ぎょーむ日誌 2007-12-20

2007 年 12 月 20 日 (木)

• 0730 起床． 朝飯． コーヒー． 洗濯． 0850 自宅発． 晴． 0905 研究室着．
• また母子里 Gibbs 林冠モデルの修正案いただいたので， ちょっと修正． みなさんに連絡メイル．
• こちらに滞在している東北大院生の神山さんの脱割算値計算方法の説明， 昨日の補足と小改造などなど．
• 1100 ごろとりあえずひとくぎり． 粕谷さん科研費を使わねばならないので， 発注したい統計学本のリスト作り． 九大の事務室に送信してみる．
• 神山さんは R & ゐんばぐすのこんびねいしょん わざ を自習中なので …… 以前に神山さんから送ってもらったんだけど使ってなかった， 八甲田湿原群植物の層別刈りとりデータにとりくんでみる． 全植物種・全 quadrat の生産構造図を全自動 R 作図で …… と思ってつくってみるとヌマガヤばかりが LAI や バイオマスに卓越していて …… 全種 plot してもサビしいかぎり． うーむ， ここまで極端だったとは．
• 正午すぎになったので神山さんをどこか昼ごはんに案内しなくては， と準備してると， ここ A 棟 8F の院生たちが神山さんをスープカレーつあーに 誘ってくれたので私はすばやく撤退． 女性大学院生の集団に包囲されてしまって 過渡に緊張してしまった状況のもとで収縮しきった胃に 刺激物満載のスープカレーを流しこむのはいかにも危険なふるまいである， と以前に医者から注意されたという健康上の理由のため． 北大生協に昼飯調達の旅にでる． ついでに書籍部もうろうろ． 研究室にもどって昼飯．
• 八甲田湿原植物の垂直構造作図のつづき． LAI とバイオマスに関してそれぞれ上位 6 種ぐらいを選抜して 一覧できる図をつくってみる． うーむ ……

• 母子里 Gibbs 林冠モデルの修正原稿を Agricultural and Forest Meteorology にオンライン提出する． 時刻は 1450． ふう． 皆さんに連絡メイルかき．
• bugs オブジェクトを解読して quatile() で CI を算出させる R コードを作って， 神山さんに昨日おわたししてたんだけど， それにわりとトンでもなバグがあって変なことになってしまった． 関数のスコープをまちがえる， という初歩的なミスだった． うう．
• その後も神山さん修論を読み直したり， 八甲田湿原計算に関する割算値 〜 GLM な構図を， 「脱」割算値 + random effects なベイズに置き換えるプログラミング & MCMC 計算， など．
• そして夜は M2 なデータ解析こんさる． まーた WinBUGS vs ゐんどーづ (XP) の対立が原因と思える挙動不審が． 以前に発見したのは model file への絶対パスに「デスクトップ」 といった日本語文字が含まれていると正しく動作しない， といったわかりやすくて阿呆らしいエラー． 今回は日本語文字はパスに含まれていないのに， あるパスでは動作せず (いま思うと「長すぎる」とダメなのか?)， 別のパスでは動作するといった奇怪な挙動だ． R2WinBUGS からゐんばぐす (ver.1.4.3) を呼び出したときに log 窓が check( という表示で BUGS コードやりかけのまま止まり， なぜか trap 窓がでて incompatible copy うんぬんと表示されてたな …… これをいま 検索 してみると， いくつかそういう報告があがっているようだ．
• そして石狩浜海浜植物の作図問題． 私が以前に作った作図プログラムがうまく動作しなかったりするのを修復．
• へろへろと撤退． 2100 研究室発． 晩飯． 2220 帰宅．
• [今日の運動]
  • また悪しきうんどう怠業生活周期にとらっぷされている ……
• [今日の食卓]
  • 朝 (0810): 米麦 0.6 合． ハムエッグ． キャベツ・ニンジン・ネギ・炒めシイタケのサラダ．
  • 昼 (1310): 研究室お茶部屋． 納豆巻．
  • 晩 (2140): 晩飯をつくる気分でもなかったので， 自宅ちかくの Globule で豆スープカレー．