ぎょーむ日誌 2015-06-02

2015 年 06 月 02 日 (火)

• 今日も記録だつらくぎみ ……
  • boxplot に「のっち」(くびれ?) をいれるのは notch = TRUE 指定だけでいいのか…! twitter.com/datasci_blogs/…   08:53:55
  • RT @shima_usa96 : 「人生で最も大事な時は、誕生でもなく、結婚でもなく、死でもなく、原腸陥入である」by ルイス・ウォルパート（英国の発生生物学者）。   09:01:34
  • "俺のオワコンコマンド整理" - 続 カッコの付け方 iga-ninja.hatenablog.com/entry/2015/05/… 終→新 grep → ag telnet → nc netstat→ss ifconfig→ip a route → ip r cpan → cpanm screen → tmux   09:39:32
  • RT @hatebu : 医学は科学じゃないんだよ『医学と仮説』: わたしが知らないスゴ本は、きっとあなたが読んでいる (51 users) bit.ly/1FR4z4c 10件のコメント b.hatena.ne.jp/entry/dain.coc…   16:45:42
  • JAGS が WinBUGS よりも「収束が遅い」とか，あれこれねがちぶな tweet ばかりしていた私ですが…じつは library(runjags) の使いかた，すごくまちがってたかも?…という可能性に気づきました…「chain ごとに初期値は明示的に設定する必要あり?」…   20:45:31
  • じつに21時間もかけた JAGS のサンプリングが図のようになっていて…runjags でJAGS並列化する場合「全 chain で明示的に初期化が必要かも?」と気づいた次第…同じモデルでも計算時間にばらつきあり?という疑惑もあって… pic.twitter.com/fjJtjsX2IN   20:50:53
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  • …ということで，並列化 JAGS の chain ごとに無難な範囲の乱数初期値を与えて再計算してみます．ひょっとしたら，「収束」が改善するだけでなく，サンプリングも速くなるかも…どうなることやら?   20:54:38
  • WinBUGS+R2WinBUGS，JAGS+rjags，Stan+rstan の場合，chain ごとの初期値を指定しなかった場合は，ひとつだけ与えた初期値セットを自動的に「使い回して」くれるんで…ぜんぜん非推奨な初期値設定なのですが，ついついさぼってうクセがついてしまって…   20:57:57
  • しつこいですが…とりあえず問題が生じているのは JAGS と library(runjags) のくみあわせで並列化したとき．私の憶測にすぎないのですが，この状況で明示的に初期値を指定しなかった場合，何かすごく変な初期値セットが与えられるのでは…疑惑を解明するべく実験してみます．   20:59:44
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 3 回
• [今日の食卓]
  • 記録だつらく