ぎょーむ日誌 2004-03-26

2004 年 03 月 26 日 (金)

• 0750 起床． 朝飯． コーヒー． 0900 自宅発． 晴． 0910 研究室着．
• 釧路大会雑用とかやらないといけないんだけど， イヤになったんで一日中 R による作図プログラミング問題にとりくんでいた． 作図はいい． ココロの平和が実現する．
• で， 題材はここ数日とりくんでる M1 平林さんの マルハナバチ人工花訪花実験 (例 ← これは PD 石井さんの実験) で得られたデータを視覚化しましょう， という趣旨で． 視覚化なくしてモデリングなし．
• いやー， この訪花データ handler に関しても， 作図なんかの機能追加とかやってるヒマあるんだったら， 使いかた解説とかを書かんといかんわけで． しかし， 本日はもはやそういう道理は捨て去り， ただひたすらに自動お絵描きの世界を構築してゆくのだ．
• とりあえず午前中を費して --- いや，もう 1320 か --- 花序内の花から花への移動を表す矢印をひっぱるところまで． まだ散房花序 (Umbel)の大だけなんだけど．

[訪花パターン自動作図の例 1]

ここしばらくやってる階層的データ構造から， 必要な部分をひっぱてきて作画させる関数． 左は上で述べてる状況よりは少し進展して， 花序内に 13 個ある花それぞれに数字で情報を書きこんでる． 矢印は polygon() で書く． ある程度の移動回数があった経路だけを矢印で示している． 矢印アタマの大小で移動量をあらわしている．

• 北大構内走． 雨が少しばかりふってるんでいつもより早く切りあげる． 昼飯． 4 月から某社の SE となる M2 大澤君が出発する． いやー， シウリザクラ 問題はぢつに勉強になりましたよ …… なんでも苫小牧からフェリーに乗ったそうなんだけど， その前に 研究林 寄ったらにわか R コンサルティングやらされたそーで． Open source software を使った商売繁盛のきざし， おおいにけっこうですな．
• Umbel 大はめどがたってきたんで， 他の花序形にもとりくむ．
• 日没ぐらいにひととーり完成． ばてた． プログラミングはたいして面倒ではないんだけど， 線とか矢印の大きさとかをバランスよくするのが難しいと思った． じつは私ってそういうセンスに欠けるところがあるんでは， とは危惧してはいるんだけど．

[訪花パターン自動作図の例 2]

追加したのは円錐花序 (Panicle) と総状花序 (Raceme)， それぞれ大小あるんで合計 6 花序形． ハチどもがうろうろさまよう様子が見てとれるんで面白い． けっこう花序のカタチによって違ってくるもんなんだねぇ …… ということがわかる実験． このように， とくに時間・空間構造あるデータでは「よい作図」 をこしらえてみせるのが重要であり， 「ちょっと修整して描き直し」 を可能とする自動作図ワザは必要不可欠だろう …… しかし， これって， 多くの生態学研究者にとっては 「ぜったいやりたくないこと」 のひとつにされてんじゃないかと思うほどに， なぜかイヤがられてるんだよねえ ……

• 作図だけでほぼ一日が終って 1900 研究室発． 1910 帰宅． 体重 73.8kg． 晩飯．
• [今日の運動]
  • 北大構内走 1330-1350． ストレッチング．
  • 腹筋運動 30 × 3 回． 腕立ふせ 3 × 3 回．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0830): 米麦 0.7 合． 卵スープ．
  • 昼 (1415): 弁当． 研究室お茶部屋． 米麦 0.7 合． コマツナ．
  • 晩 (2030): 米麦 0.7 合． タマネギ・コマツナ・エノキダケ・豆腐の煮物．