ぎょーむ日誌 2012-07-10

2012 年 07 月 10 日 (火)

• 0620 起床． ラジオ体操． 弁当の準備． 朝飯． コーヒー． 0750 自宅発． 0820 研究室着．
• 今日はめずらしくヒトと話した一日だった． 仕事はススまなかったけど．
• 朝はまず先日の SappoRo.R #1 で知り合いになった中村さんと． ハナシがおもしろすぎ． ついでといっては何だけど， 生態学会さーばーの SSL 保証書についてのびぢねすハナシなども．
• 1030 より研究室セミナー， 今日は保要さんでモウセンゴケ・ナガバモウセンゴケの花数・種子数・栄養繁殖有無の 体サイズ依存性 & 種差． 統計モデリングまわりは全部やりなおしたほうがいいけど， ともかく D 課程後半の大学院生が「脱出」が何より重要なので， ともかく最短距離でのりかばりーを……!!
• 昼飯．
• お茶区画で川井さんとハクサンイチゲ・エゾエンゴサク・ミヤマリンドウ の個体群動態モデルの議論． 昨年度の修論にあった， エゾエンゴサク個体群動態解析があまりにも古くさくて不適切でぼろぼろなので， 「現代における植物個体群動態のモデリングがこんなめちゃくちゃであっていいはずない」 という動機があって， そのあたりをひっくり返していくことを検討している．
• 川井さんは，じつはそのあたりのデータ解析・動態モデリングのセンスがかなりあり， エゾエンゴサクしたうけとか自分の研究とかで 「行列モデル」やらされながら， 「これは不便すぎる，ここは改良しよう (絶滅確率の評価とか)」 といった試行錯誤を独自にやっているヒトなので， ハナシが通じやすい．
• 以下の植物あれこれについては， 私のうろおぼえなのでいろいろまちがいがあるかもしれないが …… まずハクサンイチゲに関しては， 「行列モデル」どぐまでありがちな問題がいろいろ生じていて， 以下は私の解釈がまじった説明だけど，
  • サイズを連続値としてあつかうことができず， 恣意的な (サイズ) クラスわけを強要される
  • 個体を 1 状態 (サイズクラス) だけであらわす必要があり， 現実的ではない …… 「昨年，繁殖した」といった状態も 簡単にとりあつかいたい
  • 「行列モデルにあわせてぶったぎった」 データから割算で遷移確率を推定することになるが， それぞれの推定値の「信頼できなさ」がよくわからず， 全体の予測に与える影響をきちんと評価するのが難しい
  • 個体群増殖率 (固有値) は関心のある数量ではないのに， 行列モデルの作法では何でも固有値と関連づけられてしまう
  • 絶滅確率を知りたかったので個体ベイスモデルのシミュレイションをやった (川井さんの創意工夫)
  • しかし， 長年こういうのばかりやってきた植物生態学研究者の中には アタマがかたくなっているヒトもいて， 「増殖率が 1 以上なのに，絶滅確率がゼロではないのはなぜ?」 といった質問をするのもいる …… 現実的な有限集団と， モデルの操作的な概念にすぎない無限集団の区別がついていない!
• エゾエンゴサクに関連する問題のひとつとしては …… 実験区では， 個体群密度が高すぎて個体追跡がしんどい． 各個体のおおまかな座標 (精度 1 cm ぐらい?) はあるので「去年の位置」「今年の位置」 を「目で」比較して対応づけようとしているが …… 矛盾なく対応させることは難しい．
• そんなのは確率モデルで確率論的に対応づければいいでしょ …… と提案してみたのだけど， じつは WinBUGS みたいなのでそれをやらせるには， 何か特別の工夫が必要だな．
• その後， 予備審準備づかれの斎藤君とオオキンケイギク個体群動態雑談 …… やはりここでも「連続値 (植物の大きさ) を無理やりクラスわけぶったぎり」 がでてきたな． オオキンケイギク備忘録だけど， 多年草・一回繁殖， 地上部をかりとってもしぶとく再生する． ただし， 在来のススキとかにはヨワい．
• かんけーないけど， 外来種わーすとなんとかって， 現代の動物裁判 みたいなものだろーか? とくにその真摯さにおいて．
• 1730 研究室発． 買いもの． 1800 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯．

[北大クラーク館店書籍部]

理系新刊本こーなー …… 「統計モデリング入門」 (中央下の濃い緑帯)． あいかわらずがんばっております． 数学ガール (右上) の迫力も， あいかわらずだなぁ ……

• [今日の運動]
  • 朝のラジオ体操．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0700): シリアル． ヨーグルト．
  • 昼 (1200): 研究室． ジャガイモあげむし． サケの電磁波酒蒸し． レタス．
  • 晩 (1930): 米 0.5 合． ダイコン・ニンジン・タマネギ・ネギ・鶏肉のスープ． ホウレンソウ・豚肉・卵の炒めもの． ジャガイモあげむし．