ぎょーむ日誌 2011-01-04

2011 年 01 月 04 日 (火)

• 0720 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー． 0855 自宅発． 曇． 0920 研究室着．
• いきなり院生のとびこみデータ解析こんさる． 植物個体の空間分布の統計モデリング， ただし集中分布してるので「空地」が多い …… 難問． WinBUGS の car.normal() とかでガウス確率場を作って …… という手口， じつはゼロの多いデータではあまりうまくいかなかったりする． 少なくとも収束は悪くなる．
• 今回の場合は， じつはどの場所にどれぐらい (個体をあらわす)「点」 がちらばるかとゆーのは主問題ではなく …… とりあえずの問題としては， あたえられた点の配置のもとで， これらを二色 (二種類の植物) にわけなさい， という問題にしてしまえばよいような気もする． しかし， これまたゼロが多いと (species ごとの集中分布) MCMC に時間がかかる問題になるのかもしれない．
• 北大 の ArcGIS ライセンス， 研究室 LAN ルータのしたにある PC の場合は， ルータの IP アドレスとその下で使うマシンの台数を申告せよ， か．
• うー， アタマがなかなかきりかわらん ……
• 昼飯．
• 7 日のハナシ， ひたすらきりはり． いやはや．

[地球統計学とクリギング法]

間瀬さんの新著を買った． 空間統計本， いままでの間瀬さんの本をさらに丁寧にした内容． R の library(gstat) や library(geoR) の動作を理解したいときに役たちそう． まあ， この本が必要な生態学研究者はあまりいないかも． 出版社の編集はテぬきぎみで， 図の文字とか小さすぎたりして読みづらい．

[主要目次]
 1章　地球統計学とクリギング法
 2章　確率場と定常性
 3章　共分散関数とバリオグラム関数
 4章　共分散関数とバリオグラム関数の例
 5章　単純・通常クリギング法
 6章　ブロッククリギング法
 7章　普遍型クリギング法
 8章　多変量確率場とクロス共分散・クロス・バリオグラム関数
 9章　多変量クリギング法
10章　交差検証法によるモデル当てはめの良さの検証
11章　モデルの当てはめ
12章　確率場のシミュレーションと条件付きシミュレーション
13章　クリギング法による解析の実例
14章　パッケージgeoR を用いた地球統計学的解析の実際

• library(geoRglm) についての説明はない． help ファイルをつらつらと見くらべてみると (geoR と geoRglm)， 内容がけっこうちがっていて， たとえば library(geoR) には MCMC な関数とかない． 間瀬さん本をよく見てないんでよくわからないのだけど， ガウス確率場 + エラーも正規分布となっている場合には， 試行錯誤な推定計算とか必要ないのか?
• 現実とーひのため， R の HTML help まわりを改善．
• きりはり発表じゅんびはあとヒトいきでおわらづ …… 1810 研究室発． 雪． 買いもの． 1840 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯．
• ばてたので， また近所温泉．
• [今日の運動]
  • 朝のラジオ体操． うんどう休養日．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0810): チーズのせ焼バゲット． ゴボウ・ニンジンのコンソメスープ．
  • 昼 (1300): 研究室． 米 0.5 合． スープ． リンゴ．
  • 晩 (1930): 米 0.5 合． ゴボウ・ニンジンのコンソメスープ． ダイコン・ニンジンのなます． チンゲンサイ・ピーマン・モヤシ・シイタケ・豚肉の ショウガ・ニンニク・豆板醤・オイスターソース炒め．