ぎょーむ日誌 2007-05-07

2007 年 05 月 07 日 (月)

• 0820 起床． コーヒー． 朝飯．
• …… また朝から アカマツ 計算にかまけてしまった …… 0940 自宅発． 曇． 0955 研究室着．
• アカマツ当年生シュートの資源獲得・資源分配 & バイオマス成長の階層ベイズモデル， 初期重は「小さめ」という前堤で計算できないか試行錯誤している． 「葉重の初期重量の平均 1 dw g」 なる事前分布のもとで MCMC 計算して得られた推定結果を plot してみると …… うーむ， 変なズレかたしてるな．

• 8 月の沖縄研究会のあと， 琉大のほうにしばらくおじゃますることに．
• アカマツ試行錯誤つづく． 初期重に「個体差」いれても収束はがたがたになるわ， 「変なズレ」は改善されないわ ……
• 成長速度に「個体差」をもたせるのもなかなかもっともらしいのだが …… 指数関数的なバイオマス成長に「個体差」もたせるのは， なんというか sensitive すぎるというか， ここで何もかも「説明」できてしまうのでマズい， とわかった．
• 資源分配きりかえの中間点を個体ごとに可変とする， ってのはもっとマズい， とわかった． すごくむちゃくちゃになる．
• 資源分配関数を「個体差」で上下させると， チェンバー実験のほうはかくのごとくがたがたになる． 収束もよろしくない．

• いきづまったので昼飯．
• アカマツ計算． 成長期間に「個体差」いれるとかなりガクガクした fitting になる， と．
• 「個体差」による説明をあきらめて， 初期重をすきなように選べるようにするとこうなってしまう， と ……

• たいへんウスい壁で仕切られた隣の部屋 (講義室) では， なぜかしら東さんが何やらでかい声で 「えー， DNA ってのはだなぁ……」 と 「高校生物」 みたいな授業やってるな …… まあ， ここ地環研にくる大学院生たちの勉強履歴は「個体差」おおきいので， それに対応してるつもりなのかもしれないが．
• 初期重小さめ & アカマツ「個体差」あきらめモデルにおいて， 資源分配の中間切り換え点をもっと自由に選ばせるようにしたら …… ちょっとはマシなみかけか?

• 1750 研究室発． 1800 帰宅． 晩飯．
• とりあえず， ここまでの推定結果をわかってもらうため， アカマツモデルのごく簡単な 説明 とか書いてみる．
• お， 地震 だ． 時刻は 2309．
• アカマツモデル説明のメイル書き．

…… と同時に， 生理生態の分野で， こういう観測データが得られたときに， 成長段階の各時刻における資源分割をこうだと仮定した (素過程の組みあわせにすぎない) 簡単なシュート成長モデルを構築して， 観測データにあわせてそのパラ メーターを推定しました， というごく基本的なハナシなんかは 意外と考えられてないような気もします． 皆さん， 割算値に依存しすぎではないでしょうか ……

• [今日の運動]
  • 脱うんどう休養日， をめざしたい ……
• [今日の食卓]
  • 朝 (0840): モリモトのバタール． ネギ・豆腐・卵の炒めもの．
  • 昼 (1400): 研究室お茶部屋． モリモトのバタール．
  • 晩 (1920): 米麦 0.8 合． ネギ・タマネギ・シイタケ・豚肉の炒めもの． キュウリ．