ぎょーむ日誌 2004-10-27

2004 年 10 月 27 日 (水)

• 0800 起床． 朝飯． コーヒー． いきなり積雪してるな． 0910 自宅発． 曇ちょい雪． 0920 研究室着．

[いきなり雪]

かとーオフィスより． しかし， じつは昨日の昼間にも降っていたそーで．

• 苫小牧ボスからメイルいただき， 昨日の PPFD 問題は欠測ではなくデータはあるとのこと． それをいただくのにしばらく時間かかりそうなんで， とりあえずの試験運転も兼ねて 2004 年はぬきにして 推定計算をやらせてみる．
• 今朝， 起床したときから苫小牧直径成長モデルの推定計算方法の改善， というアイデアにとりつかれている． モデルは変更せずに， 計算方法だけを変えて高速化を実現する， という方向で．
• 現在つかっている方法は「ばか正直」という他ない 「全探索」 である． このためにイタヤカエデ一種計算するだけで 13 時間とか 27 時間も必要になってしまう． 全探索なので， 良さそうな気象フィルターセットにも ダメそうなやつらにも同じだけの労力を費して 計算している， というかんぢだ．
• さて， 気象フィルターセットが生成する 気象値セットというのは， 樹木の直径成長量の 個体群平均の年変動 のみを説明するものである (まあ，厳密にいうと「交互作用項」とかもあるんだけど)．
• いっぽうで， 気象値セットとゆーのを「どれも等価」とは考えずに， なんらかの「序列」みたいなものがあれば， 推定計算は速くなる， という状況にある (現在は等価だとみなしているので遅い)．
• であるならば， だ． 以上を組み合わせて考えると， 成長量個体群平均の年変動に対する 「何らかの距離」 の遠近で気象値セットを序列化してしまえるんではないか ……? すると一次元上に「並べられた」気象値セット， それも「良さそう」「良くなさそう」のわかる空間の上での探索， ということになり， 計算は高速化するけれど「探索もれ」はあまり起こりそうにない， というような状況が現出するよーな．
• では， 個体群平均成長量と気象値， これらふたつの時系列の「近さ」はどう定義されるべきか? マジに考えると， 何らかの確率論的距離を定義してそれを用いるべきだろう． しかしながら， この目的においては「良さそう」「良くなさそう」 といった目安さえわかれば十分なのである． つまり， ある序列における最良の気象値セットがそのまま選ばれるわけではなく， 最終的には探索プログラムが尤度 (確率論的距離) を評価して選抜していく …… だとすると， ですよ， 「とりあえずの近似的とでもいうべき序列化」 のためには「二乗誤差の和」のごとき， いーかげんな測度で十分なのかもしれん． これはラクだ．
• 問題はこの方式で計算するプログラムを作ってるヒマがあるかどーか， というあたりだ．
• 甲山さんのどろねば流体森林モデルのゲラ修正． Springer は Word で組版してるのか? 科学系出版社なら TeX かそれと同じ品質の出力が得られるソフトウェア使えよ．
• そして「ぎょーむ日誌」のアップロード失敗に気づく． いやはや．
• あ， 二重にしくじった．
• 雪はまだぱらぱら降ってるんで， 構内走はみあわせて昼飯にするか． 昼飯くってると朗報． PD 石井さんは来年からアルバーター州 (カナダ) ぐらしである．
• 今日の Trendy セミナーの予習を少々． 光合成研究に関する簡単な解説など読んでみる．
• 鍋嶋さん作のポスター (生態学会釧路大会用) からいろいろな部品を盗用する作業． お茶部屋 iMac 上で Adobe Illustlator 10 なんぞ使ってみる． おひすだの Photoshop だのは open source な類似ソフトウェアが入手できるけど， Illustlator ってのはそう簡単にはマネできないみたいだねえ． 独占企業 Adobe 社の難攻不落の要塞， ってかんぢか．
• で， その Adobe 社の Postscript 形式なファイルだが …… 日本語文字いり ps ファイルを Linux 上に移すことはできんよーですな． フォントではなく文字コードの問題， と見える．
• 北大ネット管理者から下っぱ (かつ非公式) 管理者どもへのメイル． ばかとしかいいようがない．

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北大のメール送受時にウィルスチェックを行うための
ウィルスウォール（133.87.1.140、141）がspamcopの
ブラックリストに登録されてしまいました。

http://www.hokudai.ac.jp/u-hines/hines-run/normal.html

spamcopとはSPAMメールを送信しているメールサーバなどの
IPアドレスをブラックリストとして公開しているもので、
メールシステム管理者はここを参照し、リスト内にあるIPからの
メールを受取拒否させる設定をすることでSPAMメール受信を
避けることができます。

10月23日から北大からも多数のSPAMメールが送信されたため、
北大ウィルスウォールのIPアドレスがspamcopのブラックリストに
登録されてしまいました。

従いまして現在、spamcopを参照しているメールサーバに対して
北大からメールを送信することができません。

昨日からspamcopに対してブラックリストからの登録削除申請を
行っておりますが、北大からのSPAMメールが無くなるまでは
今の状態が続く旨の返事が来ております。

つきましては、各端末のウィルスおよびスパイウェア駆除の
周知徹底をお願い致します。

現段階ではブラックリストからの削除完了には
まだ数日の時間がかかる可能性があります。
（早くても明日以降、SPAMメールが送信されていると判断された
場合はさらに長期に及ぶ可能性があります）
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• ホントに spamcop.net に登録されてる …… ぢつに不名誉ですな． すぱむ業者， 北大．
• 1630 トレンディーセミナー ， 今日は低温研の小野さん「生育環境が葉の老化過程に与える影響」． 窒素欠乏な貧栄養な環境だと葉の老化が促進されたり， 光ストレスの影響がつよくなってるみたいだったり， というハナシ． 葉の「老化」(光合成活性がおちる，など) を直接に引き起こすらしい原因のひとつに， 葉内の光合成産物の蓄積がある， と実験的に確かめておられる (光合成産物が蓄積されると RuBisCo 部品のひとつ rbcS の発現が抑制される → 光合成関連部品が減りますます窒素が出ていく)． しかし， 葉が老化してきたときに窒素を追加してやると， 葉内から光合成産物が減ってしまい， ふたたび「若がえる」(?) よーで …… 小野さんはこの光合成産物の減衰が他の部分への転流によるもの， と考えておられるらしい (しかし直接的には調べられていない)． もしそうだとすると， 「光合成してる葉は他の部分に資源をどんどん送り出せる (手もとには残らない)， やってない葉ではその場にとどこおる」 ということのよーで …… 興味ぶかい．
• 「人類の敵」 と認定されてしまったネット公害サイト hokudai.ac.jp 関連の続報． まー， いかにも北海道の大学， というようなのんびり対応で．

  10 月 27 日 (水) 16 時現在においても学内からSPAMメールが送信されている形跡があります。ウィルスまたはスパイウェアに感染している端末から送信されるメールは 1 時間で 7000 通 を越える場合もありますので、疑わしい端末や情報基盤センターから感染疑いのある端末として通知された端末についてはネットワークから切り離した状態でウィルス検査等を実行してください。

  HINES がわには学内→学外に流れる迷惑メイルを食い止める 技量がないんだよね． いや， わかってはいたはずなのだけど． やれやれ． いやはや． これからかなり不便な時期が続きそうだ．
• 同時に， 大学のせんせーがた・院生・学生の 計算機自衛能力もこのていどなわけで． ふつーのヒトたちと何ら変わるところナシ． 前にも書いたけど， 北大学内ネットは virus の一大繁殖地であり， 相互感染・汚染拡大はとどまるところナシ．
• 講座内にもこのあたりの通知をながす． さっそく， 「先方のサーヴァーがメイルうけとってくれません」 という不幸な人が相談にやってきたり． メイルだしたけりゃ， 北大やめるしかありません (まあ，学外の SMTP サーヴァー経由で出せばいいんだけどね)．
• また別の呪われ問題． M1 牛原さんが「うっかり」 ゐんどーづ XP の SP2 をあててしまったので， POP 経由でメイルが取れなくなる …… すごすぎるぞ SP2． この問題は私ではなく赤坂君が解決してしまった． なんでも「システム復元」なる機能を使えばよいとのこと …… えらく時間かかるな． そして， メイルとれるようになった．
• 苫小牧直径成長の計算 (2003 年データまでの試験運転)， 「全探索」 方式だと 10 時間弱で 640 セットしかさばけていない． つまり全部終了するのに 22 時間かかる， ということだ． 以前は 13 時間ですんだんだけど， 樹木個体が追加されたので 1.7 倍に計算時間ふえましたか．
• 2000 研究室発． 2020 帰宅． 晩飯．
• 苫小牧ボスから修正された気象データ送っていただく． A 棟 8F 闇ネットにログイン， 計算用マシン dellpn に移動してあれこれ修正． 2140 推定計算再開．
• 標本数ふえるとますます計算時間が増大する， というのがありそう …… というのも， 「全探索」の各最適化において， 標本数が多い場合には次数の高いプログラムまで検討する確率が高い， という気がする． 標本数が増大するにつれて， 複雑モデルでも AIC が悪化しない傾向がでるからだ．
• [今日の運動]
  • 腹筋運動 30 × 3 回． 腕立ふせ 5 × 3 回．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0820): 米麦 0.7 合． ハクサイのカレー． 電磁波なやつ．
  • 昼 (1310): 研究室お茶部屋． 米麦 0.7 合． ハクサイのカレー．
  • 晩 (2130): 米麦 0.9 合． ハクサイ・ダイコン・ブナシメジ・煮干の味噌汁． 火力調節できんガスレンジで 味噌汁を作るのは意外と難しい．