ぎょーむ日誌 2012-08-(21-31)
2012 年 08 月 21 日 (火)
-
0720 起床.
0230 ごろ一回とらちゃんにおこされて,
ここでなかなか寝てくれなくてばてたので,
二回目 (0630 ごろ?) のときには気づかずにぐーぐー寝すごしてしまった.
弁当の準備.
朝飯.
コーヒー.
0900 自宅発.
晴.
今日はひさびさの真夏日になる予定.
0920 研究室着.
-
今日はここしばらくの中ではよく寝たほうだと思うんだけど,
やはりアタマがぼけているのか,
朝から不要不急の問題にはまってしまった
……
PDF viewer のひとつである
evince
を (X な)
リモートで開こうとすると,
この bug report
にあるように GRIP-WARNING **: Failed to initialize gesture manager
てな警告が大量にでて,
開くのにすごく時間がかかる.
上述の bug report のやりとりみてると,
Ubuntu がタッチパネル用に準備しつつある libutouch
系のしかけに何か問題があるもよう.
(後記: とりあえず evince --disable-gestures
でなんとかなるかも)
-
試行錯誤の結果に発見した我流の解決策は,
sudo apt-get remove evince
して
sudo apt-get install evince-gtk
……
まあ,
これで問題ないみたいだ
……
と思ったら,
OS を reboot したらまたもとのダメな状態にもどった.
やっぱり libutouch
系の問題なのか?
-
お,
進化学会大会で
統計モデリング入門
が売れてるみたいですね〜
-
いまさらながら「時間がない!」と気づいた.
土曜日に,
札幌の医者 (医療技術者) なヒトたちあいてに 30 分間「統計モデリング」
なハナシをしないといけないんだよね
……
-
また医学な論文にとりくむ
……
-
昼飯.
晴.
札幌,
8 月初の真夏日.
-
また不要不急問題にとりくむ,
という現実逃避に
……
北大くらうど内の web server 機,
再起動時に自動的にネット復帰できるようにならないかしらん,
と考えて
/etc/rc.local
に bash /home/kubo/netup.sh
としてみる.
どうなることやら.
来月の停電時に真価が問われるであろう.
-
もひとつ,
こちらの
エントリー
を参考にして,
grub の起動メニューを変更できる
grub-customizer
をインストールしてみる
……
うまくいった!
しかし,
考えてみればこれは文字どーり「自殺的」とでもいうべきふるまいで,
一歩まちがえたら復旧に莫大な時間を費やせねばならぬところであった
……
といまさらながら気づく.
-
いつまでも逃避しててもしょうがないので,
とりあえず土曜日の発表準備にとりくんでみる.
さいきんは根性がなくなってきたので,
LibreOffice
(3.6.0.2 for Linux) で.
-
LibreOffice でイヤなところは数式がマトモに入らないところだが
……
同ソフトウェアの拡張機能
TexMaths
を入れると,
LaTeX な数式入力ができるとわかった.
LaTeX 数式を保存したい場合は,
別にテキストファイルをひらいてそちらにメモするしかないのかな
(まあ,それでもいいけど)
……
自分で preamble を変更してマクロを定義したり,
色を設定できる.
日本語文字をとおすのはめんどうみたいなので,
とりあえずあきらめました.
-
さらに
dvisvgm
を入れると (これは LibreOffice とは無関係のソフトウェア),
TexMaths
で SVG な数式を出力できる.
これのおかげで,
解像度に関係ないスケイラブルな数式を出力したり,
LibreOffice 内で SVG を ungroup してバラしてみたり,
文字ごとに色をつけたりできる.
Ubuntu の場合,
launchpad.net
内の PPA を設定してインストールしたほうが無難そうだ
……
ソースからコンパイルしてみたけど,なんだかうまく動作しなかったので.
-
ぢりぢりと材料をならべてみる
……
-
1810 研究室発.
買いもの.
1840 帰宅.
晩飯.
-
室内やや暑いように思ったので,
とらちゃんだっこしてベランダをうろうろ.
夏の大三角がみえた.
ベガ,アルタイル,デネブ.
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0700):
米 0.6 合.
キムチ.
- 昼 (1200):
研究室.
米 0.7 合.
トマト.
カボチャ.
鶏からあげ.
- 晩 (1940):
晩ごはん作ってもらいました.
2012 年 08 月 22 日 (水)
-
0700 起床.
今日もとらちゃんにおこされる.
哺乳瓶 + おむつ交換 + だっこうろうろのあいまに,
朝飯.
弁当の準備.
コーヒー.
0900 自宅発.
晴.
今日も真夏日となる予報.
今年最後の真夏日になってほしい
……
0920 研究室着.
-
どーにもこーにもアタマがぼーっとしてるな
……
-
ということで,
またどうでもいい問題にとりくむ.
昨日の
evince
を X remote で開くと,
GRIP-WARNING **: Failed to initialize gesture manager
といったエラーがでてなかなか開かない問題,
とりあえず evince --disable-gestures
でなんとかなるかも
……
ダメだ dbus
の問題で開かない
……
-
とおもったら,
あとで別件で再起動したら,
何のエラーもなくうまく動作した.
ひょっとしたら
sudo apt-get autoremove apparmor
したのがよかったのかな?
要再起動?
-
昼飯.
-
土曜日の発表準備をぢりぢりとすすめる.
-
日本語文字入力 (ibus + mozc) まわりでちょっとごちゃごちゃ
……
設定が反映されないので,
自暴自棄的に
sudo reboot
するとうまくいった.
どうなってるの?
-
1740 研究室発.
買いもの.
1820 帰宅.
晩飯.
[とらちゃん公園でびゅー]
ただし,
夜の
ミニ大通公園.
家の中をうろうろするのもイヤになってしまったので,
新生児をかかえて外にでた.
家の中よりずっと涼しい.
公園東端の
倫敦館
前で撮影.
外をてけてけ歩くとすぐに寝ついてくれるのでよい.
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0800):
米 0.6 合.
ゴーヤ.
- 昼 (1230):
研究室.
米 0.7 合.
トマト.
鶏からあげ.
- 晩 (1920):
晩ごはんつくってもらいました.
2012 年 08 月 23 日 (木)
-
0700 起床.
いつものごとく,
哺乳瓶 + おむつ + だっこな時間.
朝飯.
0900 自宅発.
0920 研究室着.
コーヒー.
-
大学に提出するとらちゃん書類を提出.
ついでに,
地環研すぐ東にある
鉄西まちづくりセンター
(区役所の分遣隊みたいなもの)
で戸籍謄本一通のもうしこみ.
到着するのは明日の午後.
-
石田基広さん
から訳書「Rによるモンテカルロ法入門」
を送っていただいた.
ありがとうございます.
各章はこういう内容で.
- 基本的なRプログラミング
- 乱数の生成
- モンテカルロ積分
- 収束のコントロールと加速
- モンテカルロ最適化
- メトロポリスーヘイスティングス・アルゴリズム
- ギブス・サンプラー
- MCMCアルゴリズムの収束のモニタリングと適応
[黄色の本だけど……]
シュプリンガー・ジャパン (SJ) ではなく,
丸善出版.
原著は Springer 本社から出版されたもの.
SJ はこういう本からは撤退したので.
調べてみると,
石田さんの R 訳書しりーづ
(lattice 本とか ggplot2 本など)
はすべて無事に丸善に
移行
されたようだ.
Amazon 検索だけではよくわからないので,
丸善の
検索
も参照してください.
-
おっと,
研究室のさーばー再起動したときに
(DNS 問題あれこれのせいで)
postfix でメイルが流れなくなるんだった
……
sudo /etc/init.d/postfix flush
でたまってたのを流す.
-
どーにもこーにもねむい
……
昼飯.
-
ぢりぢりと土曜日の準備
……
-
歯の修理だとか,
その他あれこれ
……
-
1820 帰宅.
晩飯.
-
今晩はかなりしっちゃかめっちゃか
……
ひへー
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0750):
米 0.6 合.
イワシ.
- 昼 (1220):
研究室.
米 0.7 合.
トマト.
サンマの缶詰.
- 晩 (1900):
晩ごはん作ってもらいました.
2012 年 08 月 24 日 (金)
-
0700 起床.
朝のおむつがえ + 哺乳びん + だっこうろうろ.
6 時間弱は寝たはずなんだが,
どーにもこーにも眠気がとれない.
弁当の準備.
朝飯.
0850 自宅発.
0910 研究室着.
コーヒー.
-
ねむけをはらいつつ,
明日の発表の準備.
主催者の医療機器会社からメイルとか来て,
どーにもこーにもきぶんわるい.
-
昼飯.
-
午後もぢりぢり
……
カフェインもたくさん.
-
まあ,
なんとかなった
……
ことにしよう,
ということで.
-
1810 研究室発.
買いもの.
1840 帰宅.
晩飯.
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0700):
米 0.6 合.
鶏肉.
- 昼 (1230):
研究室.
ぱん吉のパン.
ハム.
- 晩 (1900):
晩ごはん作ってもらいました.
2012 年 08 月 25 日 (土)
-
0720 起床
……
けっこうたくさんねてしまったような気がして,
なぜかしら不安感がつのる.
今朝も起床直後から,
とらちゃんに寝てもらうための努力いろいろ
……
一時間ほどかかった.
朝飯.
コーヒー.
ふう.
-
0920 自宅発.
晴.
0940 研究室着.
-
今日の発表内容のみなおし.
-
昼飯.
今日も真夏日は回避されてるんだけど,
室内の温度は 30 度ちかい.
ここ A 棟 8F は屋上が日光に照射されている状態なので
……
-
いまさらながら,
紹介する論文のみなおし
……
-
15 時から,
札幌駅の南東で
北海道神経画像研究会
の集まり (第 16 回だとか)
に出る.
自分のハナシは 30 分ほど.
まあ,
他流試合はいつものことだ.
-
聞き手の多くは,
札幌周辺 (?) の病院の放射線技師のヒトたち,
合計 30 人ぐらい?
……
どうも何かからくりがあるようで,
-
こういう「研究会」は医学系の何か公的な団体から
「認定」されていたりする
-
認定されてる研究会に参加すると「ポイント」
が得られる
-
技師のヒトたちは「年間○ぽいんと」
といったのるがある?
……
といったところが私の観察なのだが
……
-
発表のほうは,
まあてきとうに.
たんなるロジスティック回帰なんだけど,
主催者のヒトたちもふくめて,
あまりよく知らないようだった
……
とくに他流試合では,
このあたりの事前の見きわめが重要.
-
病院関係のヒトたちは,
まあふつーのまじめなヒトたちなのだが
……
「研究会」のうらかたとして働いている,
医療機器な会社のヒトたちはすごくアヤしい
(そもそも研究会の連絡やりとりの段階からアレだったのだが).
黒っぽいジャケットを全員が着用,
人海戦術的な動員で意外と若いヒトが多い,
ヒトを見れば「顧客様」あつかい,
「あんたらイヴェント催行会社のヒトたち?」
というぐらい場なれ
……
-
とにかく会場も設備も私とかへの謝金とかにもカネがかかっていて
……
けっきょく,
これって札幌市民とかが支払う医療費に反映されるんだよね?
-
情報交換会とか称する懇親会には,
とうぜんのことながら欠席して帰宅.
-
[今日の運動]
-
うんどうぶそくなんだろうけど,
どーにもこーにもとらちゃんばて
……
-
[今日の食卓]
- 朝 (0830):
米 0.7 合.
ベイコン.
- 昼 (1230):
研究室.
納豆まき.
- 晩 (1900):
晩ごはん作っていただきました.
2012 年 08 月 26 日 (日)
-
0720 起床.
夜中に一回哺乳瓶,
起床直後はいつものるーちん.
家のすぐちかくでやってる朝市 (といっても小さなものだが)
でパンや野菜を買った.
朝飯.
-
昨日の医療機器業者ばてもあって,
今朝はかなり「ねむいなー」というかんじで
……
とらちゃんとの格闘がつづいていたんだけど,
11 時ぐらいに 3 人ともばたっと倒れて,
1 時間すこしばかり寝た
……
これでけっこうすっきり.
-
昼飯の準備.
昼飯.
昼沐浴.
-
15 時すぎ,
また AEON 桑園内の歯科医へ.
今日はずっと以前に修復した右犬歯がやられている,
ということで以前の修復材を取り外して,
ドリルごりごり & 再修復.
これで一連の口内補修作業は終了.
-
歯科医がよいが終了,
ということでそのへんでコーヒーでも飲んでいくことに.
AEON 桑園ないにはスタバその他コーヒー屋あり,
隣には宮越屋珈琲もあるのだが
……
AEON 内テナントである
可否茶館イオン桑園店
は豆販売がもっぱらなんだけど,
その場でコーヒー抽出もやってくれる.
紙コップのテイクアウトなので安い.
日曜日はふだん 500 円のブルーマウンテンが 350 円,
しかし味はかなりおいしいと思う.
-
ちょっと買いものしてから,
帰宅.
[短冊]
神戸にいる,
とらちゃんのひいおばあちゃんが墨書しておくってくれました.
[俳句]
その裏面には一句.
-
ちょっと怠業.
-
昨日の発表準備のため,
いろいろ遅れてしまったあれこれの進捗を,
少しでも改善しようとする努力を
……
ちょっとばかり.
-
明日は大学院入試ぎょーむ
……
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0830):
モンクールのパン.
- 昼 (1330):
モンクールのパン.
トマト・ナス・タマネギ・ピーマン・パプリカ・シイタケのラタトゥイユ.
- 晩 (1900):
晩ごはんつくっていただきました.
2012 年 08 月 27 日 (月)
-
0650 起床.
今朝は
……
おむつ替えしかやってないな.
夜中にも一回やったかな (半分ねながら).
朝飯.
コーヒー.
0800 自宅発.
0820 研究室着.
-
今日は大学院入試.
0920 本部である会議室に集合.
-
午前中はひたすらそこで待機.
ThinkPad でメイルかきとか.
この会議室とかをよく使う皆さん,
ここで
eduroam
が使えるのを知らなかったそうで
……
というか,
そもそも eduroam の存在が知られていなかった.
-
正午前に昼飯.
暑い.
今日は 30 度ちょっとごえの真夏日になってしまった.
-
午後は B805 で採点作業.
-
15 時すぎから面接試験.
-
16 時ごろ,
あれこれ終了.
明日の午前中も面接だけど.
-
生態学会さーばー雑用.
バックアップの現状を確認する作業
……
...
-rw-r----- 1 root root 1.3G Aug 25 03:27 backup_esj.ne.jp_vhost_1208250323.tgz
-rw-r----- 1 root root 18K Aug 25 03:39 backup_esj.ne.jp_info_1208250323.xml
-rw-r----- 1 root root 1.3G Aug 26 03:27 backup_esj.ne.jp_vhost_1208260323.tgz
-rw-r----- 1 root root 18K Aug 26 03:39 backup_esj.ne.jp_info_1208260323.xml
-rw-r----- 1 root root 1.3G Aug 27 03:27 backup_esj.ne.jp_vhost_1208270323.tgz
-rw-r----- 1 root root 18K Aug 27 03:40 backup_esj.ne.jp_info_1208270323.xml
これらの内容を調べてみたら
/var/www/vhosts/esj.ne.jp/
まるごとらしい,
とわかった.
念のためサイズを確認しておく
……
まあ,
そういうことだろう.
# du -sh /var/www/vhosts/esj.ne.jp/
1.6G /var/www/vhosts/esj.ne.jp/
-
1810 研究室発.
1830 帰宅.
晩飯.
-
ThinkPad X201s で Ubuntu 12.04
の Linux カーネル
3.2.0-29
など 3.2 系を使うと無線 LAN が使えなくなる問題にとりくむ.
どうもこのマシンのチップは
RealTek の rtl8192SE
のようだ.
カーネル
2.6.32-41
では
r8192e_pci.ko
というドライヴァーが動いているのだが,
3.2 系にはなさそう.
RealTek 社のサイトから Linux 用最新 driver のソースを
ダウンロードしてコンパイル,
sudo modprobe rtl8192se
してみたのだが
……
どうもうまく動かない.
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0740):
米 0.7 合.
なにたべたっけ?
- 昼 (1140):
北大生協弁当.
- 晩 (1900):
晩ごはん作ってもらいました.
2012 年 08 月 28 日 (火)
-
0620 起床.
半分ねぼけながらでも,
いつものおむつがえなら
……
などと油断してたら,
いきなり「爆弾」さくれつ!
……
やられました.
[本日の爆弾犯]
どうして
「ぼくはなにもしりません」
という顔で寝てるんだろうね
……
-
朝飯.
0800 自宅発.
0820 研究室着.
今日も暑くなるかも
……
-
午前中は院試のつづき.
面接.
-
昼飯.
暑い.
けっきょくのところ,
本日は真夏日は回避されたわけだが
(ただし室温は 30 度ごえ),
ホントにぎりぎりのところで
……
-
ねむい.
-
統数研の島谷さんの新著
フィールドデータによる統計モデリングとAIC
を送っていただきました!
[島谷統計モデリング本]
私の
統計モデリング入門
では架空データばかり使っていましたが,
島谷さんの本ではリアルデータがたくさん登場.
カクレミノの開花,
トドマツなどの直径-樹高関係,
ペンギンの泳ぎ,
林業試験地の実験,
オオミズナギドリの飛翔,
などなど
……
[島谷さんといえば,Excel]
ゑくせると根性で GLM の最尤推定をやろう,
という説明の図.
-
どーにもこーにも,
あつくてしんどい
……
-
ということで,
16 時ごろに北大正門すぐ南の
Sapporo Cafe
に移動して 2 時間ほどあれこれにとりくんでみた.
ここは冷房・電源・無線 LAN 完備.
-
AEON 桑園でおむつ (90 枚ぐらいで 1000 円ちょっと)
などを買って,
1850 帰宅.
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0730):
米 0.6 合.
アカウオ.
- 昼 (1200):
研究室.
米 0.7 合.
アカウオ.
トマト.
- 晩 (1920):
晩ごはん作ってもらいました.
2012 年 08 月 29 日 (水)
-
0720 起床.
えーと,
4 時ごろだったか哺乳瓶,
それ以外はだいたい寝てたかな
……
弁当の準備.
朝飯.
コーヒー.
0820 自宅発.
0840 研究室着.
晴.
今日も昨日と同じく,
ぎりぎりで真夏日が回避されるはずなんだが
……
-
どーにもこーにも,
朝からだるいな
……
-
先日,
あれこれ提出してとらちゃんの健康保険証をつくったので,
毎年恒例の被扶養者あれこれ書類はもはや書かなくてもよし,
とのこと.
事務室から連絡で不幸ではない気分になれるのは,
たいへんに珍しいかも.
[健康保険証]
今回からカード化されました.
ひとり一枚,
ということでなかなか便利そうな.
まあ,
北大の事務まわりなんかも,
ぢりぢりと改善されている
……
と考えたいところだけど.
-
1910 研究室発.
買いもの.
1940 帰宅.
晩飯.
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0740):
米 0.6 合.
卵.
- 昼 (1210):
研究室.
米 0.7 合.
鶏肉.
トマト.
- 晩 (1900):
晩ごはん作ってもらいました.
2012 年 08 月 30 日 (木)
-
0500 ごろだったか,
ともかく早朝に起床.
で,
いろいろと
……
ねむい.
朝飯.
0830 自宅発.
ちょっと区役所によって,
0920 研究室着.
コーヒー.
ねむい.
[医療費助成]
初診料とかが安くなるとのこと.
-
気象観測 130 余年,
札幌ではほんの数回しか熱帯夜がなかった
とのことで,
昨晩はあやうく「ひさしぶりの熱帯夜」になるかと危惧されていたんだけど,
まあ観測値上ではそれはぎりぎりで回避されたよーで
……
しかし今日はまた真夏日になりそうで,
こんどこそ「今年最後の真夏日」となりますように
……
-
統計モデリング入門
の図を @KuboBook
に掲載して,
本の宣伝をしてみたり
……
どーも,
GLMM が「複数の確率分布を使った統計モデル」ってことを知らないヒトが,
けっこういるみたいで
……
-
ごちゃごちゃといろいろ連絡とか
……
-
11 時,
とっくに 30 度ごえ.
せんぷー機がかつやくしてます.
-
あついなー
-
研究室から脱出して,
昼飯.
とりあえず昼飯.
これプラス,
コーヒー 2 杯で 890 円.
北大正門でてすぐ南,
冷房・電源・無線 LAN 完備.
16 時ごろまで涼んでおりました.
ただし,
無線 LAN はいまいち?
すわった場所に依存するのか?
[ごにゃごにゃと仕事してました]
ミズナラ関係とか
……
なかなか全貌がみえない
……
-
1750 研究室発.
買いもの.
1820 帰宅.
晩飯.
[おみやげ]
隣に住んでいる子が修学旅行にいって,
とらちゃんにおみやげを買ってきてくれました!
どうもありがとう.
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0740):
シリアル.
ヨーグルト.
- 昼 (1300):
Sapporo Cafe でパスタ.
- 晩 (1900):
晩ごはん作ってもらいました.
2012 年 08 月 31 日 (金)
-
0650 起床
……
ひさびさに 7 時間ほど寝てしまった.
朝飯の準備.
朝飯.
0830 自宅発.
曇.
今日はそんなに暑くならない,
との予報.
0850 研究室着.
コーヒー.
-
ミズナラ道管問題にとりくむ.
まずは,
鍋嶋さんポスターのみなおし
……
-
全データの可視化.
これはもともと PDF 化してたんだけど,
ImageMagick の
montage
を使うと,
下のような「一枚の絵」になる.
[8 月の蕎麦]
とり天かごめとろろ蕎麦.
天ぷらはあつあつ,
蕎麦はいつものようにおいしかった.
-
以前にやった,
道管個数変化の結果をみなおす
……
そうか,
これは道管サイズ (pixel 数) 1644 以上のものだけを使った結果だった.
-
だったらサイズ分布の「大きい道管」だけにしてみると,
どうなるだろうか?
まあ,
なんとなくそれっぽく分割されているなあ.
-
鍋嶋さんから解説のメイルいただく.
「道管の抵抗は直径の 4 乗に比例する」
のおおもとは,
ハーゲン=ポアズイユ
の法則とか,
そのあたりか.
流量が直径の 4 乗となるわけで
……
-
とびこみデータ解析こんさる
……
1820 研究室発.
1840 帰宅.
晩飯.
-
[今日の運動]
-
とらちゃん上げ下げ運動
……
何回ぐらいやっただろう?
-
[今日の食卓]
- 朝 (0700):
シリアル.
ヨーグルト.
- 昼 (1300):
さか田の蕎麦.
- 晩 (1900):
晩ごはん作っていただきました.