KuboLog 2007-10-04

苦情・お叱りは，たいへんお手数かけて恐縮ですが，久保 (kubo@ees.hokudai.ac.jp) までお知らせください．

2007 年 10 月 04 日 (木)

0750 起床．朝飯．コーヒー． 0910 自宅発．晴． 0925 研究室着．

なぜかとうめん何の関係もない R における MCMC 計算まわりの現状，つまり CRAN Task View: Bayesian Inference をながめてしまう． Jouni Kerman がススめている rv はプロトタイプ状態?， Umacs はスケルトン状態かな．この Task View にのってないんだけど， ars は機能 & 使いみちがかなり限定された adaptive rejection sampler ながら，この面倒なアルゴリズムの実装例がわかるので，なかなか興味ぶかいと思う．

さらにばかばかしいコトなんだが，おうぷんおひすの操作でつまってしまった．どうも OpenOffice Writer は Insert > Fields > Page Count で総ペイジ数を取得できるみたいだけど， Impress ではそれは無いよーで．

日光会議の発表準備．おそるべきことに，ぱいぷ樹木の詳細などなどアタマからかなり脱落してしまってる，と今さらながら気づいた．こりゃー，準備に時間かかるかも．

準備にかまける前に，前後の様子を確認． 10 月なかばまでの予定としては，

日光会議発表 (およそ 30 分間) の準備: ぱいぷ樹木 (15 分) と母子里樹冠 Gibbs model (15 分)
日光要旨: 10/10 (水) まで
あ，まだ日光往還の航空券とか手配してなかった!
科研費書類かき: 10/16 (火) まで，基盤 C，群集 Bayesian modeling あたり，か?
生態学会福岡大会自由集会のもうしこみ: 10/26 (金) しめきり，今回は初心者むけ R プログラミング入門
統計学授業準備: 10/29 (月) から …… いやはや ……
雑用としては地環研 web server 管理者ひきつぎまわり，とか?

ということで， 10 月はデータ解析下うけ稼業は可能なかぎり休業したいところだ．

と発表準備のぱいぷ樹木部分にとりくんでいたら，先日の熱帯山地林樹木の形質間の相関ある事後分布問題の計算結果の概要を塩寺さんところで説明することに …… そう，計算したうけには説明責任が発生してしまうのである ……

やや遅い時間に昼飯．

[お茶部屋 AJB 表紙]

お茶部屋にあった American Journal of Botany の最新号の表紙は地球上の生物とは思えぬものであった …… Hydnora africana とゆー植物だそうで．

そして， ECOAS 計算にも説明責任が …… メイル書き．

日光準備ぱいぷ樹木篇のつづき． KuboWeb あちこちからひろってきた図の配置，だいたい終わった …… と，いったん，おうぷんおひす Impress を終了しようとすると，やっぱり終了できずに暴走するんだよね．ファイルは保存してるから強制終了すればいいわけだが．

OO.org Impress は，どうも R の生成した EPS を読みこまないよーで …… ``Unknown graphics format'' なるエラー警告をだすんだよね．

あとはぱいぷ樹木論文につかった図を PNG 化とかしてみるか ……

とか考えてると， ECOAS 再計算．モデルがどんどん複雑になるねえ …… 本日のゐんばぐす戦訓らしきモノ: パラメーター数おおいときは「ばらつき」の初期値を小さくすることが肝要?

で，そのけっこう長大なる計算結果から報告 PukiWiki page を生成させる．「自動報告書かき Perl スクリプト」を作っておいてよかった．もしこれがなかったらアタマがおかしくになってたところだ．何しろ線形予測子の fixed effects パラメーターの個数が 20 個になってしまったわけで ……

ともかく，あれこアップロードして，一休み．お茶部屋で晩飯．

またぱいぷ樹木スライドをひねくる．

作業効率がおちてきたので撤退． 2130 研究室発． 2145 帰宅．

[今日の運動]

うーむ，またうんどう休養日に ……

[今日の食卓]

朝 (0830): 米麦 0.5 合．タマネギ・ニンジン・ピーマン・エリンギ・豆腐のシチュー．
昼 (1430): 研究室お茶部屋．米麦 0.6 合．タマネギ・ニンジン・ピーマン・エリンギ・豆腐のシチュー．
晩 (1930): 研究室お茶部屋．米麦 0.7 合．タマネギ・ニンジン・ピーマン・エリンギ・豆腐のシチュー．

ぎょーむ日誌 2007-10-04

2007 年 10 月 04 日 (木)