ぎょーむ日誌 2008-06-13

2008 年 06 月 13 日 (金)

• 0700 起床． 7.5 時間ぐらいねたのでアタマの機能が復旧した， というかんぢ． 朝飯． コーヒー． 0830 自宅発． 雨のちくもり． 0845 研究室着．
• なぜかしら Springer の編集者から私のところに Use R しりーづの本の一冊として生態学ものを何か書かないか， といった質問がきた． これはなかなかおもしろそうなハナシなんだけど， その前に例の 岩波本 を書かねばならず， しかもこれはまったく進捗していないので …… Use R の件は今回はまあおことわりすることに．
• Agricultural and Forest Meteorology で in press な母子里 Gibbs 林冠モデル の巻数・ペイジなどが確定したので PDF 別刷とでもいうべき PDF ファイルができました， といった連絡をいただく． ダウンロードして共著者のみなさんに連絡． そういえば， ミネソタ大の Rebecca さんも論文できたら連絡せよ， と言っておられたのでメイルだしてみる．
• さてさて， さっさと仕事にかかりたいのだけど， そのまえにちょっと計算機雑用を． 私がもちあるいてる ThinkPad X31 は古くてあちこちコワれているのだが …… ひんぱんに遭遇する問題として， suspend してデイパックにいれとくと何かのはずみで resume してしまい， さらに歩いてるもんだから デイパック内の機体にたえざる震動がくわわる． するとどうなるかというと …… おそらくこの震動が原因で， リチウムイオン電池から大電力が発生， マザーボードは加熱するわ (つまり背中がいきなり熱くなる)， 電池残量は 10 分で半減するわでたいへんなことになる．
• といった「カチカチ山のたぬき」問題を解決するべく， いままで放置していた Vine Linux の電源まわりの問題にとりくんでみる． 設定とかがめんどうなものだから古い APM を使っていたんだけど， これをとりやめて ACPI に移行したい．
• で， いろいろと調べてみる． やった作業は，
  • sudo apt-get install acpid
  • /etc/lilo.conf (…… すみません， まだ LILO → GRUB 移行できてません ……) で append=" resume2=swap:/dev/hda2 apm=off acpi=on" と設定 (acpi=force も可)．
  • sudo /sbin/lilo して reboot
  これでカーネルは ACPI モードで動き， acpid も動作している．

  	$ cat /proc/acpi/battery/BAT0/info
  	present:                 yes
  	design capacity:         47520 mWh
  	last full capacity:      15850 mWh
  	battery technology:      rechargeable
  	design voltage:          10800 mV
  	design capacity warning: 2376 mWh
  	design capacity low:     475 mWh
  	capacity granularity 1:  1 mWh
  	capacity granularity 2:  1 mWh
  	model number:            IBM-08K8036
  	serial number:             194
  	battery type:            LION
  	OEM info:                SANYO
  

  うーむ， 古いから電池容量が激減している．
• ハイバネイションはどうすればよいか? 比較的あたらしめの情報が OpenTechPress サイトにある． えーと， Vine Linux の場合は， sudo apt-get install hibernate して sudo /usr/sbin/hibernate -f でとりあえず hibernate してくれる …… 私の場合， 上の lilo.conf 設定で resume2=swap:/dev/hda2 としているのでここにメモリ上の情報が退避されるわけだ．
• hibernate してる ThinkPad は電源スイッチ押しで復帰する． やってみると ハイバネイション失敗してたのか?! と動揺させるような boot 画面が表示されるわけだが， カーネルがたちあがったところで swap 領域から プロセスの情報復旧作業がはじまり， 無事にもとにもどる． 10-20 秒ぐらいかな?
• 上で hibernate -f と --force している理由は (私の X31 にインストールされてる) VMWare の vmnet8 などがうまく ifdown できないため． まあ， そのうちこのあたりをうまく制御する shell スクリプトなんかをかきますか．
• まだ調べてないことのひとつ: /sbin/insmod ibm_acpi は必要か? 現在はこの ibm_acpi カーネルモジュールを使用中． あとで /etc/modprobe.conf に options ibm_acpi experimental=1 hotkey=enable とでもしとけばいいのかな?
• しかし最近はすっかり default kernel づけの生活だねえ …… いっしょうけんめい kernel コンパイルしてたのも今は昔．
• うー， この作業に時間とられている …… 最後にまいなーだけど気になる問題． 私はいまだに window manager が Window Maker なんだけど， これの上でのバッテリ残量表示は wmapm を使っていた． ACPI のもとでは wmapm は使えない (APM がうごいてないため)． そこで wmacpi を使うわけだが， ここでもまた Vine Linux ならではの問題があって …… 結論からいうと wmacpi-1.99 なら OK だけど wmacpi-2.* はコンパイルできない． まあ， wmacpi-1.99 でもちゃんと動作してるように見えるんだけど． それから コンパイル作業の前に， おそらく libdockapp-0.5 をインストールする必要があるだろう …… これまた Vine Linux 4.2 のもとでは 完全には make install PREFIX=/usr できないのではあるが．
• いやー， しかし ThinkPad + Vine Linux という気むずかしい組みあわせで 無事にハイバネイションできるようになりましたよ …… なかなか感慨があるねえ．
• さーて， アリ原稿アリ原稿 ……
• あまりススまぬうちに昼飯．
• さて， 午後はがんばるぞ …… と思っていたのに， またデータ解析質問メイルが． しかも読まなかったフリができないやつだったので， 一時間ほどを返信かきに費やす． だれかたすけてー
• ともかくなんとかなったので， アリ論文原稿修正の作業にもどる．
• …… まだ終わらん． しかしばててきたので撤退． 2020 研究室発． 2035 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯．
• ふーむ， なにやら R の glm() の link 関数を自分で定義できるようだな ……

  Roger Koenker. 2006. Parametric Links for Binary Response. R-news 6(4):32-34 http://www.r-project.org/doc/Rnews/Rnews_2006-4.pdf (1.6MB)

• あ， まあ今さらながら気づいたのだが …… R 本をたくさん出してた 九天社 が営業を停止というか自己破産， か ……
• [今日の運動]
  • アリ呪われうんどう休養日
• [今日の食卓]
  • 朝 (0800): 米麦 0.6 合． 豆腐・ワカメの味噌汁．
  • 昼 (1315): 研究室お茶部屋． 米麦 0.6 合． キャベツ・ニンジン・ネギ・ミズナのサラダ． ワカメスープ．
  • 晩 (2200): 米麦 0.7 合． ネギ卵炒飯． キャベツ・ニンジン・ネギ・ミズナのサラダ．