ぎょーむ日誌 2006-12-15

2006 年 12 月 15 日 (金)

• 0820 起床． 0850 自宅発． 晴． 歩いてるうちに昨日の苫小牧シュートの階層ベイズモデルはもっと簡単化できる， と気づいた． ただし技術的問題がいくつか残っていて， そういうコードをあの WinBUGS が受けつけやがるかどうか， とか． そしてシュート内の stem vs 葉 というシュート重量分割問題を考えるのと同時に， 葉面積 vs 「厚さ」といった 葉内の重量分割問題も推定すべきだ， とわかってきた． latent variable もしくは「隠れ変数」 と呼ばれる変数を導入したモデリングでは 「問題を可能なかぎりコマぎれにしない」 原則のしばりが強くなるよな． 0905 研究室着． 朝飯． コーヒー．
• 統計数理研究所共同研究「Rの整備と利用」研究会 (先週の東京出張のアレ) での発表資料などの公開せよということになったので， じつは昨日から このあたり に PDF ファイルなど置いてる． 今回はとりあえず 「どういうソフトウェアで MCMC 計算やるのがお手軽か?」 というハナシばかり．
• お茶部屋で 宮田さんと苫小牧シュートの階層ベイズモデリング． 岩壁登攀的， と申しますか， 確実に高度はかせぎつつあるんだけど， 安全確保をとりながらなので時間がかかる， といった状況?
• 1220 昼飯前の作業は終了．
• とあるソフトウェアを MacOS X にインストールする下うけぎょーむで苦闘． MacOS X の場合， 「アプリケイション複合体をあらわすアイコン」 を copy するだけでインストール終了， となることが多いわけだが …… 中にはヘンなインストーラーを準備している package もあって， これは root 権限が必要だったりする， と．
• 夕方までまた宮田さんと苫小牧シュート Bayes モデルで試行錯誤． WinBUGS に計算をおしつけるしくみは作れたのだが …… 当方の定式化に何か問題あるらしく， Gibbs sampler が走らない． その過程で WinBUGS のへっぽこな点をまた発見してしまったんだけど， graphical model 化によるモデルチェックは完ペキではなく， まずいモデルがここを突破するとあとは WinBUGS が無限ループにおちこむ暴走状態におちいる， と．
• 苫小牧シュートの階層ベイズモデル化の正しい定式化は 「宿題」 とさせていただくことにして本日は敗退．
• 雑用いろいろとか， データ解析こんさるメイルかきとか， ツガザクラ雑談とか …… やりつつ本日の敗退問題を検討していたか， というと今回はなぜかそういう状態にはなく， いったんアタマからこの問題を 「アンインストール」 しようと試みているように思える．
• 1850 研究室発． 1905 帰宅． 体重 71.0kg． 晩飯．
• [今日の運動]
  • 腹筋運動 30 × 3 回． 腕立ふせ 5 × 3 回．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0900): 研究室お茶部屋． 食パン．
  • 昼 (1340): 研究室お茶部屋． 食パン．
  • 晩 (2000): 米麦 0.7 合． ハクサイ・ブナシメジ・ホタテの味噌汁．