ぎょーむ日誌 2006-03-20

2006 年 03 月 20 日 (月)

• 0750 起床． 朝飯． コーヒー． 0935 自宅発． 雪． 0950 研究室着．

[三月の吹雪]

また積雪しており冬に逆もどりしたような景色だ． しかし札幌がいかに風雪にまみれようとも， すでに冬は終わってしまい， 今週末は生態学会新潟大会である．

• 亀山さんのゐんどーづ機にファイル転送なクライアントソフトウェア のインストールぎょーむ …… 今まで知らなかったんだけど FileZilla というのがあって日本語化などもススんでいる． 「まあどうせ他人の PC だし」 という無責任なぽりしーでインストール． なかなか使い勝手がよい． しかし SFTP 転送ってすごく遅いな …… と思ってたらこれはあたりまえで， 転送内容を暗号化するところでてこずってるわけね．
• 苫小牧の平尾君が早くも (というか私がおそいだけだが) 講演ポスター作って送ってきたのでさっそく拝見する． メイルでコメント． けっこう時間かかる．
• 割り算とかイヤなんだけど， 「面積 21.78 m² の林分に 40326 枚のダケカンバ葉が……」 とか言ってもわかりにくい過酷な現実と妥協して leaf area index (LAI) といった割り算値を計算せねばならぬことに ……
• LAI
  • Gibbs 林冠: 4.56
  • FlatLeaf 林冠: 2.00
  とうぜんこの葉面積の違いは二酸化炭素固定速度にも反映されるわけで， てきとーなる光-光合成曲線のもとでの生産速度は
  • Gibbs 林冠: 113 g ha^-1 s^-1
  • FlatLeaf 林冠: 62.7 g ha^-1 s^-1
  • Monsi-Saeki 林冠: 75.7 g ha^-1 s^-1
  単位は少しヘンなものだけど， まあいいでしょう． で， これをマにうけると， 「葉っぱは平板」な従来型モデルは生産力をかなり過小推定していることになる． おそらく「平らな葉」の遮光効果が効率「よすぎる」ため， ということなのだろう (あと光-光合成曲線の飽和とも関係ある)．
• 光合成速度測定器に「おてがる LAI 計算」 と 昼飯． 窓の外は暴風雪． 真冬みたいだ．
• 葉面積指数だの林冠生産力だのの計算． R で． このあたり単位の換算がむやみにあって楽しくない． 表で示すべきか， と思ったんだけど図でまとめてみる．

[LAI と生産力]

あとで生産力計算のときに， 葉っぱの光透過がぬけてたことに気づいて再計算． いやはや．

• 院生のみなさんもポスター作りが佳境のようで．
• そういう状況ではよく雑談に拘束されたりするのである．
• 私は LaTeX でポスター作ってるんだが …… 院生たちは Adobe Illustrator 派と poorpoint 派が半々ぐらい …… いや， 世間の風潮にながされて後者がやや多いか?
• みなさんが言うところでは， poorpoint で A0 サイズのポスター作って， これを Adobe Acrobat で PDF ファイルに変換しようとすると， なぜかしらレイアウトとか狂ったりするそうで …… 頼るべきでないソフトウェアに何もかも片づけようとするむくいだ， とも言えるわけだが．
• さて， OpenOffice.org なら問題なく PDF 出力できるので， poorpoint からそっちに移行すればいいぢゃん， とおススめしてみたんだけど …… この解決策は半分正解で半分まちがいであった． 「よゆーあるマシン」「『ヘンな操作』してない poorpoint」 の組みあわせなら何も問題なく PDF エクスポートできる． しかしながら，
  • メモリによゆーのないマシン: poorpoint より OpenOffice.org (ゐんどーづ版) はメモリを食いつぶすらしく paging がしょっちゅう発生する …… 他のソフトウェアは閉じてるのにどうしてそうなるんだろう， といぶかしく思っていたんだけど， 考えてみると OS (XP) 自身が資源をくい散らかしてわけね
  • 呪われ poorpoint ファイル解毒失敗: いまだにおひすファイルは (ユーザーから見えない) 隠れコードがうまくあつかえてないらしく， OpenOffice.org で開いたときにそれが顕在化して (たとえば) フォント指定などが変わっていたりする
  まあ， あと R から copy & paste ではりつけられた図， とか? もうちょいマシな図のはりつけかたがあるとは思うんだけど．
• 雑談 & とらぶるシューティングに巻き込まれつつ， 夜中ちかくになってよーやくポスターがひととーり完成．

[とりあえずポスター]

大学院生たちに 「字が多すぎる」 と叱られる． アップロードして共著者の小林さん・加藤さんに連絡． まあ水曜日の午前中には印刷屋にだせるだろう ……

• 2430 研究室発． 吹雪． すげー寒い …… と思ったけどあとで調べたら気温は氷点下 1 度だった． 強風で体感温度が下がったのか． 2445 帰宅． 晩飯．
• [今日の運動]
  • また運動休養日
• [今日の食卓]
  • 朝 (0840): 米麦 0.6 合． ネギ・ハクサイ・しらたき・豆腐の煮物．
  • 昼 (1420): 研究室お茶部屋． 米麦 0.5 合． ネギ・ハクサイ・しらたき・豆腐の煮物．
  • 晩 (2510): 米麦 0.8 合． ネギ・ハクサイ・しらたき・豆腐の煮物．