ぎょーむ日誌 2005-04-18
2005 年 04 月 18 日 (月)
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0930 起床.
ぅ-.
朝飯.
コーヒー.
1030 自宅発.
晴.
1045 研究室着.
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呪われ種間比較めんどう査読問題のつづき.
勉強にはなるけど,
ひどく手間がかかる.
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とりあえず,
また
Harvey & Pagel 本
の解読にもどる.
土日に「自分ならこうする」
という計算方法をいろいろと考えたので,
本に書かれている手口あれこれが格段によく理解できるようにはなった
……
とはいえこの論文原稿みたいに,
「種の形質値」なるものの平均値を
(どこかに消失した) 共通祖先の形質値,
などと言ってしまうのはやはり根拠 free なハナシだよな.
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いや,
もちろんたとえば属の中の N 種がある時点で一斉に種分化して,
N 個の独立した形質値らんだむうぉーくを始めたんだよっと主張されるなら,
それでもかまわないんですが.
科だの属だのの起源はかかる「爆散」による,
という分類群爆散進化誕生とかいうような
新説でも提唱すりゃあいいんじゃないかな.
「多様化はバクハツだ」
とか.
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などと考えてたら,
他ならぬ Harvey & Pagel 本の訳者たる粕谷さんから,
分類群はたいてい側系統なんだから系統の代用にはならないんでは
……
というご指摘いただく.
はい,
私もさう思います
(つまり一斉爆散ではなく順次分離,
みたいな).
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新 D1 井田君から訪花頻度推定問題の相談.
これは「待ち時間」の分布に帰着されるだろう.
ある時間で観測はじめて最初の訪花昆虫がやってくるまでの時間,
これは一番単純には指数分布にしたがうはず.
そして,
これが成立するなら
「最初の訪花までの時間」
はガンマ分布になるだろう
(後記: これはまちがいで,
指数分布のままである)
……
というあたりからスタートするのがよさそう.
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新大学院生のメイルアカウント,
ようやく出揃う.
講座内メイリングリストなど整える.
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そして新 M1 の計算機に
(自分では使っていない)
ThunderBird
などインストールしてみる.
日本語表示させるには自分でいろいろと設定せんといかんようで
……
まあ,
簡単だけど.
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メイラーといえば,
私はあいかわらず
Mew-1.94
など使ってるわけだが
……
お,
新しい版
(ver 4.x)
は 2.x や 3.x とは違い 1.x っぽくなってるのか?
こんど時間があったら
(あるいはぎょーむがイヤになったら)
試してみますか.
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で,
その査読なんだが
……
これこれの引用論文を参考にして,
それと同じ方法を使ってます,
と主張している.
その引用論文のほうでは
(それが「よい解」になってんのか判然としないんだけど)
データ処理として何やってるかはわかった.
論文中の数値を組み合わせてみると,
たしかにそういう結果になるという検算もできる.
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しかるに,
その方法そのまま使ってますと主張する査読論文原稿でやってることは
……
私にはぜんぜん別物に見える.
計算もまったくあわん.
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ふと我にかえると小菅せんせー Mac で
R
ぷろぐらみんぐやらされてる.
おそらく薬物をもちいた拉致か何かによるものだろう.
で,
作業内容の「キツさ」に関しては,
われながら英雄的であったとしか表現できん.
たぶん,
怒りを抑制する薬物も投与されていたんだろう
(あるいはすでにばてきっていた,
とか).
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へろへろ状態で
2230 研究室発.
2250 帰宅.
晩飯.
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[今日の運動]
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腹筋運動 30 ×
3 回.
腕立ふせ 5 ×
3 回.
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[今日の食卓]
- 朝 (0950):
米麦 0.5 合.
乾燥野菜海藻スープ.
- 昼 (1450):
研究室お茶部屋.
米麦 0.7 合.
ジャガイモ・タマネギ・ニンジン・キャベツのカレー.
- 晩 (2330):
パン.
タマネギ・ピーマンの炒めもの.