ぎょーむ日誌 2004-11-11
2004 年 11 月 11 日 (木)
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0540 起床．
5 時間ぐらい寝た．
朝飯．
コーヒー．
0640 自宅発．
曇．
0650 研究室着．
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輪読会準備のつづき．
風邪ぎみモードはかなり離脱．
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1210 よーやく準備できた．
14 部複写．
昼飯．
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1300 より Life-history evolution in plants
輪読会．
今日は第 2 章 Modelling and Measuring Plant Life Histories
で，
行列まにあな内容である．
しかも 30 ペイジもある．
これをいっきに終らせないといけない．
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しかしながらですよ，
参加していた大学院生のほとんどが
「行列モデルって何?」
な状態であった．
こんにちの生態学分野の大学院生はそんなの知らないのである．
さらに，
だ．
行列の固有値の意味とかもぜんぜん知られていないわけで
……
このあたり，
必ずしも知らないのが今どきの理系なひとたちなのである．
いや，
昔からそうだったのかな．
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ということで，
1500 ごろまでは，
おそらく今年国内で行なわれたもっとも丁寧なる
「生態学で使う行列モデル」
の解説．
本文とはほとんど無関係．
というのも，
この第 2 章ってのはひたすらひたすら偏執的に
λ
がどうなるかって計算ばかりしてるわけで，
「この『入』ってどういう意味ですか」
では内容がまるでわからないからだ．
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いったん休憩して 1630 ごろまで，
第 2 章をななめよみ
……
「行列モデルって何かの役にたつの」
と考えてる院生あいてに解説してみてわかったんだけど，
こんにちではここまで極度に抽象化されたモデルは
「考えの起点」
としては重要だけど，
ハナシを最後までひっぱっていくチカラはない．
固有値だってよく考えるとそれほどありがたい数量ではない．
無理に使おうとすると，
この第 2 章後半のごとくやぶれかぶれになる．
ひとことでいえば，
面倒な時代になった．
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ところでこの第 2 章，
とにかく 30 ペイジであれもこれも紹介しよう，
というココロ意気はうかがえるのだが
……
いろいろとアヤしい内容も含んでいる．
最初の図は例題としてはヘンで，
固有値の計算も私のみるところほぼでたらめ．
また，
「平均弾力性と要素の変動係数」
なる変てこなグラフが示されていて，
そこに「負の相関」を見いだしてしまった著者は
「解釈」と称していいかげんなこじつけを開陳している．
じつはこれは典型的というほかない
「x vs 1/x の人造相関」
な図で統計学的にも生物学的にもなんの意味もない
「相関」
なのである．
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1630 すぎ終了．
ばてばてばて．
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井田君あいての Perl こんさる業．
データ集計に関するもの．
ついでに同じ問題を R でも解いてみる．
やはり R のほうが遅い
……
が，
おそらくもう少し速くする書きかたが存在するようにも思える．
sapply()
とか
apply
系関数をヘタに使うと遅くなるような気がする．
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かなりへろへろな状態で
1920 研究室発．
1930 帰宅．
体重 73.2kg．
晩飯．
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いきなり寝てしまったけど，
2-3 時間で目がさめる．
なんというか，
みょーに汗びっしょり．
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[今日の運動]
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[今日の食卓]
- 朝 (0550):
米麦 0.7 合．
キャベツ・ブナシメジ・豆腐のシチュー．
- 昼 (1240):
研究室お茶部屋．
米麦 0.7 合．
キャベツ・ブナシメジ・豆腐のシチュー．
- 晩 (2030):
米麦 0.7 合．
キャベツ・ブナシメジ・豆腐のシチュー．