ぎょーむ日誌 2008-11-30

2008 年 11 月 30 日 (日)

• 0800 起床． 朝飯． コーヒー． かなりの降雪． 怠業． うんどう． 体重 70.8 kg． 洗濯． 昼飯．
• 1310 自宅発． 風雪． 1325 研究室着． 大学についたあと， 外は次第に晴れてきた …… と思ったらまた吹雪． 冬の日本海側は天気が変わりやすい?
• 白崎君のシラカンバ・ホオノキデータをひねくる． なんとも巨大なゑくせるファイル (CSV 化されてるけど) だなぁ …… とまずは読みこみ・変換プログラムを．
• データになれるため， といった意味もあるのでぽちぽちと作図してみる． 理由は何なのか全然わからないけど， 2008 年ってのは苫小牧の若いホオノキたち (の頂部) にとっては 試練の年であったようで．

• 高さ成長． BP には -36 cm 成長の個体 (154.5 cm) がひとついる (表示してないけど)． シカに食われたか?

• 頂部の枝形成数． ホオノキは (個体差 random effects ヌキの) 単純なポアソン分布で表現できそうなほど簡単だ．

• さて， 数十個体の樹木・数千本の枝に関するデータが格納された R の data.frame を詳細に調べていくうちに …… ゑくせる上で作られたデータシート由来の場合はいつもいつも のコトなのだが …… いろいろと多種多様なる「まちがい」を発見していくことになる． しかも今回は「フレイムシフト」とでもよぶべきけっこうよくわからぬ シロモノがあった．
• R はこういうデータ入力まちがいの発見・修正に威力を 発揮するソフトウェアなのだが …… ちょっとデータをとってきた 本人でなければどう修正すればよいのか見当もつかぬ モノがいくつかあって， ですね． 本人は今日はいないし． ま， 明日以降に．
• いつもの指摘であるけど， 生態学の研究なんかだとこういう基本的なエラーチェックも やらずにそのままデータ解析したりすることがよくあるんだよね …… これはソフトウェアとかの問題というより， 研究者の性格とかによるのかもしれない． いろいろとヘンてこなまちがい入りデータ (をさらにゑくせる上でこぴぺ増殖したもの) を統計ソフトウェアにほうりこんで 「ゆーい，ゆーい」 とか騒いだりしてるヒトたちって何なのでしょうねえ ……
• まあ， 私がやってるチェックなんかも そんなに厳密なものではないけれど …… R でちょっと集計したり作図するだけでも， いろいろと「ここはヘンだ」というのがいろいろわかる． ゑくせる上で「手と目と根性で」 よりはよほどマシな点検だと思う． ということで， R はやはり必要不可欠な道具ですな …… ただし， 私はまだまちがいさがしの方法を体系化できてなくて， 事例ごとに工夫しているわけだけど． なにしろ事例ごとに table の構造が異なるわけで．
• 1910 研究室発． あいかわらず雪． 買いもの． 1930 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯．
• [今日の運動]
  • エアロバイク 50 分間． ストレッチ．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0830): シリアル．
  • 昼 (1240): 米麦 0.8 合． サトイモ・ニンジン・コンニャク・鶏肉の煮物．
  • 晩 (2030): 米麦 0.8 合． ナメコの味噌汁． ハクサイ・ネギ・卵の炒めもの． ヨーグルト．