ぎょーむ日誌 2001-09-16

2001 年 09 月 16 日 (日)

• 0830 起床．
• 現在時刻は 2315． 午前中は例によってあまり仕事する気になれんかったけど， 11 時頃からいままで PipeTree の調整やってた．
• まず複数の樹木による集団シミュレイションやったとき 死亡処理がうまくいってなかったようなので， このあたりを修整． 死んだ樹木をきれいに片づけるだけなんだけど， なかなかややこしい． 個体内であちこちに「死んだよ」という 死亡通知を出して順序正しく殺していかないと メモリリークが生じるからである．
• で， 死んだ個体のお役所手続きは問題なくなったんで (数日ぶりに core 吐きバグとか出たりしたけど)， 集団動態を計算しながらパラメーター調節作業を始める．
• ここ二日ほど 「テキはもう包囲した」 「だから，これから先は呪われ C++ を書く量を 1 行でも減らす」 「しかしアイテの挙動をよく見て変な兆候は見のがさない」 …… と遅まきながら頭の中をでっちあげ・開発モードから 解析・説明モードに切り替えようとしている． もう残り日数ないもんねえ．
• パラメーター調節といっても別に高尚なコトをやるわけでなく，
  • シミュレイションを実行する．
  • 結果を見て気に食わなかったら 原因を考える． パラメーターの値変えたり， コード中の数式をちょっと変更して 再試行．
  • うまくいってるように見えても 信用しないで破綻するまで条件を変えてみる．
  • 破綻したら原因を考えて システムを改善する．
  …… ということの繰りかえしである． もはやライブラリを書き換えるような大ワザは使わない．
• 試行錯誤 …… といっても， もはや 30 個体とかを同時に計算するので， えらく時間がかかる． けちけちライブラリは今のところ順調であり， メモリが足りずに計算できません， とならないのは救いである．
• バカみたいに時間を食うパラメーターセット与えたときは， 晩飯の材料を買いに行って帰って来てもまだ 計算が終了してなかったほどである． まぁ， しばらくはこういう「……ながら計算」の生活になりそう．
• どーも， いまの実験設定の限界というか， パラメーター調整・モデリングのまずさが露呈してる というか ……

[消滅する林分] 2m 四方ぐらいの周期境界林分に 30 個体ぐらい投入すると， 十数年で死ぬ個体が出始めるのはよいとして， 30 年すぎたころに過酷な競争に耐え切れず (?) 全個体がほぼ同時に消滅するのは …… ちょっと脆弱すぎるような気がする．

• よろしくない点あれこれ ……
  • 一辺 2m 周期境界独房では 高さ 300-400cm 程度の個体 1 本が限界． これは少なすぎないか? 状況にあわせて 樹木をうまく変形させれば もうちょっと詰めこめるはず．
  • 周期境界壁で囲った領域が 個体サイズに比して小さくなってきた場合に， 末端の数が徐々に減じてきて …… いきなり「クラッシュ」というかんじで 全末端が切り捨てられることがある． これは末端サイズが 何らかの理由で均質化しちゃってるんだろう． ちょっといまの「切り捨てサイズ」は 厳しくしてはいる (腹だたしいことに， ちとゆるくしただけで計算時間が急増する)．
  • 樹木中央先端 …… Verital 主軸は常に側軸にかなり資源取られるので， 個体全体が暗い環境におかれた場合に 死ぬことがままある． これでは目の上の邪魔個体が消滅したときに 敗者復活ができない． 現在の優遇措置に加えてさらに何か必要． 無理やり不死にするか?
  …… などなどと残り日数も少ないのに， 挙動不審のネタはつきないのである．
• アロメトリ教の戒律をむやみに変更するわけにはいかんので， 外部から直接観察不可能なサブモデル ―― いわば観察者にとってはブラックボックスのような 部分の調整にも手をつける． この Abies PipeTree でそういう怪しい機能を担っているのは， 光合成らしきことをやってる資源同化部分 Assimilator と， それを末端に配分してる ResourceAllocator である．
• 個体全体で稼がれた資源はいったん全部プールして (現実の植物でそんなことやってるかどうかは知らんけど， まぁ，そういうモデリングということで)， また各末端に再配分してる． このときに平等に配るのではなく傾斜配分やってる． さて， どういう末端に資源配分すべきか．
  1. よく稼いだ末端にたくさん資源をやる．
  2. 効率良く稼げる場所にいる末端にたくさんやる．
  などなど， いろいろな評価基準が考えられる．
• ここしばらく， とくに理由もなく (というわけでもないんだが) 1. のようにやってた． では 2. のように切り替えてみたら …… ああ， ちょっと妙なところに 葉っぱクラスターが形成されたりして嫌だねぇ．
• さらに枝次数でダンピングしてみたら …… とかいうふうに あまり根拠のない試行錯誤が続くのであった． やれやれ．
• けべっく出発まであと 10 日．
• 今日の食卓
  • 朝 (0930): 蕎麦．
  • 昼 (1350): 米 0.7 合． 卵炒飯． 野菜がなかった．
  • 晩 (2020): 米 0.8 合． タマネギ・シイタケ・煮干の味噌汁． オクラ納豆． シシトウ・ヒラタケのウスターソース炒め． ああ， おかずの種類が多い!