ぎょーむ日誌 2013-05-16

2013 年 05 月 16 日 (木)

• 0620 起床． とら坊の朝ミルク & こっそり抗生物質とセキどめをのませる． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー． 0830 自宅発． 完全曇天． 0840 保育所着． 保育所に行くと毎日のように何か「ふしぎなもの」 を見れるのだが …… 今朝はなぜか「ひよこ組」と「あひる組」の間をしきるガラス戸， ここに 3 名ばかりの 0 歳児がはりついて号泣していた (鼻汁も盛大に流しつつ) …… みんな， どうしたの?! 遅れてきたとら坊はぼうぜんとながめるばかり． 0910 研究室着．
• アリ群集モデルの改良案 …… あまり内ので「年差」 r.year のいれかたをちょっと変えてみる．
• 並列計算 3 個， 6700 秒から 7600 秒で終了． やはり r.year のはいりかたに問題があるな．

• まあ， すべての事前分布から切断 I(lower,upper) を排除できている点は大きな改善なんだけどねえ ……
• よくわからぬまま， すこし手なおして再計算を命じる …… 北大くらうど内の 4 つの node が分担して計算している．
• 生態学会さーばー雑用． useradd 使っていいのかな? …… よさそうだ．
• 昼飯．
• 事務室から書類をなおせという命令 …… 対処．
• 甲山さんとの会話: 「もう声はなおったの?」 「だいぶよくなりました」 「まだ後遺症があるな……」
• r.year の効果でホントに「密度」が増減すると改訂してみたモデル， 8800 秒ほどで MCMC サンプリング終了． だいたい， こんなところか． もう少し長いサンプリングが必要だ．

• ということで， n.thin を 30 から 40 に変更して， またやりなおし． 10000 秒以上も待たねばならんような ……
• 7 月あたまから始まる 統計モデリングぢゅぎょー の準備が気になってきた …… これに関連して， LaTeX ファイルの文字コードを EUC から UTF に変更したい， という問題があってですね ……
• Thomas さんが推薦しておられる TeX Live 2012 をインストールしたいのだが …… Ubuntu 12.04 (precise) でインストールできるのかしらん， と調べてみたら意外と簡単にできた． こちらの AskUbuntu にあるとおりだけど， 「正式な」 backports PPA があるので， sudo add-apt-repository ppa:texlive-backports/ppa して sudo apt-get update & (すでに texlive 2009 がインストールずみなら) sudo apt-get upgrade でよい．
• さらに UTF-8 に対応した uplatex なども使いたいので， sudo apt-get install texlive-lang-cjk なども必要．
• sudo dpkg -r dvisvgm とか sudo dpkg -r texlive-common などと問題のある package を削除してから sudo apt-get -f install で修復 ……
• さらに sudo apt-get install texlive-latex-recomended とかも必要かな? これは 0.7GB もある (そのほとんどは document??) 気のとおくなるような追加で ……
• En toi Pythmeni tes TeXnopoleos サイトの 文書作成時の注意 にあるようにクラス名 jarticle は u をアタマにつけて ujarticle に変更 …… uplatex test.tex して dvipdfmx test.dvi うまくいった!
• さてさて， よーやく これで UTF-8 で LaTeX ファイルを書けるようになったか ……
• 1720 研究室発． 買いもの． 1740 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯．

[ようやく春]

開花が遅れていた自宅前 (ミニ大通公園) のエゾヤマザクラもようやく咲きました．

• [今日の運動]
  • とらちゃんえくささいず．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0720): 米 0.7 合． セロリ・カブ・レンコン・豚スペアリブのスープ． キャベツ・ネギ・ハムのサラダ．
  • 昼 (1230): 研究室． 米 0.7 合． イワシのみりん干し． ブロッコリー． ミニトマト．
  • 晩 (1840): 米 0.7 合． セロリ・カブ・レンコン・豚スペアリブのスープ． キャベツ・ネギ・ハムのサラダ． ホウレンソウ・ミディトマト・シイタケ・卵の炒めもの．