ぎょーむ日誌 2006-06-19

2006 年 06 月 19 日 (月)

• 0830 起床． 朝飯． コーヒー． 0930 自宅発． 曇． 0945 研究室着．
• ふーむ， R project の official wiki, Rwiki が公開か．
• アカマツ論文原稿かきなおし．
• 1200 ひととーり修繕できたと思う …… 印刷出力してみる． かなり短くなってしまった． まあ， データに含まれている情報量相応， という気もするが．
• あちこちヘンな文の修正． 昼飯．
• 1345 研究室発． 健康診断うけにいく． 曇． 1355 JR 札幌駅すぐ北の 札幌複十字総合健診センター 着． 一時間ほどあれこれ検診 …… といってもほとんどは待ち時間だったわけだが． 1455 同発． 1500 研究室もどる． 身長 178.3cm， 体重は服をつけた状態で 76kg， 視力は右眼 1.5 だが左眼は 1.2 に低下． 血圧はたしか 123 の 76， 去年 とだいたい同じか．
• アカマツ論文原稿， これ以上は一人でひねくりまわしてもしょうがない， という気がしてきたので共著者の小林さん (香川大) にみてもらうことに． しかしながら， 単純なまちがいとかで意味不明になってるところがあったらマズいので， もういっぺん自分でチェック．
• しかし， 読みかえす → 意味不明瞭な文がぼろぼろと見つかる， というループが収束しない …… ついにはイヤになってしまって強制終了， make pdf 命令を発して PDF ファイルを作らせて rsync でサーヴァーにアップロード． 小林さんにメイル連絡． 時刻は 1820．
• えーと， ちょうどひと月前に major revision 通知くらって， その後はナニをしていたんだ， いったい …… ぎょーむ日誌によると， 5 月中はだいたい GLMM 解説記事原稿かき (生態学会誌編集部から本日きた連絡によると， これは「学術情報」記事になるそーで)， それから「樹木のてっぺんシュートのカタチ」まわりの勉強． その後はアカマツデータ見直し (具体的には R で自動作図プログラムをあれこれ作って大量の図を出力していた)， 旭川往還とかはさんで， 新しい階層ベイズモデルの検討に数日つかい， GLMM 解説記事提出直前のどたばたがあって， 歯医者で抜歯したり， JAGS の実戦初投入のぢたばたがあって， 怠業したり， もはや完全に別モノになるまで図・表・文のかきなおしをやって現在にいたる， か． うーむ．
• まあ， 「反主流派」ぢゃーなるたる Ecological Modelling 誌は不完全な査読に 300 日ちかくもついやしてくれるだけあって， revision の再提出期限も今から二ヶ月さきなんだが． 「反主流派」 だから原形とどめぬ大改変ぐらいおおめにみるだろう． 明らかに良くなっているし．
• 昨年 7 月末に投稿した時点では今回のような Bayesian modelling ワザをまだぜんぜん修得していなかったので (私の最初の MCMC 計算苦闘は 昨年 8 月)， そのときは今回のようには難問をかくのごとく始末できなかったんだよね …… 「欠測」部分を何かうまい方法で確率モデル化できれば 問題解決が容易になるだろう， というのは理解していたんだが．
• そもそも， なぜ今回の大改変になったかといえば， 査読者のキビしい指摘あれこれにいちいちいいわけをでっちあげるよりは モデルごと作りなおしてしまったほうがラク， という動機があるわけで． ということで， それほど無理なく 「査読者のコメント 1, 2, 3, ... に対応してたらこういうモデルにかわってしまいました」 といった cover letter は書けるはず．
• 1940 研究室発． 1955 帰宅． うんどう． 体重 74.8kg． うーむ． 晩飯．
• [今日の運動]
  • エアロバイク 40 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0850): 米麦 0.6 合． ネギ・シイタケ・豆腐・サバぶしの味噌汁．
  • 昼 (1310): 研究室お茶部屋． 米麦 0.6 合． ネギ・シイタケ・豆腐・サバぶしの味噌汁．
  • 晩 (2210): スパゲッティー． 麻婆豆腐． コンブあえもの．