ぎょーむ日誌 2005-01-18

2005 年 01 月 18 日 (火)

• 0830 起床． 0840 自宅発． 曇． 0855 研究室着． 朝飯． コーヒー．
• R 雑メモ． help.start() するとそれいこうの help() は web browser に表示される． 便利かどーか微妙なところだけど， help 中に他関数などへのハイパーリンクができるので， 多少は便利かも． Linux などなら $HOME/.Rprofile 中に options(browser = "ぶらうざへのパス") を書けば起動前に help 用 browser を指定できる (私のは default 値が /usr/bin/mozilla だった)．
• 何やらメイルかきなど． わけわからん紙きれもいっぱいくる． 「裁量労働従事者自己診断カード」だの (何かの責任のがれになるんでしょうなぁ)， 研究費の利息 (たぶん数百円だろう) を辞退しますだの．
• ぱいぷ樹木原稿なおし． なおしというか debug．
• が， いくつか問題点をなおしたとこでとどこおる． ということで， 鹿児島研究会の報告用要旨でっちあげ， という雑用ににげこむ． 締め切りつき何かが目の前から消失するのは， 些事であってもココロに落ちつきをもたらす．
• うーむ， plotnet アヤしげ予算の消化がまだ必要? しかも中間監査は本日だってさ …… 私はかんけーないけど．
• てなかんぢで終ってしまって 昼飯． 今日は院生密度がたいへん低い． おそらく講座セミナーやる小菅せんせーが， みんなの食べものに毒でもまぜたんじゃなかろーか． 内容を隠匿するのではなく， 聞き手の数をへらす (甲山さんインドネシア出張の日程も 小菅せんせーによる操作があったのだろう)， という逆転の発想． おそろしいことです．
• plotnet 予算すりつぶしの面倒は D3 赤坂君におしつけてしまう． ちょうど C-N コーダー消耗品を発注することになってたよーで． 役たたずな測定機械 (久保評) だけど， 今回はめずらしく貢献してくれそうだ．
• 1500 講座セミナー， 本日は小菅せんせーでユキザサの移植実験とそれが繁殖にあたえる影響． 小菅せんせー， 今回もじつに心理学的盲点をつく撹乱とゆーか …… モデルを複雑化して聞き手を撹乱させる (この複雑化の技法は洗練されたもので， データ解析にくわしくないヒトなら それが作為であることをみぬけない --- つまり結果がなぜこのようにややこしくなるのか理解できない)， 他人の PC を資料投影用に借用して「もとデータみせてみろ」 追及を「ここにはない」とかわす， 不慣れなマシン上の「事故」によって見せるべき結果が 「なくなってしまった」 ことにされてしまう， 独特の話術で疲労させ感情的にすることで聞き手からの追及のポイントをずらす …… といったあたりか．
• 対生態学研究者の心理戦専門家である私の分析では， ここで示された実験データから隠匿ノイズをのぞくと， 全 200 個体を一元的に扱うような 簡単な一般化線形混合モデルの一族を使った解析に統合できる， とわかった． セミナー中に簡単に指摘してみたけど， ささっと逃げられてしまったので， セミナー後に本人の身柄をおさえようとしたんだが …… すでにこの建物からは姿を消したあとで， 逆に私を足どめするために小菅せんせーが準備した 「難しい質問をもつ M2」 に拘束されてしまった． うーむ， してやられた ……
• ということで， 立花さんの 2 倍体 4 倍体混合かつ多遺伝子座かつ栄養繁殖ありの 遺伝統計学難問にとりくむ． 多遺伝子座の heterozygosity は一遺伝子座の場合の定義を自然に拡張すれば， 導出できる． 「でも有性繁殖しない植物ではこれでもマチガイなんですよね?」 という鋭い指摘にふりーづしてしまう …… 解決策おもいつかないので， とりあえず， 4 倍体の場合の電気泳動結果のよみとりだの， 場所によるサンプリング方法のちがいなど 周辺情報を教えてもらう．
• で， 夜になってもこの問題とけずにヨワりきった タイミングをみはからったかのよーにして， 小菅せんせーがもどってくる． とりあえず あんなややこしい解析はやめてもっと簡単に GLMM でできるだろう， と指摘すると， ああそんなの自分で簡単にできますできます， と言いながら去っていった． あとから気づいたんだが， これはいつもの時間かせぎではないか? またしてもやられてしまった．
• うーむ， plotnet 中間監査は「これ以上，『消耗品』かうな」 なる判定か …… さてさて， どうしたものやら． もはやばてたので撤退． 2130 研究室発． 2140 帰宅． 晩飯． 苫小牧空間相関メイルかき． 地震． 多遺伝子座 & 栄養繁殖 4 倍体問題， 少しだけ進展する． 電気泳動で「見える」のは 4 倍体の対立遺伝子セットで， ハプロイドの遺伝子セットは特定できない …… このあたり， 利用できるのではないか?
• しかし， 「そもそも有性繁殖 (減数分裂) しない 4 倍体のはぷろいど，とは?」 と考えるとわけわからんな． 架空の世界にすら gene pool が存在しない? gene pool を構成する要素が 4 倍体なのか?
• [今日の運動]
  • うんどう休養日．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0920): 研究室お茶部屋． 「北欧」サンドイッチ．
  • 昼 (1310): 研究室お茶部屋． 米麦 0.7 合． ジャガイモ・ニンジン・タマネギ・エノキダケ・豆腐のカレー．
  • 晩 (2300): 米麦 1.0 合． チンゲンサイ・モヤシ・ニラ・マイタケ・卵の炒めもの．