ぎょーむ日誌 2005-06-07

2005 年 06 月 07 日 (火)

• 0700 起床． 朝飯． コーヒー． 論文よみ． 0925 自宅発． 晴． 0940 研究室着．
• 生態学会雑用． なんちゃら委員会のメイリングリスト (管理ソフトウェアは Majordomo) をメイルで管理できるよう設定 (といっても例によって turbolinux appliance server の web interface 上でごちゃごちゃするだけ) ・試験運転する．
• 本日のセミナーの予習の論文よみ． 種子発芽． その実験データの解析なんだが …… あいかわらず arcsin だの square-root だのの変数変換やって 「``count'' データはこうやって ANOVA すりゃいいんだ」 と「お勉強」ぶりを喧伝するもの (それぞれ二項分布・ポアソン分布を仮定した解析やるべきだよね)， 301 植物種の発芽特性を何やら興味ぶかい logistic 回帰 & 尤度比検定に帰着させているもののその過程がひどく難解なもの …… いろいろありますな．
• なぜ変数変換がまずいか? 理由はいろいろある． ひとつには， 現象を説明するモデルとして複雑すぎるのである． 「発芽率」とやらの観測値が (シャーレ内種子数 N とかに関係なく) ``逆'' arcsin 正規分布 などという想像困難な確率分布からのランダムサンプル値である …… てな面妖オカルト理論は難解すぎるので， われわれ科学者の単純アタマでは理解できないのである．
• それよりは一個一個の種子の発芽がある何らかの確率で決まっており， その N 個の集積が「発芽率」として観測される， というハナシのほうがわかりやすい， ってことで．
• などと書いてたら Majordomo のパスワード設定まちがってる， とのご指摘いただくし． えーい， やはり /var/lib/majordomo 以下の設定ファイルを直接かきかえるほうがすっきりしている．
• そして 先日の 専攻化院生むけ ML 連絡どたばたに関して 「私が連絡用 web page 作れって言われたんですけど」 なる困惑 (内心激怒?!) メイルが専攻科秘書さんから …… これも予想どーりというべきか． ということで， やはり事務連絡用 tDiary (院生用にインストールしたあれ) を流用するしかないかな． しばらくお待ちくだされ返信．
• また論文読み． 昼飯．
• 1300 研究室セミナー， 本日は実吉さんでケムリ発芽なハナシ． 内容をごく乱暴に要約すると
  1. 植物の種子の中にはケムリかけられると発芽するものある
  2. 植生火災のあと植物はいろいろな方法で「わいて」くる
  とゆーものだったんだが …… はてさて， 実吉修論は 1. と 2. のどちらを重視したものになるのか， そのあたりはいまだ秘密にされているようである．
• 1530-2130 生態学会の呪われサーヴァー設定に苦闘する． あえて原因を断定するならば， TurboLinux Appliance Server (TLAS) なるしくみがヘボい． ヘボいと言って悪ければお手軽に危険だ． いっけんお手軽に見えるけれど， 正しく設定するには相当の知識が必要である． そして， こいつのウリである「仮想サイト」なる機能のせいで いろいろな限界と妥協が生じる．
• この「仮想サイト」なる実体は named & httpd & sendmail のやや面倒なる設定の組みあわせにすぎない． しかしながら， ここでちょっとややこしいことをやると何もかもぼろぼろに壊れていく， という点において「お手軽に危険」なのである．
• この中で一番安全なのは httpd である． まあ， Apache の設定方式は頑健だからなんだろう． これは問題ナシ．
• DNS (named)． これは相当に気合いと注意力が必要である． まず仮想サイトごとに「えいりあす」なるものがあちこち指定できるけれど， これは名前衝突に無頓着だとめちゃくちゃなことになる (おかげで昨日から数時間前まで新潟大会の web page が閉鎖状態だった……いやはや)． このあたり CNAME で実現してるんだけど， TLAS 内の世界ではほとんど役にたたんのではなかろーか? とりあえず CNAME 全廃した．
• では， ひとつの IP アドレスに対して複数の host 名をつけたいときにはどうしたらよいか? このときには A (アドレス) レコードを複数ならべればよい． んなことやっていいのか， と思われるかもしれないけれど BIND ``バッタ'' 本にも OK と書いてあるし， RFC1912 ``DNS の運用と設定においてよくある間違い'' でもむやみに CNAME 使うなと書いてある．
• で， 生態学会の呪われサーヴァーではどうしてるかとゆーと TLAS で
  1. DNS (primary service): 必要な「仮想サイト」ホスト名だけ IP と正引きで対応させる (「エイリアス」は使わない)
  2. 「仮想サイト」: DNS で指定した IP アドレスのみ使う; 「エイリアス」は使いみちナシ (たぶん)
  と設定した． 試行錯誤してると /etc/named/db.* といったファイルを直接さっさと書き換えたくなるもんだが， これは禁じ手である． どうも TLAS は別のデータベイスでも持ってるらしく， そういう「ぢか書き」設定は無視されるのである． がまんして web interface で書き換えていくしかない．

• 最後に， メイル (sendmail) & メイリングリスト (majordomo)． 絶望というほかない． これは TLAS の「仮想サイト」のわけわからん部分の悪影響， としか思えんところで． 「仮想サイト」のヘンなところとして
  • ドメイン名むきだしのホスト名は許されず (ただし DNS では設定できる) www だの mail だのといったよけーな「ホスト名」が必要とされる
  • この「仮想サイト」内ユーザーのみ メイル送受信が許されている (しかし送信が簡単でないのは 二ヶ月前 に書いてあるとーり)
  • この「仮想サイト」内ユーザに見えるユーザーは 単なるふつーの Unix user なので， 名前衝突に気をつける必要がある
  で， 以前に調べたとーり， 「仮想サイト」という牢獄の中からメイルをだすには sendmail -f ... といった工夫が必要になる． そしてこのあたりが数時間にわたって本日も私を苦しめたわけで ……
• 発端は某委員会用メイリングリストの設定を工夫してる竹中さんが Subject に通し番号つけられないことを発見．
• で， 当方で調べてみると majordomo はこのあたりがヒドくて， resend っていう標準的な配送用 Perl スクリプトをやめて sequencer なる別ものを使わねばならん， とわかった (Linuxexpert など参考にしつつ)．
• 基本的な設定方法はネット上のあちこちで説明されてるとーりなんだが …… この sequencer なる Perl スクリプトはじつに劣悪なしろもので …… この中味を解読し， /etc/mail/aliases.majordomo を書き換え (書き換えたら /usr/bin/newaliases の実行が必要)． たぶんもう使わんだろうけど， オプションのつけかたの順番 (最初に -C) 決め打ちなところもあるので書いてみると

  |/usr/lib/majordomo/mj-wrapper sequencer -C (設定ファイル)  -l testML -N -h (ホスト名必要) -f (sender 設定) testML-list
  

  てなかんぢか．
• …… といろいろ試行錯誤してみたんだけど， この TLAS 内の気難しい sendmail に食わせられるまともな mail header が生成できんかった (resend だとなぜか問題なくとおる …… 単純に sendmail -f してるだけなんだが)． 上記の TLAS 的ユーザー管理のおかげである．
• どうやってもダメなので， 2130 なげる． ここの研究室で運用してる qmail + ezmlm だったらすごく簡単なのに …… いやいや， アヤしげユーザー管理の TLAS 世界では qmail さえもまともに動作せんかもしれんな．
• かくもがまんにがまんを重ねて TLAS 使っている理由は， ここでこの「お手軽 Unix 設定」のわくぐみから逸脱すると， 「これって久保にしかわからんのでしょ」 とか言われて私が半永久的にこの機械の無償管理者 (すなわち生態学会奴隷) にさせられてしまうからだ． ここは何としても「オレ流」をだしてはいかんところだ．
• …… とゆーよーなきちがいじみた「敗走記録」を書き残してから撤退． 2300 研究室発． 1900 帰宅． ばてきった． 晩飯．
• [今日の運動]
  • 呪われ休養日
• [今日の食卓]
  • 朝 (0800): 米麦 0.7 合． ハクサイ・干しシイタケ・豆腐・煮干の味噌汁．
  • 昼 (1220): 研究室お茶部屋． 米麦 0.5 合． ハクサイ・干しシイタケ・豆腐・煮干の味噌汁．
  • 晩 (): 米麦 0.7 合．