ぎょーむ日誌 2009-04-24

2009 年 04 月 24 日 (金)

• 0730 起床． ねむい． 朝飯． コーヒー． 0920 自宅発． 晴． 0935 研究室着．
• また少し Cao さん問題で苦闘してみる．
• 1030 より 小林君 の D 論 「北限分布境界域における優占樹種ブナの個体群過程」 の公聴会． 各章のハナシは今までいろいろ聞いてて， コマかい点ではいろいろつっこめるなぁ， と思っていたのだが …… このようにまとめてどん， と聞くとブナの北進に関する小林君の描像が ずずーとせまってきておもしろい． 「フロント」の実態は「線のさらに前方」に点在する 孤立集団たち， といったモデルになってるわけで， これらの孤立集団たちの発生と局所的拡大が北進速度を規定するんだろうけど …… 局所的な拡大については小林研究でいろいろ解明されつつあるわけだが， 孤立集団の起源とかはなかなか難しいね．
• 昼飯．
• 1300 から臼尻の 木村幹子さん の D 論公聴会． 有名なるアイナメ雑種のハナシの最新の進展を， 優雅なる津軽イントネイションで楽しむ一時間． 道南海域ではスジアイナメ♀がアイナメ♂またはクジメ♂のテリトリーで 産卵することで F1 が形成されたりする (野外ではこの組み合わせしかない)． で， この F1 はメスのみであり， 色々と驚くべき特性をもっている． 母方 (スジアイナメ) と交雑するともとのスジアイナメにもどり， 父方 (アイナメ・クジメ) と交雑すると F1 的なやつが再生される …… この不思議なパターンを生じせしめているのは， 雑種生殖 (hybridogenesis) だった， というすごいオチでした． F1 に入ったアイナメ・クジメの染色体は組み替えられることもなく， 減数分裂の段階 (?) で排除されてしまうので子孫に伝わらない． 母方 (スジアイナメ) と新しい父方の染色体が次の「F1」 を作る， とのことで …… この F1， 他にも母方のスジアイナメより成長が良かったり， 低水温耐性をもってたりとヨイとこどり， F1 メスが F1 メスだけを再生産する効率の良さなのだが …… 現時点ではまだ何かよく分からない原因で 「道南のアイナメは雑種ばっかり」 といった状況にはなっていない (むしろ少数派)．
• 今日の D 論発表はどちらも楽しみました．
• さてさて， また Cao さん問題でぢたばたしてみたり， いろいろと雑用．
• 低温研の小野さんのご案内メイルが研究室メイリングリスト に転送される． 生理生態学なヒトたちが分担して書いておられて， いろいろと役にたちそう．

  低温研で、低温科学という冊子を毎年発行しているのですが、
  昨年度（2008年）は、「光合成研究法」を発行しました。
  冊子体は部数が限られているのですが、
  
  http://www.lowtem.hokudai.ac.jp/LTS/index.html
  
  から、ダウンロードできるようになっています。
  

• 北大祭の地環研もよおしもの実行委員会の下っぱぎょーむ． 本日 D 論公聴会を終えたばかりの小林君に「サイエンストーク」 を押しつけることに …… 快諾していただけた． よかったよかった． この一般来聴者むけの (といってもどれぐらいの人数になるのやら?) タイトルを小林君と二人で考えてみる． 「北海道を北上するブナたちの生態学」 …… なかなか躍動感があって良いのではないかな? ブナとか生態学とかいうコトバにひかれる ヒトたちが聞きにくればいいわけで．
• で， Cao さん問題というか， Alpinia の性配分問題なのだが， 平均値とれとか割算しろとか， そういう方向性なんだよね．
• 観測値 / 観測値 なる割算値をつかった統計モデリングはありえない (というか，現在ではもはやそんなことをする必要はない) わけだが …… えーい， 作図に関しては， とりあえず割算値軸を使ったほうがてっとりばやいか?
• このような状況においつめられるコトがあるだろう， と予見していたので， 今年の 1 月の授業 とか， GLM 自由集会 では下のようないいわけスライド 「図示の場合は使わざるをえないかも」 をかかげていたわけだが．

• とりあえず …… ほぼ無意味な抵抗として， 割算値ではなく log(観測値) - log(観測値) なる値を縦軸にして library(lattice) な作図コードを書いてみた．

• まあ， これで「説明要因なにもナシ，単なる個体差・花差にすぎない」 といった推定結果になっても (たぶんそうなるだろう)， この図を示せばなんとかなりそうだな． 個体差・花差の明瞭さは， なんというか overdispersion の教材に使えそうなほどだ．
• 上の図では平均値とかよけーなものは示してなくて， 全個体・全花について示している． 従来の研究なんかだと， 個体ごとに平均値なんぞを計算して， さらに直線回帰で傾きが「ゆーい」でした， と「個体・花由来の random effects なんてあるわけないだろ， どうでもいいだろ」 といった方針のデータ解析結果なんかが公表されてたりするわけだが …… それってだいじょーぶなのかね? ま， 平均値化した時点でクロでしょうな．
• 本日もなんだか時間やりくり失敗ぎみで (本質的には割算値な作図をした精神的だめーぢか?)， R 作図わざ本の翻訳原稿をチェックとかできないまま (すでに 3 日連続停滞!) ぎょーむ気力がつきてしまった …… 1930 研究室発． 1945 帰宅． 晩飯．
• [今日の運動]
  • またうんどう休養日になってしまった ……
• [今日の食卓]
  • 朝 (0800): 米麦 0.4 合． ナメコ・豆腐の味噌汁． コマツナのゴマあえ．
  • 昼 (1230): 研究室． 米麦 0.8 合． 煮干にぎり飯．
  • 晩 (2030): 米麦 0.8 合． ダイコン・レンコン・ニンジン・シイタケ・鶏肉の煮物．