ぎょーむ日誌 2006-05-29
2006 年 05 月 29 日 (月)
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0750 起床.
朝飯.
コーヒー.
0855 自宅発.
曇ちょい雨.
0910 研究室着.
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いろいろメイルかきとか.
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げのむのハナシとかで多重検定が重要になっている,
といったことは以前に伊庭さんから何度かうかがったことがあるんだが
……
それは false discovery rate (FDR;
沓掛さん
による
解説
など参照)
をあらわすひとつの例として
q-value
なるものが定義され,
このあたりがべいづと関連してますよ
といった論文だしてるのが
J.D. Storey
といったヒトたち.
Storey は
R
をつかった q-value
計算ソフトウェア
も公表している.
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えーと,
つまり多重検定とかあまりかかわりたくないし
(どういう計算やってるかもわからずに ab とか bc とかつけたがる
ありがちなアレなんかは特に),
たぶん当面は必要ないはずなんだけど
……
多重「比較」とベイズ統計学との関連は考えるべき問題で,
そうすると FDR とかに関して ``a Baysian interpretation''
できますってのは興味あるハナシになるわけです.
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先週は meta analysis まわりでこの q 値で出てきて,
それ以来ちょっと気になっていた.
めたあなりしすって何かヘンだとは思っているんだけど,
べいずな文脈で解釈すればまだしもわかるような気もする
……
これって,
じつは計算をちゃんとやろうと思ったら,
ホントはかなりたいへんではなかろうか?
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まあ,
とうぶん多重検定とかやらねばならぬ場面には遭遇しないだろうけど.
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アカマツデータみなおす.
現状のモデリングのままいくか,
それとも抜本的に変えてしまうか.
どっちも一長一短だな.
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昼飯.
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二時間ほど M1 の林 (Lin) 君の
R
講習.
いつものごとく
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データを読みこむ
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data.frame
を自由に操作できるようになる
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いろいろな図が描けるようになる
という過程の習得がまずは何より重要だと強調する.
この流れに比べたら「ゆーい差」とか,
どうでもよいハナシです.
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また北大ネット管理者連中が
「学外からは隠匿してる」ペイジ
で何やら独白してやがるな:
2006年5月28日15時43分から5月29日9時24分まで、北大メールゲートウェイにディスク障害が発生し、全学的にメールの受信が一部不能となりました。
5月29日11時54分現在、メールサーバは復旧し正常に受信可能となっております。
該当期間中にエラーとなって返送されたメールについては、北大側での自動再送はなされないため、送信者の方への再配送をご依頼くださるよう、お願いいたします。
いやはや,
こんな隠しペイジで誰にむかってしゃべっているのやら.
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こっちの北大ネット管理掛の
見苦しい top page
(公開されてる) のほうがよほど恥をさらしてると思うんだけど.
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アカマツデータの見直しつづく
……
いやー,
こういう「データをいろいろな角度から見直す」
という作業
(つまりいろいろな種類の自動作図プログラミングやってるわけだが),
R
があるのとないのでは効率がまったくちがう.
特にこのアカマツデータのごとく構造が複雑な場合には,
すごく役にたつ.
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またお茶部屋で
「帰るの早くないですか?」
と詰問されつつ
1800 研究室発.
1815 帰宅.
Amazon の (わざわざ) 古本屋で買ったのに,
なぜかしら宅配便で発送されてしまってですね.
しかも帰宅して電話しても行方不明状態?
……
と思ったら 1900 すぎにいきなり到着.
運動.
体重 73.6kg.
晩飯.
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[今日の運動]
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[今日の食卓]
- 朝 (0830):
米麦 0.6 合.
サンマ塩ゆで.
ハクサイ・豆腐・コンブの味噌汁.
- 昼 (1320):
研究室お茶部屋.
米麦 0.6 合.
サンマ塩ゆで.
ハクサイ・豆腐・コンブの味噌汁.
- 晩 (2230):
米麦 0.8 合.
ハクサイ・豆腐・コンブの味噌汁.