ぎょーむ日誌 2004-12-25
2004 年 12 月 25 日 (土)
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1000 起床．
朝飯．
コーヒー．
怠業．
昼飯．
1550 自宅発．
曇．
1600 研究室着．
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またぱいぷ原稿にとりくむ．
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院生部屋 A802 の防寒性をたかめる作業．
ブラインドのついてない窓があったんで，
お茶部屋から移植してみる．
さて，
これで少しはマシになるのか?
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で，
ぎょーむのほうの作業は進捗せづ
……
すごすごと撤退．
2120 研究室発．
2130 帰宅．
体重 74.2kg．
運動．
晩飯．
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現実逃避的隠者的思考として，
「なンか，
しち面倒な集団遺伝学問題は，
だいたいにおいて MCMC 法つかった
(よく考えると別に MCMC でなくてもいいのだが)
『隠れマルコフモデル』
で説明できてしまうのではないかしらん
……
世の中なんでも隠されている!」
といったアイデアに脳内メモリーを占拠されてしまう．
メモリー管理が意のままにならずメモリーリークしたままになったりするのは，
人間とダメ OS の共通点である．
いやいや，
ここしばらく大学院生たちの隠匿度のたかいセミナーばかり
拝聴してきたせいか?
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蛇足ではあるが，
集団遺伝学の難しい問題に対して
MCMC が常に有効なわけではない．
というのも，
観測データの標本もとである隠れ局所集団はちょっと油断すると
「尤度ゼロ」
状態
(統計力学用語でいえばエネルギー無限大)
に落ちてしまうからだ．
むろん「ええ，
ここで，
ここで奇跡のよーな突然変異が発生したのです」
と言いぬけるのは常道であるが，
クリスマスの夜も終わりつつあることだし，
おそらく世の中それほど奇跡にあふれてはいまい
(そもそも冬はそれほど遺伝子流動ないだろうし)．
他にも隠れ集団サイズがどーのこーの，
といった難点もある．
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しかし，
連鎖している多遺伝子座のランダムサンプルを生成してみよ，
といった問題には MCMC はひどく便利だな
……
と，
いまさらながらに気づく．
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[今日の運動]
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エアロバイク 55 分間．
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腹筋運動 30 ×
3 回．
腕立ふせ 5 ×
3 回．
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[今日の食卓]
- 朝 (1010):
米麦 0.5 合．
わかめスープ．
- 昼 (1500):
ロールパン．
- 晩 (2330):
米麦 1.0 合．
コマツナ・油揚煮物．