ぎょーむ日誌 2006-06-29

2006 年 06 月 29 日 (木)

• 0800 起床． 朝飯． コーヒー． 0925 自宅発． 曇． 0940 研究室着．
• R ねた． Gören Broström さんのアナウンスによると， library(glmmML) が新しくなったよーだ．

  A new version of 'glmmML' (0.28-4) is uploaded to CRAN. The most
  important new feature is the possibility to get a p-value for the test
  of the hypothesis that the variance of the random effects is zero, on
  the wishlist of many R users these days! Note two things: (i) glmmML
  only treats random intercepts for binomial and poisson models, (ii) the
  p-value is calculated thru bootstrapping (can be slow with large data sets).
  

• もひとつ R ねた． 私は棒グラフとかまったく好きではないんだけど， 世の中には棒グラフまにあがたくさんいる現実もあるわけで …… gregmisc package 中の library(gplots) の中の barplot2() 関数を使うとこういった図を生成できる．

• ネット雑用とか， 甲山さんとモデリング雑談とか．
• 母子里 Gibbs 林冠モデルの MCMC 計算コードみなおす． 今年の 二月後半ごろ からやってた計算だが …… これまたよくもまあ短期間でこんなめんどうな計算をやってくれたものよ． なンかぜんぜん記憶がよみがえらん．
• 昼飯前の時間はこういったあれこれだの， 断片的な勉強だのでオワってしまった． 昼飯．
• 院生たちが明日の研究院じんぱ， 明後日からの屋久島調査の準備とかでもりあがっていて， ややえきさいとぎみ． 私は周囲を警戒しつつ廊下を移動．
• 論文あつめあれこれ．
• 本日も進捗よろしくないなあ …… と撤退しようとしたところ， 屋久島調査地地図づくり指令が． R による調査地地図づくりは楽しいのでついつい没頭してしまう．

[個体番号つき位置図の例]

調査区もうけて研究するヒトはほぼ必ず必要としているにもかかわらず， R でも使わなければなかなか作れない個体番号つき個体位置図． R を使えばすごく簡単， という記述は 昨年 8 月 のぎょーむ日誌とかに．

• 2030 研究室発． 2050 帰宅． 晩飯．
• [今日の運動]
  • なンとも不調なうんどう休養日つづく
• [今日の食卓]
  • 朝 (0850): 米麦 0.6 合． ゆでサケ．
  • 昼 (1330): 研究室お茶部屋． 米麦 0.6 合． ゆでサケ． インスタントみそ汁．
  • 晩 (2200): 米麦 0.7 合． ニラ卵炒飯． 麻婆豆腐．