ぎょーむ日誌 2014-04-(11-20)

2014 年 04 月 11 日 (金)

• 0550 起床． 朝飯・とらめしの準備． 今朝もやや寝坊ぎみのとら坊がおきてきたので， とらめし． 朝飯． コーヒー． 洗濯もの干し． おっと保育所に持っていくものの準備が …… 0840 自宅発． やれやれ， 遅れぎみだ． 0850 保育所着． 0930 研究室着．
• 研究室ねっとわーく雑用 ……
• 昼飯．
• 粕谷さんから送っていただいた Bayes factor メモの勉強のつづき．
• Bayes うんちゃらと名乗りながら， 「ふつーこういう事前分布使いたいでしょ」というのが入ると， とたんにアヤしくなるところがなんとも使いづらい．
• いちばん無難なのは， 事前分布なし， つまりモデル甲乙それぞれパラメーター値が決め打ちだとラク …… まあ， これは尤度比をながめて， 「まーこっちのモデルがいいか」 とか結論する作法ですが．
• てもとにある統計学本ぱらぱらとながめる …… 安道知寛さんの「ベイズ統計モデリング」 (2010) などが Bayes factor について， あれこれ近年の改良案も紹介しながら， くわしくとりあつかっている．
• といったようなことを粕谷さんに返信． 宿題がひとつかたづいた．
• また別の論文原稿よみに着手する ……
• 1720 研究室発． 買いもの． 1750 帰宅． 晩飯の準備． とら風呂． とらめし．
• とら晩飯プロトコルの埋没地雷をふんだ …… このプロトコルとやらは， 日によって変化するんだけど， 本日は「テイブルの上で皿に食品を追加するな」 という禁則があったよーで， とらばんめしを前にして激怒 & 号泣 ……
• ここはもはや STAP 現象でなんとかするしかあるまい …… 刺激惹起性平和実現 (Stimulus-Triggered Achievement of Peace, STAP) とは外部からの刺激によって， 暴れまわるとらの混乱を鎮め平和が実現される現象である． 具体的には E テレの録画番組 (着ぐるみ度高めがよいとされる) を数分間視聴させる ……
• ほーら， おちついた …… とらめし & 晩飯．

[食後も何やら……]

気にいらないことがあったみたいで， ネギをふりまわしながらトイレの前の床で転げまわっております ……

• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． ネギ・豆腐の味噌汁． サケ．
  • 昼 (1200): 研究室． 北大生協のサンドイッチ．
  • 晩 (1900): ホウレンソウ・シイタケ・豚肉の鍋． 雑炊．

2014 年 04 月 12 日 (土)

• 0550 起床． 朝飯・とらめしの準備． とら坊がおきてきたので， とらめし． 朝飯． コーヒー．
• とらを近所のクリニックに運搬する． こちらは 10 分ぐらい待てばよかったけど， 薬局が大渋滞状態で待合室で 30 分ぐらい立っていた． さいわいにもとらはひと足先に帰宅したので， これにまきこまれなかったわけだが ……
• 帰宅． とら散髪 …… かなり長期間放置していたので， ばさばさ切ったら …… まあ， 「すっきり」しました．
• とらめし & 昼飯．
• わりと簡単に寝かしつけて， とらは昼寝の世界へ …… ふう， ひとやすみ．
• 1430 ごろ， とらおきてくる． おやつ食べるかい?
• おでかけあれこれ．
• 外で簡単に晩飯． 帰宅．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 「どんぐり」の角食． チーズ． キュウリ・キャベツ・ブロッコリーのサラダ．
  • 昼 (1200): タケノコうどん．
  • 晩 (1900): 改装された「極楽湯」の食堂で蕎麦・ミニカツ丼．

2014 年 04 月 13 日 (日)

• 0550 起床． 朝飯・とらめしの準備． とら坊がおきてきたので， とらめし． 朝飯． コーヒー．
• 天気が良いので， とらと東西両方向の外の景色をながめる …… 風がふくとけっこう寒い．
• 外をながめていると， 「ばす，ばす」とバスをさがしているので， とらバスマニア疑惑浮上． バスマニアって， どうなんでしょうねえ ……
• とらめし．
• 北 6 西 12 に移転してきた ふきのとう文庫 (子どもむけ図書館) に遊びにいく．

[ふきのとう文庫]

くわしくは同文庫の サイト を見てください． 子ども 20 人弱きていた． 館内うろうろしているうちに， なぜか 5 歳の女の子がとらを少しかまってくれたのだけど， これまたよくわからない理由で， とらはみょーにはしゃいで「いっさい! いっさい!」 と自分の年齢をアピールしていた (正確には 1 歳 8 ヶ月)．

• 帰宅． とらに少しパン・バナナをあげてから寝かしつけ． つかれていたのか， それから 3 時間以上もぐーぐー昼寝を継続していた ……
• 自分の昼飯の準備． 昼飯．
• とらの昼寝が深いので， のんびり ……
• 科研費データベイス に今年度から始まる新規課題なんかのデータが追加されているんだけど， そのあたりつらつらながめていると， 「ホントーに薄氷の採択だった」 とゆー気分になってきましたよょょ ……
• とらがおきてきたので近所を散歩． 最近， とらはカラスに興味をもっていて， 保育所のいきかえりのときなど， 「かー，かー」と言いながらカラスを探している． このへんのカラスは繁殖期に入っているのか (カラスの行動生態，よく知らないんですが)， 夕方になっても， 以前ほどそのへんを飛んでいないのだが …… 今日は街路樹の低い枝にとまっているやつがいたので， とらは「かー，かー」と興味しんしんで見ている．
• とら風呂． とらめし． 晩飯．
• 明日以降のとらめし・弁当などの準備 ……
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): ベイグル． ジャガイモ・ニンジン・タマネギのポタージュ． カブ・インゲン・ブロッコリーのサラダ．
  • 昼 (1350): キャベツ・ベイコンのクリームスパゲッティー．
  • 晩 (1920): 米 0.7 合． レタス・ベイコンのクリーム煮． ピーマン・キクラゲ・豚肉の炒めもの．

2014 年 04 月 14 日 (月)

• 0505 なんとなく起きてしまう． まあ， 6 時間弱， ねたので ……

• 以前はとら坊だっこしすぎて， 背筋とか痛めてしまったので， 最近はだっこの時間・姿勢などに気をつけている． しかし， 土日はどうしても「だっこ」が多くなるし， 背中がちょっと痛む． すると寝ているあいだに口が開く時間が長くなるみたいで， 口の中が乾いてしまって， あまり長時間つづけて眠れなくなったり ……
• 朝飯・とらめし・弁当の準備． 朝飯． とら坊おきてきたので， とらめし． コーヒー． 0800 自宅発． 0820 保育所着． 0850 研究室着．
• 今日はちょっと WinBUGS 調査に時間をとられた …… というか， 完全には解決しなかった．
  1. R2WBwrapper.R には bugs.seed 引数をわたすしくみがなかった (私のしょぼいプログラミング)
  2. しかし bugs.seed を指定できるように変えても， 「MCMC sample が完全に一致」 ということにはならない
  3. これはぎょーむ日誌 2012-01-30 と矛盾している? library(R2WinBUGS) が現 version である 2.1-19 になったのは 2013-04-07 か ……
  4. R2WinBUGS 内で， ユーザーが作成した作業ディレクトリのパスがうまく渡せない …… /tmp1/ と指定しているのに， R2WinBUGS が勝手に /tmp1/tmp1/ と変更 (……というふうに，実行しているようにしか見えない)
  うーむ?
• R の version を 3.1.0 にしたことと関係あるのかしらん? …… いやいや， 当然ながらというか， 変更一覧 をながめても， 該当するような項目はなさそう．
• なぞが解決しないまま 1710 研究室発． 買いもの． 保育所でとら回収． 1750 帰宅． とらめし． 晩飯．
• 洗濯もの干しとか ……
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． 豆腐の味噌汁．
  • 昼 (1420): 研究室． 米 0.7 合． トマトスープ．
  • 晩 (1900): 米 0.7 合． 豆腐の味噌汁． 豆腐・牡蠣． コマツナ・キクラゲ・豚肉の炒めもの．

2014 年 04 月 15 日 (火)

• 0600 起床． 体重 68.4 kg． キビしい冬が終わったのに， あいかわらず「やや低い状態」が継続している． ヘンな病気とかでなければ， まあ， べつに問題はないんだけど ……
• 朝飯・とらめし・弁当の準備． ささっと朝飯． とら坊がおきてきたので， とらめし …… なぜか「すぐに食いたいー」と全身で要求してきたので， 今日は起床→めしの間隔がいつもよりさらに短くなった． コーヒー． 0815 自宅発． 0825 保育所着． 0900 研究室着．
• ちょっとまた library(R2WinBUGS) を調べる．
• 1030 より研究室セミナー． 今日は自己紹介．
• 自己紹介ききながら描いていたらくがき． ヒノキ演習林の経時データにもとづく個体内・個体間資源競争モデルの検討．

• 昼飯．
• どうもいまだにセキ・鼻水が多くて， 呼吸器系に何か菌が常駐しているかんじ …… そういえば， とらもときどきげほげほしているな．
• ちょっと Perl プログラミング試行錯誤 ……
• 「研究費不正使用防止研修」 とゆーオンライン講習の受講と， 20 門からなる「北大の研究費利用てすとー」 なるものに回答する …… 45 分ほどついやしてしまった．
• また library(R2WinBUGS) の調査にもどる．
• 1720 研究室発． 保育所でとら回収 …… のはずが， なぜかいきなり， とらともども拉致されて札幌市西区の皮膚科へ． 「水いぼ」という， 放置 & 自然治癒を待つしかない診断をいただく． 1850 帰宅． とらめし． 晩飯．
• 「ぎょーむ日誌」から「体重」をひっぱりだしてきて， グラフを作ってみた．

• 私の身長は 177-178 cm ぐらい． この記録の上では何度か「暴落」みたいなのがあるな． 2006 年末あたりに始まるやつは院生が一時的にどかっと増えて， 下うけぎょーむ激増とかそんなのかな?
• 2010-2011 年あたりのは， まあ結婚ばてでしょう． かなりしんどかった …… その後は「統計モデリング入門」書きのすとれす太りか? 「しんどく」なると太るのかやせるのかわからん．
• 2012 年の赤の縦線はとら誕生日なんだけど， まあ， このあたりは育児ばてということで．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． 豆腐の味噌汁．
  • 昼 (1200): 研究室． 米 0.7 合． トマトスープ．
  • 晩 (1930): 米 0.7 合． 豆腐の味噌汁． カブ・ワカメのあえもの． ニンジン・サツマイモ・鶏肉の煮物．

2014 年 04 月 16 日 (水)

• 0550 起床 …… どうも最近はセキとかで明けがたはよく眠れない． 朝飯・とらめし・弁当の準備． とら坊がおきてきたので， とらめし． 朝飯． コーヒー． 0820 自宅発． 0830 保育所着． 0910 研究室着．
• 昨日のらくがきメモの再検討． 問題を三段階ぐらいに分割できるか? 全体は 4 つぐらいの課題があるように思うのだが (楽観的かも?) ……
  1. 無難な三次元光分布シミュレイター
  2. (いろいろと情報が足りない) ヒノキ幹のデータにもとづく生産力の推定
  3. 同データにもとづく個体内の資源競争の推定
  4. シミュレイションによる再構成
  まあ， これのうち 1. だけではハナシとして簡単すぎるかもしれないので (OpenGL とか使って簡単にできないかを検討中)， 1. と 2. で一段落， といった計画はどうだろう， という ……
• しかしヒノキ幹のデータだけでは， 2. もなかなか難しい問題かも． そもそも 1. で林冠モデルを作るときに， 何かウソみたいなものが大量に必要そうだし．

• 昼飯．
• このあたりの作図 に関して， quantile(b) + quantile(r) といった足し算はマズくて， quantile(b + r) とすべきでは， とのご指摘をいただく． はい， ここでは (b, r) がほぼ無相関だったので， 手ぬきをしました．
• ひょっとしたら無相関でもダメかな?
• 今， ちょっと実験してみたら， ぜんぜんダメだとわかった． われながらアホアホだ． いろいろ修正しなくては ……
• われながら「あほあほ」だな
• 生態学会さーばー雑用． ひさしぶりにあたらしい ML を作ったので， ちょっとメモ． 新規 ML は Plesk 側から作る． あとの作業はぜんぶ mailman 側．
• 1720 研究室発． 買いもの． とらめし． 晩飯．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． 豆腐の味噌汁． カブ・ワカメの和物．
  • 昼 (1230): 研究室． 米 0.7 合． 鶏肉． ブロッコリー． ミニトマト．
  • 晩 (1840): 米 0.7 合． ホタテ・キャベツのスープ． ホウレンソウのあえ物．

2014 年 04 月 17 日 (木)

• 0520 起床． どうも， なんだかしんどくてよくねむれない ……
• 朝飯・とらめし・弁当の準備． 朝飯． とら坊がおきてきたので， とらめし． コーヒー． 0820 自宅発． 0830 保育所着． 0910 研究室着．
• ヒノキデータ解析の検討のつづき …… ともかく個体内競争については， 一番あとまわしでも良い． そもそも局所明るさと枝次数 (簡単版) + せいぜい枝齢ぐらいしか， 説明変数として使えそうにないわけで．
• 昼飯．
• 午後もそういったことなどを検討していたような …… しかし， 記憶も記録もない． やばい ……
• 記録してないってことは， 何やら多忙だったはずだが ……
• そうだ， 事務書類のかきなおしはやった． うーむ ……
• 1710 研究室発． 買いもの． 保育所でとら回収． 1750 帰宅． とらめし・晩飯の準備． とらめし． 晩飯．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0600): 米 0.5 合． 豆腐の味噌汁．
  • 昼 (1200): 研究室． 米 0.7 合． うーん， 何をくったんだっけ?
  • 晩 (1930): 米 0.7 合． 豆腐の味噌汁． カスベの煮つけ．

2014 年 04 月 18 日 (金)

• 4 時すぎ， 口の中がからからに乾いて目がさめた …… また寝てるあいだに， 原因不明の開口． すとれすなのか， 何なのか ……
• また寝て， 0600 起床． 朝飯・とらめしの準備． ささっと朝飯． とら坊がおきてきたので， とらめし． コーヒー． 0820 自宅発． 0830 保育所着． 0910 研究室着．
• なんかまたへんな tweet をしてしまった …… 反省 ……
  • RT @PlanckScale : 熊谷女子高校の生徒さんたちが、日本の大学の論文数、科研費、教授数、センター試験の成績、女子学生の比率等の相関を分析。論文数と女子学生の比率には負の相関。⇒ www.slideshare.net/Analytics2014/…   10:32:34
  • 熊谷女子校の皆さんのたいへん興味ぶかい解析，すこし気になるのは，毎度のことながら割算値(以前にまちがった指摘しましたが)…論文数∝教員数なら論文数∝学生数 (N) となっているかも…この論文数と女子比率 (女子数 / N) を比較しても大丈夫なのかな? うーむ，負のニセ相関かも…   11:00:38
  • ああー……また前回と同じまちがいをした! われながらアホというか学習能力がないなあ…学生数 N で女子比率 f とすると女子学生は f N，割算値にすると N が分子・分母で消えるので横軸 (女子比率) には 1/N は含まれませんね．いやはや．   11:33:58
  • まあ，私の狂信的な「割算値ぎらい」はおくとして…女子比率 vs 論文数の散布図ながめていると，東大・京大の 2 点 (ひょっとしたら東大だけ) を除去すれば，ほとんど無相関ではないかな? もしくは線形相関係数ではなく順位相関係数でみたら無相関とか?   11:04:30
  • 「論文数」なる数値を増減させる原因として，学生の性別構成はほとんど関係ないのではないかなー……まあ，性差別的な私などは，自分の身辺の観察だけにもとづいて，やっぱり女性大学院生たちのほうが野郎院生どもよりかしこいんじゃあないのーなどと偏見をもっておりますが．これはまた別のハナシか．   11:21:55
  • 『憎むのでもなく、許すのでもなく』という本について以前 retweet したけど，いやはや割算値に対してこの態度でのぞむのがいいかも……グラフの軸が割算値だからといって「このやろー!」と憎まず，だからといって「データ解析は何でも割算すればOK」とゆー態度には迎合しない，という……   11:44:04
  • 記憶がかなり脱落している (自分のことながらだいじょうぶか?) 木曜日 - ぎょーむ日誌更新 hosho.ees.hokudai.ac.jp/~kubo/log/2014… #KuboLog   14:42:34
• 昼飯．
• いかん， OpenGL とか調べてたら時間が経過してしまった ……
• 1700 研究室発． 買いもの． 保育所でとら回収． 1750 帰宅． とらめし・晩飯の準備． とらめし． 晩飯．
• とらあそび & とらねかしつけ …… お， すっと寝たな．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． 豆腐の味噌汁．
  • 昼 (1200): 研究室． 米 0.7 合． トマトスープ．
  • 晩 (1900): 米 0.7 合． 豆腐の味噌汁． カスベの煮つけ．

2014 年 04 月 19 日 (土)

• 4 時前， また口の中からから起き …… おやおや， とら坊はいったい全体どういう転がりかたをした帰結として， そんな場所・そんな格好で熟睡しているんだい?
• また寝て， 0620 起床． 朝飯・とらめしの準備． 洗濯．
• かんたん朝飯． とら坊がおきてきたので， とらめし．
• 保育所につれて行こうとしたら， いきなり「う」 …… 0840 自宅発． 晴． まだ寒さを感じるけど， 春っぽくなってきたなー …… 0850 保育所着． あひる組， 土曜保育な子供がけっこう来てるな． 0930 研究室着．
• せっかく土曜日に仕事できるのに， なんとも進捗しない ……
• うー
  • RT @berobero11: ggplot2ファミリー: ggplot2, GGally, ggmcmc, ggmap, ggtern, ggsato, gg_hatano, ggrks   09:58:41
  • RT @nejiko: 子育てには長く遊べる質のいいおもちゃと、ゴミみたいな安価なおもちゃ、どちらも必要なんじゃよ……   10:23:14
  • 研究者には長く遊べる質のいい問題と，ゴミみたいに簡単にかたづけられる問題，どちらも必要なんじゃよ……   10:25:18
  • RT @muddydixon: 先ほどの資料です「データ可視化について」 #html5j www.slideshare.net/muddydixon/htm…   10:48:30
  • @muddydixon さんの「データの可視化」で紹介されている WTF Vizualizations wtfviz.net @WTFviz ……「データを一生けんめい図示したけど，見にくい」というあんちぱたーんな例を集めたもの．自分でもやってしまいそう…   10:58:37
• 昼飯．
• めんどう雑用をふたつ殲滅．
• しかしあとは机の上の整理なんかに没頭してしまった ……

• 1700 研究室発． 買いもの． 保育所でとら回収． 1750 帰宅． とらめしの準備． とらめし．
• とらあそび． おっと， またいきなり「う」 …… 本日はこれで 3 度目? 「小出し」 がつづいている．
• とら寝かしつけ．
• かんたん晩飯．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 角食． チーズ． ブンタン．
  • 昼 (1200): 研究室． シリアル． ヨーグルト． トマト．
  • 晩 (2020): 角食． チーズオムレツ．

2014 年 04 月 20 日 (日)

• 4 時ごろまた「口の中かわき」 おき． とら …… すごい転がっているな． 水のんでまた寝る．
• 0600 起床． 朝飯・とらめしの準備． 朝飯． とら坊がおきてきたので， とらめし．
• 洗濯・そうじ．
• 10 時ちかく， なんだか眠そうにしている (e.g. すぐ泣く) ので， おんぶして， ねかしつけ ……
• 昼飯．
• 買いもの． ひさしぶりに車の運転．
• とらの午後昼寝のねかしつけ．
• とら (熟睡中) の友人 (0.4 歳) が当家に訪問してくれたので， だっこしてみたり ……
• 晩飯の準備． とらめし & 晩飯．
• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): どんぐりの角食． チーズ．
  • 昼 (1230): 鶏肉うどん．
  • 晩 (1900): タケノコごはん． ぶた汁． タケノコ・チンゲンサイ・シイタケの炒めもの．