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0720 起床．
朝飯．
コーヒー．
洗濯．
0910 自宅発．
晴．
0925 研究室着．
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書きわすれてたけど，
香川大の小林さんは昨日から
太田 CREST
の会議
……
北大低温研で三日間もやるそーで．
そこでの発表に使うというんで，
母子里 MCMC 計算とか私がしたうけしてたわけで．
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生態学会さーばー雑用．
昨日うだうだ言ってたバックアップ問題が放置できなくなった
(別にコワれたわけではなく，
調査せねばならぬ状況ということ)
……
で，
過去のメイルとか調べたんだけど，
それについては今まで問い合わせもせずに放置してた，
とわかった．
われながらのんびりしてるな．
しょうがないんで，
atserver
に質問メイルだす．
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とりあえず母子里 MCMC 計算を A801 室の Dell 機で実行させとく．
試験運転のつづき，
かな．
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生態学会さーばー雑用のつづき．
とりあえず学会ぺいじどもを移動．
現在のところから FTP で再帰的に全ファイルを
get -R．
ファイル数 274．
すごくちらかってるな．
Perl スクリプトを使って全自動で URL を変更．
tar.gz してから新 server に移動．
展開．
連絡．
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で，
その新 server
(といっても新潟大会サイト用とかですでに使っているんだが)
のバックアップ体制について問い合わせの回答
atserver
からきたんだが
……
ご利用いただいております「専用＠サーバー」サービスにおきましては
弊社側でのバックアップの操作を行っておりません。
ミラーリングオプションをお申し込み時にご利用でない場合のバックアップは
お客様側にてネットワーク経由でお取りいただくこととなります。
障害発生時につきましては、ご利用開始と同じ状態での復旧となりますので、
仮想サイトの設定、バックアップの復元もネットワーク経由で
再度行っていただく必要がございます。
なんぢゃこりは
……
聞いといてよかった，
とゆーか．
もうちょい質問．
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母子里 MCMC 計算，
25 万 step では spin up (あるいは burn in) 期間としては短すぎるな．
「ササ区」「除去区」どちらでも．
葉数に関する事前分布が無情報なやつになってるせいかしらん?
まあ，
ともかく計算時間のばすだけでいいんだが，
と 50 万 step に設定してみる．
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呪われ言語 C++ で書き直したら 5-10 倍は速くなるんだろーけど
……
柔軟性は格段に失われる
(よーな気分になる)
ので，
しばらくはケガれ言語 Perl で実装しとくか．
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Markov Chain Monte Carlo (MCMC)
計算については昨日も書いたように
伊庭さんの
「ベイズ統計と統計物理」
が最良の入門書．
あとは間瀬さん
のいろいろな
統計学本，
「空間データモデリング 空間統計学の応用」
とか
「ポストゲノム時代の遺伝統計学」
(統計モデルの章)
かなぁ．
あ，
意外にもと言ったら失礼だけど，
丹後さん
の
「統計モデル入門」
の MCMC 解説もよく読むと意外とわかりやすい．
経済学本とかでベイズ推定がらみで MCMC の入門的解説してんのが
「ベイズ計量経済分析―マルコフ連鎖モンテカルロ法とその応用」
とか
「経済・経営のための統計学」
(こちらはほんのさわり)．
なぜかしら日本語版 Wikipedia の現時点での説明はそれほど良くない．
はてなダイアリーのキーワード解説
「マルコフ連鎖モンテカルロ」
が簡潔だったりする．
あとは自分でいろいろ
検索
してみてください．
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といったかんぢで昼飯前の時間がオワってしまった．
昼飯．
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atserver
からの回答がまたきた．
まず、データバックアップ serviceの有無ですが、
専用＠サーバーサービスにおいては、現在提供をいたしておりません。
ミラーリングからの復旧につきましては、HDDの異常を検出した際に、
ホットスワップにて異常の出た側のHDDを交換、自動的に同期して
サービスは継続されます。
なお、ミラーリングオプションにつきましては新規お申し込み時のみの
承りとなっておりまして、追加ご希望の場合、新規お申し込みと同様の
お手続きをお取りいただくことになりますことを、申し添えておきます。
だってさ．
れんたるさーばー商売って面倒回避のため毎日 full backup (差分方式で)
とってるだろう，
などとばくぜんと考えてた私がむちゃくちゃに甘かったよーで．
たぶん契約書とかにはデータの安全については
完全無保証とか書いてあるにちがいない．
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ミラーリング型に移行せんといかんかな．
上記のごとくミラーリングしてるなら同一ドライヴ内
rsync
わざでバックアップが取れる．
もうちょい質問．
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お．
Vine
3.2 がもうすぐでるのか．
これいいかも．
X.Org まわりとか改善してもらいたかったんで．
と言いつつ
べーた版
人柱にはなる気がない，
と利己的にふるまってみたり．
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母子里 MCMC 計算については私の無為無策的な試験運転がひたすら継続中．
計算機はたいへんだなぁ．
と無責任なゆーざーは，
定常まわりで対数尤度が上下にふらつく様子みて楽しむ．
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で，
他にもやるべき仕事あるかと考えると
……
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ツガザクラ:
これは発注者が進化学会大会雑用という牢獄に拘束されてるかぎりは
当方は何もやらなくてよい
(そういや，
現地での花の形態の観察によると
私の交雑モデルはアヤしいんぢゃねーのということだそーで)
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苫小牧宿題 (複数):
督促がなければ放置という人生になりつつあるなぁ
(「借りたカネは返すな」人生というか)
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ぱいぷ樹木まわりの
gcc-3
対応と「ついで」計算:
やってしまえばいいんだろーけど火急感ゼロ
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アリモデル:
同上
ということで，
他の仕事は放置して母子里 MCMC 計算のつづき．
とりあえず，
アタマの中に計算の詳細が残っているうちにそのあたりを文章にしてみるか．
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入院中の某氏からお電話いただく．
今日の午前中，
手術は無事に終了．
メッシュ手術
とかで 20cm もハラを切ったとか．
まだしばらく入院生活ですなぁ
……
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また
atserver
から回答．
ミラーリング設定時にHDDの１台に障害が発生した場合でも、
HDD以外のシステムからは、HDDは正常に稼動しているように認識されたまま
ですので、IPアドレスには変更はなく、DNS Serverの再設定も不要で、
サービス提供は継続されます。
ミラーリング有への移行時には、該当サーバ自体がDNS Serverを兼ねている
という事情もありますので、一時的に弊社のDNS Serverにてドメインを
登録させていただき、切り替え作業完了後にドメインの登録を該当サーバに戻す
ということでしたら、ご協力させていただくことは可能でございます。
ミラーリングについてはまあそんなところかな．
正副同時にコワれたら終りだけど．
DNS server については一ヶ月間新旧併存策でいくしかないかな，
という気がする．
しかしミラーリングだけで月額 +10000 円とはおいしい商売だよねえ．
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生態学会さーばーあれこれ本日ぶん，
これで一件落着したかな．
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1730 ぐらいから急激に空腹になる．
1830 研究室発．
1845 帰宅．
1930 自宅発北大構内走．
2030 帰宅．
体重 72.6kg．
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晩飯の準備．
NHK ラジオは通常の番組ではなく台風情報ながしているな，
と TV ない当家では世間の動きを知るのであった．
晩飯．
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昨日の「院生経費」に関して訂正メイルが配られている．
修士課程院生 7.4 万円．
博士課程院生 11.2 万円．
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[今日の運動]
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[今日の食卓]
- 朝 (0810):
米麦 0.7 合．
モヤシ・ピーマン・ニラ・ショウガ・豚レバの炒めもの．
- 昼 (1300):
研究室お茶部屋．
米麦 0.5 合．
モヤシ・ピーマン・ニラ・ショウガ・豚レバの炒めもの．
- 晩 (2150):
米麦 0.8 合．
メカブ．
サバ電磁波酒蒸し．
キャベツ・ブナシメジ・豆腐のシチュー．