ぎょーむ日誌 2006-03-05

2006 年 03 月 05 日 (日)

• 0650 起床． 進化植物学研究会 の第二日目， 定山渓の温泉ホテル「瑞苑」． 朝風呂． よーやく入れた． 朝からけっこう入ってる (まあ定山渓は温泉しかないところではあるけれど)． 朝飯． コーヒー．

[定山渓 - じょうざんけい]

会議室からのながめ． 札幌市の南西はずれのこういう谷間にある温泉街．

• 0900 から本日の研究発表二題． まずは 城田徹央さん (北大) の「東シベリア，明るいタイガの森林構造」． 森林火災 (東シベリアは林床火災が多い) と森林の空間構造に関する解析で， ギャップ更新 (大径木周辺をさける) & 一斉更新木たちの高さ競争 (ぱいぷ樹木 みたいな状況)， というかんぢのよーで． 城田さんと私は同年配 (かつ同じ九州大学出身) なんだけど， 私とちがって城田さんの発表は「学者」という雰囲気があっていいよね …… このあたりって他人の研究成果への距離のおきかた (& 距離をおく方向) に左右されたりするものなのかしらん． 近すぎても遠すぎてもダメなんだろう (私の場合だと生態学分野の研究成果には距離をとりすぎ，ということか)．
• 最後に高橋一男君 (北大地環研の 生態遺伝) の「ショウジョウバエにおける空間的集中と共存」． 材料はショウジョウバエで研究室は 生態遺伝だけど遺伝学まわりとはまったく関係ナシ， むしろこんにちでは珍しいといえる純然たる個体群動態 (種間競争あり) のハナシである． さらに昨晩の雑談でわかったんだけけど高橋君は MASS 本 (Venables & Ripley, 2002) の愛読者で (とうぜん R を使いこなしており 「ゑくせるなんて……」 とかキビしく批判してたような気がする)， 使われている統計学的手法も GLM, L 関数, 生残解析の比例ハザードモデル， parametric bootstrap 法， と尋常ではない． すでに Oikos とかに多数の成果が 発表 されている …… ただしこれまた昨晩の雑談でもでたんだけど， 空間構造まわりの解析に関しては L 関数とかではなく (というところまでは本人もすでによく承知していた)， Gibbs 分布にもとづく別のやりかた (ってことでまたしても geoRglm とかになってしまうわけ?) のほうが観察された現象をよりよく説明できるだろう．
• ちょっとメモ． 質疑応答で ショウジョウバエの集合フェロモン について教えてもらったこと:
  1. 集合フェロモンと呼ばれている物質の実体は， 交尾時にオスからメスに渡されるもの
  2. これの (本来の???) 機能は交尾ずみのメスから 他のオスを遠ざけることにある
  3. この物質はメスが産卵時に (盛大に?) 放出される
  4. するとその場所に他のメスたちが (産卵のため?) よりあつまってくる
  ふーむ ……
• 1120 ごろ研究発表終了． 今回はなんと四題すべてにおいてデータの空間構造が本質的かつ重要であり， そのあたりに興味のある私としては どれもこれも考えさせられるものばかりだった． とても良い研究会でした．
• で， その研究会の幹事として諸事とりしきりの陣頭にたってくださった 庄山さんが司会する「進化植物学研究会」事務会議． さて来年はどこでやることになるのやら．
• 1210 またバスでホテル発． 帰路ではひたすらばてる． 1310 ごろ地環研着． おつかれさまでした．
• 昼飯前後は母子里 Gibbs 林冠モデルにとりくむ …… が眠くて眠くてあまりススまず．
• ちょっと気分かえるべく， コーヒー飲んで単純なネット雑用やってるうちに徐々に体調がましになってくる． また母子里まわりにもどる．

[ダメなところは常にダメ]

Gibbs 分布からの標本 4 つ， 観測された明るさ vs モデルが予測する明るさ． あてはまりが悪いところ (「線」からはずれてる点ども) はどこでも悪いままということがわかる．

• 上の図のあてはまり悪いところ， もうちょいどうにかならんかな …… さらに詰めこめる葉数も 30000 枚ぐらいなんで， あと 10000 枚ぐらい増えないかしらん， と試行錯誤．
• 「葉っぱをたてる」 とたくさん詰めこめるような気がするけれど， じつはそうではない， とわかった． 「仰角は自由にとっていいよ」 と何もかも MCMC 計算の判断におまかせしてやると， 39000 枚ぐらい葉っぱをおしこむことができ， さらにあてはまりの良さも改善した．
• 1910 研究室発． 雨． 1940 帰宅． 晩飯．
• よるおそくまで計算試行錯誤がつづく．
• [今日の運動]
  • うんどう不足ひたすらつづく ……
• [今日の食卓]
  • 朝 (0730): ホテル朝飯ばいきんぐ．
  • 昼 (1410): 研究室お茶部屋． こんびに握り飯二個．
  • 晩 (2110): スパゲッティー． ハクサイ・ニンジン・シイタケ・タラすりみシチュー．