ぎょーむ日誌 2001-09-10

2001 年 09 月 10 日 (月)

• 0700 起床． 寝れたのは結局 0200 すぎ． 今晩はバグ戦争なんぞやらずにさっさと寝る， と決意．
• 朝飯・弁当の準備． 朝飯． シャワー． コーヒー．
• 0745 自宅発． 雨． 台風 15 号というのが接近してるらしい． 燃えるゴミ出し． 特急に乗って 0754 京急平和島発． 普通に乗り換えて 0820 京急上大岡発． 横浜方面， 雨強し． 0835 研究所着．
• 朝から気分悪い． コーヒー飲んだのがまずかったか．
• ここしばらく甲山さんの Abies 論文の別刷りを探してたんだけど なかなか見つからなかった． 今朝， ふと気づいたんだけど， 目の前の液晶ディスプレイの横にずいぶんと前から 立てかけてあった． うーむ．
• で， 拝読すると …… なんかいま計算してるのとは違うような． まぁ， このあたりはおいおい調節してみよう．
• アタマがまだぼけてる状態なので， いーかげんに Abies PipeTree 試験運転などやったりしながら， メイルなど書いたりする． まだマトモに動かぬ樹木シミュレイターに関する 研究成果とやらの発表に関連する連絡を 分離独立目論む某州に送ったり． やれやれ． あ， 飛行機発着待ちのための宿泊まだとってないよう．
• なーんか BookPC の計算速度遅くないか? クロック数 733MHz のはずなんだが， 自宅外づけ計算機 Mate650MHz より遅いような気がする． どちらも PentiumIII．
• ちょっとした小改良しただけで午前中終了． 昨日の「ぎょーむ日誌」の下ぶぐれな「こみこみ」 樹木はイヤだと思った甲山さんメイルによってめでたく 垂直系・水平系の主軸長さ→側軸長さ変換のモデルが再統一された． まぁ， 一次式モデルなんだが．

• 弁当食いながら計算させてみると， たしかに横方向の分裂はこれで多少は食い止められる． しかしなかなか下の枝が死なない． やはり競争をきつくせんといかんのじゃないかな． ところで種内競争というような生態学じゃーごんはあるけど， 個体内競争， という概念はあるんだろうか． まぁ， いまの PipeTree の場合， 個体内の資源共有の度合が強いんで， あたかも「競争」みたいに見えるんだが．
• ところでどうしてこんなに計算遅いんだろう …… と思ったら， いまたまたま調べていたパラメーターセットは すごく矮化した個体を生成するものだった． 狭いところにぎちぎちに詰め込んだら， そりゃあ計算速度落ちますね． 三次元区画で切り分けるというまじないが効かなくなるから．
• 逆に言えば計算にどれぐらい時間かかっているのか， を見ればどんな樹型なのかだいたい想像がつく， ということですな． 計算が速いときはすらりとしてる．
• 弁当の飯がうまく感じられる． 体力が少し回復してきたんだろうか． あるいは昨晩調達してきた オーストラリア産コシヒカリの功名かしらん?
• 午後もメイルなど書いたり小手先変更→試運転といった ぬるいことをやっていたんだけど， いつまでもうだうだしてられないので， 次なる改造の準備に着手する． 三次元区画 Voxels の境界処理である．
• 三次元虚業ライブラリー， すでにかなりややこしくなってるんで， いきなりぱっとみて本能のおもむくままにコード改変， とはいかない． 関連するコードを 10 ペイジほど印刷し， どのポイントで変更するか， といった検討をしてみる．
• その結果わかったのは …… 境界条件処理， というのはどうしてもどろくさくなってしまう， という現実である． えーい． またまためんどうだ． しかしこれもまた逃げられぬ局面だ．
• 生物統計メイリングリスト biometry を通じて， 三中さんから今年の計量生物学セミナーの 案内 ． 「Bioinformatics: ゲノム情報による遺伝子の探索，機能予測， 集団構造と進化の推定」 か …… すごく楽しそうだけど， 今回はパス． どうもそのあたりは何か別の予定 (複数) がありそうな ……
• 三次元区画 Voxels の境界条件問題だが …… メモに問題点を列挙してみるとかなりややこしいものになる， とわかった． もいちどメモを整理してから コーディングしてみよう．
• ということで本日は撤退． 1745 研究所発． 雨やんでる． 普通に乗って 1800 京急杉田発． 快特に乗り換えて 1810 京急上大岡発． 普通に乗り換えて 1800 京急川崎発． 京急蒲田すぎるあたりからざーざー降ってきた． 1900 帰宅．
• ラジオの台風情報ききながらぼーっと晩飯を食い紅茶を飲む．
• おっと時刻はすでに 2100． 帰りの電車の中でくだんの三次元境界問題に関する うまい処理法を思いついた． やっぱりちょっと vi (vim) エディターから 離れてあれこれ考えをひねってみたりすると， 良い方法なんかを思いついたりするもんだ．
• とはいえ， 今晩もいまから三次元ライブラリに手を加えたりはしない． 悪質なバグが発生したら眠れなくなる． そのかわり， アイデアを整理したメモをぢりぢり作ってみるかな …… うーむ， 「どのカベにぶちあたったか?」 の判定は泥くさいままだ．
• で， 私にしては珍しくてきぱきと こういう詳細でながーいメモ を 2240 ごろに書き上げてしまってから， ようやくある重大なことに気づいた． 自分はなんて阿呆なんだ． こんなごちゃごちゃした関数作る必要， まったくないじゃない． 境界条件が三種類もあってあってややこしい． そうですか． だったら， 継承を使えばいいだけじゃない． 呪われ言語 C++ なんだから． Boundary を基底クラスとして， BoundaryAbsorptive と BoundaryReflective と BoundaryPeriodic を派生すればいいんでしょう? いちいち条件分岐する必要なし． 衝突点を特定するときも 六枚の Boundary* からなる vector<Boundary*> くるくる回すだけ． そっちのほうがよっぽどすっきりスマート， 柔軟性も高い …… いやー， まいったまいった． ははは …… はは ……
• 今日は平日でありながら休日のごとき 静かな一日でありました． まぁ， そういう日があってもいいでしょう． 発表までの日数が残されていない， という点を看過しえるならば …… さーて， 寝よ寝よ．
• 今日の食卓
  • 朝 (0715): 米 0.6 合． ツルムラサキおひたし． キムチの素味． じつは昨日の昼の残り．
  • 昼 (1220): 弁当． 米 0.8 合． 朝と同じ．
  • 晩 (1920): 米 0.6 合． タマネギ・ニンニク茎・ヒラタケ・卵の炒めもの．