ぎょーむ日誌 2005-04-29

2005 年 04 月 29 日 (金)

• 0940 起床． 朝飯． コーヒー． 選択． 怠業．
• 屋久島葉寿命モデルについて考える …… 菊沢さん 葉の寿命本 とか出版されてるわけだが …… 私の理解では， そもそも「葉の寿命」なるものをどうやって計算すべきか， こういう基本的なことがらが依然としてナゾのまま放置 (といったらおこられるのだろうけど)， というのがこのあたりの現状だろう． 少なくとも屋久島データに関しては， 何かモデリングに関するうまい工夫が必要とされているのである． しかも樹種数が 23 もあるし．
• 1615 自宅発北大構内走． 曇天． 1700 帰宅． 体重 75.0kg． うーむ．
• 1730 自宅発． 曇． 1745 研究室着． 昼飯 …… ってすでに夜なんだが．
• A802 のカラーレイザープリンター， LBP-2810 トナー過剰放出がなおっているのか? ただしマゼンダの印字位置がずれている． calibration 命じる …… 五分ほど時間を要する． あ， これもなおった．
• 他のいろいろな仕事をほうりだしてしまって， 相互作用あり空間構造問題にとりくんでしまう． いやはや．

[白板らくがき]

もやもやした考えをまとめるには白板でらくがき， がよかったりする．

• マルコフ確率場で， パラメーターセット p のもとで あるパターンの対数尤度は log(そのパターンが出現する確率 | p) - log(Σ(あるパターンが出現する確率 | p)) となるわけだが， うしろの項はなかなか計算できない， と． で， いろいろと定数を分離したり， MCMC 平均値に置き換えるとゆー工夫なんかをやったりしていくわけだが …… やっぱりこれって苦労するわりには見とおしがよくない， というのをまた確認しただけにおわった． えーい
• で， そういう場合はどうすればいいのかとゆーと …… 「隠れマルコフモデル」 ですよ． これは生態学のあちこちに出現する難題あれこれの解決に かなり有用な考えかただと思う． まだぜんぜん使われていないけど (ゲノムよりな分野ではすでによく使われている) …… まあ， そのうち皆さん使いまくるようになるんでしょう．
• たとえば， いま考えてる 一番簡単なモデルを図で説明するとこういうかんぢで． いままで私はなぜかしら カクレ状態だけで閉じないといけない， などと思いこんでいたんだけど (教科書には こういう図 ばかり掲載されてるせいか?) …… 今日いろいろアタマをひねってるうちに， この図のごとくオモテから影響うけることにしたって いっこうにさしつかえあるまいよ， と気づいた． 考えてみれば あたりまえのハナシだったんだが．

• 駒ヶ岳にいってきた院生によると， やはり今年は雪どけが遅くて何もかも雪の下， という状況らしい． 2230 研究室発． 2250 帰宅． 晩飯の準備． お茶部屋からいろいろと賞味期限ぎれの調味料のたぐいを回収してきて使ってる． 中には年単位で賞味期限がすぎているのもあったりするんで， なかなか恐ろしい． 晩飯．
• また巨大なる寒天よせを作ってしまった． 本日はパイナップル． 電気泳動やるわけでもないのに アガロース のあつかいに習熟しつつあるなぁ．
• [今日の運動]
  • 北大構内走 45 分間．
• [今日の食卓]
  • 朝 (1030): モヤシ・乾燥野菜海藻・ナメコ・コンブの味噌汁． マイタケ・卵の炒めもの．
  • 昼 (1810): 研究室お茶部屋． 「北欧」食パン．
  • 晩 (2330): イワシ電磁波蒸し． キュウリ． キャベツ・ニンジン・セロリ・ブナシメジ・豆腐・タコのカレー．