ぎょーむ日誌 2001-05-10

2001 年 05 月 10 日 (木)

• 0530 起床． 昨晩の「消灯」が 2200 で， 今朝 0330 ごろに目が覚めたんだけど， そのまま 2 時間ほどぢっとしてました． 体内時計が早いほうにずれてしまうのもね．
• 朝飯・弁当の準備． シャワー． 朝飯． コーヒー．
• 0708 自宅発． 曇． 気温低くて良い． 特急で 0716 京急平和島発． いつもより早い列車である． 普通に乗り換えて 0740 京急上大岡発． 0805 研究所着．
• 「今日のろーどく」を再開する． 場所は私の「逃れの街」と化してしまった 独房群屋上である． ま， そのうち耐え切れないほど暑くなるんだろうが， いまはまだ快適だ．
• 第二章の終りのほうで止まった蝋山本はいったん措き， Simon Levin の一般向け生態系・多様性・進化・複雑系本である Fragile Dominion に取り組む．
• 今日の朗読
  Simon Levin ``Fragile Dominion''
  Chapter 1. Biodeversity and Our Lives -- A Cautionary Tale --
  • Human Stewardship of a Chanding Enviroment: A Historical Perspective and a Grance at the Future ( - p.5)
  • Disappearing Biodiversity ( - p.8)
• 今日のところは一章の半分まで． 環境問題うんぬんからなぜ生物多様性を維持することが 重要か， というハナシにさしかかるところである．
• いまやってる Pasoh 解析下請け計算は 多様性のハナシに何やら関係あるらしい． 発注者の甲山さんの意図はいまだ全体がつかめないんだが (ということにしておこう)， この「商品」が陳列される見本市にして「敵地」たる Princeton， その頭領 Simon Levin について研究しておくのも 悪くないかも知れない．
• 北大内の何箇所かの web server が不法侵入されて ペイジを書き換えられちゃったんだとか． ことごとく M$-Window$2000 にサーヴァー やらせてるところ， とのこと． 自業自得だ． とか書いてると， Linux + Apache の致命的な穴が見つかったりして．
• しかし何で新型 OS なのにいまだにそうやすやすと 「乗っ取られたり」 するわけ? ZDNet で調べると …… この記事 かな． IIS がやられてんのか．
• 九大の とーや師匠 からメイルを頂戴し， ssh の RSA 認証での 「パスフレイズ一度きり入力」 のワザを伝授していただくことになった．
• その方法を Vine Linux 2.x の標準的な 一般ユーザーとして実現するには以下のとーりである．
  • ssh-keygen で生成した identity.pub の中身を先方 (つまりリモートがわ) の $HOME/.ssh/authorized_keys に追加しておく．
  • $HOME/.bash_procile に下の行を追加．
    eval `ssh-agent -s`
    
  • $HOME/.xinitrc に下の行を追加．
    SSH_ASKPASS=/usr/libexec/openssh/x11-ssh-askpass ssh-add <&-
    
  この効果を一番てっとりばやく試すには， 一度完全に logout してからやりなおす． login して (すると $bash_profile が評価される) startx で X を立ち上げると x11-ssh-askpass が ssh RSA 認証の パスフレイズを聞いてくるので入力する． そのあとに開かれる X 上の terminal emulator (kterm など) ではパスフレイズを入れなくても リモートのホストに ssh/slogin/scp などできる．
• では X ではないコンソール上ではどうするか． 上のやりかたを参考にネット上でしらべてみたところ， 以下のようにやればよい， とわかった．

	$ ssh-agent $SHELL     # ssh-agent な bash など起動
	$ ssh-add              # パスフレイズ聞かれるので入力

これで， あとはこの ssh-agent な bash 上では パスフレイズなしでリモートホストに ssh できる．
• これで (私の設定では役立たずだった) .shosts ファイルなど不要になる． $HOME/.ssh/authorized_keys に RSA 認証キイを登録して RSAAuthentication できるようにしておけばよいだけである． 北大<鳳翔> にも まるですっと入れたので感銘うける．
• いやはや助かりました． たとえばこの「ぎょーむ日誌」の更新は 今まで 2 回もパスワード入力を 要求されていたのである (ssh 経由した rsync と ssh 経由したペイジ生成コマンド)． いまやたんに「ぎょーむ日誌更新コマンド」 logupdate.pl をいれるだけ． ああ，楽ちん．
• 生態学者 ThinkPad 顕彰倶楽部 (いつのまにそんなモノできたのか?) の盟友たる浦口さん (北大) が 新規調達機種を選定中との情報． 私もなんとなくそのあたりを調べてみる (自分が買うわけでもないのに)． うーん all in one なやつですか …… そして IBM はこのクラスのマシンを 10 万円台前半で提供しつつある， と知って驚く． いやあのよくわからぬ HPA 液晶じゃなくて TFT 液晶なやつですよ． すごい時代だなぁ．
• ああ， ssh と ThinkPad で午前中が終わってしまった． 昼飯食ってからも メイル書きあれこれ．
• 午後になって雑用に忙殺されているはずの 甲山さん (Pasoh 解析発注者) からまーた怪しげな計算依頼． 甲山わーるどにおいては 「集団の最大到達サイズ」 とゆーのが重要ということになっている． で， 私はそんなの測定できないし， 推定しよーにもバラつきおおきいんで 意味無いですぜ， ダンナ， という認識． 先日の分布95% サイズというのは そのあたりを示すものだったのである．
• で， 今日は何かと思えば 「観測された最大サイズの 90% 以上の 個体のサイズの平均」 …… って何ですかこれは． ばらつき大きい量を基点にした 統計量なんてやはりばらつき大きいに 決まってるじゃないか …… という返信書いてるうちにアタマの中が 「ああっ， 生態学者っつーのは 平均値の計算さえすれば 数値から『ケガれ』が消える という宗教に取りつかれてるなぁ …… おはらいぢゃあるまいに ……」 うんたらかんたら …… とどんどん暴走していって， ついにその 「平均とろうと呪われは呪われ」の 実例を計算する Perl スクリプトを書いてしまった．
• 「サイズ」 (たとえば太さ) をもつ樹木個体の集団を 乱数で生成する． 確率変数であるこのサイズは 平均値 10 (すなわちλ= 0.1) の 指数分布に従う個体数 200 の集団を 100 個作る． で， その集団の「上のほう」に関するいろいろな 指標を計算してみると

					集団平均	標準偏差
	---------------------------------------------------------
	(1) 観測された最大サイズ:	59.4		13.7
	(2) 上記 90% までの平均サイズ:	58.7		14.2
	(3) 頻度 95% でのサイズ:	28.5		 2.5
	---------------------------------------------------------

となった． ということで (当然ながら) (3) の頻度 95% サイズの推定値のばらつきが もっとも小さい． そして (1) と (2) の「信頼できなさ」は似たよーなもんだ， とわかる．
• 蛇足ながら，λ=0.1 の指数分布の 95% 点は 30.0 なので， 上の「(3) 頻度 95 % サイズ」推定値から 1σの範囲内に 真の値が含まれてることがわかるだろう (指数分布には分布の上限がないので， (1)(2) はこういう評価ができないのもマズいところだ)．
• 甲山さんに報告メイル送ったのが 1520． 上のモンテカルロ実験のコードを再点検してから， ssh とサイズ問題まとめた「ぎょーむ日誌」 なんぞ書いてると 1620． いやはや． ちょっと屋上に逃避してストレッチでもしてから， お茶でも飲もう． お， 晴れてきたな．
• 世界闇ネット管理者組合 (いつのまにそんなモノできたのか?) の同志たる牧さんから， お手元の闇ネット呪われぎみ， という連絡． 状況不明． 健闘を祈るばかり．
• よーやく， 三次元ライブラリ改装工事のつづき． いやはや．
• と思ったら， 「観測された最大サイズ個体を基準にして ……」 のアイデアに愛着のある甲山さんが どうのこうのと言ってきたので， 集団サイズを 50-5000 と変化させた 計算結果 も送りつける． 実際に計算してみると 「観測された最大サイズ」 ってものの危うさがよくわかるな (あ， いかん …… 「ニセ」アカマツで似たような指標を使ってるぞ)． いっぽうで， 95 パーセンタイル値 (という名前だと教えていただいた) のほうは理論値 30 にどんどん収束していく …… これって不偏推定量かも?
• 結局， 今日は三次元ライブラリの改装はすすまなかった． 1805 研究所発． 1815 京急杉田発． 特急に乗り換えて 1820 京急上大岡発． 1850 帰宅．
• ThinkPad が絶不調である． 稼働中の本体にさわっただけで電源オチてしまう． あちこち押したりひっぱたいたりしてるうちに また電源が入る． どうなってるんだろうか．
• とりあえず分解して調べられるところは全部調べてみた． うーん， 見て分かるはずもなし． 10 回ぐらいリブートさせられた (とうぜんそのたびに e2fsck が動いてしまう)．
• しょーがないんで外づけ鍵盤で このぎょーむ日誌など書いている． 本体にはさわるとたちまち電源切れてしまうんで． 変だなぁ． 夕方， 独房出るときはどうもなかったのに．
• 今日は眠気にやられる暇もなく ThinkPad 点検にあけくれてしまった． 時刻はすでに 2210． 2300 までには消灯しよう．
• 今日の食卓
  • 朝 (0630): 米 0.6 合． ホウレンソウおひたし． 麺つゆ味． ゴマ・茹でシイタケ和え． 昨晩の味噌汁の残り．
  • 昼 (1205): 弁当． 米 0.8 合． ホウレンソウおひたし．
  • 晩 (1930): 米 0.8 合． タマネギ・ニラ・ヒラタケのカレー．