? --- まあ，私の場合，アタマの中であつかえる一パラグラフのサイズが かなり短いだけなのかもしれないけれど．

• 自由集会の準備， ぢりぢり ……
• 1750 研究室発． お， 木星・金星がいよいよ大接近? 買いもの． 1830 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯．
• [今日の運動]
  • 朝のラジオ体操．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0700): 米 0.5 合． タマネギ・油揚げの味噌汁． ゆで豚肉ポン酢あえ． ミズナ．
  • 昼 (1200): 研究室． 米 0.7 合． ゆで豚肉ポン酢あえ． 加賀あげ． ジャガイモ． ミニトマト． ミズナ． リンゴ．
  • 晩 (1930): 米 0.5 合． シジミの味噌汁． ネギ・シイタケ・ヤリイカの炒めもの． ナガイモすりおろし．

2012 年 03 月 14 日 (水)

• 0620 起床． ラジオ体操． 弁当の準備． 朝飯． コーヒー． 0750 自宅発． 晴． 0820 研究室着．
• 自由集会の準備ぢりぢり …… よい例題が作れない ……
• きばらしに生態学関連の mailing list である jeconet に案内を投稿したみた．

  jeconet の皆様
  
  北大の久保です．生態学会大会で自由集会「データ解析で出会う統計的問題 -- 分割表の問題
  と統計モデリング」(http://goo.gl/qQ1Ok) を開催しますので，その案内を配信させていただ
  きます．
  
  今回は「分割表」というデータ構造のあつかいについて議論したいと思います．「分割表」
  というと何やら難しそうですが，要するに「一個，二個……」と数えられるデータを表にま
  とめたもので，生態学のいろいろな分野でよく登場するデータ構造です．こういう形式の
  データにであったときの対処として，一部では「条件反射的にカイ自乗検定」といった作法
  がいまだにうけつがれている事例もみかけますが……この自由集会では「もっと他にもいろ
  いろ自由にできるよね」といった方向性で進めていきたいと考えております．興味のある皆
  さんに参加していただけるとうれしいです．よろしくお願いいたします．
  
  また，集会後には簡単なうちあげを予定しています．参加してくださるかたは，お手数です
  が http://hosho.ees.hokudai.ac.jp/~kubo/ce/JesParty.html から申しこみをお願いいたします．
  
  -----------------------------------------------------------------
  [W23] データ解析で出会う統計的問題 -- 分割表の問題と統計モデリング
  
  (以下，集会ペイジ の内容)
  
  

• 準備は何も進展してないが， ちょっとだけすっきり． それから， 現在のところ うちあげ 参加希望者は 3 名だけです． どうなることやら …… まあ， 人数が少ないので jeconet で宣伝してみる気になったわけですが．
• うーむ， 例題が ……
• 昼飯． さっさと食って 散髪にいく． 前回は1/19， またマがあいてしまった …… ちょっと気分転換になったけど．
• ぢりぢり
• まだまだ前途遼遠． 1740 研究室発． なぜかしら農学部に寄り道せねばならぬことに． 買いもの． 1830 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯．

[ひさびさに農学部に寄る]

まあ， 環境科学院の建物よりは立派だよね ……

• [今日の運動]
  • 朝のラジオ体操．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0700): 米 0.5 合． シジミの味噌汁． ジャガイモオムレツ． ミズナ．
  • 昼 (1200): 研究室． 米 0.7 合． 塩鮭． ジャガイモオムレツ． 根菜あげ． ブロッコリー． ミニトマト． ミズナ． リンゴ．
  • 晩 (1920): ハクサイ・ネギ・ニラ・エノキダケ・豆腐・しらたき・タラ・カキの鍋物． 卵雑炊．

2012 年 03 月 15 日 (木)

• 0620 起床． ラジオ体操． 弁当の準備． 朝飯． コーヒー． 0750 自宅発． 0820 研究室着．
• 自由集会 の準備ぢりぢり ……
• 粕谷さん本の原稿を送っていただいたので， 印刷出力してみた．

[粕谷 GLM 本の原稿]

共立出版の Rで学ぶデータサイエンス しりーづの一冊 (近刊)． ぶあつい …… 内容は岩波統計モデル本 とけっこうかぶっているけれど， 説明のやりかたは「いかにも粕谷さん」なもの． 皆さん， 両方買うのがいいですよ!

• 昼飯．
• 自由集会の準備すべきなんだが， ついつい粕谷さん本のはしからはしまで目をとおしてしまった． 分割表のハナシなども紹介されていて， ごちゃごちゃしたアタマの中がすこし整理された．
• 自由集会の準備ぢりぢり …… 例題はいろいろと改善されつつあるんだけど， 投影資料は 1 ペイジもすすまない．
• 明日出発なんだけどなぁ (自由集会は月曜日夜) …… 1730 研究室発． 買いもの． 1810 帰宅． 「冷蔵庫内一掃」的な晩飯の準備． 晩飯．
• なぜかしら， iOS5.1 アップデイト無限ループ という呪われきった状態におちいった iPhone 4S (自分のものではない) を救出するミッションにとりくまねばならぬことに …… これはなかなかのごうもんですよ …… 検索してみると， 幸か不幸か， 同じような状況で苦しんでいるヒトたちが多数いて， 参考になる情報から各種デマのたぐいまで， これまた狂気のごとくびゅんびゅんとびかっている．
• で， 試行錯誤の過程はヌキにして， 手さぐりとカンにたよった今回の解決策は …… 他の iPhone から FaceTime よびだし (するとなぜか OS が使える状態になる) → なかばやけくそで「設定」から「設定をすべて消去して再起動」みたいなことをやると， まあとりあえず何とかなりました (再起動の過程で Siri を OFF にしたけど， これが意味があったのか無意味なのかわからん)． これは最適な解決策ではないと思うんだけど， まあとりあえず「なんとかなった」事例のひとつということで．

  「もう一つ，聞きたいことがある．──科学者にとって，一番大切なことは何かな?」
  「カンです」言下に田所博士は答えた．

  小松左京 「日本沈没」 (1973)

• などといったことに消耗してしまって， 自由集会の準備をつづける気力が枯渇状態 ……
• [今日の運動]
  • 朝のラジオ体操．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0700): 米 0.5 合． タマネギ・油揚げの味噌汁．
  • 昼 (1320): 研究室． 米 0.7 合． ハーブソーセイジ． 根菜あげ． ブロッコリー． ミニトマト． ミズナ． リンゴ．
  • 晩 (1910): 米 0.7 合． ジャガイモ・ニンジン・タマネギ・シイタケ・鶏肉のカレー． ハクサイ・ネギ・カニカマボコのサラダ．

2012 年 03 月 16 日 (金)

• 0620 起床． ラジオ体操． 弁当の準備． 朝飯． コーヒー．
• 明日から大津で 生態学会大会 なので本日移動． とりあえず， 荷物の準備．
• そしていまだに終わってない 自由集会 (月曜日夜) の準備のつづき．
• 1135 自宅発． 晴． 1150 JR 札幌駅着． 1210 快速エアポートに乗って同発． 昼飯． 1246 新千歳空港着．

[また B-737-800]

今日はひさびさの JAL かと思いきや， 客室乗務員さんたちが赤いジャケット着用の JEX だった．

• 1340 JAL2512 便 30J 座席で出発． 機内では自由集会例題づくりの試行錯誤． 1550 関空着． 1616 特急はるかに乗って同発． 1732 京都着． 1737 東海道本線に乗り換えて同発 1752 石山着． 1800 ホテルのマイクロバスに乗って出発．
• 15 分ほどで宿着． 琵琶湖畔のちょっとりぞーとっぽい変わった建物． 部屋はものすごくひろくて快適． これなら 5 泊してもだいじょうぶかも．
• なぜかしら …… といつものごとく書いてばかりではややこしい場合もあるので， 明示的に書くと， まゆみさん・そのお母さん・さらにそのお母さんと宿の中華料理屋で晩飯． おいしく楽しくいただきました．
• [今日の運動]
  • 朝のラジオ体操．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0710): ぱん吉の角食． チーズ． トマト．
  • 昼 (1230): 快速エアポート車内で， 札幌駅内のパン屋 Little Mermaid のサンドイッチ．
  • 晩 (1930): 中華料理いろいろ．

2012 年 03 月 17 日 (土)

• 生態学会大会 の琵琶湖畔ぐらし 2 日目． 0710 起床． 朝飯．
• 0755 宿発． ちょっと雨． 0804 宿の前のバス亭から JR 瀬田駅いきのバス (2 分おくれ) に乗って出発．

[琵琶湖畔]

宿の前． むこーのほうに琵琶湖大橋が見えてます．

• 10 分ほどで駅のバス亭着． 260 円． 同じバス亭から会場 (龍谷大学) いきの満員バスにのる． 私と同様に， 午前の委員会とかに出席するヒトたち． 0830 ごろ到着． 龍谷大学まで 210 円． 二人ならタクシーでも同じぐらいか?
• 満員バスで弘前大の石田さんと雑談． 八甲田のブナとかの霜害の影響を年輪からよみとる …… といったことをやっておられるそうで． うーむ， あちこちで年輪解析なヒトが増えているな．
• 0900 から大会企画委員会． この会議に出るのもこれで最後だなあ ……などと安堵しつつ， うしろのほうで内職にいそしむ．
• 自由集会 の例題のひとつ， 2 × 9 分割表 (「項目数」が多い場合) の例題はなんとかうまく作れた …… たぶん．

• あとは「反復する分割表」のハナシだ． これは， いろいろ試行錯誤してるんだけど， 意外とうまくいかない． 何がうまくいかないかというと， 分割表ごとの random effects みたいなものがあったとしても， 「反復を無視して統合 & 単純な GLM」という乱暴な推定で， なんとなくうまくいってしまうんだよね． うーむ? …… random effects のいれかたが悪いんだろうなあ．
• 私が内職している会場では， 各部会の「今年度の悪戦苦闘」とでも題するべき凄惨な報告がつづいている． これは今回は東アジア生態学会連合 (EAFES …… 実体のよくわからない機構) との合同なので， あれこれとオペレイションが複雑化し， さらにはいんたーなしょなるな文化的な問題もあり …… といった状況のようで， これが全体の運営とかシンポジウム編成とかポスター発表まわりとかの部会はすごいことに …… 私が所属している発表編成部会 (単発的な 15 分間の口頭発表の編成) はまったくラクだったわけですが．
• 次に EAFES との合同大会があるとすれば 6 年後とのこと …… それって北海道担当ぢゃん! たぶん札幌でやるんだろうなぁ …… どうなることやら．
• 1130 から別室で電子情報委員会 (第 1 回)． 30 名以上が参加していた企画委員会とはちがって， これは 7 名だけの簡単なもの． えーと， 私の「やること」になったのは ……
  • データバックアップの再確認
  • SSL 証明書の取得てつづき
  • WordPress とか何か CMS なシステムの試験的導入
  といったところだったか? 私の担当ではないけれど， 会員名簿まわりをまともなものにする必要ありそう．
• 昼飯．

[委員会弁当]

お茶つきで 800 円． 委員会後に食った．

• 自分の 自由集会 の準備ができてないので， 宿に撤退することに． 1404 バスに乗って龍谷大学発． 1420 JR 瀬田駅着．
• うんどう不足を多少なりとも解消しようと， 駅から宿まで歩いて帰ろうとしたのだが ……

[思わぬ苦難が!]

瀬田駅から西に 1.4 km 弱 (直線距離)， なーんてことはないよと思って歩き始めたのだが． 最初は「各町内に寺がひとつある」ような不思議な住宅地内を てけてけと航過していたのだが …… 地図上に縦横に走る水路が私の行くてをはばんだのであった!

[宿のすぐ近く]

畑のすぐむこうにあやしげな鉄塔がたっていて， そこが宿なんだけど …… この畑をとりかこむ水路を渡渉できる場所がわからん．

[あぜ道をゆく]

北方をみると水路にかかる細い鉄橋が見つかったので， 他人の畑のあぜ道を突破することに．

[しかしまた別の水路にはばまれる]

えーい ……

• けっきょく， ふだんは off にしている iPhone の 3G データ通信を on， 現在地の確認ならびにこの水路迷宮を脱出する， かぼそい脱出経路を確認したのであった …… 15 時すぎに宿着． 瀬田駅から 40 分以上歩いたか． まあ多少のうんどう不足解消になった．
• 部屋でぐったり．
• ズボンのすそとか泥だらけになったので洗面台で洗濯．
• ぐったりしたまま動けん． どうも「ばて」が蓄積してるかんぢで．
• シャワーに入ったら少しさっぱりしました． しかし時刻はすでに 18 時ちかい ……
• 晩飯の買い出し． 部屋にもどって晩飯． コーヒー．
• 自由集会の準備， ぢりぢり ……
• [今日の運動]
  • 瀬田うろうろ 40 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0730): 豆パン．
  • 昼 (1250): 委員会弁当．
  • 晩 (1900): 麦飯パック． ゴボウ・ニンジンサラダ． 神戸のおばあちゃんにもらったイカナゴ．

2012 年 03 月 18 日 (日)

• 生態学会大会 の琵琶湖畔ぐらし 3 日目． 0750 起床． 宿のちかくにあるパン屋まで買い出しにいく． 朝飯． コーヒー．
• 部屋にこもって， ひたすら 自由集会 の準備．
• ラジオ体操． 昼飯． 14 時前．
• 1 時間ほどそのへんぷらぷら歩く．
• また部屋にこもって自由集会の準備のつづき．

• 20 時ごろ晩飯．
• 自由集会の準備， おわらん ……
• [今日の運動]
  • ラジオ体操．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0820): Rosetta のサンドイッチ．
  • 昼 (1350): 宿の近くでピッツアとパスタ．
  • 晩 (2000): 宿の近くで寿司．

2012 年 03 月 19 日 (月)

• 生態学会大会 の琵琶湖畔ぐらし 4 日目． 0700 起床． 晴． 朝飯． コーヒー．
• ひたすら 自由集会 の準備のつづき …… 本日夕方にまにあうか? あ， 自由集会ペイジの開始時間がまちがっている! …… と思ったら， ぎょーむ日誌のリンクのほうがまちがってた! いやはや． 絶不調． 修正．

[宿の中庭]

ときどきながめてみたり．

• まだ終わらん． しかし， 昼すぎに宿から出て， まずは昼飯．

[親子丼]

宿のちかくの焼き鳥屋で．

• 昼はバスの運行本数がかなり少ないので， タクシーで宿から大会会場の龍谷大学まで行ってみる． 1750 円． 1310 会場着．
• 17 時すぎまで， 休憩室でひたすら準備 …… なんとかまにあったかな．
• 1730 より 自由集会．

[A 会場]

こういう広いところでやりました．

[粕谷さん]

自由集会ではレーザーポインターを貸してもらえない， というのを失念していて， ちょっと困った …… まあ， なんとかなったんだけど． 来年からは忘れずに自前のレーザーポインターを準備しましょう．

[来てくださった皆さん]

100 名ぐらいかな?

[4 とおりの統計モデル]

分割表を説明するときには， これらはどれも同じ結果を出すということが証明されてるそーで．

• で， 私のハナシ． 翌日に 自由集会ペイジ でとりあえず版を公開しました．

• 無事に終了．
• 龍谷大学からバスで JR 瀬田駅に移動． 駅のちかくの居酒屋で 18 名ぐらいでうちあげ． 当方はばてぎみ， 皆さんはお元気でした．
• その後， 20 分ほど歩いて， 11 時すぎに宿にもどった．
• [今日の運動]
  • ラジオ体操．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0700): 宿の近所のパン屋 Rosetta で買ったサンドイッチとか．
  • 昼 (1300): 親子丼．
  • 晩 (1900): うちあげ．

2012 年 03 月 20 日 (火)

• 生態学会大会 の琵琶湖畔ぐらし 5 日目． 0750 起床． パン屋に買い出しへ． 朝飯． コーヒー．
• 昨日の自由集会 (準備) ばて・ばーんあうとが継続している …… 昨日の自分の投影資料のとりあえず版を 自由集会 ペイジからダウンロードできるようにする． 粕谷さんのはしばらくおまちください．
• 昼すぎまでちょっとうろうろ．
• 午後はポスター会場ウロウロ．
• 宿にもどって風呂場で洗濯．
• 晩飯．
• [今日の運動]
  • うんどうぶそくだなぁ …… いろいろ歩きまわったけど
• [今日の食卓]
  • 朝 (0700): 宿の近くのパン屋 Rosetta で買ったサンドイッチ．
  • 昼 (1200): お弁当．
  • 晩 (1900): 宿の近くのローソンで買った麦飯パック・ヒジキと大豆の煮物．