ぎょーむ日誌 2016-09-(01-10)

2016 年 09 月 01 日 (木)

• 0520 起床． 海馬りはびりてけてけ走 30 分． 朝飯の準備その他ばたばた． 0830 保育所着． 0900 研究室着．
  • 孤高の島国・アイスランドの歴史 -世界史専門ブログ- reki.hatenablog.com/entry/160901-I… "北海道と四国を足したほどの面積に、東京都目黒区ほどの人が住んでいる計算です……産業は昔から牧畜・漁業が盛んでしたが、現在では金融産業が主力になっています"   11:52:14
  • 生態学複数の限定的資源の添加は草原の多様性を低下させる go.nature.com/iREib9 "植物バイオマスの影響を考慮して調整した後でも…資源の供給を増加させるとニッチの次元が減って多様性が低下し、生産力と種構成のターンオーバーが共に増大することが分かった"   12:32:18
  • 生態学会さーばー雑用…SSL 保証書の交換，なんとか終了．最後の Plesk UI な操作を完全にド忘れしてた…いやはや…2013 年のぎょーむ日誌 hosho.ees.hokudai.ac.jp/~kubo/log/2013… に助けられた…年に一度の複雑作業． pic.twitter.com/B7PgXNGgTo   13:16:38
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  • RT @AstroKatie : It's OK to be sad when a beautiful hypothesis is killed by ruthless data. But take comfort: its sacrifice makes the herd stronger.   18:47:02
• 2100 とら寝かしつけ …… 夜の「Pokemon Go!」で少しは早くねてくれたか ……

2016 年 09 月 02 日 (金)

• 0520 起床． 朝飯の準備その他ばたばた． 0830 保育所着． 0900 研究室着．
  • RT @ibaibabaibai : 深宇宙にたどり着いたカメラが送ってきた、1,000枚の写真｜WIRED.jp wired.jp/2016/08/11/100…   07:46:42
  • RT @ogugeo : フランス南部の Tuc d'Audoubert 洞窟の中にある約14,000年前に粘土で作られた二頭のヨーロッパバイソンのレリーフ。 imgur.com/O3hQtLL 1912年に発見され、後に年代測定で非常に古いことが判明。知名度は高くないが精巧で重要な考古遺物。   10:19:27
  • 『〆切本』あの大作家は書かないのか、書けないのか - HONZ honz.jp/articles/-/43274 "誰しも学校の試験前に掃除をしたり、部屋の模様替えをしたりした経験はあるはずだ。作家も同じらしく、〆切前に不可解な行動をとることはあるようだ"   11:29:16
  • 白亜紀末にいるはずのない小型翼竜を発見 natgeo.nikkeibp.co.jp/atcl/news/16/0… "この時代の小型翼竜の化石が見つからなかったことから「小型翼竜は鳥類に取って代わられた」との推論があらわれ、さらにその理由として「翼竜は生き残るために大型化をたどった」と考えられるように…"   11:33:18
  • RT @KamiMasahiro : 東大の研究不正が大きく報じられています。何人かの基礎の教授に聞きましたが「100％アウト」と口を揃えます。東大本部は、どのような対応をとるのでしょうか。 以下が告発文です。 ow.ly/d/5cvq ow.ly/d/5cvr   13:43:51
  • 気候変動観測衛星「GCOM-C」ってのはこれか www.jaxa.jp/projects/sat/g… 北大苫小牧研究林に設置された検証サイト(500ｍ×500ｍの大規模調査区…の地上部バイオマスや葉量の計測など) を光学観測するとのこと www.hokudaiforest.jp/%E7%8B%AC%E8%8…   14:18:56
  • 気候変動観測衛星 GCOM-C1 はまだ打ち上げられてない（今年度中?） ja.wikipedia.org/wiki/%E5%9C%B0… GCOM-C は極軌道をとり "降交点通過地方太陽時は10時30分±15分の午前軌道"…苫小牧研究林は何やら位置的に都合がよいらしい…と林長に教えてもらった…   14:25:57
  • RT @MethodsEcolEvol : The "should you log-transform counts" saga continues (by @ecostats , @mitchest , @Jakub_Stats & Tony Ives) bit.ly/2cf1FNy #OpenAccess   21:59:25
  • 遅ね遅おき４才児ぼーい先生の生活リズムをシフトさせるべく…ここ数日「夜のモンスターハント」に GO!…まあ2kmぐらい歩きまわると就寝時刻が30-50分ぐらい早まる効果があるよーなないよーな…ぼーい先生，夜あそびで満足，従者はくたびれ…まあ，ベッド本読み時間はすこし短縮したかも…   22:07:25
• 2120 とら寝かしつけ …… 苦闘してます ……

2016 年 09 月 03 日 (土)

• 0520 起床． 海馬りはびりてけてけ走 30 分． 朝飯の準備その他ばたばた．
  • RT @jeremystan : Just discovered alt + mouse selects a rectangle of text in @rstudio pic.twitter.com/ELNa4C65Dd   15:25:07
  • RT @berobero11 : お。Wonderful Rシリーズの書名全部出てる！ pic.twitter.com/RzeZGiDjcS   20:34:01
• 午前， 台風のせいで気温が高くて暑いなか， ぼーい先生を宮の沢の皮膚科まで自転車でつれていくとゆーみっしょん …… しんどくて夏ばて．
• 午後も暑い札幌市内を自転車移動． 研究室ですこしうだうだ．
• 2140 とら寝かしつけ …… ばてつつ苦闘してます ……

2016 年 09 月 04 日 (日)

• 0530 起床． 海馬りはびりてけてけ走 30 分． 朝飯の準備その他ばたばた．
  • RT @monotropastrum : 『Stan: sparse CARをためす』Taglibro de H｜ ito-hi.blog.so-net.ne.jp/2016-09-04   13:28:15
  • RT @aminophen : 【告知】脚注番号直後で改行できない問題などに対処した新しい pLaTeX を出しました。ascmac パッケージは pdfLaTeX などでも動くようになります。 acetaminophen.hatenablog.com/entry/new-plat…   13:29:57
  • RT @jnishihiro : 木材の輸入を通して輸出国の生物多様性にどれほど影響を及ぼしてるか？「生物多様性フットプリント」について、西嶋さんたちの新しい論文。いまなら全文読める。 www.sciencedirect.com/science/articl…   13:41:11
  • 残暑ばて（札幌で⁇）&ぼーい先生ばてなのか、朝からカラダのあちこちイタい…今朝もふちょー感をおして札幌市電まつり随行員として出動…ふらふらいよいよひどく、念のため持参した体温計で…あらら38℃ちかい…教訓:カラダの痛み→すぐ体温測定 pic.twitter.com/AsBoIkXJhQ   16:05:09
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  • 札幌・大通公園の築山なすべり台。先天性「こわがり」かも…なぼーい先生も果敢に滑落してます…ここでレスキュー信号だして救助車をまつ… pic.twitter.com/WvpKQ3VRBm   16:10:35
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  • 午後はひたすらたおれています… pic.twitter.com/20TiwZ9OKP   16:12:11
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  • 免疫系の反抗体制が整ったらしく体温上昇中…ふらふらする…   17:25:50

2016 年 09 月 05 日 (月)

• 高熱で記憶がトンでます…
  • 昨晩は体温が40℃あたりまで上昇。今朝は平熱だったので、大学でサーバあれこれの停電あけ再起動。どうもアタマがふらふら気持ち悪いので帰宅。ベッドにもぐりこむ。検温してみたら37.9℃まで再上昇してた…今日もおとなしくしていよう…   11:04:07
  • 体温 39℃ちかくまで再上昇。なぜかカラダの震えが間欠的に…これは免疫の暴走ではなく、筋肉振動させて高熱状態にする生体防御の一種のようで… gooday.nikkei.co.jp/atcl/report/14…   11:33:11
  • 体温40.6℃…以前もこういう「育児ばて熱」を何度か経験したような…育児がヘタな親ががんばると（あるいは子どもの「〇〇やって〜」親コントロール能力が高いと）無意識のうちにすとれすふるになり、免疫系が衰えて病原体が増殖して高熱を発する…むしろ、めんたるクリニックであつかう問題か？   13:20:48

2016 年 09 月 06 日 (火)

• 0520 起床． 筋肉痛で歩行困難な状況に …… これは昨日までの高熱が原因みたい． 現在の体温は平熱． 0830 保育所着． 0910 よろよろと研究室着．
  • RT @berobero11 : ブログ更新しました→階層ベイズモデルとWAIC - StatModeling Memorandum statmodeling.hatenablog.com/entry/waic-wit…   04:28:14
  • RT @nj_tierney : So @rstudio now renders LaTeX equations inline, thanks guys! pic.twitter.com/k9m0Z6O9fa   11:06:49
  • RT @willyoes : 娘の日本語補習校、クラスメイトの３分の２が愛知県出身らしい。デトロイトは愛知と自動車業界で関わりが深く、日本人の一番多く住む地区はリトル名古屋と呼ばれている。   11:13:12
  • RT @cnn_co_jp : 通信途絶の彗星着陸機「フィラエ」発見、探査計画終了間際 www.cnn.co.jp/fringe/3508857…   11:49:02
  • RT @h_okumura : 『Rで楽しむ統計』サポートページ（）は昨日あわてて作りました github.com/okumuralab/Rfo… うまくいけばcd fig; makeで図版がすべて作れるかも（未確認）   14:01:16
  • RT @nakano_lab : 奥村晴彦先生の「Rで楽しむ統計」を概観した。 統計を学ぶテキストとして秀逸だと思う。概要の説明に続いて、Rでの記述例が示されているので、何となくわかったら早速やってみよう！という感じ。 因みに、エピローグは「ネ申Excelの黄昏」ｗ www.kyoritsu-pub.co.jp/bookdetail/978…   14:01:29
  • RT @h_okumura : 結城さんに負けずに私も:『Rで楽しむ統計』 www.amazon.co.jp/dp/4320112415 アマゾンで予約受付中   14:01:37
  • 奥村さんの新著「Rで楽しむ統計」送っていただきました！ありがとうございます．今までにないR本…という第一印象です．B5版本文179頁にもりだくさんながら整理された内容，おもしろい例題，読みやすい組版…たしかに「楽しい』です． pic.twitter.com/uRO03hKQtd   14:17:29
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  • RT @KamiMasahiro : 東大医学部問題について、私見を述べました。 jbpress.ismedia.jp/articles/-/47797 ノバルティス血液内科、iPS森口、JADNI、VART、眼科教授不正入試疑惑、研究不正です。宮園医学部長の責任が大きいと思います。不祥事が続く中、医学部長を続け、総長選挙にも立候補しました   14:32:06
  • 日曜・月曜日の40℃高熱，今朝は何ごともなかったかのように平熱…しかし，足の筋肉がなぜかしらひどい筋肉痛．背筋も痛む…うーむ，ぼーい先生の「だっこー」で酷使された部位がひへーしているのだろうか．発熱との関係は不明…「血液検査の結果をみても原因まったく不明」とのクリニック診断でした   14:48:14
  • RT @MinatoNakazawa : @h_okumura 【ご恵贈御礼】本日，ご高著『Wonderful R 1: Rで楽しむ統計』共立出版，ISBN 978-4-320-11241-4が届きました。ご恵贈くださりありがとうございます。普通の統計のテキストとは一味違った構成で面白そうです。   14:51:03
  • 「R で楽しむ統計」 www.amazon.co.jp/dp/4320112415/ の例題がおもしろいのは，奥村さんの好奇心によって広く長年にわたって蒐集された多くの「材料」の中から「ぜいたく」に精選されたものだから…という気がしてきましたよ…いまさらながら，好奇心は研究者の必要条件だなー…と…   15:15:09
  • RT @MinatoNakazawa : ぼくも「普通の統計のテキストとは一味違った構成」と書きましたが，「今までにないR本」，たしかにそうですね。 twitter.com/KuboBook/statu…   15:32:30
  • RT @UN_NERV : 【北海道 稚内市 避難勧告の対象地域を拡大】 北海道稚内市は、市内を流れるクサンル川の水位が上昇しているとして、避難勧告を出す地域を拡大しました。 nerv.link/Zg6sc4   15:37:43
  • RT @skmt_kun : 天は道北の交通網も破壊しようとしているのか   15:38:02
  • RT @kenmetrics : 統計関連学会連合大会の企画セッション「これからの統計科学を考える」に心理統計の立場で呼んでいただいたので「心理学におけるオープンサイエンスの進展と統計学にできること」という発表をしました。心評特集号とても参考にさせていただきました。 www3.psy.senshu-u.ac.jp/~ken/jjsm2016.…   16:48:31
  • 岡田さんの「心理学におけるオープンサイエンスの進展と統計学にできること」講演 www3.psy.senshu-u.ac.jp/~ken/jjsm2016.… のスライド，p値の分布がおもしろすぎる…近年になるほど悪化しつつある「ゆーい差」決戦主義でしょうか… pic.twitter.com/hMXezxC8Dg   16:58:51
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  • ２日つづいた高熱から脱した…と思ったら今日は歩行困難になるほどの全身筋肉痛…検索しても原因よくわからなかったけど，高熱→筋肉痛はよくある連鎖反応らしいとゆーことはわかりました．ひとあし早く，足腰や背筋がヨワって歩行困難になる老後の自分自身を疑似体験してしまったようなきぶんです…   21:39:41
  • RT @syakkindama : 方言を方言と認知していない北海道民には「自分は訛っていない」という驕りがある。   22:11:11
  • 50時間の高熱にやられていたせいか…体重が 2 kg 下落．まあ，筋肉の修復もままならぬ体内経済状況なんでしょうか…   22:27:54

2016 年 09 月 07 日 (水)

• 記録だつらく．
  • 植物生態学の場合，時系列データの少ない観測回数（<20とか）場合もけっこうあるのだが…各個体の実データをplot(acf(ts(x))) しても時間的自己相関が図示される場合とそうでない場合がある．これは単純な乱歩では再現できない．実験してみると乱歩+各時刻独立成分が必要みたい…   11:58:52
  • 単純乱歩は長さ20でもACFで「時間的自己相関アリ」と判定される頻度が高い．しかしここで各時刻独立の乱数を「てきとうに」に加えると植物の成長データにみられる，個体ごとに自己相関あり・なしパターンが再現されるみたいだ．状態空間モデルとかであつかうべき現象で，そうしてきたのだが…   12:02:58
  • データ解析に使っていた乱歩＋各時刻独立ノイズというモデルが観測された個体差（個体ごとの観測系列を調べると，個体ごとに時間相関の有無が異なる）のパターンを説明可能とは15分前までまったく気づかなかった．いやはや．個体ごとにACFがあったり・なかったり…に気づいたのが20分前ですが…   12:08:59
  • さらにいいかげんなハナシですみませんが…植物ではなく北海道の夏の平均気温など年一度のデータ，20年ぶんだと時間的自己相関なるものはまったくないし上昇トレンドなんかも推定できない，みたい．気象データなんかはもっと長く観測しないと時間的自己相関なんかも見えてこないのではないかな…？   12:12:35
  • 気象データでも100年ぶんぐらいのデータあれば時間的自己相関の効果は重要になりそう．気象庁サイトに丁寧な解説 www.data.jma.go.jp/cpdinfo/temp/t… ありますが時間的自己相関は無視しているので「ゆーい」な温暖化，状態空間モデルだと上昇トレンドあり，ただし事後分布は広い…   12:20:00
  • 気象庁が親切に公開してくれている長期データ www.data.jma.go.jp/cpdinfo/temp/l… を状態空間モデルあてはめ例（試行錯誤中）は hosho.ees.hokudai.ac.jp/~kubo/ce/EcoSj… ←こちら，下の図は時間的自己相関無視の危険例… pic.twitter.com/rKu81ZWIW1   12:25:37
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  • RT @went1955 : Theory and practice (via @AcademicsSay ) pic.twitter.com/pCX7D2TZB5   13:52:24
  • ばてばて→高熱風邪→全身筋肉痛→歩行困難…が昨日までのハナシ…今日は薬剤塗湿布をはりつけていたので…ついさきほど，よーやく手を使わずに椅子から立てるよーになりました．「クララ」の心境です．しかし，まだ床に落ちてるものを取るのは無理… pic.twitter.com/MSs8znUGpW   16:15:53
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  • 9/17-9/19 東京出張しないといけないんだけど…9/17(土)の東京周辺の宿がどこも予約でいっぱい…空室なし…みなさん，東京都を好きすぎでしょ…教訓：東京出張がきまったらまずは宿を取る．キャンセルわりと容易だから．あまり都心部に出張に行かないから，またど忘れするんだろうな…   16:20:22
  • さて，カプセルは避けたい…なにか策を…じつは先述の「空室なし」は条件つきであり，それを緩和すればなんとかなるかも…ありました，ごく少数ながら「喫煙」部屋が．まあ，どんかんな私なら何とかなるでしょう．JR蒲田そば．「かまたぁ？」いや，用務先移動には便利，おいしい珈琲屋もあります…   16:25:22
  • 今回の東京出張，都心部は回避して東京駅に直結する JR ぞいであれば，どこでもよかったのだが…まあ私の検索能力の限界で蒲田の喫煙部屋で雨露をしのぐことになりました．もっと良い解はあったのかも．もたもたしていて，川崎の禁煙部屋をゲットしそこねたのは…筋肉痛のせいにしておきましょう…   16:31:20
• 2140 とら寝かしつけ …… 苦闘してます ……

2016 年 09 月 08 日 (木)

• 0530 起床． 高熱→筋肉痛はじりじりとなおってきた …… 朝飯の準備その他ばたばた． 0840 保育所着． 0920 研究室着．
  • @kimegukurumi そういえばカプセルはまだ利用したことがないので，ちょっと体験してみたい気がしてきました…   09:43:50
  • RT @Kenmatsu4 : 先ほどの発表資料です！(*´ω｀*) 「AUCが0.01改善したって どういうことですか？」 www.slideshare.net/matsukenbook/d… #dslt祭り   09:49:32
  • R demos for BDA3 andrewgelman.com/2016/09/06/r-d… Gelman さんからのお知らせ．BDA3本の R 用デモソースコードができたそうでーす (Python 版などは以前からあったとのこと） pic.twitter.com/WXD1ynbmk8   10:28:57
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  • RT @tkobyashi : 行動計量学43巻2号に「計量政治学と行動計量学の接点」という特集が掲載されました。岡田謙介先生( @kenmetrics )と星野崇宏先生との仕事です。どの論文も大変面白いので是非ご覧ください。特集は次号にも続きます（たぶん）。 pic.twitter.com/PlC7MfPUDL   10:43:32
  • 新しい "The R Journal" でてますね journal.r-project.org/archive/2016-1/ …あ，"R" logo は古いままだ…新しい logo は cran.r-project.org/logo.html pic.twitter.com/9yqie8xuRG   10:47:51
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  • The R Journal Vol 8-1 "Spatio-Temporal Interpolation using gstat" journal.r-project.org/archive/2016-1… gstat を使った時間・空間の欠測補完，クリギング pic.twitter.com/gtyOjIse0v   11:17:20
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  • RT @tarohmaru : @KuboBook 確かにp=.07だったりすると、モデルを改善して5%水準で有意にしてやろうと思うことはある。ただ、モデルの改善はp値にかかわらず常に心がけるべき、というのが正論だろう。コストの低い実験だと偶然有意差出るまで実験を繰り返す人もいるとかいないとか。捏造は論外。   11:21:21
  • The R Journal 8-1 "Model Builder for Item Factor Analysis with OpenMx" journal.r-project.org/archive/2016-1… 項目因子解析（項目反応理論）のモデルビルダー …なんとベイズモデル化も可能なのか？   11:25:40
  • Gender Prediction Methods Based on First Names with genderizeR journal.r-project.org/archive/2016-1… 名前を見てジェンダーを予測する genderizeR pic.twitter.com/sEHZAY2JpB   11:32:26
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  • Annual Mean Temperature Trends - 12 Airports rclimate.wordpress.com/2016/09/06/ann… お，12 空港で測定された気温データの自己相関，いいねー pic.twitter.com/Aw7HZxqQa0   12:07:15
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  • 「統計数理」の「生態学における統計モデリング」特集号の冊子体が50部(!)とどいた…希望者に配布したいが，どうしたものか．各記事の PDF ファイルは www.ism.ac.jp/editsec/toukei… で無料でダウンロードできます． pic.twitter.com/fOOtCwqDKc   14:05:13
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• 2140 とら寝かしつけ …… 苦闘してます ……

2016 年 09 月 09 日 (金)

• 0610 起床． 体調はだいぶマシになってけど， 走るとかラジオ体操なんかは， まだムリなかんじ …… しんどい． 朝飯の準備その他ばたばた． 0820 保育所着． 0850 研究室着．
  • RT @uranoken : 【告知】SappoRo.R #7 を10月29日（土）午後に北海学園大学豊平キャンパスで開催します。講師および発表者絶賛募集中。 #SappoRoR bit.ly/SappoRoR7 pic.twitter.com/cPw9WukmOt   09:34:29
  • RT @shima__shima : 科学技術計算関連Pythonパッケージの概要 by @shima__shima www.slideshare.net/shima__shima/p… 本日の FIT2016 での講演 www.ipsj.or.jp/event/fit/fit2… の資料を更新し，ダウンロード可能にしました． よろしければご覧下さい．   09:45:26
  • RT @wired_jp : かくも奇妙で美しい、鳥たちの「飛行模様」 wired.jp/2016/09/09/xav… #最新記事   11:11:49
  • 札幌の人口　まもなく減るの？ dd.hokkaido-np.co.jp/news/area/sapp… "少子化などで２０２０年までに人口減少が始まるとする市の推計だ。だが…１５年国勢調査速報値で、市内の人口は推計を大きく上回る１９５万４千人になった。専門家は今後も増え、「２００万人都市」になる可能性も"   12:49:36
  • いっぽうで北海道全体の人口は5年間で2.2%ほど減っています… 北海道の人口2.2％減の538万人　札幌の一極集中進む　　：日本経済新聞 www.nikkei.com/article/DGXLZO…   12:57:22
• 2140 とら寝かしつけ …… 苦闘してます ……

2016 年 09 月 10 日 (土)

• 0600 起床． まだふちょー感つづき， うんどー休養日もつづく …… 朝飯の準備その他ばたばた． 0830 保育所着． 0850 研究室着．
• 茗荷谷準備ぢりぢり ……
  • 統計数理「生態学における統計モデリング」特集号 www.ism.ac.jp/editsec/toukei… の執筆者の一人・仁科さんblog「状態空間モデルを使ったリター分解のパラメータ推定」のすすめ… forest-environment.cocolog-nifty.com/forest/2016/09…   09:54:52
  • RT @robustgar : same data, different representations garstats.wordpress.com/2016/05/27/the… pic.twitter.com/yGKwm46aXG   13:56:41
• あれこれやりくりを工夫して， なんとか …… 2130 とら寝かしつけ …… 苦闘してます ……