ぎょーむ日誌 2015-02-(21-28)

2015 年 02 月 21 日 (土)

• 0600 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー．
• とらと遊ぶ．
• 1020 自宅発． 1050 研究室着．
• ぢりぢり
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． 豆腐の味噌汁． キャベツのサラダ．
  • 昼 (1200): 研究室． 米 0.7 合． カレー．
  • 晩 (1900): 米 0.7 合． チャーハン． コマツナ・シイタケ・豚肉の炒めもの．

2015 年 02 月 22 日 (日)

• 0600 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー．
• けっきょく， 本日午前はとらとふらふら遊びに出て …… 札幌市電・地下鉄・中央バス・JR 北海道バスなど乗り継いで， 札幌 TV 塔から円山公園まで ……
• 昼飯． とら寝かしつけ ……
• 研究室にいったけれど， とらばてでなかなか進捗せづ ……
• そして夜のとら寝かしつけにも苦闘 …… 今日は合計 2 時間以上， とら寝かしつけに費やしている． 一日 24 時間， 起きてる時間は 17 時間ぐらいなので， かなりの消耗であると実感されるな ……
• 一年前のぎょーむ日誌をみると， 1.5 歳児とらあいてにかなりひへーしていたようだ． 夜泣きとか． その一年前の 0.5 歳児とらには， あまり苦労してなかったみたい …… 一年後の 3.5 歳児とらは， どんな漢字だろうか．
• 「寒い」ということは意外と「ひへー」の原因となる．
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): ベイグル． 野菜スープ．
  • 昼 (1200): キッシュ． 野菜スープ．
  • 晩 (1900): 鳥のスープ鍋．

2015 年 02 月 23 日 (月)

• 0500 起床 …… 今週の土日の集中講義の準備がまだできてない …… というのが気になってよくねむれない．
• 少しだけ作業をすすめる …… しかし， それはじゅぎょー準備ではなく， コンロンソウデータのややこしい処理だったりするわけだが ……
• 朝飯・弁当の準備． 朝飯． コーヒー．
• 0810 自宅発． 0820 保育所着． 0850 研究室着．
• ラジオ体操．
• ちょっとうんどう， 30 秒ぶらさがり． 昼飯．
• ぢりぢりじゅぎょーじゅんび ……
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 記録だつらく

2015 年 02 月 24 日 (火)

• 0550 起床． 朝飯・弁当の準備． 朝飯． コーヒー．
• 0800 自宅発． ちょっと雪がぱらぱらふっているけれど， とらとてけてけ歩く． 今日は， やや早めに出れたので三方向行きの JR 北海道バス (札幌・琴似営業所・啓明行き) を見ることができたので， とらは満足したもよう． 0815 保育所着． 0845 研究室着．
• なかなか進捗しない集中講義 (今週の土日だ!) のつづき ……
• 昼飯．
• いろいろとたすけていただきました ……
  • RT @kaz_yos : Stan: A platform for Bayesian inference www.stat.columbia.edu/~gelman/presen…   05:53:27
  • RT @yutannihilation : ggplot2の等高線にラベルをつける - Technically, technophobic. notchained.hatenablog.com/entry/2015/02/…   09:25:32
  • RT @berobero11 : dirichlet(A,A,A,A,A,A) （Aが大きい値）からは真四角な6面サイコロが生成されやすく、dirichlet(大,小,小,小,小,小)からは1の目だけ出やすいサイコロが生成されやすく、dirichlet(全部小)だと一部の目だけが出やすいサイコロが生成されやすい。   14:03:21
  • RT @berobero11 : よくある場合においては、ベータ分布はコインのゆがみを決める分布、ディレクリ分布はサイコロのゆがみを決める分布、と言ってもいいかな。   14:03:40
  • RT @berobero11 : ディレクリ分布をベータ分布改、ベルヌーイ分布をコイン分布、カテゴリカル分布をサイコロ分布とダサく呼ぶことで精神的な障壁を下げるライフハック。   14:03:49
  • RT @ibaibabaibai : 出ました～　マニアックですがよろしく 特集「生体高分子の揺らぎとダイナミクス－シミュレーションと実験の統計解析－」 www.ism.ac.jp/editsec/toukei…   15:50:00
  • 終わりの見えないじゅぎょー準備につかれて，JAGS&rjags 出力 mcmc.list を bugs に変換する(不完全な)関数とか書いてしまった…脱ゐんばぐすは順中に進捗，しかし R2WinBUGS 依存からの脱出は意外と難しい…   15:53:59
  • 
  • library(R2WinBUGS) で定義される plot.bugs() の図示も「かんぺき」ではなく，ほぼ正しいけどびみょーにおかしいような気がする…mcmc.list から bugs への変換が不完全なんだろうね…   16:01:07
  • 
  • @berobero11 あ，berobero さんの昨日の記事中の mcmc.list2bugs を見落としていました．私も似たようなの書いてみましたが，いくつか要素が脱落してますね．berobero 関数つかわせていただきます．   16:30:19
  • post.mcmc.list → bugs の変換． @berobero さんの昨日の記事 heartruptcy.blog.fc2.com/blog-entry-170… の mcmc.list2bugs が完成度がより高く，図示が正しくなった．原因は私の mcpar <- attr(b1, "mcpar") 忘れ   16:38:10
  • @berobero11 ありがとうございます! たすかりました．   16:41:09
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． タマネギ・油揚げの味噌汁． サケ． セロリ・ニンジンのソース炒め． カブのサラダ．
  • 昼 (1200): 研究室． 米 0.7 合． サケ． セロリ・ニンジンのソース炒め． ブロッコリー．
  • 晩 (1900): 米 0.7 合． タマネギ・油揚げの味噌汁． 豚肉・野菜炒め．

2015 年 02 月 25 日 (水)

• 記録が混乱してて …… TwiLog しか残っていない!
  • 集中講義だのあれこれで「統計モデルとは何か?」の例示どりぶん(おりえんてっど?)な説明が必要になり，サイコロの統計モデルというハナシをでっちあげたのだが…発想は悪くはないと思うけど，実際に説明してみて，その後の改良が必要そうなかんじ…   17:10:58
  • 
  • 「統計モデルでできること」といいつつ，実際のところは確率分布でできることを説明してるだけ…なのだが，よくわからぬ「みどりぼん」世界では確率分布は単体では動作しない部品，その部品を組みこまれた統計モデルが「道具」として機能を発揮する，みたいな…みどりぼんファンタジー世界へようこそ…   17:17:26
• ひたすらじゅぎょうのじゅんびしてたのかな ……
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 記録だつらく

2015 年 02 月 26 日 (木)

• この日も記録だつらく
  • 明日，新千歳から東京に移動するのだが…ANA から「さっさと移動すれば?」メイルがきた…"2月27日、低気圧の影響による北海道エリアを中心に降雪や強風が予想されており、遅延・欠航・他空港への着陸や出発地への引き返しの可能性があります"   10:03:40
  • いまいち楽しくない Rstudio の鍵盤ショートカット．コード編集用の擬vimモードもあるけど…これもいまいち感が (esc 遠い)．いつの日か，自由に設定できるようになったらいいな… support.rstudio.com/hc/en-us/artic…   10:51:48
  • 
  • 量子力学の啓蒙書はなぜどれもわかりにくいのか - Togetterまとめ togetter.com/li/788039 "後に整理されたものをまるで第一発見者が最初から見抜いていたといわんばかりの書き方をするものが多くて、それでいつも途中でわけがわからなくなる"   12:19:33
  • RT @ksmzn : ブートストラップ法の統計量分散の過小評価を検証する rpubs.com/ksmzn/bootstra…   19:57:54
  • RT @yuskesuzki : Code for Sapporo関係者がインタビューを受けました > 札幌市の公開データから保育園・幼稚園情報をマップに一元化。 www.sapporosmile.com/projects/code-…   22:30:15
  • RT @seiji_zenitani : 最近の TeX は「図版は PDF 形式」「PDFプレビューを推奨」 www.slideshare.net/doraTeX/the-hi… 最後の関門は出版社の論文投稿システム。PDF だと図がはみ出ることが多く、投稿時に EPS に直している。arXiv では問題ない。   22:31:04
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • きろくだつらく

2015 年 02 月 27 日 (金)

• 午後， 集中講義のため出発したようだけど， やはり記憶・記録だつらく ……
  • RT @Butayama3 : ぶたやま初のコーヒーまとめ。/コーヒーは救われるべきなのか。　～日経サイエンス4月号発売記念～ - Togetterまとめ togetter.com/li/788417 @togetter_jp さんから   09:27:28
  • 『完璧な夏の日』が熱い！（※当社調べ） - Togetterまとめ togetter.com/li/787755 2015年2月21日発売の『完璧な夏の日』ラヴィ・ティドハー／茂木健訳（創元ＳＦ文庫）が発売開始からご好評を賜り…   09:37:31
  • 
  • CRAN にまた新しい GLMM あてはめ package である "glmm" が今月になって追加されてる cran.r-project.org/web/packages/g… MCMCではないモンテカルロ尤度近似 (MCLA) で近似最尤推定をするみたい   11:30:33
  • 
  • どうでもいいが，CRAN から glmmADMB とかは消失してるな…   11:43:51
  • ADMBとは日本だと水産資源解析ぎょーかいで愛用されてる汎用かつ強力なモデルあてはめソフトウェア．以前は内容非公開で使う気しなかった…が，いつのまにかBSDライセンスで何もかも公開されてる www.admb-project.org   11:49:37
  • 
  • まとめると，R の library(glmmADMB) という package はなくなったけれど…それとは別のハナシとして，ADMB は独立に発展しているソフトウェアで，以前のくろーづどな方針を転換して，あれこれ公開するようになりました…ということでした．   11:54:23
  • R から ADMB 使えるようになる library(R2admb) があり cran.r-project.org/web/packages/R… いまもきちんと更新されてる．maintainer はカナダに移った Ben Bolker せんせい，か… www.slideshare.net/bbolker/openso…   12:03:54
  • RT @khoi : How diseases disappeared in the US after vaccines introduced. If you believe science. www.fastcodesign.com/3042769/infogr…   12:08:59
  • BUGS code と ADMB code の比較の例 www.admb-project.org/examples/winbu…   12:27:33
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  • 私が水産資源解析なヒトたちから教えてもらって，聞きかじったハナシですが… ・ADMB つかう目的は面倒な統計モデルの最尤推定 ・ややこしい尤度も数値積分でごりごり評価…高次元(?) でもなぜかコケないらしい ・推定計算がむちゃくちゃ速い …とのことです．うーむ…??   12:36:20
  • WikiBooksのLaTeX解説は親切 en.wikibooks.org/wiki/LaTeX/Hyp… \usepackage{hyperref} \url{ www.wikibooks.org } \href{ www.wikibooks.org }{Wikibooks home}   12:53:01
  • RT @berobero11 : Stanのチュートリアルビデオ(公式ホームページからのリンク)。Gelman先生とかが言うには分かりやすいらしい。 mc-stan.org/tutorials.html #あとで見る   13:28:57
  • 東京都心部におけるですまーち的(しゃべるほうもきくほうも)集中講義に召集されたので札幌発…お、ですまーち的24時間旅にでるトワイライトだ…   15:07:06
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  • 初めてB-787 に乗れるのは単純にうれしいな…   15:08:37
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  • 羽田着。二ヶ月ほど散髪してないので10分でアタマやってくれる店に入ったのだけど…おじさん客に大人気で30分ぐらい待つことになりそう。鏡の下に羽田発全機一覧が逐次更新されてておもしろい…   17:36:47
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  • 私のアタマは簡単だつたのか8分でしあげてもらった。所要時間にかなり個体差あり。アスリート的な理容師のみなさん、がんばってください。   18:03:41
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• ということで， 今晩から京急・大鳥居に隣接する宿で三泊ほど …… 明日から筑波大 (大塚) の 集中講義．
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． 豆腐の味噌汁． 鶏からあげ． ミニトマト． カブサラダ．
  • 昼 (1220): 研究室． 米 0.7 合． 鶏からあげ． ミニトマト． カブサラダ．
  • 晩 (1910): 大鳥居の やぶ久， 茶そば + 穴子天丼 (よーやく大田区でアナゴを食うというせれもにーを挙行)． おまけ天ぷらまでついてて， なかなか食べごたえあり．

2015 年 02 月 28 日 (土)

• 東京出張 2 日目． この日は朝から夕方まで， 地下鉄丸ノ内線・茗荷谷駅ちかくの筑波大学 (大塚) で「統計モデリング入門」 の集中講義．
• 記録・記憶だつらくぎみ ……
  • 明日の集中講義の準備がつづく真夜中… PDFファイルの特定のページだけとりこむ方法を発見…! tex.stackexchange.com/questions/9144… \includegraphics[page=3,...]{abc.pdf} とか指定すればよい   00:23:45
  • 
  • これで集中講義の一時間目に説明する「この二日間の授業の概要」がかんたんに作れる… Beamer わくが二重になって，ちょっと (いや，かなり?) かっこわるいけどね…   00:26:37
  • 
  • だそく補足だけど，\includegraphics[page=ぺいじ数,...]{abc.pdf} とする場合は，あらかじめ ebb -x abc.pdf とかやっておいて，abc.pdf に対応する abc.xbb を作っておくことが必要．   00:29:33
  • . @shima__shima ありがとうございます! texlive2013 を使っているのですが，ebb も extractbb もこの texlive に含まれていたもので… ebb -x も extractbb も動作は同じようですね (共通のコード?ライブラリ?)…   00:43:46
  • なんとかひととおり，明日の授業準備ができたような…気もする．いやはや．ところで「北大がおちた」うんぬんとか私がよく騒いでるけど，rsync を するとポートスキャンか何かと勘違いして，何かでたらめなアクセス制限をかけているらしい… というコトをうらづける状況証拠がそろいつつある…   01:41:34
  • このヘンてこなアクセス制限のせいで，学外から rsync を使ってファイルをまとめて転送できなくてとても困る．講義資料アップロードできない．いったんアクセス拒否くらってしまった状態になると，学外の別ホストにファイルを転送，そこから rsync 使わずにファイル転送するしかない…   01:46:46
  • RT @psycle44 : ggmcmcでトレースプロット、事後分布、自己相関を美しくプロット。テーマはsoralized   19:34:19
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • だつらく